MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 108102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_013159	GCG	2	6	437331	437336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054519
11002	NC_013159	CGA	3	9	437410	437418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11003	NC_013159	CAT	2	6	437452	437457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054519
11004	NC_013159	CGA	2	6	437485	437490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11005	NC_013159	CGA	2	6	437674	437679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11006	NC_013159	CTG	2	6	437681	437686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11007	NC_013159	GCAAGA	2	12	437748	437759	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	257054519
11008	NC_013159	CGA	2	6	437770	437775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11009	NC_013159	CG	4	8	437836	437843	0 %	0 %	50 %	50 %	257054519
11010	NC_013159	GGA	2	6	437851	437856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054519
11011	NC_013159	GCA	2	6	437904	437909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11012	NC_013159	CGA	2	6	437919	437924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11013	NC_013159	CGA	2	6	437932	437937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11014	NC_013159	ACG	2	6	437949	437954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11015	NC_013159	CCT	2	6	438000	438005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054519
11016	NC_013159	ACC	2	6	438024	438029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054519
11017	NC_013159	GAC	2	6	438056	438061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11018	NC_013159	GAG	2	6	438089	438094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054519
11019	NC_013159	GGAC	2	8	438169	438176	25 %	0 %	50 %	25 %	257054519
11020	NC_013159	TGG	2	6	438211	438216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054519
11021	NC_013159	GCG	2	6	438228	438233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054519
11022	NC_013159	GAA	2	6	438295	438300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054519
11023	NC_013159	TGA	2	6	438313	438318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054519
11024	NC_013159	TGA	2	6	438394	438399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054519
11025	NC_013159	GA	3	6	438465	438470	50 %	0 %	50 %	0 %	257054519
11026	NC_013159	CGA	2	6	438484	438489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11027	NC_013159	GGGC	2	8	438547	438554	0 %	0 %	75 %	25 %	257054519
11028	NC_013159	AGTCCG	2	12	438555	438566	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11029	NC_013159	AGG	2	6	438606	438611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054519
11030	NC_013159	CGA	2	6	438699	438704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11031	NC_013159	GAC	2	6	438716	438721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11032	NC_013159	CAC	2	6	438736	438741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054519
11033	NC_013159	GGCA	2	8	438801	438808	25 %	0 %	50 %	25 %	257054519
11034	NC_013159	GAC	2	6	438874	438879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11035	NC_013159	GCCGAC	2	12	438886	438897	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257054519
11036	NC_013159	CGG	2	6	438921	438926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054519
11037	NC_013159	GTGG	2	8	438931	438938	0 %	25 %	75 %	0 %	257054519
11038	NC_013159	CGG	2	6	438972	438977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054519
11039	NC_013159	CGG	2	6	438996	439001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054519
11040	NC_013159	CCG	2	6	439004	439009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054519
11041	NC_013159	GGC	2	6	439015	439020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054519
11042	NC_013159	GGA	2	6	439024	439029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054519
11043	NC_013159	CGC	2	6	439036	439041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054519
11044	NC_013159	CG	3	6	439070	439075	0 %	0 %	50 %	50 %	257054519
11045	NC_013159	GCC	2	6	439081	439086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054519
11046	NC_013159	GCCC	2	8	439090	439097	0 %	0 %	25 %	75 %	257054519
11047	NC_013159	ACC	3	9	439111	439119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054519
11048	NC_013159	CGT	2	6	439139	439144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11049	NC_013159	CGA	3	9	439159	439167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054519
11050	NC_013159	AAC	2	6	439178	439183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054519
11051	NC_013159	CGA	2	6	439233	439238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054520
11052	NC_013159	TG	3	6	439251	439256	0 %	50 %	50 %	0 %	257054520
11053	NC_013159	TCG	2	6	439304	439309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054520
11054	NC_013159	ACT	2	6	439344	439349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054520
11055	NC_013159	GCC	2	6	439516	439521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11056	NC_013159	GAG	2	6	439528	439533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_013159	CGGGC	2	10	439540	439549	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11058	NC_013159	CAC	2	6	439599	439604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11059	NC_013159	GCC	2	6	439653	439658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11060	NC_013159	CCGC	2	8	439696	439703	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11061	NC_013159	ACGA	2	8	439729	439736	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11062	NC_013159	GGTGT	2	10	439755	439764	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_013159	CAC	2	6	439772	439777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11064	NC_013159	CGG	2	6	439781	439786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_013159	GAC	2	6	439791	439796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_013159	GGC	2	6	439808	439813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_013159	GGTTCG	2	12	439825	439836	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11068	NC_013159	CGC	2	6	439850	439855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11069	NC_013159	CAC	2	6	439928	439933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11070	NC_013159	GCG	2	6	439950	439955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_013159	GCG	3	9	440020	440028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_013159	GCC	2	6	440095	440100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11073	NC_013159	GCG	2	6	440111	440116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_013159	TGC	2	6	440149	440154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_013159	CCG	2	6	440173	440178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11076	NC_013159	GC	3	6	440181	440186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11077	NC_013159	CAC	2	6	440238	440243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11078	NC_013159	ATGT	2	8	440276	440283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_013159	ACG	2	6	440362	440367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11081	NC_013159	GC	3	6	440464	440469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11082	NC_013159	CCG	2	6	440476	440481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11083	NC_013159	CGTG	2	8	440482	440489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11084	NC_013159	GGT	2	6	440502	440507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_013159	C	6	6	440513	440518	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11086	NC_013159	TG	3	6	440562	440567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_013159	CGG	2	6	440575	440580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11088	NC_013159	CGT	2	6	440597	440602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_013159	AAC	2	6	440607	440612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_013159	CAA	2	6	440630	440635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_013159	CGT	3	9	440639	440647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11093	NC_013159	CGA	2	6	440736	440741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054521
