MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 108102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_013159	TGA	2	6	553344	553349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054615
14002	NC_013159	CGC	2	6	553375	553380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054615
14003	NC_013159	GTG	2	6	553420	553425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054615
14004	NC_013159	CGA	2	6	553462	553467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054615
14005	NC_013159	CAT	2	6	553477	553482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054615
14006	NC_013159	CAA	2	6	553483	553488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054615
14007	NC_013159	CAT	2	6	553489	553494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054615
14008	NC_013159	CCG	4	12	553533	553544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14009	NC_013159	GCGTGC	2	12	553545	553556	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_013159	C	7	7	553614	553620	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14011	NC_013159	TCG	2	6	553652	553657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_013159	CGC	2	6	553696	553701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14013	NC_013159	AGCG	2	8	553707	553714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14014	NC_013159	GGC	2	6	553720	553725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_013159	CGG	2	6	553747	553752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_013159	CGA	2	6	553799	553804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054616
14017	NC_013159	CTG	2	6	553818	553823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054616
14018	NC_013159	CGG	2	6	553836	553841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054616
14019	NC_013159	GCA	2	6	553871	553876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054616
14020	NC_013159	CCAG	2	8	553886	553893	25 %	0 %	25 %	50 %	257054616
14021	NC_013159	TCG	2	6	553930	553935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054616
14022	NC_013159	CGTC	2	8	553955	553962	0 %	25 %	25 %	50 %	257054616
14023	NC_013159	TGGG	2	8	553987	553994	0 %	25 %	75 %	0 %	257054616
14024	NC_013159	GTC	3	9	554022	554030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054616
14025	NC_013159	CGCC	2	8	554081	554088	0 %	0 %	25 %	75 %	257054616
14026	NC_013159	GGC	3	9	554091	554099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054616
14027	NC_013159	CCG	2	6	554152	554157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054616
14028	NC_013159	GTC	3	9	554232	554240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054616
14029	NC_013159	GTA	2	6	554259	554264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054616
14030	NC_013159	CG	3	6	554267	554272	0 %	0 %	50 %	50 %	257054616
14031	NC_013159	GCA	2	6	554276	554281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054616
14032	NC_013159	TCG	3	9	554329	554337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054616
14033	NC_013159	GTC	3	9	554340	554348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054616
14034	NC_013159	TCG	3	9	554368	554376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054616
14035	NC_013159	GTC	2	6	554379	554384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054616
14036	NC_013159	GTC	3	9	554403	554411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054616
14037	NC_013159	CTC	2	6	554445	554450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054616
14038	NC_013159	CGC	2	6	554457	554462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054616
14039	NC_013159	CTC	2	6	554466	554471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054616
14040	NC_013159	GGT	2	6	554472	554477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054616
14041	NC_013159	TCG	2	6	554479	554484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054616
14042	NC_013159	GGCG	2	8	554585	554592	0 %	0 %	75 %	25 %	257054616
14043	NC_013159	GCGA	2	8	554692	554699	25 %	0 %	50 %	25 %	257054616
14044	NC_013159	CCA	2	6	554759	554764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054616
14045	NC_013159	GTC	3	9	554796	554804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054616
14046	NC_013159	GGGC	2	8	554828	554835	0 %	0 %	75 %	25 %	257054616
14047	NC_013159	GGT	2	6	554852	554857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054616
14048	NC_013159	CGC	2	6	554892	554897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054616
14049	NC_013159	TCC	2	6	554929	554934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054616
14050	NC_013159	CTC	2	6	554958	554963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054616
14051	NC_013159	GTG	2	6	554981	554986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054616
14052	NC_013159	GAT	2	6	555033	555038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054616
14053	NC_013159	ACC	2	6	555065	555070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14054	NC_013159	ACA	2	6	555168	555173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14055	NC_013159	TGAC	2	8	555198	555205	25 %	25 %	25 %	25 %	257054617
14056	NC_013159	GTGA	2	8	555272	555279	25 %	25 %	50 %	0 %	257054617
14057	NC_013159	AGG	2	6	555306	555311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054617
14058	NC_013159	GC	3	6	555393	555398	0 %	0 %	50 %	50 %	257054617
14059	NC_013159	CGC	2	6	555403	555408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054617
14060	NC_013159	TTC	2	6	555470	555475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054617
14061	NC_013159	TCG	2	6	555480	555485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14062	NC_013159	ATC	2	6	555551	555556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054617
14063	NC_013159	TGC	2	6	555557	555562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14064	NC_013159	CGA	2	6	555616	555621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14065	NC_013159	GGT	2	6	555631	555636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054617
14066	NC_013159	CGA	2	6	555640	555645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14067	NC_013159	TTC	2	6	555755	555760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054617
