MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 108102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_013159	GC	3	6	632419	632424	0 %	0 %	50 %	50 %	257054681
16002	NC_013159	CGT	2	6	632439	632444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054681
16003	NC_013159	GGT	2	6	632490	632495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054681
16004	NC_013159	ACG	2	6	632504	632509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054681
16005	NC_013159	TTC	2	6	632515	632520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054681
16006	NC_013159	CTC	2	6	632538	632543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054681
16007	NC_013159	TTC	2	6	632557	632562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054681
16008	NC_013159	CGT	2	6	632587	632592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054681
16009	NC_013159	CCG	2	6	632624	632629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054681
16010	NC_013159	ACGCG	2	10	632655	632664	20 %	0 %	40 %	40 %	257054681
16011	NC_013159	CGG	2	6	632717	632722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054681
16012	NC_013159	GGC	2	6	632733	632738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054681
16013	NC_013159	GTG	2	6	632746	632751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054681
16014	NC_013159	C	6	6	632860	632865	0 %	0 %	0 %	100 %	257054681
16015	NC_013159	CGC	2	6	632919	632924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054681
16016	NC_013159	GGGA	2	8	633026	633033	25 %	0 %	75 %	0 %	257054681
16017	NC_013159	GTGG	2	8	633109	633116	0 %	25 %	75 %	0 %	257054681
16018	NC_013159	CGC	3	9	633156	633164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054681
16019	NC_013159	GCT	2	6	633174	633179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054681
16020	NC_013159	CCA	2	6	633248	633253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054681
16021	NC_013159	ACC	2	6	633318	633323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054681
16022	NC_013159	GCCC	2	8	633334	633341	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16023	NC_013159	GTG	2	6	633356	633361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_013159	GAA	2	6	633394	633399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054682
16025	NC_013159	AGTGAC	2	12	633421	633432	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257054682
16026	NC_013159	GGT	2	6	633502	633507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054682
16027	NC_013159	GGC	2	6	633587	633592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054682
16028	NC_013159	CGG	3	9	633604	633612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054682
16029	NC_013159	CGA	2	6	633640	633645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054682
16030	NC_013159	GGAT	2	8	633650	633657	25 %	25 %	50 %	0 %	257054682
16031	NC_013159	TCGA	2	8	633695	633702	25 %	25 %	25 %	25 %	257054682
16032	NC_013159	CGGGG	2	10	633734	633743	0 %	0 %	80 %	20 %	257054682
16033	NC_013159	GACGG	2	10	633770	633779	20 %	0 %	60 %	20 %	257054682
16034	NC_013159	GCT	2	6	633796	633801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054682
16035	NC_013159	GCC	2	6	633890	633895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054682
16036	NC_013159	CTG	3	9	633935	633943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054682
16037	NC_013159	CGGG	2	8	634031	634038	0 %	0 %	75 %	25 %	257054682
16038	NC_013159	CGG	2	6	634081	634086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054682
16039	NC_013159	CGC	2	6	634120	634125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054682
16040	NC_013159	CAC	2	6	634127	634132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054682
16041	NC_013159	CGAT	2	8	634156	634163	25 %	25 %	25 %	25 %	257054682
16042	NC_013159	GGC	2	6	634192	634197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054682
16043	NC_013159	CG	3	6	634256	634261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16044	NC_013159	CGGAT	2	10	634301	634310	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16045	NC_013159	GAC	2	6	634359	634364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054683
16046	NC_013159	GCT	3	9	634383	634391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054683
16047	NC_013159	GCCC	2	8	634413	634420	0 %	0 %	25 %	75 %	257054683
16048	NC_013159	CTC	2	6	634435	634440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054683
16049	NC_013159	CGG	2	6	634452	634457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054683
16050	NC_013159	CGC	2	6	634459	634464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054683
16051	NC_013159	CGC	2	6	634577	634582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054683
16052	NC_013159	ATC	2	6	634601	634606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054683
16053	NC_013159	TCG	3	9	634620	634628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054683
16054	NC_013159	CAC	2	6	634660	634665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054683
16055	NC_013159	TGT	2	6	634713	634718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054683
16056	NC_013159	CG	3	6	634768	634773	0 %	0 %	50 %	50 %	257054683
16057	NC_013159	CT	3	6	634821	634826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16058	NC_013159	GCC	3	9	634834	634842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16059	NC_013159	TGA	2	6	634917	634922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_013159	CG	3	6	634933	634938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16061	NC_013159	GTTCC	2	10	635049	635058	0 %	40 %	20 %	40 %	257054684
16062	NC_013159	CACG	2	8	635096	635103	25 %	0 %	25 %	50 %	257054684
16063	NC_013159	CGT	2	6	635116	635121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054684
16064	NC_013159	CGGG	2	8	635212	635219	0 %	0 %	75 %	25 %	257054684
16065	NC_013159	ACG	3	9	635251	635259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054684
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16068	NC_013159	CGA	2	6	635363	635368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054684
16069	NC_013159	CCGACG	2	12	635395	635406	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257054684
16070	NC_013159	C	6	6	635442	635447	0 %	0 %	0 %	100 %	257054684
16071	NC_013159	GCT	2	6	635467	635472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054684
16072	NC_013159	GAG	2	6	635496	635501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054684
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16074	NC_013159	GCCG	2	8	635512	635519	0 %	0 %	50 %	50 %	257054684
