MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 64986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_013959	GGGAG	2	10	2333593	2333602	20 %	0 %	80 %	0 %	291614761
50002	NC_013959	ACA	2	6	2333672	2333677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614761
50003	NC_013959	TGG	2	6	2333712	2333717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614761
50004	NC_013959	GGC	2	6	2333741	2333746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614761
50005	NC_013959	A	7	7	2333760	2333766	100 %	0 %	0 %	0 %	291614761
50006	NC_013959	CAATAC	2	12	2333795	2333806	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	291614761
50007	NC_013959	AT	3	6	2333827	2333832	50 %	50 %	0 %	0 %	291614761
50008	NC_013959	ACT	2	6	2333857	2333862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614761
50009	NC_013959	AGC	2	6	2334002	2334007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614761
50010	NC_013959	CAAT	2	8	2334012	2334019	50 %	25 %	0 %	25 %	291614761
50011	NC_013959	CTG	2	6	2334024	2334029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614761
50012	NC_013959	CTG	2	6	2334072	2334077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614761
50013	NC_013959	GGT	2	6	2334119	2334124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614761
50014	NC_013959	TCA	2	6	2334189	2334194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614761
50015	NC_013959	TGG	2	6	2334228	2334233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614761
50016	NC_013959	CAA	2	6	2334238	2334243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614761
50017	NC_013959	CGG	2	6	2334300	2334305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614761
50018	NC_013959	GCA	2	6	2334306	2334311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614761
50019	NC_013959	CAA	2	6	2334325	2334330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614761
50020	NC_013959	G	6	6	2334483	2334488	0 %	0 %	100 %	0 %	291614761
50021	NC_013959	CA	5	10	2334514	2334523	50 %	0 %	0 %	50 %	291614761
50022	NC_013959	TAA	2	6	2334538	2334543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291614761
50023	NC_013959	GTC	2	6	2334554	2334559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614761
50024	NC_013959	ACA	2	6	2334690	2334695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614761
50025	NC_013959	GGC	2	6	2334713	2334718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614761
50026	NC_013959	CAA	2	6	2334775	2334780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614761
50027	NC_013959	TCA	2	6	2334783	2334788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614761
50028	NC_013959	ACA	2	6	2334885	2334890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614761
50029	NC_013959	TCA	2	6	2334891	2334896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614761
50030	NC_013959	GAC	2	6	2334902	2334907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614761
50031	NC_013959	CAT	2	6	2334916	2334921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614761
50032	NC_013959	GGCAAC	2	12	2334929	2334940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614761
50033	NC_013959	AGA	2	6	2334993	2334998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291614761
50034	NC_013959	CGGCGA	2	12	2335039	2335050	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291614761
50035	NC_013959	ATG	2	6	2335077	2335082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614761
50036	NC_013959	ACGGGG	2	12	2335091	2335102	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	291614761
50037	NC_013959	T	6	6	2335139	2335144	0 %	100 %	0 %	0 %	291614761
50038	NC_013959	CAG	2	6	2335255	2335260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614761
50039	NC_013959	TCA	2	6	2335269	2335274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614761
50040	NC_013959	CAA	2	6	2335384	2335389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614761
50041	NC_013959	GCA	2	6	2335437	2335442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614761
50042	NC_013959	TCA	2	6	2335500	2335505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614761
50043	NC_013959	CGG	2	6	2335540	2335545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614761
50044	NC_013959	GTT	2	6	2335556	2335561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614761
50045	NC_013959	GCG	2	6	2335569	2335574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614761
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50047	NC_013959	CGG	2	6	2335645	2335650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614761
50048	NC_013959	CGG	2	6	2335678	2335683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614761
50049	NC_013959	CAA	2	6	2335720	2335725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614761
50050	NC_013959	CCA	2	6	2335728	2335733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614761
50051	NC_013959	TCG	2	6	2335764	2335769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614761
50052	NC_013959	GCG	2	6	2335797	2335802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614761
50053	NC_013959	ACC	2	6	2335838	2335843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614761
50054	NC_013959	CGG	2	6	2335885	2335890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614761
50055	NC_013959	GGCA	2	8	2335918	2335925	25 %	0 %	50 %	25 %	291614761
50056	NC_013959	TGG	2	6	2335948	2335953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614761
50057	NC_013959	GCA	2	6	2336040	2336045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614761
50058	NC_013959	AATC	2	8	2336061	2336068	50 %	25 %	0 %	25 %	291614761
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50060	NC_013959	TGA	2	6	2336168	2336173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614761
50061	NC_013959	CTG	2	6	2336188	2336193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614762
50062	NC_013959	GAT	2	6	2336226	2336231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614762
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50064	NC_013959	GA	3	6	2336368	2336373	50 %	0 %	50 %	0 %	291614762
50065	NC_013959	AACA	2	8	2336379	2336386	75 %	0 %	0 %	25 %	291614762
50066	NC_013959	CCTT	2	8	2336395	2336402	0 %	50 %	0 %	50 %	291614763
50067	NC_013959	GT	3	6	2336416	2336421	0 %	50 %	50 %	0 %	291614763
