MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 108102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_013159	CGT	2	6	594721	594726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054647
15003	NC_013159	CTC	2	6	594803	594808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054647
15004	NC_013159	GGTC	2	8	594823	594830	0 %	25 %	50 %	25 %	257054647
15005	NC_013159	GAA	2	6	594881	594886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054647
15006	NC_013159	GGT	2	6	594893	594898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054647
15007	NC_013159	GTC	2	6	594899	594904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054647
15008	NC_013159	GAC	3	9	594980	594988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054647
15009	NC_013159	TGG	2	6	594994	594999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054647
15010	NC_013159	TCG	2	6	595047	595052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054647
15011	NC_013159	TCG	2	6	595074	595079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054647
15012	NC_013159	ACG	2	6	595089	595094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054647
15013	NC_013159	CCA	2	6	595135	595140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054647
15014	NC_013159	TCC	2	6	595218	595223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054647
15015	NC_013159	CGA	2	6	595258	595263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054647
15016	NC_013159	CGGTC	2	10	595309	595318	0 %	20 %	40 %	40 %	257054648
15017	NC_013159	TGC	2	6	595322	595327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054648
15018	NC_013159	CT	3	6	595329	595334	0 %	50 %	0 %	50 %	257054648
15019	NC_013159	CCT	2	6	595374	595379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054648
15020	NC_013159	GGC	2	6	595384	595389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054648
15021	NC_013159	CGT	2	6	595393	595398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054648
15022	NC_013159	AAC	2	6	595409	595414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054648
15023	NC_013159	CGG	2	6	595422	595427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054648
15024	NC_013159	CGG	2	6	595437	595442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054648
15025	NC_013159	GTC	2	6	595465	595470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054648
15026	NC_013159	GGC	2	6	595507	595512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054648
15027	NC_013159	CG	3	6	595556	595561	0 %	0 %	50 %	50 %	257054648
15028	NC_013159	CGG	2	6	595571	595576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054648
15029	NC_013159	GCC	2	6	595621	595626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054648
15030	NC_013159	TGA	2	6	595650	595655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054648
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15032	NC_013159	GGCC	2	8	595679	595686	0 %	0 %	50 %	50 %	257054648
15033	NC_013159	TCG	2	6	595709	595714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054648
15034	NC_013159	GTC	2	6	595741	595746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054648
15035	NC_013159	CTG	2	6	595774	595779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054648
15036	NC_013159	CGT	2	6	595872	595877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054648
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15039	NC_013159	CCA	2	6	595947	595952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054648
15040	NC_013159	TCC	2	6	596009	596014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054648
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15042	NC_013159	CTG	2	6	596071	596076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054648
15043	NC_013159	ATGGG	2	10	596102	596111	20 %	20 %	60 %	0 %	257054648
15044	NC_013159	TGC	2	6	596144	596149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054648
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15052	NC_013159	GTC	2	6	596401	596406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054648
15053	NC_013159	TTC	2	6	596428	596433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054648
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15055	NC_013159	G	6	6	596523	596528	0 %	0 %	100 %	0 %	257054648
15056	NC_013159	GAGC	2	8	596550	596557	25 %	0 %	50 %	25 %	257054648
15057	NC_013159	CAG	3	9	596587	596595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054648
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15061	NC_013159	CGG	2	6	596870	596875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054649
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15073	NC_013159	GCA	3	9	597318	597326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054650
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15088	NC_013159	GAC	2	6	597874	597879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054651
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15091	NC_013159	CCCG	2	8	597968	597975	0 %	0 %	25 %	75 %	257054651
15092	NC_013159	CCG	2	6	598028	598033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054651
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15100	NC_013159	TGC	2	6	598251	598256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054651
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15103	NC_013159	GCC	2	6	598321	598326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054651
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15119	NC_013159	GCC	2	6	599288	599293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054651
15120	NC_013159	ACC	2	6	599299	599304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054651
15121	NC_013159	CCT	2	6	599478	599483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15122	NC_013159	GCT	2	6	599489	599494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15124	NC_013159	CCG	2	6	599532	599537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15125	NC_013159	CGGG	2	8	599578	599585	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15126	NC_013159	GCGAG	2	10	599631	599640	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15127	NC_013159	AGG	2	6	599653	599658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15147	NC_013159	CGGCT	2	10	600216	600225	0 %	20 %	40 %	40 %	257054652
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15175	NC_013159	CGT	2	6	601245	601250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054654
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15179	NC_013159	ACCG	2	8	601344	601351	25 %	0 %	25 %	50 %	257054654
15180	NC_013159	TCGG	2	8	601354	601361	0 %	25 %	50 %	25 %	257054654
