MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus L.D.8.5 chromosome

Total Repeats: 59991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013769	AAGAT	2	10	599557	599566	60 %	20 %	20 %	0 %	284997042
13002	NC_013769	TA	3	6	599618	599623	50 %	50 %	0 %	0 %	284997042
13003	NC_013769	CTATA	2	10	599624	599633	40 %	40 %	0 %	20 %	284997042
13004	NC_013769	AGA	2	6	599681	599686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284997042
13005	NC_013769	ATT	2	6	599766	599771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284997042
13006	NC_013769	GAT	2	6	599790	599795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284997042
13007	NC_013769	TAAT	2	8	599857	599864	50 %	50 %	0 %	0 %	284997042
13008	NC_013769	AGA	2	6	599936	599941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284997042
13009	NC_013769	AT	4	8	599944	599951	50 %	50 %	0 %	0 %	284997042
13010	NC_013769	CAC	2	6	600046	600051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284997042
13011	NC_013769	ATA	2	6	600058	600063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284997042
13012	NC_013769	GTT	2	6	600075	600080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284997042
13013	NC_013769	AATAT	2	10	600235	600244	60 %	40 %	0 %	0 %	284997042
13014	NC_013769	AT	3	6	600263	600268	50 %	50 %	0 %	0 %	284997042
13015	NC_013769	AAT	2	6	600279	600284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284997042
13016	NC_013769	TTA	2	6	600325	600330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_013769	T	6	6	600339	600344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_013769	TTG	2	6	600349	600354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_013769	GGT	2	6	600417	600422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_013769	ATA	2	6	600439	600444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284997043
13021	NC_013769	TA	3	6	600449	600454	50 %	50 %	0 %	0 %	284997043
13022	NC_013769	AAAT	2	8	600465	600472	75 %	25 %	0 %	0 %	284997043
13023	NC_013769	TA	3	6	600552	600557	50 %	50 %	0 %	0 %	284997043
13024	NC_013769	AGGGA	2	10	600567	600576	40 %	0 %	60 %	0 %	284997043
13025	NC_013769	GGAA	2	8	600913	600920	50 %	0 %	50 %	0 %	284997044
13026	NC_013769	AGG	2	6	600931	600936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284997044
13027	NC_013769	GAT	2	6	600960	600965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284997044
13028	NC_013769	TTA	3	9	601071	601079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284997045
13029	NC_013769	TAA	2	6	601227	601232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284997045
13030	NC_013769	AGAA	2	8	601243	601250	75 %	0 %	25 %	0 %	284997045
13031	NC_013769	AGA	2	6	601314	601319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284997045
13032	NC_013769	AGGA	2	8	601429	601436	50 %	0 %	50 %	0 %	284997045
13033	NC_013769	TTTA	2	8	601505	601512	25 %	75 %	0 %	0 %	284997045
13034	NC_013769	GTT	2	6	601588	601593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284997045
13035	NC_013769	TAAT	2	8	601595	601602	50 %	50 %	0 %	0 %	284997045
13036	NC_013769	ATT	2	6	601615	601620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284997045
13037	NC_013769	TGG	2	6	601633	601638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284997045
13038	NC_013769	GGA	2	6	601778	601783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284997045
13039	NC_013769	AAG	2	6	601831	601836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284997045
13040	NC_013769	ATT	2	6	601839	601844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284997045
13041	NC_013769	TTA	2	6	601856	601861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284997045
13042	NC_013769	TAC	2	6	601908	601913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284997045
13043	NC_013769	AGA	2	6	601920	601925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284997045
13044	NC_013769	TGA	2	6	601937	601942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284997045
13045	NC_013769	CTTA	2	8	601976	601983	25 %	50 %	0 %	25 %	284997045
13046	NC_013769	AGT	2	6	602021	602026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284997045
13047	NC_013769	ATA	3	9	602061	602069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_013769	ATT	3	9	602082	602090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_013769	TAATT	2	10	602110	602119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_013769	AAT	2	6	602135	602140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_013769	TTA	2	6	602166	602171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_013769	AG	3	6	602224	602229	50 %	0 %	50 %	0 %	284997046
13053	NC_013769	TACT	2	8	602261	602268	25 %	50 %	0 %	25 %	284997046
13054	NC_013769	TAA	3	9	602269	602277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284997046
13055	NC_013769	TAT	2	6	602281	602286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284997046
13056	NC_013769	TGA	2	6	602317	602322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284997046
