MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 108102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013159	CTC	2	6	495319	495324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12502	NC_013159	GAG	2	6	495342	495347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_013159	CCCG	2	8	495348	495355	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12504	NC_013159	GTC	2	6	495357	495362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_013159	G	6	6	495385	495390	0 %	0 %	100 %	0 %	257054568
12506	NC_013159	AGC	2	6	495428	495433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12507	NC_013159	TCGA	2	8	495437	495444	25 %	25 %	25 %	25 %	257054568
12508	NC_013159	GCA	2	6	495450	495455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12509	NC_013159	CAC	2	6	495465	495470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054568
12510	NC_013159	CTC	2	6	495580	495585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054568
12511	NC_013159	AAC	2	6	495683	495688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054568
12512	NC_013159	GCG	2	6	495693	495698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054568
12513	NC_013159	CTG	2	6	495727	495732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12514	NC_013159	CGG	2	6	495777	495782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054568
12515	NC_013159	GCC	2	6	495829	495834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054568
12516	NC_013159	CTC	2	6	495865	495870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054568
12517	NC_013159	GCT	2	6	495888	495893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12518	NC_013159	GGT	2	6	495908	495913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054568
12519	NC_013159	CGG	2	6	495916	495921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054568
12520	NC_013159	GAC	2	6	495944	495949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12521	NC_013159	TGC	2	6	495965	495970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12522	NC_013159	CTG	2	6	495988	495993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12523	NC_013159	CGG	2	6	495994	495999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054568
12524	NC_013159	GTCGT	2	10	496061	496070	0 %	40 %	40 %	20 %	257054568
12525	NC_013159	AGC	2	6	496082	496087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12526	NC_013159	CGC	3	9	496105	496113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054568
12527	NC_013159	TCC	2	6	496115	496120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054568
12528	NC_013159	CGG	2	6	496134	496139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054568
12529	NC_013159	GTC	2	6	496156	496161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12530	NC_013159	CCT	2	6	496191	496196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054568
12531	NC_013159	TCC	2	6	496280	496285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054568
12532	NC_013159	TCG	2	6	496295	496300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12533	NC_013159	GGGC	2	8	496330	496337	0 %	0 %	75 %	25 %	257054568
12534	NC_013159	CGT	3	9	496341	496349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12535	NC_013159	CGT	2	6	496353	496358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12536	NC_013159	CGG	2	6	496395	496400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054568
12537	NC_013159	CCT	2	6	496408	496413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054568
12538	NC_013159	GGC	2	6	496472	496477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054568
12539	NC_013159	GTG	2	6	496487	496492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054568
12540	NC_013159	GGC	2	6	496493	496498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054568
12541	NC_013159	CGT	2	6	496500	496505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12542	NC_013159	GCG	2	6	496511	496516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054568
12543	NC_013159	GTC	2	6	496529	496534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12544	NC_013159	GCG	2	6	496535	496540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054568
12545	NC_013159	CGG	2	6	496542	496547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054568
12546	NC_013159	GTC	2	6	496579	496584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12547	NC_013159	CCT	2	6	496653	496658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054568
12548	NC_013159	TCG	2	6	496694	496699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12549	NC_013159	TCC	2	6	496706	496711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054568
12550	NC_013159	TCG	2	6	496739	496744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12551	NC_013159	TCCGC	2	10	496806	496815	0 %	20 %	20 %	60 %	257054568
12552	NC_013159	CGT	2	6	496839	496844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12553	NC_013159	CGAGT	2	10	496902	496911	20 %	20 %	40 %	20 %	257054568
12554	NC_013159	GGT	2	6	496931	496936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054568
12555	NC_013159	TCC	2	6	496937	496942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054568
12556	NC_013159	GCGG	2	8	496982	496989	0 %	0 %	75 %	25 %	257054568
12557	NC_013159	GGCGGT	2	12	497057	497068	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	257054568
12558	NC_013159	GCC	2	6	497087	497092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054568
12559	NC_013159	GCCT	2	8	497096	497103	0 %	25 %	25 %	50 %	257054568
12560	NC_013159	CG	3	6	497140	497145	0 %	0 %	50 %	50 %	257054568
12561	NC_013159	CTCGGG	2	12	497161	497172	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257054568
12562	NC_013159	GTAG	2	8	497190	497197	25 %	25 %	50 %	0 %	257054568
12563	NC_013159	G	6	6	497263	497268	0 %	0 %	100 %	0 %	257054568
12564	NC_013159	CAC	3	9	497305	497313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054568
12565	NC_013159	CAC	2	6	497377	497382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054568
12566	NC_013159	CCG	2	6	497390	497395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054568
12567	NC_013159	TCG	2	6	497522	497527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054568
12568	NC_013159	CTC	2	6	497566	497571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054568
12569	NC_013159	GGT	2	6	497601	497606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054568
12570	NC_013159	GGT	2	6	497713	497718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054568
12571	NC_013159	CG	3	6	497799	497804	0 %	0 %	50 %	50 %	257054568
12572	NC_013159	GCA	2	6	497814	497819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054568
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12574	NC_013159	CGG	2	6	498107	498112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12575	NC_013159	CGT	2	6	498118	498123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12580	NC_013159	TGC	3	9	498267	498275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054569