50068	NC_013959	TGC	2	6	2336426	2336431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614763
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50084	NC_013959	GCG	2	6	2337143	2337148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614763
50085	NC_013959	CG	3	6	2337186	2337191	0 %	0 %	50 %	50 %	291614763
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50089	NC_013959	ATC	2	6	2337278	2337283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614763
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50098	NC_013959	TGA	2	6	2337526	2337531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614764
50099	NC_013959	CTG	2	6	2337537	2337542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614764
50100	NC_013959	CACG	2	8	2337593	2337600	25 %	0 %	25 %	50 %	291614764
50101	NC_013959	CGC	3	9	2337659	2337667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614764
50102	NC_013959	ACG	2	6	2337685	2337690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614764
50103	NC_013959	CGA	2	6	2337722	2337727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614764
50104	NC_013959	TCG	2	6	2337736	2337741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614764
50105	NC_013959	GC	3	6	2337755	2337760	0 %	0 %	50 %	50 %	291614764
50106	NC_013959	ATT	2	6	2337823	2337828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291614764
50107	NC_013959	GCAT	2	8	2337857	2337864	25 %	25 %	25 %	25 %	291614764
50108	NC_013959	GCA	2	6	2337932	2337937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614764
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50111	NC_013959	TGG	2	6	2338098	2338103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614764
50112	NC_013959	ATG	2	6	2338174	2338179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614765
50113	NC_013959	TGGC	2	8	2338180	2338187	0 %	25 %	50 %	25 %	291614765
50114	NC_013959	CGA	2	6	2338239	2338244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614765
50115	NC_013959	CTG	2	6	2338393	2338398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614765
50116	NC_013959	CAG	2	6	2338459	2338464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614765
50117	NC_013959	CTG	2	6	2338501	2338506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614765
50118	NC_013959	TGA	2	6	2338568	2338573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614765
50119	NC_013959	TGT	2	6	2338595	2338600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614765
50120	NC_013959	CAGC	2	8	2338617	2338624	25 %	0 %	25 %	50 %	291614765
50121	NC_013959	CTG	2	6	2338666	2338671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614765
50122	NC_013959	GAAA	2	8	2338683	2338690	75 %	0 %	25 %	0 %	291614765
50123	NC_013959	GCT	3	9	2338713	2338721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614765
50124	NC_013959	GCG	2	6	2338736	2338741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614765
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50126	NC_013959	CAACT	2	10	2338855	2338864	40 %	20 %	0 %	40 %	291614765
50127	NC_013959	CTT	2	6	2338899	2338904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614765
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50129	NC_013959	CTG	2	6	2339034	2339039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614765
50130	NC_013959	TGC	2	6	2339081	2339086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614765
50131	NC_013959	AACG	2	8	2339131	2339138	50 %	0 %	25 %	25 %	291614765
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50133	NC_013959	CTTG	2	8	2339238	2339245	0 %	50 %	25 %	25 %	291614765
50134	NC_013959	GC	3	6	2339335	2339340	0 %	0 %	50 %	50 %	291614765
50135	NC_013959	CAA	2	6	2339346	2339351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614765
50136	NC_013959	CGC	3	9	2339406	2339414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614765
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50143	NC_013959	CGA	2	6	2339746	2339751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614766
50144	NC_013959	ATC	2	6	2339769	2339774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614766
50145	NC_013959	TGC	2	6	2339775	2339780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614766
50146	NC_013959	GCC	2	6	2339792	2339797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614766
50147	NC_013959	TGC	2	6	2339818	2339823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614766
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50150	NC_013959	GAT	2	6	2339860	2339865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614766
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50152	NC_013959	GCA	2	6	2339926	2339931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614766
50153	NC_013959	GCC	2	6	2339963	2339968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614766
50154	NC_013959	CGCT	2	8	2340033	2340040	0 %	25 %	25 %	50 %	291614766
50155	NC_013959	GCG	2	6	2340103	2340108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614766
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50159	NC_013959	TCA	2	6	2340307	2340312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614766
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50168	NC_013959	CCA	2	6	2340505	2340510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614767
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50172	NC_013959	CAGC	2	8	2340685	2340692	25 %	0 %	25 %	50 %	291614767
50173	NC_013959	TCGCG	2	10	2340706	2340715	0 %	20 %	40 %	40 %	291614767
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50180	NC_013959	CAGC	2	8	2340878	2340885	25 %	0 %	25 %	50 %	291614768
50181	NC_013959	CGC	2	6	2340886	2340891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614768
50182	NC_013959	GCA	2	6	2340951	2340956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614768
50183	NC_013959	GCA	2	6	2340966	2340971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614768
50184	NC_013959	CAT	3	9	2341029	2341037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614768
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50186	NC_013959	TCT	2	6	2341068	2341073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614768
50187	NC_013959	TCT	2	6	2341161	2341166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614768
