MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus L.D.8.5 chromosome

Total Repeats: 59991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013769	TCA	2	6	226007	226012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284996666
5002	NC_013769	CATT	2	8	226119	226126	25 %	50 %	0 %	25 %	284996666
5003	NC_013769	ACT	2	6	226295	226300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284996666
5004	NC_013769	ACT	2	6	226316	226321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284996666
5005	NC_013769	TTA	2	6	226338	226343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996666
5006	NC_013769	TG	3	6	226408	226413	0 %	50 %	50 %	0 %	284996666
5007	NC_013769	GCT	2	6	226421	226426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284996666
5008	NC_013769	TA	3	6	226534	226539	50 %	50 %	0 %	0 %	284996666
5009	NC_013769	CTA	2	6	226683	226688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284996666
5010	NC_013769	ATT	2	6	226795	226800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_013769	AATA	2	8	226801	226808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_013769	GAA	2	6	226821	226826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_013769	TTACAT	2	12	226828	226839	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5014	NC_013769	TATTT	2	10	226864	226873	20 %	80 %	0 %	0 %	284996667
5015	NC_013769	CTA	2	6	226931	226936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284996667
5016	NC_013769	TATG	2	8	226976	226983	25 %	50 %	25 %	0 %	284996667
5017	NC_013769	TA	3	6	227025	227030	50 %	50 %	0 %	0 %	284996667
5018	NC_013769	TGT	2	6	227056	227061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284996667
5019	NC_013769	AT	3	6	227084	227089	50 %	50 %	0 %	0 %	284996667
5020	NC_013769	AATT	2	8	227151	227158	50 %	50 %	0 %	0 %	284996667
5021	NC_013769	TCC	2	6	227183	227188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284996667
5022	NC_013769	TAT	2	6	227286	227291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996667
5023	NC_013769	CAAGC	2	10	227312	227321	40 %	0 %	20 %	40 %	284996667
5024	NC_013769	CT	3	6	227390	227395	0 %	50 %	0 %	50 %	284996667
5025	NC_013769	AAT	2	6	227471	227476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996667
5026	NC_013769	CT	3	6	227481	227486	0 %	50 %	0 %	50 %	284996667
5027	NC_013769	GAAA	2	8	227518	227525	75 %	0 %	25 %	0 %	284996667
5028	NC_013769	TAT	2	6	227531	227536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996667
5029	NC_013769	TAAT	2	8	227563	227570	50 %	50 %	0 %	0 %	284996667
5030	NC_013769	CT	4	8	227579	227586	0 %	50 %	0 %	50 %	284996667
5031	NC_013769	TTAAT	2	10	227588	227597	40 %	60 %	0 %	0 %	284996667
5032	NC_013769	TCC	2	6	227610	227615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284996667
5033	NC_013769	GGT	2	6	227632	227637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284996667
5034	NC_013769	ATT	2	6	227682	227687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996667
5035	NC_013769	T	6	6	227713	227718	0 %	100 %	0 %	0 %	284996667
5036	NC_013769	TGT	2	6	227733	227738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284996667
5037	NC_013769	AGTA	2	8	227776	227783	50 %	25 %	25 %	0 %	284996667
5038	NC_013769	TAAG	2	8	227900	227907	50 %	25 %	25 %	0 %	284996667
5039	NC_013769	CCT	2	6	227918	227923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284996667
5040	NC_013769	TAAT	2	8	228104	228111	50 %	50 %	0 %	0 %	284996667
5041	NC_013769	GTC	2	6	228120	228125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284996667
5042	NC_013769	TCT	2	6	228138	228143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284996667
5043	NC_013769	TTA	2	6	228185	228190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_013769	TA	3	6	228235	228240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_013769	ACT	2	6	228332	228337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284996668
5046	NC_013769	AAT	2	6	228341	228346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996668
5047	NC_013769	GAT	2	6	228428	228433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284996668
5048	NC_013769	AGA	2	6	228484	228489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996668
5049	NC_013769	TAG	2	6	228808	228813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284996668
5050	NC_013769	TA	4	8	228837	228844	50 %	50 %	0 %	0 %	284996668
5051	NC_013769	TAG	2	6	228849	228854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284996668
5052	NC_013769	AAGTA	2	10	228958	228967	60 %	20 %	20 %	0 %	284996668
5053	NC_013769	CGATT	2	10	228985	228994	20 %	40 %	20 %	20 %	284996668
5054	NC_013769	AAC	2	6	229034	229039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284996668
5055	NC_013769	TAG	2	6	229047	229052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284996668
5056	NC_013769	AGG	2	6	229190	229195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284996668
5057	NC_013769	AAG	2	6	229293	229298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996668
5058	NC_013769	AG	3	6	229468	229473	50 %	0 %	50 %	0 %	284996668
5059	NC_013769	TAC	2	6	229492	229497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284996668
5060	NC_013769	AT	4	8	229646	229653	50 %	50 %	0 %	0 %	284996668
5061	NC_013769	GAAG	2	8	229654	229661	50 %	0 %	50 %	0 %	284996668
5062	NC_013769	TTG	2	6	229703	229708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284996668
5063	NC_013769	TTAG	2	8	229799	229806	25 %	50 %	25 %	0 %	284996668
5064	NC_013769	AGG	2	6	229831	229836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284996668
5065	NC_013769	TAA	2	6	229837	229842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996668