15181	NC_013159	CGAA	2	8	601398	601405	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15182	NC_013159	CTT	2	6	601432	601437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054655
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15188	NC_013159	CGT	2	6	601746	601751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054655
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15194	NC_013159	CGT	2	6	602088	602093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054655
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15211	NC_013159	GAT	2	6	602623	602628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054655
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15220	NC_013159	TGC	2	6	602909	602914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054655
15221	NC_013159	GCGG	2	8	602926	602933	0 %	0 %	75 %	25 %	257054655
15222	NC_013159	GTG	2	6	602990	602995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054655
15223	NC_013159	GTC	2	6	603131	603136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15226	NC_013159	GCT	2	6	603201	603206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054656
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15229	NC_013159	CG	3	6	603280	603285	0 %	0 %	50 %	50 %	257054656
15230	NC_013159	GAG	2	6	603322	603327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054656
15231	NC_013159	CGG	2	6	603371	603376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054656
15232	NC_013159	GTT	2	6	603399	603404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054656
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15234	NC_013159	TCGC	2	8	603439	603446	0 %	25 %	25 %	50 %	257054656
15235	NC_013159	TGG	2	6	603449	603454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054656
15236	NC_013159	GGC	2	6	603477	603482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054656
15237	NC_013159	GCCGG	2	10	603529	603538	0 %	0 %	60 %	40 %	257054656
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15239	NC_013159	GCCCGG	2	12	603644	603655	0 %	0 %	50 %	50 %	257054656
15240	NC_013159	CTCG	2	8	603672	603679	0 %	25 %	25 %	50 %	257054656
15241	NC_013159	GAC	2	6	603696	603701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054656
15242	NC_013159	CGT	2	6	603722	603727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054656
15243	NC_013159	GGC	2	6	603761	603766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054656
15244	NC_013159	GC	3	6	603769	603774	0 %	0 %	50 %	50 %	257054656
15245	NC_013159	GTC	2	6	603883	603888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054656
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15345	NC_013159	GC	3	6	607666	607671	0 %	0 %	50 %	50 %	257054661
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15359	NC_013159	GGA	2	6	608285	608290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054661
15360	NC_013159	GT	3	6	608329	608334	0 %	50 %	50 %	0 %	257054661
15361	NC_013159	CGC	2	6	608336	608341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054661
15362	NC_013159	CGCGG	2	10	608359	608368	0 %	0 %	60 %	40 %	257054661
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15364	NC_013159	CGG	2	6	608500	608505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054661
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15367	NC_013159	GAG	2	6	608663	608668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054662
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15369	NC_013159	TGC	2	6	608817	608822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054662
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15371	NC_013159	CGGC	2	8	608886	608893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15372	NC_013159	CCG	2	6	608907	608912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15373	NC_013159	TGG	2	6	608992	608997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054663
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15394	NC_013159	GC	3	6	609752	609757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15395	NC_013159	GAT	2	6	609797	609802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054664
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15397	NC_013159	GTC	2	6	609860	609865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054664
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15446	NC_013159	CGGG	2	8	611764	611771	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15447	NC_013159	CGT	2	6	611817	611822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054666
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15471	NC_013159	CGCC	2	8	612873	612880	0 %	0 %	25 %	75 %	257054667
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15477	NC_013159	CGCC	2	8	613077	613084	0 %	0 %	25 %	75 %	257054667
15478	NC_013159	CCT	2	6	613095	613100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054667
15479	NC_013159	CCG	2	6	613104	613109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054667
15480	NC_013159	CCG	2	6	613119	613124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054667
15481	NC_013159	CGG	2	6	613182	613187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054667
15482	NC_013159	CGG	2	6	613203	613208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054667
15483	NC_013159	TCG	2	6	613241	613246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054667
15484	NC_013159	CGT	2	6	613284	613289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054667
15485	NC_013159	CGT	2	6	613302	613307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054667
15486	NC_013159	CCG	2	6	613310	613315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054667
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15488	NC_013159	CGT	2	6	613329	613334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054667
15489	NC_013159	CGT	2	6	613407	613412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054667
15490	NC_013159	CGG	2	6	613501	613506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054667
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15492	NC_013159	CGG	2	6	613534	613539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054667
15493	NC_013159	GTC	2	6	613554	613559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054667
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15498	NC_013159	GTC	2	6	613751	613756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054667
15499	NC_013159	TGC	2	6	613763	613768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054667
15500	NC_013159	GTGG	2	8	613771	613778	0 %	25 %	75 %	0 %	257054667

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