MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_013959	CGCCTG	2	12	2401325	2401336	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291614832
51502	NC_013959	GAG	2	6	2401344	2401349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291614832
51503	NC_013959	GCCT	2	8	2401434	2401441	0 %	25 %	25 %	50 %	291614832
51504	NC_013959	TCA	2	6	2401486	2401491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614832
51505	NC_013959	GC	3	6	2401515	2401520	0 %	0 %	50 %	50 %	291614832
51506	NC_013959	TCA	2	6	2401610	2401615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614832
51507	NC_013959	ACA	2	6	2401633	2401638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614832
51508	NC_013959	AT	3	6	2401696	2401701	50 %	50 %	0 %	0 %	291614832
51509	NC_013959	ATC	2	6	2401743	2401748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614832
51510	NC_013959	ATG	2	6	2401894	2401899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614832
51511	NC_013959	T	6	6	2402025	2402030	0 %	100 %	0 %	0 %	291614832
51512	NC_013959	GGC	2	6	2402152	2402157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51513	NC_013959	CTT	2	6	2402220	2402225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51514	NC_013959	ATC	2	6	2402314	2402319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614833
51515	NC_013959	GCA	2	6	2402320	2402325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614833
51516	NC_013959	GAT	2	6	2402373	2402378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614833
51517	NC_013959	TGGC	2	8	2402387	2402394	0 %	25 %	50 %	25 %	291614833
51518	NC_013959	TCG	2	6	2402402	2402407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614833
51519	NC_013959	CAT	2	6	2402424	2402429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614833
51520	NC_013959	CAA	2	6	2402478	2402483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51521	NC_013959	CAG	2	6	2402514	2402519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51522	NC_013959	GCT	2	6	2402587	2402592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51523	NC_013959	CTC	2	6	2402595	2402600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51524	NC_013959	GCA	2	6	2402603	2402608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51525	NC_013959	TGTT	2	8	2402656	2402663	0 %	75 %	25 %	0 %	291614834
51526	NC_013959	TCAG	2	8	2402668	2402675	25 %	25 %	25 %	25 %	291614834
51527	NC_013959	GCGCC	2	10	2402846	2402855	0 %	0 %	40 %	60 %	291614834
51528	NC_013959	CA	3	6	2402874	2402879	50 %	0 %	0 %	50 %	291614834
51529	NC_013959	ATC	2	6	2402883	2402888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614834
51530	NC_013959	GCT	2	6	2402912	2402917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614834
51531	NC_013959	TTC	2	6	2403033	2403038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614834
51532	NC_013959	A	8	8	2403068	2403075	100 %	0 %	0 %	0 %	291614834
51533	NC_013959	TCC	2	6	2403087	2403092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51534	NC_013959	TA	3	6	2403136	2403141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51535	NC_013959	TGT	2	6	2403202	2403207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51536	NC_013959	CGC	2	6	2403212	2403217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614835
51537	NC_013959	GC	3	6	2403265	2403270	0 %	0 %	50 %	50 %	291614835
51538	NC_013959	GCG	2	6	2403392	2403397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614835
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51540	NC_013959	AGC	2	6	2403440	2403445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614835
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51542	NC_013959	ACG	2	6	2403512	2403517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614835
51543	NC_013959	TGCG	2	8	2403564	2403571	0 %	25 %	50 %	25 %	291614835
51544	NC_013959	CGC	2	6	2403603	2403608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614835
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51547	NC_013959	CAT	2	6	2403690	2403695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614835
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51551	NC_013959	CGA	2	6	2403872	2403877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614835
51552	NC_013959	CGG	2	6	2403888	2403893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614835
51553	NC_013959	CCG	2	6	2404028	2404033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614835
51554	NC_013959	GC	3	6	2404267	2404272	0 %	0 %	50 %	50 %	291614835
51555	NC_013959	GCCT	2	8	2404307	2404314	0 %	25 %	25 %	50 %	291614835
51556	NC_013959	TGC	2	6	2404514	2404519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614835
51557	NC_013959	CTG	2	6	2404527	2404532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614835
51558	NC_013959	TCG	2	6	2404582	2404587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51559	NC_013959	ACG	2	6	2404653	2404658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614836
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51561	NC_013959	AAG	2	6	2404697	2404702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614836
51562	NC_013959	CTG	2	6	2404787	2404792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614836
51563	NC_013959	GC	3	6	2404830	2404835	0 %	0 %	50 %	50 %	291614836
51564	NC_013959	AT	3	6	2404852	2404857	50 %	50 %	0 %	0 %	291614836
51565	NC_013959	CAT	2	6	2404891	2404896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614836
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51567	NC_013959	CTG	2	6	2404976	2404981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614836
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51571	NC_013959	AAAAGG	2	12	2405067	2405078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614836
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51573	NC_013959	CAGC	2	8	2405246	2405253	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51574	NC_013959	GAG	2	6	2405263	2405268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51575	NC_013959	GGC	2	6	2405275	2405280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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51580	NC_013959	CGG	2	6	2405490	2405495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51581	NC_013959	CAG	2	6	2405554	2405559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51587	NC_013959	CTT	2	6	2405860	2405865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51588	NC_013959	TTC	2	6	2405914	2405919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51589	NC_013959	CCA	2	6	2405925	2405930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51590	NC_013959	GCA	2	6	2405952	2405957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51591	NC_013959	ATG	2	6	2405963	2405968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51592	NC_013959	CCA	2	6	2406027	2406032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51593	NC_013959	CCCG	2	8	2406042	2406049	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51594	NC_013959	GCC	2	6	2406065	2406070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51595	NC_013959	CGC	2	6	2406076	2406081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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51598	NC_013959	TTG	2	6	2406137	2406142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51599	NC_013959	GTTCA	2	10	2406160	2406169	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51600	NC_013959	CGA	2	6	2406201	2406206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51602	NC_013959	TGT	2	6	2406300	2406305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51603	NC_013959	CTG	2	6	2406325	2406330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51606	NC_013959	CAG	2	6	2406385	2406390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51608	NC_013959	TCCA	2	8	2406511	2406518	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51609	NC_013959	GAA	2	6	2406550	2406555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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51612	NC_013959	GAT	2	6	2406805	2406810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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51614	NC_013959	GCCT	2	8	2406947	2406954	0 %	25 %	25 %	50 %	291614837