5066	NC_013769	AGAT	2	8	229923	229930	50 %	25 %	25 %	0 %	284996668
5067	NC_013769	TAA	2	6	230034	230039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996668
5068	NC_013769	AT	3	6	230045	230050	50 %	50 %	0 %	0 %	284996668
5069	NC_013769	TAAA	2	8	230077	230084	75 %	25 %	0 %	0 %	284996668
5070	NC_013769	TAT	2	6	230098	230103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_013769	AT	3	6	230220	230225	50 %	50 %	0 %	0 %	284996669
5072	NC_013769	TAA	2	6	230232	230237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996669
5073	NC_013769	GAA	2	6	230315	230320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996669
5074	NC_013769	TGT	2	6	230350	230355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284996669
5075	NC_013769	GAA	3	9	230380	230388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284996669
5076	NC_013769	TAA	2	6	230391	230396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996669
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5078	NC_013769	A	6	6	230420	230425	100 %	0 %	0 %	0 %	284996669
5079	NC_013769	ATT	2	6	230460	230465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996669
5080	NC_013769	TTG	2	6	230481	230486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284996669
5081	NC_013769	A	6	6	230550	230555	100 %	0 %	0 %	0 %	284996669
5082	NC_013769	A	6	6	230572	230577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_013769	TAT	2	6	230584	230589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996670
5084	NC_013769	TTCT	2	8	230635	230642	0 %	75 %	0 %	25 %	284996670
5085	NC_013769	AGT	2	6	230671	230676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284996670
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5087	NC_013769	CTT	2	6	230711	230716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284996670
5088	NC_013769	TA	3	6	230748	230753	50 %	50 %	0 %	0 %	284996670
5089	NC_013769	ATT	2	6	230791	230796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996670
5090	NC_013769	GCTT	2	8	230852	230859	0 %	50 %	25 %	25 %	284996670
5091	NC_013769	TA	3	6	230885	230890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_013769	TTA	2	6	230924	230929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_013769	TTG	2	6	230969	230974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_013769	ATTT	2	8	230985	230992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_013769	GGT	2	6	231051	231056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284996671
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5097	NC_013769	GATA	2	8	231122	231129	50 %	25 %	25 %	0 %	284996671
5098	NC_013769	TAG	2	6	231149	231154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284996671
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5100	NC_013769	AGT	2	6	231245	231250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284996671
5101	NC_013769	A	6	6	231275	231280	100 %	0 %	0 %	0 %	284996671
5102	NC_013769	A	7	7	231291	231297	100 %	0 %	0 %	0 %	284996671
5103	NC_013769	TGA	2	6	231334	231339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284996671
5104	NC_013769	TGTT	2	8	231368	231375	0 %	75 %	25 %	0 %	284996671
5105	NC_013769	TTA	2	6	231395	231400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996671
5106	NC_013769	TGAA	2	8	231409	231416	50 %	25 %	25 %	0 %	284996671
5107	NC_013769	AGATT	2	10	231420	231429	40 %	40 %	20 %	0 %	284996671
5108	NC_013769	GAAT	2	8	231515	231522	50 %	25 %	25 %	0 %	284996671
5109	NC_013769	TAA	2	6	231574	231579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996671
5110	NC_013769	AAGA	2	8	231657	231664	75 %	0 %	25 %	0 %	284996671
5111	NC_013769	ATG	2	6	231827	231832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_013769	AAAG	2	8	231833	231840	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_013769	TA	3	6	231844	231849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_013769	ATA	2	6	231958	231963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996672
5115	NC_013769	TTC	2	6	231993	231998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284996672
5116	NC_013769	CTT	2	6	232059	232064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284996672
5117	NC_013769	AAT	2	6	232099	232104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284996673
5118	NC_013769	AT	3	6	232310	232315	50 %	50 %	0 %	0 %	284996673
5119	NC_013769	TTC	2	6	232316	232321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284996673
5120	NC_013769	AGAT	2	8	232429	232436	50 %	25 %	25 %	0 %	284996673
5121	NC_013769	GCT	2	6	232454	232459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284996673
5122	NC_013769	TA	3	6	232496	232501	50 %	50 %	0 %	0 %	284996673
5123	NC_013769	TAG	2	6	232512	232517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284996673
5124	NC_013769	GAT	2	6	232537	232542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284996673
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5126	NC_013769	TGC	2	6	232642	232647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284996673
5127	NC_013769	GTAATC	2	12	232697	232708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284996673
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5239	NC_013769	ATAG	2	8	237638	237645	50 %	25 %	25 %	0 %	284996679
5240	NC_013769	TAT	2	6	237657	237662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284996679
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5247	NC_013769	TGA	2	6	237983	237988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_013769	T	6	6	250060	250065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_013769	TTA	2	6	250090	250095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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