MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus lugdunensis HKU09-01 chromosome

Total Repeats: 63084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013893	ATA	2	6	27	32	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013893	TTA	2	6	74	79	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013893	AAT	2	6	108	113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013893	ATA	2	6	135	140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013893	AC	3	6	216	221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013893	ATT	2	6	234	239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013893	TTA	2	6	266	271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013893	T	6	6	276	281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013893	AAAT	2	8	284	291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013893	ATT	2	6	318	323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013893	TAA	2	6	328	333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013893	TCA	2	6	387	392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013893	AAG	2	6	577	582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549372
14	NC_013893	CATTA	2	10	623	632	40 %	40 %	0 %	20 %	289549372
15	NC_013893	TCA	2	6	654	659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549372
16	NC_013893	ACA	2	6	680	685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549372
17	NC_013893	ATG	2	6	810	815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549372
18	NC_013893	T	6	6	890	895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013893	ATT	2	6	925	930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013893	AGT	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013893	AT	3	6	994	999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013893	TTC	2	6	1027	1032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013893	GAT	2	6	1044	1049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013893	TAA	2	6	1067	1072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013893	AGTT	2	8	1076	1083	25 %	50 %	25 %	0 %	289549373
26	NC_013893	TGT	3	9	1114	1122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549373
27	NC_013893	GTA	2	6	1126	1131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549373
28	NC_013893	TAAT	2	8	1145	1152	50 %	50 %	0 %	0 %	289549373
29	NC_013893	AAT	2	6	1155	1160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549373
30	NC_013893	AATTG	2	10	1189	1198	40 %	40 %	20 %	0 %	289549373
31	NC_013893	TAAA	2	8	1227	1234	75 %	25 %	0 %	0 %	289549373
32	NC_013893	CAA	2	6	1238	1243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549373
33	NC_013893	TTC	2	6	1337	1342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549373
34	NC_013893	TTC	2	6	1347	1352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549373
35	NC_013893	CAT	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549373
36	NC_013893	TAA	2	6	1437	1442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549373
37	NC_013893	TTA	2	6	1478	1483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549373
38	NC_013893	ATC	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013893	TAAT	2	8	1505	1512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013893	TAA	2	6	1526	1531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013893	TGT	2	6	1558	1563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013893	ATT	2	6	1567	1572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013893	TAA	2	6	1573	1578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013893	TAA	2	6	1603	1608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549374
45	NC_013893	A	6	6	1612	1617	100 %	0 %	0 %	0 %	289549374
46	NC_013893	AT	3	6	1624	1629	50 %	50 %	0 %	0 %	289549374
47	NC_013893	TAG	2	6	1640	1645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549374
48	NC_013893	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549374
49	NC_013893	AGAA	2	8	1700	1707	75 %	0 %	25 %	0 %	289549374
50	NC_013893	ATA	2	6	1731	1736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549374
51	NC_013893	TTGA	2	8	1791	1798	25 %	50 %	25 %	0 %	289549374
52	NC_013893	AAT	2	6	1812	1817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549374
53	NC_013893	A	6	6	1833	1838	100 %	0 %	0 %	0 %	289549374
54	NC_013893	GCTT	2	8	1890	1897	0 %	50 %	25 %	25 %	289549374
55	NC_013893	TCAT	2	8	1938	1945	25 %	50 %	0 %	25 %	289549374
56	NC_013893	CTA	2	6	1950	1955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549374
57	NC_013893	AC	3	6	1967	1972	50 %	0 %	0 %	50 %	289549374
58	NC_013893	T	6	6	1987	1992	0 %	100 %	0 %	0 %	289549374
59	NC_013893	AG	3	6	2011	2016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013893	TAAT	2	8	2029	2036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013893	TAA	2	6	2042	2047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013893	T	7	7	2069	2075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013893	TAA	2	6	2180	2185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013893	ATT	2	6	2192	2197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013893	ATA	2	6	2250	2255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013893	A	6	6	2262	2267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013893	TAA	2	6	2268	2273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013893	GTT	2	6	2292	2297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013893	ATCA	2	8	2310	2317	50 %	25 %	0 %	25 %	289549375
70	NC_013893	AGA	2	6	2325	2330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549375
71	NC_013893	TTGA	2	8	2339	2346	25 %	50 %	25 %	0 %	289549375
72	NC_013893	A	6	6	2350	2355	100 %	0 %	0 %	0 %	289549375
73	NC_013893	GTAG	2	8	2357	2364	25 %	25 %	50 %	0 %	289549375
74	NC_013893	TAA	2	6	2438	2443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549375
75	NC_013893	TCA	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549376
76	NC_013893	ATT	2	6	2541	2546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549376
77	NC_013893	T	7	7	2574	2580	0 %	100 %	0 %	0 %	289549376
78	NC_013893	A	6	6	2606	2611	100 %	0 %	0 %	0 %	289549376
79	NC_013893	AATT	2	8	2613	2620	50 %	50 %	0 %	0 %	289549376
