MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED98 plasmid pAVY

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013451	AGCA	2	8	1	8	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013451	AATA	2	8	59	66	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013451	A	6	6	66	71	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013451	TAT	2	6	114	119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013451	ATAA	2	8	129	136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013451	A	6	6	135	140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013451	TGT	2	6	170	175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013451	T	6	6	279	284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013451	ATTT	2	8	306	313	25 %	75 %	0 %	0 %	262225766
10	NC_013451	A	6	6	322	327	100 %	0 %	0 %	0 %	262225766
11	NC_013451	GGGA	2	8	356	363	25 %	0 %	75 %	0 %	262225766
12	NC_013451	GTC	2	6	369	374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262225766
13	NC_013451	AAC	2	6	450	455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262225766
14	NC_013451	TTG	2	6	470	475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262225766
15	NC_013451	A	6	6	492	497	100 %	0 %	0 %	0 %	262225766
16	NC_013451	AGA	2	6	554	559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262225766
17	NC_013451	GAA	2	6	576	581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262225766
18	NC_013451	GAA	2	6	586	591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262225766
19	NC_013451	A	6	6	608	613	100 %	0 %	0 %	0 %	262225766
20	NC_013451	TTAA	2	8	615	622	50 %	50 %	0 %	0 %	262225766
21	NC_013451	GACGTT	2	12	659	670	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	262225766
22	NC_013451	A	7	7	677	683	100 %	0 %	0 %	0 %	262225766
23	NC_013451	TGA	2	6	701	706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225766
24	NC_013451	TGA	2	6	770	775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225766
25	NC_013451	TA	3	6	786	791	50 %	50 %	0 %	0 %	262225766
26	NC_013451	TGAT	2	8	862	869	25 %	50 %	25 %	0 %	262225766
27	NC_013451	TA	3	6	898	903	50 %	50 %	0 %	0 %	262225766
28	NC_013451	A	6	6	940	945	100 %	0 %	0 %	0 %	262225766
29	NC_013451	TA	3	6	1003	1008	50 %	50 %	0 %	0 %	262225766
30	NC_013451	ATT	2	6	1081	1086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262225766
31	NC_013451	ATG	2	6	1150	1155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262225766
32	NC_013451	AGCA	2	8	1238	1245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013451	CG	3	6	1252	1257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013451	TTTATA	2	12	1264	1275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013451	TA	4	8	1272	1279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013451	AT	4	8	1281	1288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013451	TTA	2	6	1391	1396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013451	AGCT	2	8	1398	1405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013451	GTGA	2	8	1416	1423	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.