MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 108102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_013159	ATG	2	6	514072	514077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054585
13003	NC_013159	GCA	2	6	514092	514097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054585
13004	NC_013159	CAG	2	6	514101	514106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054585
13005	NC_013159	GA	3	6	514122	514127	50 %	0 %	50 %	0 %	257054585
13006	NC_013159	GAA	2	6	514173	514178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054585
13007	NC_013159	GAAAA	2	10	514229	514238	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_013159	CTCGG	2	10	514250	514259	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13009	NC_013159	GCT	2	6	514370	514375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13012	NC_013159	AGT	2	6	514499	514504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13014	NC_013159	ATG	2	6	514572	514577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_013159	CGG	3	9	514579	514587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13017	NC_013159	TGT	2	6	514693	514698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_013159	CTG	3	9	514795	514803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_013159	TGC	2	6	514840	514845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_013159	AGT	2	6	514907	514912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_013159	GAT	2	6	515020	515025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_013159	GCA	2	6	515067	515072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_013159	TCG	2	6	515142	515147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13025	NC_013159	TCGT	2	8	515294	515301	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13069	NC_013159	GTTG	2	8	517094	517101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13074	NC_013159	GCAG	2	8	517220	517227	25 %	0 %	50 %	25 %	257054590
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13105	NC_013159	GCACG	2	10	518565	518574	20 %	0 %	40 %	40 %	257054590
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13123	NC_013159	CGC	2	6	519612	519617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054590
13124	NC_013159	GAT	2	6	519648	519653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054590
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13126	NC_013159	CGA	2	6	519705	519710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054590
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13129	NC_013159	GCG	2	6	519972	519977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054590
13130	NC_013159	GCT	2	6	520029	520034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054590
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13132	NC_013159	GAC	2	6	520132	520137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054590
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13153	NC_013159	CGT	2	6	520928	520933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054591
13154	NC_013159	GC	3	6	520979	520984	0 %	0 %	50 %	50 %	257054591
13155	NC_013159	CGC	2	6	521009	521014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054591
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13162	NC_013159	CGA	2	6	521294	521299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054591
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13238	NC_013159	GC	3	6	523883	523888	0 %	0 %	50 %	50 %	257054591
13239	NC_013159	AC	3	6	523951	523956	50 %	0 %	0 %	50 %	257054591
13240	NC_013159	CACC	2	8	523964	523971	25 %	0 %	0 %	75 %	257054591
13241	NC_013159	GCC	2	6	524037	524042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054591
13242	NC_013159	CGC	2	6	524105	524110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054591
13243	NC_013159	GGC	2	6	524117	524122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054591
13244	NC_013159	GTC	2	6	524171	524176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054591
13245	NC_013159	GCAG	2	8	524190	524197	25 %	0 %	50 %	25 %	257054591
13246	NC_013159	GCT	2	6	524228	524233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054591
13247	NC_013159	CGA	2	6	524234	524239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054591
13248	NC_013159	CGC	3	9	524249	524257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054591
13249	NC_013159	TCGC	2	8	524277	524284	0 %	25 %	25 %	50 %	257054591
13250	NC_013159	AAC	2	6	524296	524301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054591
13251	NC_013159	TCCAA	2	10	524302	524311	40 %	20 %	0 %	40 %	257054591
13252	NC_013159	CCG	2	6	524347	524352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054591
13253	NC_013159	CACGGA	2	12	524384	524395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054591
13254	NC_013159	GCC	2	6	524415	524420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054591
13255	NC_013159	GCC	2	6	524467	524472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054591
13256	NC_013159	CGC	2	6	524514	524519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054591
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13258	NC_013159	GCT	2	6	524555	524560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054591
13259	NC_013159	GCGT	2	8	524566	524573	0 %	25 %	50 %	25 %	257054591
13260	NC_013159	CGGAG	2	10	524606	524615	20 %	0 %	60 %	20 %	257054591
13261	NC_013159	TCG	2	6	524703	524708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054592
