MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 108102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_013159	GCC	2	6	836541	836546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21002	NC_013159	CGA	2	6	836653	836658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054875
21003	NC_013159	CCG	2	6	836680	836685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054875
21004	NC_013159	TCG	2	6	836688	836693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054875
21005	NC_013159	GCC	2	6	836763	836768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054875
21006	NC_013159	CG	3	6	836770	836775	0 %	0 %	50 %	50 %	257054875
21007	NC_013159	CCCG	2	8	836988	836995	0 %	0 %	25 %	75 %	257054875
21008	NC_013159	CGAC	2	8	837003	837010	25 %	0 %	25 %	50 %	257054875
21009	NC_013159	GCA	2	6	837037	837042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054875
21010	NC_013159	CGA	2	6	837073	837078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054875
21011	NC_013159	GCC	2	6	837112	837117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054875
21012	NC_013159	CGG	2	6	837160	837165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054875
21013	NC_013159	CCA	2	6	837178	837183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054875
21014	NC_013159	AC	3	6	837344	837349	50 %	0 %	0 %	50 %	257054875
21015	NC_013159	GCA	2	6	837442	837447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054875
21016	NC_013159	AC	3	6	837520	837525	50 %	0 %	0 %	50 %	257054875
21017	NC_013159	CCG	2	6	837603	837608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21018	NC_013159	G	14	14	837627	837640	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21019	NC_013159	TGC	2	6	837675	837680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054876
21020	NC_013159	CGC	2	6	837720	837725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054876
21021	NC_013159	CCA	2	6	837764	837769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054876
21022	NC_013159	TCG	2	6	837826	837831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054876
21023	NC_013159	GTC	2	6	837888	837893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054876
21024	NC_013159	CGT	2	6	837953	837958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054876
21025	NC_013159	CCA	2	6	837962	837967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054876
21026	NC_013159	CGTG	2	8	837996	838003	0 %	25 %	50 %	25 %	257054876
21027	NC_013159	CCT	2	6	838007	838012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054876
21028	NC_013159	TCA	2	6	838052	838057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054876
21029	NC_013159	CG	3	6	838095	838100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21030	NC_013159	GTT	2	6	838135	838140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21031	NC_013159	GTG	2	6	838220	838225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21032	NC_013159	GGT	2	6	838284	838289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21033	NC_013159	TCG	2	6	838301	838306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21034	NC_013159	GAA	2	6	838371	838376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21035	NC_013159	CA	3	6	838389	838394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21036	NC_013159	AC	3	6	838413	838418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21037	NC_013159	TCG	2	6	838430	838435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21038	NC_013159	CGC	2	6	838440	838445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21039	NC_013159	GCG	2	6	838490	838495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21040	NC_013159	GCG	2	6	838505	838510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21041	NC_013159	AGT	2	6	838569	838574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21042	NC_013159	GCA	2	6	838601	838606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21043	NC_013159	AC	3	6	838617	838622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21044	NC_013159	TGCC	2	8	838626	838633	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21045	NC_013159	GCG	2	6	838675	838680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21046	NC_013159	TCA	2	6	838728	838733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054877
21047	NC_013159	CTG	2	6	838764	838769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21048	NC_013159	CGA	2	6	838786	838791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21049	NC_013159	TCG	2	6	838890	838895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21050	NC_013159	CGA	2	6	838906	838911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21051	NC_013159	GCCAC	2	10	838923	838932	20 %	0 %	20 %	60 %	257054877
21052	NC_013159	CGA	3	9	838975	838983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21053	NC_013159	GCG	2	6	839028	839033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054877
21054	NC_013159	CGGG	2	8	839061	839068	0 %	0 %	75 %	25 %	257054877
21055	NC_013159	CGG	2	6	839074	839079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054877
21056	NC_013159	CCG	2	6	839124	839129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054877
21057	NC_013159	CGT	2	6	839198	839203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21058	NC_013159	CGGCCC	2	12	839224	839235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054877
21059	NC_013159	ACC	2	6	839306	839311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054877
21060	NC_013159	ACG	2	6	839325	839330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21061	NC_013159	GCG	2	6	839351	839356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054877
21062	NC_013159	TGC	2	6	839424	839429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21063	NC_013159	CCA	2	6	839445	839450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054877
21064	NC_013159	GAG	2	6	839456	839461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054877
21065	NC_013159	TGG	2	6	839484	839489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054877
21066	NC_013159	GT	3	6	839528	839533	0 %	50 %	50 %	0 %	257054877
21067	NC_013159	TCA	2	6	839544	839549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054877
21068	NC_013159	CGC	2	6	839575	839580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054877
21069	NC_013159	CGC	2	6	839615	839620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054877
