MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 43489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_012926	CTG	2	6	1816024	1816029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253756291
37002	NC_012926	CCA	2	6	1816143	1816148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253756291
37003	NC_012926	CATA	2	8	1816150	1816157	50 %	25 %	0 %	25 %	253756291
37004	NC_012926	AGC	2	6	1816163	1816168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253756291
37005	NC_012926	CTT	2	6	1816246	1816251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253756291
37006	NC_012926	CCA	2	6	1816253	1816258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253756291
37007	NC_012926	TTG	2	6	1816268	1816273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253756291
37008	NC_012926	ACCATC	2	12	1816355	1816366	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	253756291
37009	NC_012926	GAA	2	6	1816457	1816462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253756291
37010	NC_012926	GGT	2	6	1816486	1816491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253756291
37011	NC_012926	CAT	2	6	1816564	1816569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253756291
37012	NC_012926	GCT	2	6	1816605	1816610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253756291
37013	NC_012926	GAC	2	6	1816650	1816655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253756291
37014	NC_012926	TTTCA	2	10	1816745	1816754	20 %	60 %	0 %	20 %	253756291
37015	NC_012926	GAA	2	6	1816820	1816825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253756291
37016	NC_012926	CAA	2	6	1816894	1816899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253756291
37017	NC_012926	CAC	2	6	1816990	1816995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253756291
37018	NC_012926	CAT	2	6	1817003	1817008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253756291
37019	NC_012926	TCA	2	6	1817049	1817054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253756291
37020	NC_012926	CAA	2	6	1817092	1817097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253756291
37021	NC_012926	ATC	2	6	1817129	1817134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253756291
37022	NC_012926	TTGC	2	8	1817157	1817164	0 %	50 %	25 %	25 %	253756291
37023	NC_012926	GTC	2	6	1817297	1817302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253756291
37024	NC_012926	CGT	2	6	1817317	1817322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253756291
37025	NC_012926	ACC	2	6	1817348	1817353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253756291
37026	NC_012926	AGT	2	6	1817366	1817371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253756291
37027	NC_012926	TCA	2	6	1817385	1817390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253756291
37028	NC_012926	TGA	2	6	1817402	1817407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253756291
37029	NC_012926	CTG	2	6	1817452	1817457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253756291
37030	NC_012926	TGC	2	6	1817501	1817506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253756291
37031	NC_012926	TGC	2	6	1817528	1817533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253756291
37032	NC_012926	TTTG	2	8	1817616	1817623	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37033	NC_012926	TTA	2	6	1817628	1817633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37034	NC_012926	TAAA	2	8	1817672	1817679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37035	NC_012926	T	6	6	1817712	1817717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37036	NC_012926	CAT	2	6	1817718	1817723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37037	NC_012926	T	6	6	1817731	1817736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37038	NC_012926	T	6	6	1817742	1817747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37039	NC_012926	ATA	2	6	1817775	1817780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37040	NC_012926	T	7	7	1817849	1817855	0 %	100 %	0 %	0 %	253756292
37041	NC_012926	AGA	2	6	1817877	1817882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253756292
37042	NC_012926	AAGT	2	8	1817918	1817925	50 %	25 %	25 %	0 %	253756292
37043	NC_012926	AGCA	2	8	1817964	1817971	50 %	0 %	25 %	25 %	253756292
37044	NC_012926	CTT	2	6	1818152	1818157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253756292
37045	NC_012926	TAA	2	6	1818158	1818163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253756292
37046	NC_012926	CAT	2	6	1818164	1818169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253756292
37047	NC_012926	TAT	2	6	1818180	1818185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253756292
37048	NC_012926	A	6	6	1818197	1818202	100 %	0 %	0 %	0 %	253756292
37049	NC_012926	ATA	2	6	1818299	1818304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253756292
37050	NC_012926	ATC	2	6	1818379	1818384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253756292
37051	NC_012926	GGC	2	6	1818451	1818456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253756292
37052	NC_012926	ACCA	2	8	1818472	1818479	50 %	0 %	0 %	50 %	253756292
37053	NC_012926	CAA	2	6	1818566	1818571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253756292
37054	NC_012926	CAA	2	6	1818574	1818579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253756292
37055	NC_012926	AGT	2	6	1818600	1818605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253756292
37056	NC_012926	ATG	2	6	1818617	1818622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253756292
37057	NC_012926	TGA	2	6	1818665	1818670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253756292
37058	NC_012926	A	8	8	1818708	1818715	100 %	0 %	0 %	0 %	253756292
37059	NC_012926	TGT	2	6	1818774	1818779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253756292
37060	NC_012926	GCA	3	9	1818781	1818789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253756292
37061	NC_012926	TGT	2	6	1818798	1818803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253756292
37062	NC_012926	AAGATC	2	12	1818911	1818922	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	253756292