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51738	NC_013959	ACC	2	6	2412870	2412875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614843
51739	NC_013959	CG	3	6	2412880	2412885	0 %	0 %	50 %	50 %	291614843
51740	NC_013959	CGG	2	6	2412920	2412925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614843
51741	NC_013959	GCG	2	6	2412931	2412936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614843
51742	NC_013959	CCG	2	6	2412958	2412963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614843
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51744	NC_013959	CAT	2	6	2413004	2413009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614843
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51746	NC_013959	GCG	2	6	2413128	2413133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614843
51747	NC_013959	A	6	6	2413201	2413206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51748	NC_013959	T	6	6	2413278	2413283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51757	NC_013959	GCT	2	6	2413529	2413534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614844
51758	NC_013959	CTTCAC	2	12	2413559	2413570	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	291614844
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51832	NC_013959	ATCGC	2	10	2416415	2416424	20 %	20 %	20 %	40 %	291614846
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51835	NC_013959	TCC	2	6	2416595	2416600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291614846
51836	NC_013959	ATC	2	6	2416646	2416651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614846
51837	NC_013959	CTG	2	6	2416658	2416663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614846
51838	NC_013959	TGA	2	6	2416680	2416685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614846
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51840	NC_013959	TTC	2	6	2416751	2416756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614846
51841	NC_013959	CTG	3	9	2416823	2416831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614846
51842	NC_013959	GCA	2	6	2416848	2416853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614846
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51844	NC_013959	CGATGT	2	12	2416890	2416901	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	291614846
51845	NC_013959	TCA	2	6	2416902	2416907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614846
51846	NC_013959	CG	3	6	2416929	2416934	0 %	0 %	50 %	50 %	291614846
51847	NC_013959	GC	3	6	2416983	2416988	0 %	0 %	50 %	50 %	291614846
51848	NC_013959	TGC	2	6	2417016	2417021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614846
51849	NC_013959	CTGC	2	8	2417180	2417187	0 %	25 %	25 %	50 %	291614846
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51851	NC_013959	CGG	2	6	2417257	2417262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614846
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51965	NC_013959	GTC	2	6	2422280	2422285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614852
51966	NC_013959	AAT	2	6	2422358	2422363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291614852
51967	NC_013959	TTC	2	6	2422369	2422374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614852
51968	NC_013959	CCG	2	6	2422410	2422415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614852
51969	NC_013959	ACT	2	6	2422444	2422449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614852
51970	NC_013959	GTT	2	6	2422462	2422467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614852
51971	NC_013959	TGC	2	6	2422512	2422517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614852
51972	NC_013959	CAT	2	6	2422519	2422524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614852
51973	NC_013959	GCC	2	6	2422558	2422563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614852
51974	NC_013959	TCGGCC	2	12	2422575	2422586	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291614852
51975	NC_013959	TGCG	2	8	2422617	2422624	0 %	25 %	50 %	25 %	291614852
51976	NC_013959	CGG	2	6	2422669	2422674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614852
51977	NC_013959	CGC	2	6	2422719	2422724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614853
51978	NC_013959	CAC	2	6	2422763	2422768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614853
51979	NC_013959	TGG	2	6	2422801	2422806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614853
51980	NC_013959	CG	3	6	2422855	2422860	0 %	0 %	50 %	50 %	291614853
51981	NC_013959	AGCA	2	8	2422959	2422966	50 %	0 %	25 %	25 %	291614853
51982	NC_013959	CAT	2	6	2422967	2422972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614853
51983	NC_013959	CTG	2	6	2422989	2422994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614853
51984	NC_013959	GCA	2	6	2423028	2423033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614853
51985	NC_013959	CCA	2	6	2423228	2423233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614853
51986	NC_013959	TATG	2	8	2423256	2423263	25 %	50 %	25 %	0 %	291614853
51987	NC_013959	GC	3	6	2423268	2423273	0 %	0 %	50 %	50 %	291614853
51988	NC_013959	GCG	2	6	2423284	2423289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614853
51989	NC_013959	CAT	2	6	2423294	2423299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614853
51990	NC_013959	CGA	2	6	2423353	2423358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614854
51991	NC_013959	CGC	2	6	2423393	2423398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614854
51992	NC_013959	CGA	2	6	2423476	2423481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614854
51993	NC_013959	GTG	2	6	2423525	2423530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614854
51994	NC_013959	TGA	2	6	2423547	2423552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614854
51995	NC_013959	GAG	2	6	2423567	2423572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291614854
51996	NC_013959	GCA	2	6	2423653	2423658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614854
51997	NC_013959	GAT	2	6	2423683	2423688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614854
51998	NC_013959	GCGCA	2	10	2423696	2423705	20 %	0 %	40 %	40 %	291614854
51999	NC_013959	AAT	2	6	2423754	2423759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291614854
52000	NC_013959	CGA	2	6	2423790	2423795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614855

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