21070	NC_013159	CGG	2	6	839704	839709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054877
21071	NC_013159	GC	3	6	839743	839748	0 %	0 %	50 %	50 %	257054877
21072	NC_013159	ACG	2	6	839754	839759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21073	NC_013159	GCT	2	6	839779	839784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21074	NC_013159	AGG	2	6	839793	839798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054877
21075	NC_013159	CCG	2	6	839801	839806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054877
21076	NC_013159	CGA	2	6	839812	839817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21077	NC_013159	GTC	2	6	839840	839845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21078	NC_013159	GGT	2	6	839917	839922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054877
21079	NC_013159	TCG	2	6	839931	839936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21080	NC_013159	TGC	2	6	839994	839999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21081	NC_013159	AGA	2	6	840000	840005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054877
21082	NC_013159	TCG	2	6	840006	840011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21083	NC_013159	CAG	2	6	840041	840046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21084	NC_013159	CGC	2	6	840052	840057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054877
21085	NC_013159	CCG	2	6	840058	840063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054877
21086	NC_013159	GCC	2	6	840091	840096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054877
21087	NC_013159	GCA	2	6	840114	840119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21088	NC_013159	GC	3	6	840162	840167	0 %	0 %	50 %	50 %	257054877
21089	NC_013159	TCGGC	2	10	840168	840177	0 %	20 %	40 %	40 %	257054877
21090	NC_013159	GAA	2	6	840268	840273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054877
21091	NC_013159	GCCGAC	2	12	840368	840379	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257054877
21092	NC_013159	GCT	2	6	840403	840408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054877
21093	NC_013159	CG	3	6	840421	840426	0 %	0 %	50 %	50 %	257054877
21094	NC_013159	GCC	2	6	840453	840458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054877
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21097	NC_013159	GGT	2	6	840583	840588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054877
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21101	NC_013159	CGC	2	6	840752	840757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054877
21102	NC_013159	TCA	2	6	840765	840770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054877
21103	NC_013159	CGA	2	6	840821	840826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21104	NC_013159	CGA	2	6	840838	840843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21105	NC_013159	GCC	2	6	840891	840896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054878
21106	NC_013159	GGCG	2	8	840905	840912	0 %	0 %	75 %	25 %	257054878
21107	NC_013159	CG	3	6	840911	840916	0 %	0 %	50 %	50 %	257054878
21108	NC_013159	ACC	2	6	840936	840941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054878
21109	NC_013159	GAG	2	6	840948	840953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054878
21110	NC_013159	CG	4	8	841004	841011	0 %	0 %	50 %	50 %	257054878
21111	NC_013159	CGC	2	6	841032	841037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054878
21112	NC_013159	GTC	2	6	841091	841096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054878
21113	NC_013159	ACC	2	6	841126	841131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054878
21114	NC_013159	ACG	2	6	841153	841158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054878
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21116	NC_013159	GAC	2	6	841233	841238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054878
21117	NC_013159	TCC	2	6	841275	841280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054878
21118	NC_013159	TGC	2	6	841288	841293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054878
21119	NC_013159	TGG	2	6	841294	841299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054878
21120	NC_013159	ACG	2	6	841339	841344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054878
21121	NC_013159	TGC	2	6	841366	841371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054878
21122	NC_013159	CGCGG	2	10	841469	841478	0 %	0 %	60 %	40 %	257054878
21123	NC_013159	TCA	2	6	841483	841488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054878
21124	NC_013159	GCT	2	6	841559	841564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054878
21125	NC_013159	GTC	2	6	841608	841613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054878
21126	NC_013159	GC	3	6	841619	841624	0 %	0 %	50 %	50 %	257054878
21127	NC_013159	CGA	2	6	841630	841635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054878
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21131	NC_013159	CAA	2	6	841895	841900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054878
21132	NC_013159	CCTCGT	2	12	841901	841912	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257054878
21133	NC_013159	CTG	2	6	841947	841952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054878
21134	NC_013159	GTC	2	6	841980	841985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054878
21135	NC_013159	CCG	2	6	842003	842008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054878
21136	NC_013159	TGG	2	6	842035	842040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054878
21137	NC_013159	TCGACA	2	12	842062	842073	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257054878
21138	NC_013159	TCA	2	6	842077	842082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054878
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21144	NC_013159	CGA	3	9	842273	842281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054878
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21147	NC_013159	CGG	2	6	842401	842406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054878
21148	NC_013159	CGA	2	6	842423	842428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054878
21149	NC_013159	GTC	2	6	842447	842452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054878
21150	NC_013159	TGG	2	6	842461	842466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054878
21151	NC_013159	GAG	2	6	842487	842492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054878
