MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus gallolyticus UCN34 chromosome

Total Repeats: 51505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013798	A	6	6	7	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013798	CTTT	2	8	40	47	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013798	T	6	6	89	94	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013798	T	6	6	121	126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013798	ACT	2	6	164	169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013798	T	6	6	189	194	0 %	100 %	0 %	0 %	288904224
7	NC_013798	T	6	6	248	253	0 %	100 %	0 %	0 %	288904224
8	NC_013798	ATTT	2	8	299	306	25 %	75 %	0 %	0 %	288904224
9	NC_013798	GTT	2	6	322	327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288904224
10	NC_013798	ATT	2	6	350	355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288904224
11	NC_013798	TTG	2	6	390	395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288904224
12	NC_013798	AGT	2	6	436	441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904224
13	NC_013798	CAA	2	6	462	467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288904224
14	NC_013798	A	7	7	471	477	100 %	0 %	0 %	0 %	288904224
15	NC_013798	AAC	2	6	595	600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288904224
16	NC_013798	GGA	2	6	623	628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288904224
17	NC_013798	AAT	2	6	683	688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288904224
18	NC_013798	CTG	2	6	714	719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288904224
19	NC_013798	TCA	2	6	726	731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288904224
20	NC_013798	TGA	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904224
21	NC_013798	GAA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288904224
22	NC_013798	GAA	2	6	857	862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288904224
23	NC_013798	ATA	2	6	891	896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288904224
24	NC_013798	CAAT	2	8	987	994	50 %	25 %	0 %	25 %	288904224
25	NC_013798	TTG	2	6	1149	1154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288904224
26	NC_013798	GCA	2	6	1193	1198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288904224
27	NC_013798	GC	3	6	1340	1345	0 %	0 %	50 %	50 %	288904224
28	NC_013798	CG	3	6	1363	1368	0 %	0 %	50 %	50 %	288904224
29	NC_013798	GGAA	2	8	1401	1408	50 %	0 %	50 %	0 %	288904224
30	NC_013798	ATTGAA	2	12	1490	1501	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	288904224
31	NC_013798	GTT	2	6	1569	1574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013798	AAC	2	6	1575	1580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013798	CG	3	6	1587	1592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013798	CAA	2	6	1618	1623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013798	CTA	5	15	1636	1650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013798	TAA	2	6	1661	1666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013798	TAA	2	6	1700	1705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288904225
38	NC_013798	TCTT	3	12	1707	1718	0 %	75 %	0 %	25 %	288904225
39	NC_013798	AG	3	6	1738	1743	50 %	0 %	50 %	0 %	288904225
40	NC_013798	CTA	2	6	1750	1755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288904225
41	NC_013798	CAA	2	6	1777	1782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288904225
42	NC_013798	ACATT	2	10	1807	1816	40 %	40 %	0 %	20 %	288904225
43	NC_013798	CTT	2	6	1922	1927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288904225
44	NC_013798	GAA	2	6	1971	1976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288904225
45	NC_013798	GCA	2	6	2136	2141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288904225
46	NC_013798	GTT	2	6	2283	2288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288904225
47	NC_013798	GAT	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904225
48	NC_013798	TCT	2	6	2356	2361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288904225
49	NC_013798	TTG	2	6	2445	2450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288904225
50	NC_013798	TAA	2	6	2567	2572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288904225
51	NC_013798	GAA	2	6	2619	2624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288904225
52	NC_013798	GTT	2	6	2718	2723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288904225
53	NC_013798	TGA	2	6	2768	2773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904225
54	NC_013798	GAA	2	6	2842	2847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013798	CTTTT	2	10	2873	2882	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013798	TAA	2	6	2943	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013798	TAT	2	6	2961	2966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288904226
58	NC_013798	CAT	2	6	3025	3030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288904226
59	NC_013798	TTA	2	6	3049	3054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288904226
60	NC_013798	GA	3	6	3088	3093	50 %	0 %	50 %	0 %	288904226
61	NC_013798	TTG	2	6	3134	3139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288904226
62	NC_013798	GAG	2	6	3140	3145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288904226
63	NC_013798	TAT	2	6	3199	3204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288904226
64	NC_013798	ATT	2	6	3264	3269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288904226
65	NC_013798	AAG	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288904226
66	NC_013798	GCA	2	6	3355	3360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288904226
67	NC_013798	GTT	2	6	3364	3369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288904226
68	NC_013798	GCT	2	6	3376	3381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288904226
