MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus L.D.8.5 chromosome

Total Repeats: 59991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013769	CAT	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013769	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013769	CCT	2	6	47	52	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013769	TC	3	6	61	66	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013769	TTTC	2	8	134	141	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013769	GT	3	6	179	184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013769	ATT	2	6	290	295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013769	GTCAC	2	10	357	366	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_013769	ATT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013769	TAA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013769	T	8	8	444	451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013769	TATT	2	8	525	532	25 %	75 %	0 %	0 %	284996408
13	NC_013769	TAT	2	6	536	541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996408
14	NC_013769	TAT	2	6	578	583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996408
15	NC_013769	ATT	2	6	619	624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996408
16	NC_013769	GTT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284996408
17	NC_013769	GTT	2	6	647	652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284996408
18	NC_013769	CTT	2	6	672	677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284996408
19	NC_013769	TTAC	2	8	700	707	25 %	50 %	0 %	25 %	284996408
20	NC_013769	GGT	2	6	866	871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284996409
21	NC_013769	A	6	6	886	891	100 %	0 %	0 %	0 %	284996409
22	NC_013769	AG	3	6	941	946	50 %	0 %	50 %	0 %	284996409
23	NC_013769	TGC	2	6	961	966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284996409
24	NC_013769	GTAA	2	8	1049	1056	50 %	25 %	25 %	0 %	284996409
25	NC_013769	GAG	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284996409
26	NC_013769	ATGAGG	2	12	1089	1100	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	284996409
27	NC_013769	TGG	2	6	1144	1149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284996409
28	NC_013769	TAT	2	6	1164	1169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996409
29	NC_013769	GATAA	2	10	1238	1247	60 %	20 %	20 %	0 %	284996409
30	NC_013769	ATA	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996409
31	NC_013769	AGAGG	2	10	1308	1317	40 %	0 %	60 %	0 %	284996409
32	NC_013769	AT	3	6	1359	1364	50 %	50 %	0 %	0 %	284996409
33	NC_013769	TTA	2	6	1368	1373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996409
34	NC_013769	ATC	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284996409
35	NC_013769	ACG	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284996409
36	NC_013769	AAC	2	6	1467	1472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284996409
37	NC_013769	TAA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996409
38	NC_013769	ATG	2	6	1524	1529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284996409
39	NC_013769	AGC	2	6	1609	1614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284996409
40	NC_013769	AGCT	2	8	1617	1624	25 %	25 %	25 %	25 %	284996409
41	NC_013769	TGG	2	6	1627	1632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284996409
42	NC_013769	G	6	6	1631	1636	0 %	0 %	100 %	0 %	284996409
43	NC_013769	AG	3	6	1684	1689	50 %	0 %	50 %	0 %	284996409
44	NC_013769	CCTT	2	8	1711	1718	0 %	50 %	0 %	50 %	284996409
45	NC_013769	AAG	2	6	1738	1743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996409
46	NC_013769	AGA	2	6	1756	1761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996409
47	NC_013769	TAA	2	6	1798	1803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996409
48	NC_013769	CAAA	2	8	1807	1814	75 %	0 %	0 %	25 %	284996409
49	NC_013769	AGA	2	6	1829	1834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996409
50	NC_013769	ATA	2	6	1844	1849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996409
51	NC_013769	TGG	2	6	1906	1911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284996409
52	NC_013769	AAG	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996409
53	NC_013769	GTATTG	2	12	1983	1994	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	284996409
54	NC_013769	TGA	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284996409
55	NC_013769	AGA	2	6	2033	2038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996410
56	NC_013769	AGA	2	6	2087	2092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996410
57	NC_013769	CTA	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284996410
58	NC_013769	GGA	2	6	2159	2164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284996410
59	NC_013769	AAG	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996410
60	NC_013769	AT	3	6	2183	2188	50 %	50 %	0 %	0 %	284996410
61	NC_013769	AAG	3	9	2240	2248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996410
62	NC_013769	GAA	2	6	2268	2273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996410
63	NC_013769	AAG	2	6	2274	2279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996410
64	NC_013769	ATT	2	6	2289	2294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996410
65	NC_013769	ATT	2	6	2310	2315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996410
66	NC_013769	ATT	2	6	2320	2325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996410
67	NC_013769	TAAA	2	8	2366	2373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013769	TA	5	10	2382	2391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013769	ATA	2	6	2409	2414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996411
