MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 43489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_012926	ACA	2	6	47654	47659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754684
1003	NC_012926	CAC	2	6	47664	47669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253754684
1004	NC_012926	TGT	2	6	47689	47694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754684
1005	NC_012926	GTA	2	6	47750	47755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754684
1006	NC_012926	GCTT	2	8	47872	47879	0 %	50 %	25 %	25 %	253754685
1007	NC_012926	CCTA	2	8	47958	47965	25 %	25 %	0 %	50 %	253754685
1008	NC_012926	TAT	2	6	47971	47976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754685
1009	NC_012926	GAAGT	2	10	48053	48062	40 %	20 %	40 %	0 %	253754685
1010	NC_012926	TGA	2	6	48130	48135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754685
1011	NC_012926	TAT	2	6	48151	48156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754685
1012	NC_012926	GAA	2	6	48167	48172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754685
1013	NC_012926	TTATC	2	10	48184	48193	20 %	60 %	0 %	20 %	253754685
1014	NC_012926	GCTA	2	8	48226	48233	25 %	25 %	25 %	25 %	253754685
1015	NC_012926	TC	3	6	48245	48250	0 %	50 %	0 %	50 %	253754685
1016	NC_012926	TTG	2	6	48263	48268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754685
1017	NC_012926	ATT	2	6	48276	48281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754685
1018	NC_012926	TAATC	2	10	48292	48301	40 %	40 %	0 %	20 %	253754685
1019	NC_012926	GGA	2	6	48368	48373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754685
1020	NC_012926	ATG	2	6	48427	48432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754686
1021	NC_012926	TAT	2	6	48443	48448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754686
1022	NC_012926	TC	3	6	48501	48506	0 %	50 %	0 %	50 %	253754686
1023	NC_012926	TTG	3	9	48520	48528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754686
1024	NC_012926	TCAAT	2	10	48551	48560	40 %	40 %	0 %	20 %	253754686
1025	NC_012926	CAG	2	6	48602	48607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754686
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1029	NC_012926	TAT	2	6	48781	48786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754686
1030	NC_012926	TTATT	2	10	48804	48813	20 %	80 %	0 %	0 %	253754686
1031	NC_012926	CAG	2	6	48814	48819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754686
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1035	NC_012926	A	6	6	48958	48963	100 %	0 %	0 %	0 %	253754687
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1041	NC_012926	ATTG	2	8	49663	49670	25 %	50 %	25 %	0 %	253754687
1042	NC_012926	GAAA	2	8	49699	49706	75 %	0 %	25 %	0 %	253754687
1043	NC_012926	TTTA	2	8	49813	49820	25 %	75 %	0 %	0 %	253754688
1044	NC_012926	TTG	2	6	49892	49897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754688
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1053	NC_012926	GAT	3	9	50316	50324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754688
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1056	NC_012926	GCTT	2	8	50409	50416	0 %	50 %	25 %	25 %	253754688
1057	NC_012926	ATT	2	6	50440	50445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754688
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1063	NC_012926	ATT	2	6	50731	50736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754689
1064	NC_012926	GTA	2	6	50752	50757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754689
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1090	NC_012926	GATT	2	8	51712	51719	25 %	50 %	25 %	0 %	253754689
1091	NC_012926	CT	3	6	51742	51747	0 %	50 %	0 %	50 %	253754689
1092	NC_012926	TAG	2	6	51847	51852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754689
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1094	NC_012926	ATTT	2	8	51963	51970	25 %	75 %	0 %	0 %	253754689
1095	NC_012926	TCA	2	6	52145	52150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754689
1096	NC_012926	CAG	2	6	52152	52157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754689
1097	NC_012926	GA	3	6	52164	52169	50 %	0 %	50 %	0 %	253754689
1098	NC_012926	ATC	2	6	52171	52176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754689
1099	NC_012926	GACC	2	8	52234	52241	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_012926	AGTCTA	2	12	52242	52253	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1101	NC_012926	TAA	3	9	52262	52270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012926	TGA	2	6	52281	52286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_012926	ATAG	2	8	52302	52309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_012926	GAGAA	2	10	52310	52319	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_012926	AAAC	2	8	52322	52329	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_012926	GGA	2	6	52349	52354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_012926	AG	3	6	52361	52366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012926	GAA	2	6	52388	52393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_012926	AT	3	6	52405	52410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_012926	GAA	2	6	52444	52449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_012926	GAG	2	6	52484	52489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_012926	GAAT	2	8	52542	52549	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012926	TA	3	6	52720	52725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_012926	TGA	2	6	52933	52938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754690
1115	NC_012926	ACC	2	6	52985	52990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253754690
1116	NC_012926	TGG	2	6	53070	53075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754690
1117	NC_012926	GAG	2	6	53147	53152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754690
1118	NC_012926	CAT	2	6	53188	53193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754690
1119	NC_012926	GCC	2	6	53236	53241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253754690
1120	NC_012926	CGG	2	6	53367	53372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253754690
1121	NC_012926	GCT	2	6	53402	53407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754690
1122	NC_012926	TCG	2	6	53419	53424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754690
1123	NC_012926	AGA	2	6	53577	53582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754690
1124	NC_012926	GAG	2	6	53654	53659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754690
1125	NC_012926	GGA	2	6	53671	53676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754690
1126	NC_012926	CAG	2	6	53699	53704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754690
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