13262	NC_013159	CGG	2	6	524735	524740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054592
13263	NC_013159	CTG	2	6	524741	524746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054592
13264	NC_013159	ACG	2	6	524792	524797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054592
13265	NC_013159	ACC	2	6	524868	524873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054592
13266	NC_013159	GCT	2	6	524902	524907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054592
13267	NC_013159	GTC	2	6	524909	524914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054592
13268	NC_013159	ACC	2	6	524915	524920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054592
13269	NC_013159	CGA	2	6	524929	524934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054592
13270	NC_013159	ATC	2	6	525002	525007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054592
13271	NC_013159	CCG	2	6	525090	525095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054592
13272	NC_013159	CGC	2	6	525172	525177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054592
13273	NC_013159	CCA	2	6	525237	525242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054592
13274	NC_013159	GGAC	2	8	525274	525281	25 %	0 %	50 %	25 %	257054592
13275	NC_013159	CGC	2	6	525313	525318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054592
13276	NC_013159	ACT	2	6	525322	525327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054592
13277	NC_013159	GCC	2	6	525338	525343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054592
13278	NC_013159	GC	3	6	525349	525354	0 %	0 %	50 %	50 %	257054592
13279	NC_013159	ATGCC	2	10	525360	525369	20 %	20 %	20 %	40 %	257054592
13280	NC_013159	CCG	3	9	525387	525395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054592
13281	NC_013159	CGG	2	6	525417	525422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054592
13282	NC_013159	TGG	2	6	525433	525438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054592
13283	NC_013159	GGA	2	6	525586	525591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054592
13284	NC_013159	CAC	2	6	525613	525618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054592
13285	NC_013159	CGC	2	6	525691	525696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054592
13286	NC_013159	GC	3	6	525748	525753	0 %	0 %	50 %	50 %	257054592
13287	NC_013159	CCA	2	6	525754	525759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054592
13288	NC_013159	CG	3	6	525902	525907	0 %	0 %	50 %	50 %	257054592
13289	NC_013159	CCG	2	6	525933	525938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054592
13290	NC_013159	GTG	2	6	525968	525973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054592
13291	NC_013159	GCG	2	6	525991	525996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054592
13292	NC_013159	CGA	2	6	526006	526011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054592
13293	NC_013159	CGA	2	6	526057	526062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054592
13294	NC_013159	CGG	2	6	526066	526071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054592
13295	NC_013159	GGC	2	6	526105	526110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054592
13296	NC_013159	C	6	6	526110	526115	0 %	0 %	0 %	100 %	257054592
13297	NC_013159	GTG	2	6	526142	526147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054592
13298	NC_013159	GCCGTC	2	12	526166	526177	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257054592
13299	NC_013159	CGTG	2	8	526202	526209	0 %	25 %	50 %	25 %	257054592
13300	NC_013159	GGA	2	6	526225	526230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054592
13301	NC_013159	CGC	2	6	526240	526245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054592
13302	NC_013159	CAC	2	6	526306	526311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054592
13303	NC_013159	CGC	2	6	526342	526347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054592
13304	NC_013159	CGG	2	6	526408	526413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054592
13305	NC_013159	GTCG	2	8	526465	526472	0 %	25 %	50 %	25 %	257054592
13306	NC_013159	GGT	2	6	526480	526485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054592
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13308	NC_013159	ACCT	2	8	526559	526566	25 %	25 %	0 %	50 %	257054592
13309	NC_013159	CGC	2	6	526582	526587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054592
13310	NC_013159	GCC	2	6	526599	526604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054592
13311	NC_013159	GTC	2	6	526766	526771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054592
13312	NC_013159	GGA	2	6	526780	526785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054592
13313	NC_013159	CGG	2	6	526819	526824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054592
13314	NC_013159	GCG	2	6	526826	526831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054592
13315	NC_013159	CGGTGC	2	12	526845	526856	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257054592
13316	NC_013159	GCT	2	6	526900	526905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054592
13317	NC_013159	GTG	2	6	526927	526932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054592
13318	NC_013159	CTCCGG	2	12	526959	526970	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257054592
13319	NC_013159	CGAA	2	8	526972	526979	50 %	0 %	25 %	25 %	257054592
13320	NC_013159	GGC	2	6	526999	527004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054592
13321	NC_013159	CGA	2	6	527017	527022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054592