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12582	NC_013159	ACGT	2	8	498383	498390	25 %	25 %	25 %	25 %	257054569
12583	NC_013159	TCGGAC	2	12	498489	498500	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257054569
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12585	NC_013159	GCC	2	6	498507	498512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054569
12586	NC_013159	TGG	2	6	498552	498557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054569
12587	NC_013159	GGTG	2	8	498574	498581	0 %	25 %	75 %	0 %	257054569
12588	NC_013159	TCG	2	6	498588	498593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054569
12589	NC_013159	GGGCAT	2	12	498640	498651	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257054569
12590	NC_013159	GCA	2	6	498658	498663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054569
12591	NC_013159	GGT	2	6	498688	498693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054569
12592	NC_013159	CCG	2	6	498708	498713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054569
12593	NC_013159	CGG	2	6	498729	498734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054569
12594	NC_013159	GTC	2	6	498749	498754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054569
12595	NC_013159	TGG	2	6	498771	498776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054569
12596	NC_013159	CACCG	2	10	498787	498796	20 %	0 %	20 %	60 %	257054569
12597	NC_013159	CGG	2	6	498829	498834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054569
12598	NC_013159	TCA	2	6	498852	498857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054569
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12600	NC_013159	TCGTG	2	10	498873	498882	0 %	40 %	40 %	20 %	257054569
12601	NC_013159	CTG	2	6	498893	498898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054569
12602	NC_013159	GGCCT	2	10	498902	498911	0 %	20 %	40 %	40 %	257054569
12603	NC_013159	ACT	2	6	498925	498930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054569
12604	NC_013159	GGT	2	6	498937	498942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054569
12605	NC_013159	CGT	2	6	498952	498957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054569
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12607	NC_013159	GCT	2	6	498991	498996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054569
12608	NC_013159	TGG	2	6	499014	499019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054569
12609	NC_013159	GTG	2	6	499022	499027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054569
12610	NC_013159	GAC	2	6	499044	499049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054569
12611	NC_013159	GAG	2	6	499050	499055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054569
12612	NC_013159	GAA	2	6	499070	499075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054569
12613	NC_013159	CGT	2	6	499080	499085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054569
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12615	NC_013159	AGG	2	6	499307	499312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054570
12616	NC_013159	CGT	2	6	499323	499328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054570
12617	NC_013159	GTTGCC	2	12	499374	499385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054570
12618	NC_013159	CGA	2	6	499395	499400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054570
12619	NC_013159	GAAC	2	8	499479	499486	50 %	0 %	25 %	25 %	257054570
12620	NC_013159	ATC	2	6	499516	499521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054570
12621	NC_013159	TGC	2	6	499526	499531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054570
12622	NC_013159	GC	3	6	499556	499561	0 %	0 %	50 %	50 %	257054570
12623	NC_013159	CCG	2	6	499620	499625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054570
12624	NC_013159	CGG	2	6	499676	499681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054570
12625	NC_013159	CGG	2	6	499709	499714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054570
12626	NC_013159	TCA	2	6	499730	499735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054570
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12628	NC_013159	CGT	2	6	499902	499907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054570
12629	NC_013159	GCC	2	6	499912	499917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054570
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12632	NC_013159	CGC	2	6	500012	500017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054571
12633	NC_013159	TGC	2	6	500044	500049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054571
12634	NC_013159	GGT	2	6	500091	500096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054571
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12636	NC_013159	TGC	2	6	500116	500121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054571
12637	NC_013159	GCG	2	6	500124	500129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054571
12638	NC_013159	CTG	2	6	500151	500156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054571
12639	NC_013159	CGCTG	2	10	500245	500254	0 %	20 %	40 %	40 %	257054571
12640	NC_013159	GAG	2	6	500267	500272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12641	NC_013159	TGA	2	6	500276	500281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054572
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12645	NC_013159	CG	3	6	500321	500326	0 %	0 %	50 %	50 %	257054572
12646	NC_013159	GCT	2	6	500349	500354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054572
12647	NC_013159	GGTG	2	8	500367	500374	0 %	25 %	75 %	0 %	257054572
12648	NC_013159	CTG	2	6	500410	500415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054572
12649	NC_013159	GGA	2	6	500430	500435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054572
12650	NC_013159	TTC	2	6	500557	500562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054572
12651	NC_013159	GTC	2	6	500584	500589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054572
12652	NC_013159	AGG	2	6	500660	500665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054572
12653	NC_013159	CTT	2	6	500673	500678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054572
12654	NC_013159	GGGGT	2	10	500695	500704	0 %	20 %	80 %	0 %	257054572
12655	NC_013159	GCG	2	6	500828	500833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12656	NC_013159	CGC	2	6	500843	500848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054573
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12658	NC_013159	GTC	2	6	500906	500911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054573
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12664	NC_013159	CGG	3	9	501151	501159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054573
