MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN08

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013738	GATG	2	8	184	191	25 %	25 %	50 %	0 %	284006005
2	NC_013738	CTG	2	6	224	229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006005
3	NC_013738	CCG	2	6	259	264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284006005
4	NC_013738	TTC	2	6	276	281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284006005
5	NC_013738	TAC	2	6	388	393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006005
6	NC_013738	AAT	2	6	437	442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284006005
7	NC_013738	CCGG	2	8	526	533	0 %	0 %	50 %	50 %	284006005
8	NC_013738	CCG	2	6	535	540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284006005
9	NC_013738	GCA	2	6	559	564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006005
10	NC_013738	GCC	2	6	581	586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284006005
11	NC_013738	CAC	2	6	599	604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284006005
12	NC_013738	GGA	2	6	683	688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284006005
13	NC_013738	ATG	2	6	693	698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006005
14	NC_013738	C	6	6	729	734	0 %	0 %	0 %	100 %	284006005
15	NC_013738	AGT	4	12	789	800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006005
16	NC_013738	TA	3	6	827	832	50 %	50 %	0 %	0 %	284006005
17	NC_013738	CAG	2	6	878	883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013738	GTA	2	6	925	930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013738	TCG	2	6	1099	1104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006006
20	NC_013738	GGT	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006006
21	NC_013738	AGT	2	6	1155	1160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006006
22	NC_013738	ATC	2	6	1234	1239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006006
23	NC_013738	GTT	2	6	1275	1280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006006
24	NC_013738	GTA	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006006
25	NC_013738	AGT	2	6	1502	1507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013738	GTGA	2	8	1513	1520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013738	GTT	2	6	1541	1546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013738	TATGT	2	10	1560	1569	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013738	TTC	2	6	1611	1616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013738	GCA	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006007
31	NC_013738	TTCA	2	8	1708	1715	25 %	50 %	0 %	25 %	284006007
32	NC_013738	GTT	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006007
33	NC_013738	GTT	2	6	1953	1958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006007
34	NC_013738	AGA	2	6	1983	1988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013738	ACT	2	6	2029	2034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013738	AAG	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284006008
37	NC_013738	CGTT	2	8	2152	2159	0 %	50 %	25 %	25 %	284006008
38	NC_013738	TAC	2	6	2202	2207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006008
39	NC_013738	CTAC	2	8	2234	2241	25 %	25 %	0 %	50 %	284006008
40	NC_013738	GTA	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006008
41	NC_013738	ATG	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006008
42	NC_013738	A	6	6	2409	2414	100 %	0 %	0 %	0 %	284006008
43	NC_013738	GAA	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284006008
44	NC_013738	TTG	2	6	2432	2437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006008
45	NC_013738	TGA	2	6	2494	2499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006008
46	NC_013738	GTT	2	6	2533	2538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006008
47	NC_013738	TTC	2	6	2625	2630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284006009
48	NC_013738	TTTGG	2	10	2648	2657	0 %	60 %	40 %	0 %	284006009
49	NC_013738	TGAG	2	8	2690	2697	25 %	25 %	50 %	0 %	284006009
50	NC_013738	TAAC	2	8	2743	2750	50 %	25 %	0 %	25 %	284006009
51	NC_013738	ACGCCC	2	12	2831	2842	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	284006009
52	NC_013738	GCT	2	6	2907	2912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006009
53	NC_013738	AAT	2	6	2978	2983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284006009
54	NC_013738	GTA	2	6	3229	3234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006009
55	NC_013738	GCTT	2	8	3288	3295	0 %	50 %	25 %	25 %	284006009
56	NC_013738	TGG	2	6	3371	3376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006009
57	NC_013738	TTC	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284006009
58	NC_013738	CGT	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006009
59	NC_013738	CTTT	2	8	3499	3506	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013738	TAAAAC	2	12	3532	3543	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013738	A	9	9	3548	3556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013738	TTA	2	6	3583	3588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013738	TTA	2	6	3616	3621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013738	TTA	2	6	3649	3654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013738	TTA	2	6	3671	3676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013738	A	6	6	3723	3728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013738	ATA	2	6	3760	3765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013738	TTG	3	9	3775	3783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013738	A	7	7	3818	3824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013738	AAAG	2	8	3889	3896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013738	GGC	2	6	3919	3924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013738	TTA	2	6	4018	4023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013738	AAAAT	2	10	4058	4067	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013738	AAGC	2	8	4116	4123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013738	TCGG	2	8	4152	4159	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013738	GTA	2	6	4236	4241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006010
77	NC_013738	GTGA	2	8	4334	4341	25 %	25 %	50 %	0 %	284006010
78	NC_013738	CCG	2	6	4389	4394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284006010
79	NC_013738	TTG	2	6	4410	4415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006010
80	NC_013738	CAA	2	6	4423	4428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284006010
81	NC_013738	CGA	2	6	4468	4473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006010
82	NC_013738	TCA	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006010
83	NC_013738	GAT	2	6	4518	4523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006010
84	NC_013738	GAAG	2	8	4581	4588	50 %	0 %	50 %	0 %	284006011
85	NC_013738	GAAAA	2	10	4589	4598	80 %	0 %	20 %	0 %	284006011
86	NC_013738	GCT	2	6	4611	4616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006011
87	NC_013738	ATG	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006011
88	NC_013738	CAG	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006011
89	NC_013738	GAA	2	6	4738	4743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284006011
90	NC_013738	AAG	2	6	4747	4752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284006011
91	NC_013738	TAC	2	6	4760	4765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006011
92	NC_013738	GCC	2	6	4784	4789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284006011
93	NC_013738	CACATT	2	12	4855	4866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006011
94	NC_013738	AAC	2	6	5058	5063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284006011
95	NC_013738	ACG	2	6	5083	5088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006011
96	NC_013738	AG	3	6	5127	5132	50 %	0 %	50 %	0 %	284006011
97	NC_013738	ACG	2	6	5183	5188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006011
98	NC_013738	CAG	2	6	5257	5262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006011
99	NC_013738	GAA	2	6	5374	5379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284006011
100	NC_013738	AGC	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006011
101	NC_013738	GAA	2	6	5422	5427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284006011
102	NC_013738	ACA	2	6	5430	5435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284006011
103	NC_013738	A	6	6	5435	5440	100 %	0 %	0 %	0 %	284006011
104	NC_013738	CGG	2	6	5545	5550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284006012
105	NC_013738	TGC	2	6	5614	5619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006012
106	NC_013738	GGC	2	6	5675	5680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284006012
107	NC_013738	CA	3	6	5694	5699	50 %	0 %	0 %	50 %	284006012
108	NC_013738	TAC	2	6	5783	5788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006012
109	NC_013738	TGG	2	6	5827	5832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006012
110	NC_013738	TG	3	6	5851	5856	0 %	50 %	50 %	0 %	284006012
111	NC_013738	ACT	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006012
112	NC_013738	ACAA	2	8	5893	5900	75 %	0 %	0 %	25 %	284006012
113	NC_013738	ACT	2	6	5926	5931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006012
114	NC_013738	AAC	2	6	5961	5966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284006012
115	NC_013738	ACG	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006012
116	NC_013738	ATT	2	6	6059	6064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013738	ACA	2	6	6066	6071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.