80	NC_013893	ATT	2	6	2643	2648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549376
81	NC_013893	TCA	2	6	2651	2656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549376
82	NC_013893	AAT	2	6	2743	2748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549376
83	NC_013893	TAT	2	6	2818	2823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013893	T	6	6	2846	2851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013893	T	6	6	2874	2879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013893	TTA	2	6	2881	2886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013893	GTA	2	6	2887	2892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013893	AATC	2	8	2967	2974	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013893	TAA	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013893	TAC	2	6	3037	3042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013893	T	6	6	3129	3134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013893	TTTA	2	8	3143	3150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013893	AAATG	2	10	3204	3213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013893	ATG	2	6	3224	3229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549377
95	NC_013893	TAT	2	6	3285	3290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549377
96	NC_013893	TCA	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549377
97	NC_013893	ACA	2	6	3350	3355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549377
98	NC_013893	AT	3	6	3383	3388	50 %	50 %	0 %	0 %	289549377
99	NC_013893	GC	3	6	3409	3414	0 %	0 %	50 %	50 %	289549377
100	NC_013893	ATT	2	6	3472	3477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549377
101	NC_013893	TTG	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549377
102	NC_013893	A	6	6	3599	3604	100 %	0 %	0 %	0 %	289549377
103	NC_013893	GGT	2	6	3611	3616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549377
104	NC_013893	ACA	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549377
105	NC_013893	AAC	2	6	3654	3659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549377
106	NC_013893	TAA	2	6	3724	3729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549377
107	NC_013893	ATT	2	6	3749	3754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549377
108	NC_013893	AGA	2	6	3772	3777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549377
109	NC_013893	GTAT	2	8	3782	3789	25 %	50 %	25 %	0 %	289549377
110	NC_013893	GAA	2	6	3827	3832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549377
111	NC_013893	TA	3	6	3879	3884	50 %	50 %	0 %	0 %	289549377
112	NC_013893	AATTAT	2	12	4016	4027	50 %	50 %	0 %	0 %	289549377
113	NC_013893	T	7	7	4311	4317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013893	T	6	6	4369	4374	0 %	100 %	0 %	0 %	289549378
115	NC_013893	TG	3	6	4383	4388	0 %	50 %	50 %	0 %	289549378
116	NC_013893	CTG	2	6	4395	4400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549378
117	NC_013893	TGT	2	6	4487	4492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549378
118	NC_013893	T	6	6	4499	4504	0 %	100 %	0 %	0 %	289549378
119	NC_013893	TTC	3	9	4511	4519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549378
120	NC_013893	GAA	2	6	4528	4533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549378
121	NC_013893	T	6	6	4535	4540	0 %	100 %	0 %	0 %	289549378
122	NC_013893	A	6	6	4581	4586	100 %	0 %	0 %	0 %	289549378
123	NC_013893	TAT	2	6	4591	4596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549378
124	NC_013893	CTT	2	6	4627	4632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549378
125	NC_013893	T	6	6	4646	4651	0 %	100 %	0 %	0 %	289549378
126	NC_013893	TTC	2	6	4664	4669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549378
127	NC_013893	A	7	7	4806	4812	100 %	0 %	0 %	0 %	289549378
128	NC_013893	TAA	2	6	4816	4821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549378
129	NC_013893	TGCT	2	8	4834	4841	0 %	50 %	25 %	25 %	289549378
130	NC_013893	ATC	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013893	TA	3	6	4939	4944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013893	AATT	2	8	4960	4967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013893	AC	3	6	4986	4991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013893	TAA	2	6	4997	5002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013893	AATT	2	8	5015	5022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013893	TA	4	8	5024	5031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013893	A	6	6	5031	5036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013893	GGA	2	6	5038	5043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013893	AGC	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289549379
140	NC_013893	TA	3	6	5104	5109	50 %	50 %	0 %	0 %	289549379
141	NC_013893	TGA	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549379
142	NC_013893	GT	3	6	5154	5159	0 %	50 %	50 %	0 %	289549379
143	NC_013893	ATG	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549379
144	NC_013893	TCA	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549379
145	NC_013893	AGA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
146	NC_013893	AGA	2	6	5309	5314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
147	NC_013893	ACA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549379
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160	NC_013893	ATT	3	9	5656	5664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549379
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162	NC_013893	TTA	2	6	5706	5711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549379
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166	NC_013893	TA	3	6	5863	5868	50 %	50 %	0 %	0 %	289549379
167	NC_013893	TCAA	2	8	5917	5924	50 %	25 %	0 %	25 %	289549379
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171	NC_013893	TGTT	2	8	6196	6203	0 %	75 %	25 %	0 %	289549380
172	NC_013893	ATT	2	6	6243	6248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549380
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179	NC_013893	ACT	2	6	6683	6688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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