69	NC_013798	TAA	2	6	3405	3410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288904226
70	NC_013798	A	6	6	3462	3467	100 %	0 %	0 %	0 %	288904226
71	NC_013798	TAA	2	6	3549	3554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288904226
72	NC_013798	TGG	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288904226
73	NC_013798	GT	3	6	3618	3623	0 %	50 %	50 %	0 %	288904226
74	NC_013798	T	6	6	3642	3647	0 %	100 %	0 %	0 %	288904226
75	NC_013798	TGT	2	6	3665	3670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288904226
76	NC_013798	CTTA	2	8	3701	3708	25 %	50 %	0 %	25 %	288904226
77	NC_013798	AG	3	6	3750	3755	50 %	0 %	50 %	0 %	288904226
78	NC_013798	AATTGA	2	12	3759	3770	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	288904226
79	NC_013798	CAC	2	6	3806	3811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288904226
80	NC_013798	TATT	2	8	3822	3829	25 %	75 %	0 %	0 %	288904226
81	NC_013798	TGAAA	2	10	3869	3878	60 %	20 %	20 %	0 %	288904227
82	NC_013798	A	7	7	3911	3917	100 %	0 %	0 %	0 %	288904227
83	NC_013798	AATG	2	8	3921	3928	50 %	25 %	25 %	0 %	288904227
84	NC_013798	ATG	2	6	3990	3995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904227
85	NC_013798	GCC	2	6	3997	4002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288904227
86	NC_013798	AAAG	2	8	4022	4029	75 %	0 %	25 %	0 %	288904227
87	NC_013798	AAT	2	6	4047	4052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013798	TA	3	6	4090	4095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013798	AAT	2	6	4147	4152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013798	CAG	2	6	4184	4189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288904228
91	NC_013798	GCT	2	6	4258	4263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288904228
92	NC_013798	TGGTA	2	10	4296	4305	20 %	40 %	40 %	0 %	288904228
93	NC_013798	A	7	7	4354	4360	100 %	0 %	0 %	0 %	288904228
94	NC_013798	CAA	2	6	4367	4372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288904228
95	NC_013798	GTG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288904228
96	NC_013798	TAA	2	6	4434	4439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288904228
97	NC_013798	GTT	2	6	4480	4485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288904228
98	NC_013798	TGA	3	9	4494	4502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904228
99	NC_013798	TTG	2	6	4538	4543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288904228
100	NC_013798	AATT	2	8	4566	4573	50 %	50 %	0 %	0 %	288904228
101	NC_013798	AATT	2	8	4577	4584	50 %	50 %	0 %	0 %	288904228
102	NC_013798	TAA	2	6	4605	4610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288904228
103	NC_013798	AAAGAT	2	12	4648	4659	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	288904228
104	NC_013798	TTC	2	6	4679	4684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288904228
105	NC_013798	A	6	6	4685	4690	100 %	0 %	0 %	0 %	288904228
106	NC_013798	AGA	3	9	4740	4748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288904228
107	NC_013798	A	6	6	4751	4756	100 %	0 %	0 %	0 %	288904228
108	NC_013798	ACA	2	6	4780	4785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288904228
109	NC_013798	TGA	2	6	4812	4817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904228
110	NC_013798	TGC	2	6	4872	4877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288904228
111	NC_013798	GTT	3	9	4894	4902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288904228
112	NC_013798	GAA	3	9	4918	4926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288904228
113	NC_013798	TGA	3	9	4938	4946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904228
114	NC_013798	ATT	2	6	4956	4961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288904228
115	NC_013798	TGC	2	6	5010	5015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288904228
116	NC_013798	CTTG	2	8	5022	5029	0 %	50 %	25 %	25 %	288904228
117	NC_013798	ACTT	2	8	5038	5045	25 %	50 %	0 %	25 %	288904228
118	NC_013798	CAG	2	6	5048	5053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288904228
119	NC_013798	AAG	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288904228
120	NC_013798	CTC	2	6	5099	5104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288904228
121	NC_013798	AGC	2	6	5106	5111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288904228
122	NC_013798	ATG	2	6	5168	5173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904228
123	NC_013798	AAG	2	6	5207	5212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288904228
124	NC_013798	GTC	2	6	5216	5221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288904228
125	NC_013798	GAA	2	6	5227	5232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288904228
126	NC_013798	ATTA	2	8	5295	5302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013798	A	6	6	5320	5325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013798	GGAAA	2	10	5353	5362	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013798	TTG	2	6	5380	5385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288904229
130	NC_013798	ATA	2	6	5425	5430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288904229
131	NC_013798	ACCA	2	8	5552	5559	50 %	0 %	0 %	50 %	288904229
132	NC_013798	TTG	2	6	5595	5600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288904229
133	NC_013798	TAT	2	6	5604	5609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288904229
134	NC_013798	ATATTG	2	12	5611	5622	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	288904229
135	NC_013798	ATG	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904229
136	NC_013798	CTG	2	6	5692	5697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288904229
137	NC_013798	GAT	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904229
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