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11095	NC_013159	GAG	2	6	440807	440812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054521
11096	NC_013159	ACT	2	6	440881	440886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054521
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11098	NC_013159	GCG	2	6	441041	441046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054521
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11101	NC_013159	GGT	2	6	441169	441174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054521
11102	NC_013159	GGA	2	6	441187	441192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054521
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11104	NC_013159	GTG	2	6	441263	441268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054521
11105	NC_013159	TTG	2	6	441269	441274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054521
11106	NC_013159	GCG	2	6	441356	441361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054521
11107	NC_013159	GT	3	6	441370	441375	0 %	50 %	50 %	0 %	257054521
11108	NC_013159	CGC	2	6	441418	441423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054521
11109	NC_013159	CGA	2	6	441478	441483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054521
11110	NC_013159	GCG	2	6	441551	441556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054521
11111	NC_013159	CGC	2	6	441574	441579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054521
11112	NC_013159	AC	3	6	441588	441593	50 %	0 %	0 %	50 %	257054521
11113	NC_013159	TGC	2	6	441603	441608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054521
11114	NC_013159	CGA	2	6	441619	441624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054521
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11116	NC_013159	GCAG	2	8	441635	441642	25 %	0 %	50 %	25 %	257054521
11117	NC_013159	TCA	2	6	441648	441653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054521
11118	NC_013159	GC	4	8	441706	441713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11119	NC_013159	GGTT	2	8	441715	441722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_013159	GCGT	2	8	441802	441809	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11121	NC_013159	CGC	2	6	441830	441835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11122	NC_013159	GCG	2	6	441852	441857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11123	NC_013159	ACC	2	6	441859	441864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11124	NC_013159	AC	3	6	441902	441907	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11125	NC_013159	AAC	2	6	441944	441949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11126	NC_013159	GCA	2	6	442013	442018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054522
11127	NC_013159	ACG	2	6	442022	442027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054522
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11130	NC_013159	ATC	2	6	442139	442144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054522
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11159	NC_013159	CCT	2	6	443502	443507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054523
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11172	NC_013159	CCGA	2	8	443954	443961	25 %	0 %	25 %	50 %	257054523
11173	NC_013159	GAGT	2	8	444007	444014	25 %	25 %	50 %	0 %	257054523
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11203	NC_013159	CGA	3	9	445395	445403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11204	NC_013159	TGGTT	2	10	445423	445432	0 %	60 %	40 %	0 %	257054525
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11228	NC_013159	GCT	2	6	446234	446239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054525
11229	NC_013159	GCG	2	6	446302	446307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11230	NC_013159	GGCA	2	8	446491	446498	25 %	0 %	50 %	25 %	257054526
11231	NC_013159	CGG	2	6	446513	446518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054526
11232	NC_013159	TCG	2	6	446522	446527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054526
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11235	NC_013159	GTC	2	6	446589	446594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054526
11236	NC_013159	GCC	2	6	446628	446633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054526
11237	NC_013159	CACG	2	8	446696	446703	25 %	0 %	25 %	50 %	257054526
11238	NC_013159	CCCACC	2	12	446725	446736	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	257054526
11239	NC_013159	GGT	2	6	446759	446764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054526
11240	NC_013159	CAT	2	6	446774	446779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054526
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11242	NC_013159	GGA	2	6	446810	446815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054526
11243	NC_013159	AGC	2	6	446832	446837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054526
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11246	NC_013159	GC	3	6	446921	446926	0 %	0 %	50 %	50 %	257054526
11247	NC_013159	GTC	2	6	446961	446966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054526
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11481	NC_013159	GGT	2	6	456078	456083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054534
11482	NC_013159	GCG	3	9	456156	456164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054534
11483	NC_013159	TTA	2	6	456165	456170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257054534
11484	NC_013159	CG	3	6	456210	456215	0 %	0 %	50 %	50 %	257054534
11485	NC_013159	CGCA	2	8	456217	456224	25 %	0 %	25 %	50 %	257054534
11486	NC_013159	GTC	2	6	456242	456247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054535
11487	NC_013159	CGA	2	6	456275	456280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054535
11488	NC_013159	CGA	2	6	456308	456313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054535
11489	NC_013159	GGT	2	6	456315	456320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054535
11490	NC_013159	GCT	2	6	456326	456331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054535
11491	NC_013159	CGA	2	6	456335	456340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054535
11492	NC_013159	CAG	2	6	456347	456352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054535
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11497	NC_013159	GGCG	2	8	456509	456516	0 %	0 %	75 %	25 %	257054535
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