16075	NC_013159	TCG	2	6	635581	635586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054684
16076	NC_013159	CGA	2	6	635726	635731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054684
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16080	NC_013159	GTG	2	6	635841	635846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054684
16081	NC_013159	CGGT	2	8	635850	635857	0 %	25 %	50 %	25 %	257054684
16082	NC_013159	GTC	3	9	635904	635912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054684
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16088	NC_013159	GGAC	2	8	636240	636247	25 %	0 %	50 %	25 %	257054685
16089	NC_013159	CCT	2	6	636255	636260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054685
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16092	NC_013159	ACG	2	6	636299	636304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054685
16093	NC_013159	CCGG	2	8	636353	636360	0 %	0 %	50 %	50 %	257054685
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16100	NC_013159	GCT	2	6	636645	636650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054685
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16104	NC_013159	TCG	2	6	636755	636760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054685
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16108	NC_013159	CG	3	6	636913	636918	0 %	0 %	50 %	50 %	257054685
16109	NC_013159	AGTG	2	8	636932	636939	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_013159	TGG	2	6	636958	636963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_013159	CTG	2	6	636974	636979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054686
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16115	NC_013159	TGC	2	6	637107	637112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054686
16116	NC_013159	GCCGAC	2	12	637130	637141	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257054686
16117	NC_013159	ACG	2	6	637224	637229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054686
16118	NC_013159	GTC	2	6	637280	637285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054686
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16120	NC_013159	CGG	2	6	637321	637326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054686
16121	NC_013159	CGGA	2	8	637385	637392	25 %	0 %	50 %	25 %	257054686
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16152	NC_013159	CGC	2	6	638550	638555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16230	NC_013159	ACG	2	6	641638	641643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16231	NC_013159	CTT	2	6	641666	641671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16232	NC_013159	GTCCGG	2	12	641692	641703	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16233	NC_013159	CGG	3	9	641726	641734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16234	NC_013159	CGA	2	6	641748	641753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16235	NC_013159	ACGGC	2	10	641766	641775	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16236	NC_013159	CGT	2	6	641845	641850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16237	NC_013159	CGGCCG	2	12	641870	641881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16238	NC_013159	TCG	2	6	641933	641938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16239	NC_013159	GCGG	3	12	641941	641952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16240	NC_013159	GTC	2	6	642093	642098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16241	NC_013159	CGA	2	6	642334	642339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054691
16242	NC_013159	CTA	2	6	642445	642450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054691
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16244	NC_013159	CTT	2	6	642502	642507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054691
16245	NC_013159	CGG	2	6	642526	642531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054691
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16249	NC_013159	TCG	2	6	642680	642685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054692
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16254	NC_013159	GGCG	2	8	642984	642991	0 %	0 %	75 %	25 %	257054692
16255	NC_013159	CGGCC	3	15	643026	643040	0 %	0 %	40 %	60 %	257054692
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16345	NC_013159	GGTG	2	8	646913	646920	0 %	25 %	75 %	0 %	257054696
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16356	NC_013159	GAAG	2	8	647217	647224	50 %	0 %	50 %	0 %	257054696
16357	NC_013159	GGA	2	6	647238	647243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054696
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16479	NC_013159	CGC	2	6	651530	651535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054703
16480	NC_013159	CGT	2	6	651634	651639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054703
16481	NC_013159	G	6	6	651644	651649	0 %	0 %	100 %	0 %	257054703
16482	NC_013159	TCGT	2	8	651669	651676	0 %	50 %	25 %	25 %	257054703
16483	NC_013159	TCC	2	6	651711	651716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16484	NC_013159	GTC	2	6	651720	651725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16485	NC_013159	GCG	2	6	651751	651756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16486	NC_013159	CTC	2	6	651810	651815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16487	NC_013159	ACG	2	6	651832	651837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16488	NC_013159	GC	3	6	651863	651868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16489	NC_013159	GGAG	2	8	651879	651886	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16490	NC_013159	GGC	2	6	651895	651900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054704
16491	NC_013159	CCGGA	2	10	651910	651919	20 %	0 %	40 %	40 %	257054704
16492	NC_013159	AGG	2	6	651942	651947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054704
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16494	NC_013159	TCG	3	9	651993	652001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054704
16495	NC_013159	GGA	2	6	652012	652017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054704
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16497	NC_013159	CCA	2	6	652050	652055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054704
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16499	NC_013159	GGCCT	2	10	652101	652110	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16500	NC_013159	GC	3	6	652137	652142	0 %	0 %	50 %	50 %	257054705

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