MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 108102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013159	GC	3	6	19525	19530	0 %	0 %	50 %	50 %	257054107
502	NC_013159	GGCG	2	8	19540	19547	0 %	0 %	75 %	25 %	257054107
503	NC_013159	GCC	2	6	19593	19598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054107
504	NC_013159	CGGTGC	2	12	19615	19626	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257054107
505	NC_013159	TGG	2	6	19659	19664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054107
506	NC_013159	TCG	2	6	19665	19670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054107
507	NC_013159	GGGT	2	8	19696	19703	0 %	25 %	75 %	0 %	257054107
508	NC_013159	CGC	2	6	19710	19715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054107
509	NC_013159	GC	3	6	19733	19738	0 %	0 %	50 %	50 %	257054107
510	NC_013159	TGC	2	6	19765	19770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054107
511	NC_013159	CGC	2	6	19811	19816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054107
512	NC_013159	GA	3	6	19859	19864	50 %	0 %	50 %	0 %	257054107
513	NC_013159	CGT	2	6	19876	19881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054107
514	NC_013159	CG	3	6	19922	19927	0 %	0 %	50 %	50 %	257054107
515	NC_013159	CGAG	2	8	19941	19948	25 %	0 %	50 %	25 %	257054107
516	NC_013159	CAG	2	6	19964	19969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054107
517	NC_013159	CAG	2	6	20018	20023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054107
518	NC_013159	TGA	2	6	20035	20040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054107
519	NC_013159	GAC	2	6	20078	20083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054107
520	NC_013159	GGTGCG	2	12	20132	20143	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	257054107
521	NC_013159	ACC	3	9	20187	20195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054107
522	NC_013159	CGC	3	9	20258	20266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054107
523	NC_013159	CAC	2	6	20288	20293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054107
524	NC_013159	CCA	2	6	20414	20419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054107
525	NC_013159	GTT	2	6	20449	20454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054107
526	NC_013159	CGT	2	6	20461	20466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054107
527	NC_013159	TCC	2	6	20471	20476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_013159	GCG	2	6	20524	20529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_013159	CCA	2	6	20531	20536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_013159	CCGG	2	8	20545	20552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_013159	CCA	2	6	20559	20564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_013159	CGA	2	6	20591	20596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_013159	GGT	2	6	20749	20754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013159	TCC	2	6	20788	20793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_013159	CGT	2	6	20794	20799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_013159	TGT	2	6	20842	20847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013159	TCG	3	9	20861	20869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_013159	GAG	2	6	20878	20883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_013159	CGG	2	6	21020	21025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_013159	GTC	2	6	21029	21034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_013159	TCG	2	6	21075	21080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_013159	GAG	2	6	21210	21215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054108
543	NC_013159	TCT	2	6	21232	21237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054108
544	NC_013159	GAG	2	6	21285	21290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054108
545	NC_013159	CGG	2	6	21316	21321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054108
546	NC_013159	GAC	2	6	21387	21392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054108
547	NC_013159	G	6	6	21416	21421	0 %	0 %	100 %	0 %	257054108
548	NC_013159	GTC	2	6	21432	21437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054108
549	NC_013159	ACGCGC	2	12	21564	21575	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
550	NC_013159	CCGA	2	8	21654	21661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
551	NC_013159	GTG	2	6	21746	21751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054109
552	NC_013159	CGA	2	6	21772	21777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054109
553	NC_013159	GAA	2	6	21838	21843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054109
554	NC_013159	CAT	2	6	21856	21861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054109
555	NC_013159	CGA	2	6	21886	21891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054109
556	NC_013159	TCG	2	6	21894	21899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054109
557	NC_013159	CCA	2	6	21966	21971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054109
558	NC_013159	CGC	2	6	21979	21984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054109
559	NC_013159	GCT	2	6	21991	21996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054109
560	NC_013159	AGC	2	6	22025	22030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054109
561	NC_013159	AAG	2	6	22043	22048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054109
562	NC_013159	ACA	2	6	22053	22058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054109
563	NC_013159	GAG	2	6	22088	22093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054109
564	NC_013159	CGC	2	6	22129	22134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054109
565	NC_013159	GAG	2	6	22171	22176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_013159	TCG	2	6	22211	22216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_013159	GTC	2	6	22252	22257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054110
568	NC_013159	GGC	2	6	22280	22285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054110
569	NC_013159	GTC	2	6	22314	22319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054110
570	NC_013159	GGGC	2	8	22345	22352	0 %	0 %	75 %	25 %	257054110
571	NC_013159	CCG	2	6	22366	22371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054110
572	NC_013159	CGG	2	6	22463	22468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054110
573	NC_013159	CTC	2	6	22487	22492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054110
574	NC_013159	CGC	2	6	22532	22537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054110
575	NC_013159	CAG	2	6	22544	22549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054110
576	NC_013159	TGGCCT	2	12	22594	22605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054110
577	NC_013159	GGC	2	6	22613	22618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054110
578	NC_013159	GC	3	6	22631	22636	0 %	0 %	50 %	50 %	257054110
579	NC_013159	GCG	2	6	22661	22666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054110
580	NC_013159	CCG	2	6	22675	22680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054110
581	NC_013159	GCC	2	6	22686	22691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054110
582	NC_013159	TTC	2	6	22704	22709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054110
583	NC_013159	TCC	2	6	22734	22739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054110
584	NC_013159	GTT	2	6	22744	22749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054110
585	NC_013159	GC	3	6	22811	22816	0 %	0 %	50 %	50 %	257054110
586	NC_013159	GC	3	6	22826	22831	0 %	0 %	50 %	50 %	257054110
587	NC_013159	CCG	2	6	22861	22866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054110
588	NC_013159	GCC	2	6	22872	22877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054110
589	NC_013159	GCC	2	6	22881	22886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054110