70	NC_013769	TAT	2	6	2465	2470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996411
71	NC_013769	TAA	2	6	2500	2505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996411
72	NC_013769	TAA	2	6	2509	2514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996411
73	NC_013769	TA	3	6	2520	2525	50 %	50 %	0 %	0 %	284996411
74	NC_013769	TAGG	2	8	2563	2570	25 %	25 %	50 %	0 %	284996411
75	NC_013769	AGA	2	6	2579	2584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996411
76	NC_013769	CTTT	2	8	2661	2668	0 %	75 %	0 %	25 %	284996411
77	NC_013769	AGC	2	6	2681	2686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284996411
78	NC_013769	ATT	2	6	2713	2718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996411
79	NC_013769	GAT	2	6	2820	2825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284996411
80	NC_013769	TAA	2	6	2827	2832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996411
81	NC_013769	TGC	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284996411
82	NC_013769	AAT	2	6	2873	2878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996411
83	NC_013769	TGC	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284996411
84	NC_013769	GCA	2	6	2973	2978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284996411
85	NC_013769	TGAT	2	8	2986	2993	25 %	50 %	25 %	0 %	284996411
86	NC_013769	TA	3	6	3066	3071	50 %	50 %	0 %	0 %	284996411
87	NC_013769	TAC	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284996411
88	NC_013769	AATTGC	2	12	3083	3094	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284996411
89	NC_013769	AAT	2	6	3128	3133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996411
90	NC_013769	T	6	6	3248	3253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013769	T	6	6	3272	3277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013769	GGTT	2	8	3323	3330	0 %	50 %	50 %	0 %	284996412
93	NC_013769	GAA	2	6	3346	3351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996412
94	NC_013769	AAG	2	6	3356	3361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996412
95	NC_013769	TTTAAG	2	12	3365	3376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284996412
96	NC_013769	CAAT	2	8	3386	3393	50 %	25 %	0 %	25 %	284996412
97	NC_013769	ATC	3	9	3435	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284996412
98	NC_013769	TAT	2	6	3458	3463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996412
99	NC_013769	AAC	2	6	3484	3489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284996412
100	NC_013769	GGA	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284996412
101	NC_013769	TGA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284996412
102	NC_013769	AAG	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996413
103	NC_013769	AGAA	2	8	3655	3662	75 %	0 %	25 %	0 %	284996413
104	NC_013769	CCA	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284996413
105	NC_013769	TTTA	2	8	3696	3703	25 %	75 %	0 %	0 %	284996413
106	NC_013769	TCC	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284996413
107	NC_013769	TCCTT	2	10	3843	3852	0 %	60 %	0 %	40 %	284996413
108	NC_013769	TTA	2	6	3869	3874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996413
109	NC_013769	ACTA	2	8	3921	3928	50 %	25 %	0 %	25 %	284996413
110	NC_013769	TTG	2	6	3938	3943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284996413
111	NC_013769	TAT	3	9	3954	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996413
112	NC_013769	T	6	6	3962	3967	0 %	100 %	0 %	0 %	284996413
113	NC_013769	TAA	2	6	4045	4050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996413
114	NC_013769	TAG	2	6	4066	4071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284996413
115	NC_013769	A	6	6	4072	4077	100 %	0 %	0 %	0 %	284996413
116	NC_013769	CGTTA	2	10	4086	4095	20 %	40 %	20 %	20 %	284996413
117	NC_013769	T	6	6	4142	4147	0 %	100 %	0 %	0 %	284996413
118	NC_013769	TCC	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284996413
119	NC_013769	CTT	2	6	4204	4209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284996413
120	NC_013769	CATT	2	8	4221	4228	25 %	50 %	0 %	25 %	284996413
121	NC_013769	TC	3	6	4274	4279	0 %	50 %	0 %	50 %	284996414
122	NC_013769	TC	3	6	4310	4315	0 %	50 %	0 %	50 %	284996414
123	NC_013769	CCTCTG	2	12	4501	4512	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	284996414
124	NC_013769	CTGTG	2	10	4517	4526	0 %	40 %	40 %	20 %	284996414
125	NC_013769	AAG	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996414
126	NC_013769	CCA	2	6	4603	4608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284996414
127	NC_013769	GTAAT	2	10	4663	4672	40 %	40 %	20 %	0 %	284996414
128	NC_013769	AAT	2	6	4705	4710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996414
129	NC_013769	GTTTT	2	10	4737	4746	0 %	80 %	20 %	0 %	284996414
130	NC_013769	TC	3	6	4780	4785	0 %	50 %	0 %	50 %	284996414
131	NC_013769	AGG	2	6	4788	4793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284996414
132	NC_013769	TAT	2	6	4871	4876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013769	TCT	2	6	4947	4952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284996415
134	NC_013769	TACG	2	8	4985	4992	25 %	25 %	25 %	25 %	284996415
135	NC_013769	TA	3	6	4999	5004	50 %	50 %	0 %	0 %	284996415
136	NC_013769	ATTGAT	2	12	5009	5020	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284996415
137	NC_013769	CTT	2	6	5044	5049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284996415
138	NC_013769	TAA	2	6	5051	5056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996415
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