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12670	NC_013159	GCC	2	6	501365	501370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054573
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12676	NC_013159	GCTG	2	8	501676	501683	0 %	25 %	50 %	25 %	257054573
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12688	NC_013159	TGA	2	6	502000	502005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054573
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12690	NC_013159	CTCC	2	8	502137	502144	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12691	NC_013159	GATC	2	8	502210	502217	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12692	NC_013159	A	6	6	502230	502235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12693	NC_013159	CAG	2	6	502248	502253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12694	NC_013159	GATT	2	8	502254	502261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12695	NC_013159	CGT	2	6	502278	502283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12696	NC_013159	ATCT	2	8	502290	502297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12697	NC_013159	AGA	2	6	502405	502410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12698	NC_013159	GAG	2	6	502425	502430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12699	NC_013159	TCG	2	6	502464	502469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12700	NC_013159	GT	3	6	502502	502507	0 %	50 %	50 %	0 %	257054574
12701	NC_013159	CGTC	2	8	502559	502566	0 %	25 %	25 %	50 %	257054574
12702	NC_013159	GGC	2	6	502586	502591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054574
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12707	NC_013159	GCT	2	6	502682	502687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12710	NC_013159	GGT	2	6	502756	502761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12711	NC_013159	GGCG	2	8	502789	502796	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12712	NC_013159	CTG	2	6	502811	502816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12713	NC_013159	GAG	2	6	502911	502916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12714	NC_013159	CGT	2	6	502954	502959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054575
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12723	NC_013159	GAG	2	6	503177	503182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054575
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12726	NC_013159	ATC	3	9	503261	503269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054575
12727	NC_013159	ATC	3	9	503309	503317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054575
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12731	NC_013159	TCGA	2	8	503489	503496	25 %	25 %	25 %	25 %	257054575
12732	NC_013159	CCA	2	6	503556	503561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054575
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12735	NC_013159	TGG	2	6	503688	503693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054575
12736	NC_013159	CCTC	2	8	503697	503704	0 %	25 %	0 %	75 %	257054575
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12861	NC_013159	TGT	2	6	508427	508432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054581
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12949	NC_013159	GCA	2	6	512046	512051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054581
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12952	NC_013159	GTG	2	6	512173	512178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054581
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12955	NC_013159	ACG	2	6	512325	512330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12959	NC_013159	CGGAT	2	10	512464	512473	20 %	20 %	40 %	20 %	257054582
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12963	NC_013159	ATC	2	6	512529	512534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054582
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12966	NC_013159	ATG	2	6	512665	512670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054582
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12968	NC_013159	GGC	2	6	512799	512804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054582
12969	NC_013159	TCC	2	6	512940	512945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12970	NC_013159	GGC	2	6	513069	513074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054583
12971	NC_013159	GGC	2	6	513094	513099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054583
12972	NC_013159	TGT	2	6	513134	513139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054583
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12974	NC_013159	CGTC	2	8	513216	513223	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12975	NC_013159	TGA	2	6	513248	513253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12976	NC_013159	AACCT	2	10	513367	513376	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12977	NC_013159	TC	4	8	513460	513467	0 %	50 %	0 %	50 %	257054584
12978	NC_013159	TCTG	2	8	513473	513480	0 %	50 %	25 %	25 %	257054584
12979	NC_013159	CGG	2	6	513516	513521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054584
12980	NC_013159	GTC	2	6	513544	513549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054584
12981	NC_013159	GGT	2	6	513559	513564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054584
12982	NC_013159	GTG	2	6	513580	513585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054584
12983	NC_013159	GGT	2	6	513615	513620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054584
12984	NC_013159	GTT	2	6	513640	513645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054584
12985	NC_013159	GTG	2	6	513664	513669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054584
12986	NC_013159	CCG	2	6	513700	513705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054584
12987	NC_013159	ACG	2	6	513731	513736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054584
12988	NC_013159	ATGG	2	8	513756	513763	25 %	25 %	50 %	0 %	257054585
12989	NC_013159	GCG	2	6	513793	513798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054585
12990	NC_013159	GATG	2	8	513848	513855	25 %	25 %	50 %	0 %	257054585
12991	NC_013159	TCGG	2	8	513863	513870	0 %	25 %	50 %	25 %	257054585
12992	NC_013159	CGGAT	2	10	513871	513880	20 %	20 %	40 %	20 %	257054585
12993	NC_013159	TCG	2	6	513885	513890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054585
12994	NC_013159	CGG	2	6	513899	513904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054585
12995	NC_013159	GCC	2	6	513924	513929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054585
12996	NC_013159	ATC	2	6	513936	513941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054585
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12999	NC_013159	TGG	2	6	514019	514024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054585
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