37063	NC_012926	AAG	2	6	1818986	1818991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253756292
37064	NC_012926	TGG	2	6	1819009	1819014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253756292
37065	NC_012926	A	7	7	1819049	1819055	100 %	0 %	0 %	0 %	253756292
37066	NC_012926	T	7	7	1819085	1819091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37067	NC_012926	GAGT	2	8	1819138	1819145	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37068	NC_012926	AGA	2	6	1819211	1819216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37069	NC_012926	CTC	2	6	1819230	1819235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37070	NC_012926	CAA	2	6	1819389	1819394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253756293
37071	NC_012926	ATC	2	6	1819406	1819411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253756293
37072	NC_012926	TCGGAC	2	12	1819421	1819432	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253756293
37073	NC_012926	GTA	2	6	1819450	1819455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253756293
37074	NC_012926	TTC	2	6	1819462	1819467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253756293
37075	NC_012926	AATGG	2	10	1819529	1819538	40 %	20 %	40 %	0 %	253756293
37076	NC_012926	ATC	2	6	1819555	1819560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253756293
37077	NC_012926	ATA	2	6	1819562	1819567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253756293
37078	NC_012926	CCA	3	9	1819646	1819654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253756293
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37080	NC_012926	ATC	2	6	1819706	1819711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253756293
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37083	NC_012926	GTC	2	6	1819814	1819819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253756293
37084	NC_012926	GGCACG	2	12	1819867	1819878	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	253756293
37085	NC_012926	TGG	2	6	1819920	1819925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253756293
37086	NC_012926	GAT	2	6	1819954	1819959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253756293
37087	NC_012926	GAT	2	6	1820047	1820052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253756293
37088	NC_012926	TTG	2	6	1820084	1820089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253756293
37089	NC_012926	TAT	2	6	1820190	1820195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253756293
37090	NC_012926	CGG	2	6	1820200	1820205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253756293
37091	NC_012926	T	6	6	1820224	1820229	0 %	100 %	0 %	0 %	253756293
37092	NC_012926	CTTC	2	8	1820298	1820305	0 %	50 %	0 %	50 %	253756293
37093	NC_012926	TGT	2	6	1820307	1820312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253756293
37094	NC_012926	TAGG	2	8	1820353	1820360	25 %	25 %	50 %	0 %	253756293
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37099	NC_012926	TTCT	2	8	1820703	1820710	0 %	75 %	0 %	25 %	253756293
37100	NC_012926	ATA	2	6	1820717	1820722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253756293
37101	NC_012926	AC	3	6	1820782	1820787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37102	NC_012926	T	6	6	1820801	1820806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37103	NC_012926	ATTTC	2	10	1820830	1820839	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37104	NC_012926	GAT	2	6	1820891	1820896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37105	NC_012926	TTCG	2	8	1820916	1820923	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37106	NC_012926	TTC	2	6	1820930	1820935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37107	NC_012926	TTGG	2	8	1820948	1820955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37108	NC_012926	TTCA	2	8	1821067	1821074	25 %	50 %	0 %	25 %	253756294
37109	NC_012926	TTC	2	6	1821099	1821104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253756294
37110	NC_012926	GAG	2	6	1821164	1821169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253756294
37111	NC_012926	TCT	2	6	1821201	1821206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253756294
37112	NC_012926	AGA	2	6	1821226	1821231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253756294
37113	NC_012926	CTGA	2	8	1821251	1821258	25 %	25 %	25 %	25 %	253756294
37114	NC_012926	TCA	2	6	1821283	1821288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253756294
37115	NC_012926	GGTTG	2	10	1821392	1821401	0 %	40 %	60 %	0 %	253756294
37116	NC_012926	AG	3	6	1821483	1821488	50 %	0 %	50 %	0 %	253756294
37117	NC_012926	TGA	2	6	1821527	1821532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253756295
37118	NC_012926	TGTAAA	2	12	1821569	1821580	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	253756295
37119	NC_012926	TGG	2	6	1821637	1821642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253756295
37120	NC_012926	GTC	2	6	1821702	1821707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253756295
37121	NC_012926	TTCC	2	8	1821927	1821934	0 %	50 %	0 %	50 %	253756295
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37131	NC_012926	GAT	2	6	1822374	1822379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253756295
37132	NC_012926	CTGG	2	8	1822391	1822398	0 %	25 %	50 %	25 %	253756295
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37228	NC_012926	CT	4	8	1827149	1827156	0 %	50 %	0 %	50 %	253756299
37229	NC_012926	ATC	2	6	1827162	1827167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253756299
37230	NC_012926	TCAT	2	8	1827226	1827233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37231	NC_012926	TCA	2	6	1827238	1827243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37232	NC_012926	T	6	6	1827245	1827250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37233	NC_012926	ATTG	2	8	1827254	1827261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37234	NC_012926	CATA	2	8	1827277	1827284	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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