14068	NC_013159	CCGGA	2	10	555778	555787	20 %	0 %	40 %	40 %	257054617
14069	NC_013159	AC	3	6	555790	555795	50 %	0 %	0 %	50 %	257054617
14070	NC_013159	GTG	2	6	555800	555805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054617
14071	NC_013159	CTG	2	6	555878	555883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14072	NC_013159	GCC	2	6	555926	555931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054617
14073	NC_013159	TGA	2	6	555954	555959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054617
14074	NC_013159	CGGCA	2	10	556061	556070	20 %	0 %	40 %	40 %	257054617
14075	NC_013159	CAC	2	6	556079	556084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054617
14076	NC_013159	AGC	2	6	556119	556124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14077	NC_013159	GTG	2	6	556202	556207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054617
14078	NC_013159	GTC	2	6	556210	556215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14079	NC_013159	CCA	2	6	556267	556272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054617
14080	NC_013159	GCCG	2	8	556277	556284	0 %	0 %	50 %	50 %	257054617
14081	NC_013159	CG	3	6	556283	556288	0 %	0 %	50 %	50 %	257054617
14082	NC_013159	GGCCG	2	10	556289	556298	0 %	0 %	60 %	40 %	257054617
14083	NC_013159	GAC	2	6	556379	556384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14084	NC_013159	GAA	3	9	556387	556395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054617
14085	NC_013159	AAG	2	6	556412	556417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054617
14086	NC_013159	TCG	2	6	556464	556469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14087	NC_013159	CCG	2	6	556470	556475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054617
14088	NC_013159	TGC	2	6	556518	556523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14089	NC_013159	GCG	2	6	556564	556569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054617
14090	NC_013159	GGA	2	6	556576	556581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054617
14091	NC_013159	GACC	2	8	556592	556599	25 %	0 %	25 %	50 %	257054617
14092	NC_013159	TCC	2	6	556617	556622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054617
14093	NC_013159	GCCATC	2	12	556625	556636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257054617
14094	NC_013159	CG	3	6	556640	556645	0 %	0 %	50 %	50 %	257054617
14095	NC_013159	GCC	2	6	556652	556657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054617
14096	NC_013159	GAG	2	6	556667	556672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054617
14097	NC_013159	GAG	2	6	556688	556693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054617
14098	NC_013159	CGT	2	6	556697	556702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14099	NC_013159	AACC	2	8	556742	556749	50 %	0 %	0 %	50 %	257054617
14100	NC_013159	CGT	2	6	556800	556805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14101	NC_013159	GGA	2	6	556843	556848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054617
14102	NC_013159	CAG	2	6	556871	556876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14103	NC_013159	AGC	2	6	556932	556937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14104	NC_013159	CTG	2	6	556946	556951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14105	NC_013159	GGA	2	6	556978	556983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054617
14106	NC_013159	GGC	2	6	556993	556998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054617
14107	NC_013159	GTGG	2	8	557026	557033	0 %	25 %	75 %	0 %	257054617
14108	NC_013159	CGT	2	6	557059	557064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14109	NC_013159	TCG	2	6	557094	557099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14110	NC_013159	CG	3	6	557122	557127	0 %	0 %	50 %	50 %	257054617
14111	NC_013159	TGC	3	9	557139	557147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14112	NC_013159	ACG	2	6	557166	557171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14113	NC_013159	GCG	2	6	557176	557181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054617
14114	NC_013159	CGA	2	6	557191	557196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14115	NC_013159	CGA	2	6	557299	557304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14116	NC_013159	CGA	2	6	557314	557319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054617
14117	NC_013159	GCC	3	9	557347	557355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054617
14118	NC_013159	AACG	2	8	557366	557373	50 %	0 %	25 %	25 %	257054617
14119	NC_013159	CGC	2	6	557422	557427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054617
14120	NC_013159	GGA	2	6	557431	557436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054617
14121	NC_013159	CGGC	2	8	557449	557456	0 %	0 %	50 %	50 %	257054617
14122	NC_013159	GGA	2	6	557491	557496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054617
14123	NC_013159	ACT	2	6	557508	557513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054617
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14127	NC_013159	CGC	2	6	557665	557670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054617
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14132	NC_013159	GGTCG	2	10	558006	558015	0 %	20 %	60 %	20 %	257054618
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14134	NC_013159	CGC	2	6	558089	558094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054618
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14141	NC_013159	CACC	2	8	558248	558255	25 %	0 %	0 %	75 %	257054618
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14151	NC_013159	CCG	2	6	558873	558878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054619
14152	NC_013159	GTT	2	6	558895	558900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054619
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14175	NC_013159	CGCT	2	8	559834	559841	0 %	25 %	25 %	50 %	257054619
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14179	NC_013159	CGA	2	6	560034	560039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054619