50188	NC_013959	CAG	2	6	2341213	2341218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614768
50189	NC_013959	GAT	2	6	2341405	2341410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614768
50190	NC_013959	GAT	2	6	2341483	2341488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614768
50191	NC_013959	GAT	2	6	2341648	2341653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614768
50192	NC_013959	GCT	2	6	2341686	2341691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614768
50193	NC_013959	TGC	2	6	2341698	2341703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614768
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50200	NC_013959	CGC	2	6	2342095	2342100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614768
50201	NC_013959	ACC	2	6	2342171	2342176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614768
50202	NC_013959	CGC	2	6	2342263	2342268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614768
50203	NC_013959	TCG	2	6	2342279	2342284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614768
50204	NC_013959	CGC	2	6	2342353	2342358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614768
50205	NC_013959	CAGATA	2	12	2342428	2342439	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	291614768
50206	NC_013959	GC	3	6	2342458	2342463	0 %	0 %	50 %	50 %	291614768
50207	NC_013959	CAG	2	6	2342464	2342469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614768
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50211	NC_013959	CGA	2	6	2342661	2342666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614769
50212	NC_013959	CAG	2	6	2342725	2342730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614769
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50214	NC_013959	GCG	2	6	2342751	2342756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614769
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50217	NC_013959	CCAG	2	8	2342808	2342815	25 %	0 %	25 %	50 %	291614769
50218	NC_013959	CGG	2	6	2342841	2342846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614769
50219	NC_013959	GTC	2	6	2342869	2342874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614769
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50223	NC_013959	GTT	2	6	2342986	2342991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614769
50224	NC_013959	GCC	2	6	2342998	2343003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614769
50225	NC_013959	CTT	2	6	2343013	2343018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291614769
50226	NC_013959	GAT	2	6	2343019	2343024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614769
50227	NC_013959	TTCCAG	2	12	2343028	2343039	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	291614769
50228	NC_013959	GTT	2	6	2343067	2343072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291614769
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50235	NC_013959	ATGA	2	8	2343353	2343360	50 %	25 %	25 %	0 %	291614770
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50462	NC_013959	AAGCTC	2	12	2353549	2353560	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291614778
50463	NC_013959	CGA	2	6	2353650	2353655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614778
50464	NC_013959	GATC	2	8	2353716	2353723	25 %	25 %	25 %	25 %	291614778
50465	NC_013959	GAC	2	6	2353756	2353761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614778
50466	NC_013959	CAT	2	6	2353779	2353784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614778
50467	NC_013959	AAC	2	6	2353841	2353846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291614778
50468	NC_013959	CTG	3	9	2353852	2353860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614778
50469	NC_013959	TTAA	2	8	2354087	2354094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50470	NC_013959	CCG	2	6	2354113	2354118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614779
50471	NC_013959	CGCGC	2	10	2354158	2354167	0 %	0 %	40 %	60 %	291614779
50472	NC_013959	GC	3	6	2354175	2354180	0 %	0 %	50 %	50 %	291614779
50473	NC_013959	CGG	2	6	2354239	2354244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614779
50474	NC_013959	TCA	2	6	2354281	2354286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614779
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50476	NC_013959	GCC	2	6	2354427	2354432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291614779
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50480	NC_013959	CATG	2	8	2354655	2354662	25 %	25 %	25 %	25 %	291614780
50481	NC_013959	CAG	2	6	2354688	2354693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614780
50482	NC_013959	TCG	2	6	2354708	2354713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614780
50483	NC_013959	CGG	3	9	2354739	2354747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614780
50484	NC_013959	CTG	2	6	2354830	2354835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614780
50485	NC_013959	GGC	2	6	2354890	2354895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614780
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50488	NC_013959	CAC	2	6	2355012	2355017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291614781
50489	NC_013959	CGA	2	6	2355020	2355025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614781
50490	NC_013959	CGTC	2	8	2355034	2355041	0 %	25 %	25 %	50 %	291614781
50491	NC_013959	ATGAA	2	10	2355085	2355094	60 %	20 %	20 %	0 %	291614781
50492	NC_013959	GGC	2	6	2355120	2355125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614781
50493	NC_013959	AGC	2	6	2355138	2355143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291614781
50494	NC_013959	TCA	2	6	2355181	2355186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291614781
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50496	NC_013959	GTC	2	6	2355239	2355244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291614781
50497	NC_013959	GGC	2	6	2355259	2355264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291614781
50498	NC_013959	GCTT	2	8	2355320	2355327	0 %	50 %	25 %	25 %	291614782
50499	NC_013959	GAT	3	9	2355482	2355490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291614782
50500	NC_013959	TGG	2	6	2355590	2355595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291614782

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