13322	NC_013159	CGG	2	6	527049	527054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054592
13323	NC_013159	AAG	2	6	527135	527140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054592
13324	NC_013159	CGC	2	6	527146	527151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054592
13325	NC_013159	TCG	2	6	527166	527171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054592
13326	NC_013159	TTC	2	6	527237	527242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054592
13327	NC_013159	CGG	2	6	527299	527304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054592
13328	NC_013159	GGT	2	6	527385	527390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13329	NC_013159	GC	3	6	527415	527420	0 %	0 %	50 %	50 %	257054593
13330	NC_013159	GTGAT	2	10	527425	527434	20 %	40 %	40 %	0 %	257054593
13331	NC_013159	CAC	2	6	527504	527509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054593
13332	NC_013159	GAC	3	9	527517	527525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054593
13333	NC_013159	GAG	2	6	527542	527547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054593
13334	NC_013159	GCG	2	6	527569	527574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054593
13335	NC_013159	TTC	2	6	527595	527600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054593
13336	NC_013159	CCGAAA	2	12	527662	527673	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	257054593
13337	NC_013159	CAC	2	6	527723	527728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054593
13338	NC_013159	CCAC	2	8	527731	527738	25 %	0 %	0 %	75 %	257054593
13339	NC_013159	CGT	2	6	527759	527764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054593
13340	NC_013159	GAA	2	6	527787	527792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054593
13341	NC_013159	GGA	2	6	527819	527824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054593
13342	NC_013159	CGA	2	6	527825	527830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054593
13343	NC_013159	CCG	2	6	527842	527847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054593
13344	NC_013159	GCAC	2	8	527886	527893	25 %	0 %	25 %	50 %	257054593
13345	NC_013159	CGC	2	6	527906	527911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054593
13346	NC_013159	CGA	3	9	527942	527950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054593
13347	NC_013159	CCA	2	6	527953	527958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054593
13348	NC_013159	CCG	2	6	527959	527964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054593
13349	NC_013159	GGC	2	6	528002	528007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054593
13350	NC_013159	CCGC	2	8	528010	528017	0 %	0 %	25 %	75 %	257054593
13351	NC_013159	CCG	2	6	528022	528027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054593
13352	NC_013159	TCC	2	6	528067	528072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054593
13353	NC_013159	CGA	2	6	528128	528133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054593
13354	NC_013159	GCCG	2	8	528216	528223	0 %	0 %	50 %	50 %	257054593
13355	NC_013159	TTC	2	6	528264	528269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054593
13356	NC_013159	ACA	2	6	528275	528280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054593
13357	NC_013159	CAC	2	6	528298	528303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054593
13358	NC_013159	CG	3	6	528357	528362	0 %	0 %	50 %	50 %	257054593
13359	NC_013159	TCGACC	2	12	528385	528396	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257054593
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13480	NC_013159	CCG	2	6	533836	533841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054598
13481	NC_013159	GTG	2	6	533859	533864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054598
13482	NC_013159	CGG	2	6	533891	533896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054598
13483	NC_013159	CTGGC	2	10	533952	533961	0 %	20 %	40 %	40 %	257054598
13484	NC_013159	CAG	2	6	533984	533989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054598
13485	NC_013159	CGA	2	6	533999	534004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054598
13486	NC_013159	ACG	2	6	534007	534012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054598
13487	NC_013159	CGGC	2	8	534031	534038	0 %	0 %	50 %	50 %	257054598
13488	NC_013159	ACC	2	6	534042	534047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054598
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13490	NC_013159	GGT	2	6	534143	534148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054598
13491	NC_013159	TGG	2	6	534153	534158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054598
13492	NC_013159	GTG	2	6	534207	534212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054598
13493	NC_013159	ACG	2	6	534217	534222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054598
13494	NC_013159	GTC	2	6	534300	534305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054598
13495	NC_013159	ACG	2	6	534376	534381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054598
13496	NC_013159	GTG	2	6	534466	534471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13497	NC_013159	TCG	2	6	534482	534487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13498	NC_013159	GCG	2	6	534595	534600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13500	NC_013159	GCT	2	6	534741	534746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054599

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