590	NC_013159	GC	3	6	22917	22922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_013159	GTGAGC	2	12	22930	22941	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
592	NC_013159	TGG	2	6	22969	22974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_013159	TGAC	2	8	23097	23104	25 %	25 %	25 %	25 %	257054111
594	NC_013159	TCG	2	6	23214	23219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054111
595	NC_013159	ACG	2	6	23286	23291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054111
596	NC_013159	GGT	2	6	23360	23365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054111
597	NC_013159	CTG	2	6	23423	23428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054111
598	NC_013159	TCA	2	6	23472	23477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054111
599	NC_013159	CGC	2	6	23490	23495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054111
600	NC_013159	GTC	2	6	23552	23557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054111
601	NC_013159	TCGC	2	8	23565	23572	0 %	25 %	25 %	50 %	257054111
602	NC_013159	CGT	2	6	23608	23613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054111
603	NC_013159	GC	3	6	23635	23640	0 %	0 %	50 %	50 %	257054111
604	NC_013159	TCG	2	6	23656	23661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_013159	CG	3	6	23699	23704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
606	NC_013159	GTG	2	6	23723	23728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054112
607	NC_013159	GACG	2	8	23743	23750	25 %	0 %	50 %	25 %	257054112
608	NC_013159	ACA	2	6	23775	23780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054112
609	NC_013159	C	6	6	23792	23797	0 %	0 %	0 %	100 %	257054112
610	NC_013159	C	6	6	23800	23805	0 %	0 %	0 %	100 %	257054112
611	NC_013159	CAG	2	6	23825	23830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054112
612	NC_013159	TGG	2	6	23849	23854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054112
613	NC_013159	GCAG	2	8	23862	23869	25 %	0 %	50 %	25 %	257054112
614	NC_013159	TG	3	6	23882	23887	0 %	50 %	50 %	0 %	257054112
615	NC_013159	GTCG	2	8	23929	23936	0 %	25 %	50 %	25 %	257054112
616	NC_013159	TG	3	6	23954	23959	0 %	50 %	50 %	0 %	257054112
617	NC_013159	GCA	2	6	23971	23976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054112
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619	NC_013159	GTC	2	6	24056	24061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054112
620	NC_013159	ACC	2	6	24138	24143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054112
621	NC_013159	CGT	2	6	24184	24189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054112
622	NC_013159	CGA	2	6	24196	24201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054112
623	NC_013159	TGG	2	6	24203	24208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054112
624	NC_013159	GCT	2	6	24211	24216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054112
625	NC_013159	GCG	2	6	24380	24385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054112
626	NC_013159	CCG	2	6	24396	24401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054112
627	NC_013159	TGC	2	6	24450	24455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054112
628	NC_013159	CGG	2	6	24474	24479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054112
629	NC_013159	ATC	2	6	24488	24493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054112
630	NC_013159	GTT	2	6	24535	24540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054112
631	NC_013159	TGG	2	6	24558	24563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054112
632	NC_013159	GAT	2	6	24577	24582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054112
633	NC_013159	CGGTG	2	10	24628	24637	0 %	20 %	60 %	20 %	257054112
634	NC_013159	GCC	3	9	24647	24655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054112
635	NC_013159	GTG	2	6	24668	24673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054112
636	NC_013159	CTC	2	6	24748	24753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054113
637	NC_013159	CGT	2	6	24759	24764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054113
638	NC_013159	GTC	2	6	24804	24809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054113
639	NC_013159	TCGAGT	2	12	24821	24832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257054113
640	NC_013159	GTG	2	6	24863	24868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054113
641	NC_013159	GCC	2	6	24907	24912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054113
642	NC_013159	AGG	2	6	24947	24952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054113
643	NC_013159	ACG	2	6	24962	24967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054113
644	NC_013159	CAC	2	6	25003	25008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054113
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646	NC_013159	CGG	2	6	25074	25079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054113
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649	NC_013159	CGTC	2	8	25187	25194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
650	NC_013159	TCA	2	6	25223	25228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054114
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653	NC_013159	GAG	2	6	25341	25346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054114
654	NC_013159	CGC	2	6	25392	25397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054114
655	NC_013159	GGC	2	6	25426	25431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054114
656	NC_013159	TCT	2	6	25442	25447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054114
657	NC_013159	GGCA	2	8	25545	25552	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
658	NC_013159	GAGC	2	8	25564	25571	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
659	NC_013159	TGC	2	6	25588	25593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
660	NC_013159	GGTCG	2	10	25595	25604	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
661	NC_013159	GAG	2	6	25616	25621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
662	NC_013159	GAG	2	6	25639	25644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
663	NC_013159	CGG	2	6	25723	25728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_013159	CCGG	2	8	25762	25769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
665	NC_013159	C	6	6	25802	25807	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
666	NC_013159	CCGG	2	8	25826	25833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
667	NC_013159	GCCG	2	8	25872	25879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
668	NC_013159	GCC	2	6	25884	25889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
669	NC_013159	C	6	6	25893	25898	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
670	NC_013159	CGC	2	6	25916	25921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
671	NC_013159	CTC	2	6	25922	25927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
672	NC_013159	CGC	2	6	26006	26011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054115
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682	NC_013159	GGGT	2	8	26414	26421	0 %	25 %	75 %	0 %	257054115
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719	NC_013159	CTT	2	6	27820	27825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
720	NC_013159	GCT	2	6	28037	28042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054118
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723	NC_013159	ACG	2	6	28095	28100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054118
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751	NC_013159	GC	3	6	28932	28937	0 %	0 %	50 %	50 %	257054119
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755	NC_013159	GAC	2	6	29044	29049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054119
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757	NC_013159	TGC	2	6	29085	29090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054119
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