13057	NC_013769	CTAAA	2	10	602340	602349	60 %	20 %	0 %	20 %	284997046
13058	NC_013769	TAA	2	6	602376	602381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284997046
13059	NC_013769	TATT	2	8	602401	602408	25 %	75 %	0 %	0 %	284997046
13060	NC_013769	TGA	2	6	602494	602499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284997046
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13062	NC_013769	A	6	6	602727	602732	100 %	0 %	0 %	0 %	284997047
13063	NC_013769	TTC	2	6	602881	602886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284997047
13064	NC_013769	ATCCAG	2	12	602959	602970	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284997047
13065	NC_013769	TA	3	6	602982	602987	50 %	50 %	0 %	0 %	284997047
13066	NC_013769	ATG	2	6	602993	602998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284997047
13067	NC_013769	AAT	2	6	603020	603025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_013769	TTC	3	9	603046	603054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_013769	TCT	2	6	603060	603065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_013769	ATACTT	2	12	603121	603132	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13071	NC_013769	TAA	2	6	603153	603158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_013769	AG	3	6	603245	603250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_013769	A	6	6	603290	603295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_013769	AGG	2	6	603298	603303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_013769	AAAT	2	8	603356	603363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_013769	TAA	2	6	603407	603412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_013769	TA	3	6	603433	603438	50 %	50 %	0 %	0 %	284997048
13078	NC_013769	TCT	2	6	603520	603525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284997048
13079	NC_013769	TAT	2	6	603585	603590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284997048
13080	NC_013769	ACT	2	6	603591	603596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284997048
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13083	NC_013769	GTAT	2	8	603700	603707	25 %	50 %	25 %	0 %	284997048
13084	NC_013769	AT	3	6	603728	603733	50 %	50 %	0 %	0 %	284997048
13085	NC_013769	AAT	2	6	603765	603770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284997048
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13088	NC_013769	TAA	2	6	603894	603899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284997048
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13091	NC_013769	TCT	2	6	604271	604276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284997048
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13094	NC_013769	CTAT	2	8	604348	604355	25 %	50 %	0 %	25 %	284997048
13095	NC_013769	CTT	2	6	604410	604415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284997048
13096	NC_013769	CTA	2	6	604435	604440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284997048
13097	NC_013769	CTT	2	6	604493	604498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284997048
13098	NC_013769	CTT	2	6	604533	604538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284997048
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13101	NC_013769	ATTCT	2	10	604694	604703	20 %	60 %	0 %	20 %	284997048
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13103	NC_013769	TCC	2	6	604813	604818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284997048
13104	NC_013769	GAATC	2	10	604838	604847	40 %	20 %	20 %	20 %	284997048
13105	NC_013769	CTT	2	6	604953	604958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284997048
13106	NC_013769	GA	3	6	605040	605045	50 %	0 %	50 %	0 %	284997048
13107	NC_013769	ACTT	2	8	605067	605074	25 %	50 %	0 %	25 %	284997048
13108	NC_013769	AGA	2	6	605080	605085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284997048
13109	NC_013769	TCT	2	6	605219	605224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284997048
13110	NC_013769	CCTCT	2	10	605252	605261	0 %	40 %	0 %	60 %	284997048
13111	NC_013769	GAT	2	6	605272	605277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284997048
13112	NC_013769	CT	3	6	605294	605299	0 %	50 %	0 %	50 %	284997048
13113	NC_013769	GA	3	6	605313	605318	50 %	0 %	50 %	0 %	284997048
13114	NC_013769	TAT	2	6	605382	605387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284997048
13115	NC_013769	TAT	2	6	605406	605411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284997048
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13117	NC_013769	TC	3	6	605523	605528	0 %	50 %	0 %	50 %	284997048
13118	NC_013769	ACTA	2	8	605538	605545	50 %	25 %	0 %	25 %	284997048
13119	NC_013769	TA	3	6	605574	605579	50 %	50 %	0 %	0 %	284997048
13120	NC_013769	TTA	3	9	605609	605617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284997048
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13122	NC_013769	TCTT	2	8	605683	605690	0 %	75 %	0 %	25 %	284997048
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