14180	NC_013159	CAC	2	6	560043	560048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054619
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14182	NC_013159	CG	3	6	560088	560093	0 %	0 %	50 %	50 %	257054619
14183	NC_013159	GCG	2	6	560181	560186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054620
14184	NC_013159	GGA	2	6	560189	560194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054620
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14194	NC_013159	GCCA	2	8	560461	560468	25 %	0 %	25 %	50 %	257054620
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14198	NC_013159	CGGC	2	8	560587	560594	0 %	0 %	50 %	50 %	257054620
14199	NC_013159	CGGC	2	8	560689	560696	0 %	0 %	50 %	50 %	257054620
14200	NC_013159	TGGCGA	2	12	560717	560728	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257054620
14201	NC_013159	GGT	2	6	560733	560738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054620
14202	NC_013159	CGA	2	6	560762	560767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054620
14203	NC_013159	G	6	6	560798	560803	0 %	0 %	100 %	0 %	257054620
14204	NC_013159	GGT	2	6	560810	560815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054620
14205	NC_013159	TGC	2	6	560945	560950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054620
14206	NC_013159	TCG	2	6	561034	561039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054620
14207	NC_013159	CGGC	2	8	561059	561066	0 %	0 %	50 %	50 %	257054620
14208	NC_013159	CCGA	2	8	561111	561118	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14209	NC_013159	TGC	2	6	561159	561164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054621
14210	NC_013159	GTC	2	6	561316	561321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054621
14211	NC_013159	CCACC	2	10	561411	561420	20 %	0 %	0 %	80 %	257054621
14212	NC_013159	GCT	2	6	561433	561438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054621
14213	NC_013159	CGAC	2	8	561492	561499	25 %	0 %	25 %	50 %	257054621
14214	NC_013159	GCC	2	6	561517	561522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054621
14215	NC_013159	GC	3	6	561743	561748	0 %	0 %	50 %	50 %	257054621
14216	NC_013159	GAGGG	2	10	561765	561774	20 %	0 %	80 %	0 %	257054621
14217	NC_013159	CCG	2	6	561799	561804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14218	NC_013159	CAC	2	6	561823	561828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14219	NC_013159	GCACG	2	10	561902	561911	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14220	NC_013159	GGT	2	6	561915	561920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14221	NC_013159	TCG	2	6	561965	561970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14222	NC_013159	CGT	2	6	561990	561995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14223	NC_013159	GGA	2	6	562016	562021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14224	NC_013159	GT	4	8	562145	562152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14225	NC_013159	CGAT	2	8	562156	562163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14226	NC_013159	TTG	2	6	562183	562188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14227	NC_013159	CGT	2	6	562253	562258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14228	NC_013159	TCG	3	9	562315	562323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054622
14229	NC_013159	GCG	2	6	562380	562385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054622
14230	NC_013159	GAC	2	6	562451	562456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054622
14231	NC_013159	GC	3	6	562479	562484	0 %	0 %	50 %	50 %	257054622
14232	NC_013159	CCG	2	6	562509	562514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054622
14233	NC_013159	CA	3	6	562561	562566	50 %	0 %	0 %	50 %	257054622
14234	NC_013159	GAG	2	6	562614	562619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054622
14235	NC_013159	GTC	2	6	562669	562674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054622
14236	NC_013159	GGTGCT	2	12	562676	562687	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	257054622
14237	NC_013159	GCT	2	6	562733	562738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054622
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14239	NC_013159	GA	3	6	562800	562805	50 %	0 %	50 %	0 %	257054622
14240	NC_013159	GTG	2	6	562833	562838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054622
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14272	NC_013159	GT	3	6	564139	564144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14434	NC_013159	GTTC	2	8	572288	572295	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14484	NC_013159	GTG	2	6	574173	574178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14485	NC_013159	CGG	2	6	574377	574382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14486	NC_013159	CG	3	6	574435	574440	0 %	0 %	50 %	50 %	257054629
14487	NC_013159	TCCGC	2	10	574466	574475	0 %	20 %	20 %	60 %	257054629
14488	NC_013159	CGC	2	6	574533	574538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054629
14489	NC_013159	CG	3	6	574581	574586	0 %	0 %	50 %	50 %	257054629
14490	NC_013159	CCA	2	6	574619	574624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054629
14491	NC_013159	GCA	2	6	574643	574648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054629
14492	NC_013159	CGG	2	6	574658	574663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054629
14493	NC_013159	AAG	2	6	574712	574717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054629
14494	NC_013159	CGCA	2	8	574737	574744	25 %	0 %	25 %	50 %	257054629
14495	NC_013159	CGA	2	6	574763	574768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054629
14496	NC_013159	CGA	2	6	574772	574777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054629
14497	NC_013159	GGT	2	6	574817	574822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054629
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14499	NC_013159	CCGC	2	8	574867	574874	0 %	0 %	25 %	75 %	257054629
14500	NC_013159	CGG	3	9	574910	574918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054629

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