MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN07

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013737	T	6	6	1	6	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013737	T	6	6	8	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013737	T	6	6	45	50	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013737	ACCA	2	8	415	422	50 %	0 %	0 %	50 %	284005993
5	NC_013737	TC	3	6	463	468	0 %	50 %	0 %	50 %	284005993
6	NC_013737	CATC	2	8	622	629	25 %	25 %	0 %	50 %	284005993
7	NC_013737	AAGG	2	8	665	672	50 %	0 %	50 %	0 %	284005993
8	NC_013737	GGAG	2	8	727	734	25 %	0 %	75 %	0 %	284005993
9	NC_013737	AGG	2	6	805	810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005993
10	NC_013737	TC	3	6	816	821	0 %	50 %	0 %	50 %	284005993
11	NC_013737	CAA	2	6	878	883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005993
12	NC_013737	TGA	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005993
13	NC_013737	AG	3	6	1029	1034	50 %	0 %	50 %	0 %	284005993
14	NC_013737	A	6	6	1041	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	284005993
15	NC_013737	GAC	2	6	1139	1144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005993
16	NC_013737	C	6	6	1153	1158	0 %	0 %	0 %	100 %	284005993
17	NC_013737	ACA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005993
18	NC_013737	TAA	2	6	1408	1413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005994
19	NC_013737	GAA	2	6	1457	1462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005994
20	NC_013737	GCCA	2	8	1624	1631	25 %	0 %	25 %	50 %	284005994
21	NC_013737	TAA	2	6	1676	1681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005994
22	NC_013737	A	6	6	1680	1685	100 %	0 %	0 %	0 %	284005995
23	NC_013737	ATC	2	6	1771	1776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005995
24	NC_013737	AACC	2	8	1894	1901	50 %	0 %	0 %	50 %	284005996
25	NC_013737	AACC	2	8	1926	1933	50 %	0 %	0 %	50 %	284005996
26	NC_013737	AGA	2	6	1976	1981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005996
27	NC_013737	GAC	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005996
28	NC_013737	CAGC	2	8	2023	2030	25 %	0 %	25 %	50 %	284005996
29	NC_013737	TGACC	2	10	2063	2072	20 %	20 %	20 %	40 %	284005996
30	NC_013737	GA	3	6	2101	2106	50 %	0 %	50 %	0 %	284005996
31	NC_013737	TGA	2	6	2124	2129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005996
32	NC_013737	AATT	2	8	2174	2181	50 %	50 %	0 %	0 %	284005997
33	NC_013737	CCGA	2	8	2224	2231	25 %	0 %	25 %	50 %	284005997
34	NC_013737	T	6	6	2365	2370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013737	AGAT	2	8	2371	2378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013737	TAA	2	6	2421	2426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005998
37	NC_013737	A	6	6	2453	2458	100 %	0 %	0 %	0 %	284005998
38	NC_013737	ATC	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005998
39	NC_013737	AAC	2	6	2521	2526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005998
40	NC_013737	AAC	2	6	2651	2656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005998
41	NC_013737	CTT	2	6	2700	2705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005998
42	NC_013737	ATC	2	6	2720	2725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005998
43	NC_013737	ATC	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005998
44	NC_013737	TCG	2	6	2738	2743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005998
45	NC_013737	TAGA	2	8	2813	2820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013737	GCC	2	6	2845	2850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_013737	TGA	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013737	AATC	2	8	2869	2876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013737	TAAT	2	8	2920	2927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013737	CAA	2	6	3075	3080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013737	CTG	2	6	3130	3135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013737	AAG	2	6	3197	3202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013737	TTA	2	6	3209	3214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013737	TCC	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_013737	GAAC	2	8	3534	3541	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013737	CCA	2	6	3574	3579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013737	CGG	2	6	3583	3588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013737	CTT	2	6	3606	3611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005999
59	NC_013737	TCG	2	6	3648	3653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005999
60	NC_013737	CGG	2	6	3660	3665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005999
61	NC_013737	CGCT	2	8	3671	3678	0 %	25 %	25 %	50 %	284005999
62	NC_013737	GTTGA	2	10	3680	3689	20 %	40 %	40 %	0 %	284005999
63	NC_013737	TACC	2	8	3701	3708	25 %	25 %	0 %	50 %	284005999
64	NC_013737	T	6	6	3745	3750	0 %	100 %	0 %	0 %	284005999
65	NC_013737	TGG	2	6	3834	3839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005999
66	NC_013737	CAA	2	6	3848	3853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005999
67	NC_013737	TGA	3	9	3879	3887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005999