21152	NC_013159	ACG	2	6	842530	842535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054878
21153	NC_013159	CGC	2	6	842540	842545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054878
21154	NC_013159	CAC	2	6	842555	842560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054878
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21156	NC_013159	GTT	2	6	842576	842581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054878
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21158	NC_013159	GTTGCC	2	12	842618	842629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054878
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21164	NC_013159	CGA	2	6	842825	842830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054878
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21168	NC_013159	GTG	2	6	843018	843023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054878
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21171	NC_013159	TGG	2	6	843070	843075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054878
21172	NC_013159	GGTC	2	8	843200	843207	0 %	25 %	50 %	25 %	257054878
21173	NC_013159	CGA	2	6	843223	843228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054878
21174	NC_013159	GTCG	2	8	843239	843246	0 %	25 %	50 %	25 %	257054878
21175	NC_013159	GCC	2	6	843285	843290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054878
21176	NC_013159	CGT	2	6	843305	843310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054878
21177	NC_013159	ACC	2	6	843442	843447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21178	NC_013159	AAT	2	6	843487	843492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21179	NC_013159	CGA	2	6	843503	843508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21180	NC_013159	CG	3	6	843542	843547	0 %	0 %	50 %	50 %	257054879
21181	NC_013159	GTG	2	6	843576	843581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054879
21182	NC_013159	G	6	6	843657	843662	0 %	0 %	100 %	0 %	257054879
21183	NC_013159	CGC	2	6	843677	843682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054879
21184	NC_013159	CCT	2	6	843692	843697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054879
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21186	NC_013159	CCGC	2	8	843762	843769	0 %	0 %	25 %	75 %	257054879
21187	NC_013159	CGA	2	6	843826	843831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054879
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21190	NC_013159	CGA	2	6	843908	843913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054879
21191	NC_013159	CTG	2	6	843924	843929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054879
21192	NC_013159	GTG	2	6	843969	843974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054879
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21194	NC_013159	TCG	3	9	844027	844035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054879
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21201	NC_013159	GCCG	2	8	844192	844199	0 %	0 %	50 %	50 %	257054880
21202	NC_013159	GCG	2	6	844204	844209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054880
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21206	NC_013159	CTG	3	9	844373	844381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054880
21207	NC_013159	CCG	2	6	844423	844428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054880
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21214	NC_013159	GGGC	2	8	844590	844597	0 %	0 %	75 %	25 %	257054880
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21218	NC_013159	GTG	2	6	844710	844715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054881
21219	NC_013159	GCC	2	6	844717	844722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054881
21220	NC_013159	CGC	2	6	844781	844786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054881
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21222	NC_013159	ACG	2	6	844817	844822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054881
21223	NC_013159	GGA	2	6	844932	844937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054881
21224	NC_013159	ACGG	2	8	844947	844954	25 %	0 %	50 %	25 %	257054881
21225	NC_013159	CGA	2	6	844956	844961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054881
21226	NC_013159	GTT	2	6	845016	845021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054881
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21228	NC_013159	GTG	3	9	845110	845118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054881
21229	NC_013159	GCGG	2	8	845196	845203	0 %	0 %	75 %	25 %	257054881
21230	NC_013159	CGC	2	6	845246	845251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054881
21231	NC_013159	TAC	2	6	845269	845274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054881
21232	NC_013159	GGC	2	6	845292	845297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054881
21233	NC_013159	GAG	2	6	845311	845316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054881
21234	NC_013159	GT	3	6	845336	845341	0 %	50 %	50 %	0 %	257054881
21235	NC_013159	CGG	2	6	845342	845347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054881
21236	NC_013159	GCT	2	6	845409	845414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054881
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21352	NC_013159	GGAC	2	8	849873	849880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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21477	NC_013159	CGT	2	6	854031	854036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054891
21478	NC_013159	GGC	2	6	854047	854052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054891
21479	NC_013159	GGC	2	6	854056	854061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054891
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21481	NC_013159	CGA	2	6	854073	854078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054891
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21484	NC_013159	GCA	2	6	854145	854150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054891
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21487	NC_013159	GCC	2	6	854470	854475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054891
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21492	NC_013159	CTC	2	6	854685	854690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21497	NC_013159	GCATCG	2	12	854855	854866	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257054892
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