68	NC_013737	CAG	2	6	3913	3918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005999
69	NC_013737	GCG	2	6	3935	3940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005999
70	NC_013737	GCT	2	6	3985	3990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005999
71	NC_013737	AAT	2	6	4032	4037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013737	ATA	2	6	4046	4051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013737	ACA	2	6	4061	4066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013737	AAC	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013737	A	6	6	4097	4102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013737	AAC	2	6	4132	4137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284006000
77	NC_013737	ATG	2	6	4152	4157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006000
78	NC_013737	TGC	2	6	4167	4172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006000
79	NC_013737	TGG	2	6	4189	4194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006000
80	NC_013737	CGT	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006000
81	NC_013737	GTT	2	6	4378	4383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006000
82	NC_013737	GTC	2	6	4386	4391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006000
83	NC_013737	GGATT	2	10	4435	4444	20 %	40 %	40 %	0 %	284006000
84	NC_013737	TGCT	2	8	4454	4461	0 %	50 %	25 %	25 %	284006000
85	NC_013737	ATC	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006000
86	NC_013737	TCA	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006000
87	NC_013737	AGT	2	6	4552	4557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006000
88	NC_013737	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284006001
89	NC_013737	ACC	2	6	4756	4761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284006001
90	NC_013737	CGG	3	9	4841	4849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284006001
91	NC_013737	CTT	2	6	4956	4961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284006001
92	NC_013737	CCT	2	6	5027	5032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284006001
93	NC_013737	GGC	2	6	5061	5066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284006001
94	NC_013737	GGT	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006001
95	NC_013737	GCT	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006001
96	NC_013737	CTGCT	2	10	5257	5266	0 %	40 %	20 %	40 %	284006001
97	NC_013737	TGG	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006002
98	NC_013737	CTT	2	6	5416	5421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284006002
99	NC_013737	TGC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006002
100	NC_013737	TCG	2	6	5541	5546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006002
101	NC_013737	GCC	2	6	5643	5648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284006002
102	NC_013737	TCA	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006002
103	NC_013737	GTG	2	6	5826	5831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006002
104	NC_013737	TGGT	2	8	5838	5845	0 %	50 %	50 %	0 %	284006002
105	NC_013737	GAT	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006002
106	NC_013737	TTC	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284006002
107	NC_013737	CTG	2	6	5981	5986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006002
108	NC_013737	CG	3	6	6002	6007	0 %	0 %	50 %	50 %	284006002
109	NC_013737	ACT	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006002
110	NC_013737	TCC	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284006002
111	NC_013737	TTG	2	6	6225	6230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006002
112	NC_013737	C	6	6	6347	6352	0 %	0 %	0 %	100 %	284006002
113	NC_013737	TCA	2	6	6364	6369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006002
114	NC_013737	CGTC	2	8	6405	6412	0 %	25 %	25 %	50 %	284006003
115	NC_013737	CCA	2	6	6444	6449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284006003
116	NC_013737	GCT	2	6	6519	6524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006003
117	NC_013737	ACT	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006003
118	NC_013737	CTG	2	6	6805	6810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006003
119	NC_013737	GTA	2	6	6853	6858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013737	TAAA	2	8	6897	6904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013737	TAAT	2	8	6935	6942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013737	ATT	2	6	6955	6960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013737	GAA	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013737	CT	3	6	7017	7022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013737	GTT	2	6	7187	7192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013737	GACT	2	8	7197	7204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013737	TAT	2	6	7219	7224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013737	AAT	2	6	7228	7233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013737	TAA	2	6	7250	7255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013737	C	7	7	7272	7278	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_013737	TCCT	2	8	7281	7288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.