MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 43489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_012926	AAGTT	2	10	692554	692563	40 %	40 %	20 %	0 %	253755242
14003	NC_012926	ATG	2	6	692565	692570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755242
14004	NC_012926	GCT	2	6	692652	692657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755242
14005	NC_012926	AGT	2	6	692672	692677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755242
14006	NC_012926	GTT	2	6	692702	692707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253755242
14007	NC_012926	GAA	2	6	692754	692759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253755242
14008	NC_012926	AGA	2	6	692774	692779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253755242
14009	NC_012926	TGA	2	6	692833	692838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755242
14010	NC_012926	ATT	2	6	692868	692873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253755242
14011	NC_012926	GCA	2	6	692895	692900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253755242
14012	NC_012926	ACAG	2	8	693006	693013	50 %	0 %	25 %	25 %	253755242
14013	NC_012926	TGA	2	6	693083	693088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755242
14014	NC_012926	GAT	3	9	693126	693134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755242
14015	NC_012926	GCAGAT	2	12	693168	693179	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	253755242
14016	NC_012926	ATG	2	6	693181	693186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755242
14017	NC_012926	GGA	2	6	693246	693251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253755242
14018	NC_012926	ACG	2	6	693320	693325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253755242
14019	NC_012926	AGC	2	6	693374	693379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253755242
14020	NC_012926	AAT	2	6	693433	693438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253755242
14021	NC_012926	TCA	2	6	693454	693459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755243
14022	NC_012926	A	7	7	693552	693558	100 %	0 %	0 %	0 %	253755243
14023	NC_012926	A	6	6	693578	693583	100 %	0 %	0 %	0 %	253755243
14024	NC_012926	TCA	2	6	693606	693611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755243
14025	NC_012926	GAT	2	6	693752	693757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755243
14026	NC_012926	A	7	7	693767	693773	100 %	0 %	0 %	0 %	253755243
14027	NC_012926	CTT	3	9	693778	693786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253755243
14028	NC_012926	CCTC	2	8	693799	693806	0 %	25 %	0 %	75 %	253755243
14029	NC_012926	AG	3	6	693842	693847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_012926	TAAT	2	8	693866	693873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_012926	AAAATC	2	12	693882	693893	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14032	NC_012926	TTGAT	2	10	693907	693916	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_012926	TCTA	2	8	693927	693934	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14034	NC_012926	ATTC	2	8	694082	694089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14035	NC_012926	TAT	2	6	694160	694165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_012926	GGAT	2	8	694179	694186	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_012926	A	6	6	694237	694242	100 %	0 %	0 %	0 %	253755244
14038	NC_012926	GAA	2	6	694275	694280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253755244
14039	NC_012926	A	6	6	694291	694296	100 %	0 %	0 %	0 %	253755244
14040	NC_012926	TTCTTT	2	12	694297	694308	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	253755244
14041	NC_012926	GAA	2	6	694314	694319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253755244
14042	NC_012926	TAG	2	6	694338	694343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755244
14043	NC_012926	TAG	2	6	694381	694386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755244
14044	NC_012926	AG	3	6	694421	694426	50 %	0 %	50 %	0 %	253755244
14045	NC_012926	A	6	6	694470	694475	100 %	0 %	0 %	0 %	253755244
14046	NC_012926	CTA	2	6	694526	694531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755244
14047	NC_012926	ACAT	2	8	694556	694563	50 %	25 %	0 %	25 %	253755244
14048	NC_012926	A	6	6	694573	694578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_012926	A	7	7	694583	694589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_012926	AGG	2	6	694698	694703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_012926	A	6	6	694720	694725	100 %	0 %	0 %	0 %	253755245
14052	NC_012926	CCA	2	6	694777	694782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253755245
14053	NC_012926	CAT	2	6	694815	694820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755245
14054	NC_012926	ATC	2	6	694870	694875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755245
14055	NC_012926	AGT	2	6	694878	694883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755245
14056	NC_012926	TCA	2	6	694916	694921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755245
14057	NC_012926	ACC	2	6	694929	694934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253755245
14058	NC_012926	GCT	2	6	694936	694941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755245
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14060	NC_012926	CAAA	2	8	694988	694995	75 %	0 %	0 %	25 %	253755245
14061	NC_012926	A	7	7	695186	695192	100 %	0 %	0 %	0 %	253755246
14062	NC_012926	TGC	2	6	695206	695211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755246
14063	NC_012926	A	6	6	695217	695222	100 %	0 %	0 %	0 %	253755246
14064	NC_012926	AGA	2	6	695248	695253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253755246
14065	NC_012926	AACT	2	8	695275	695282	50 %	25 %	0 %	25 %	253755246
14066	NC_012926	ACGT	2	8	695331	695338	25 %	25 %	25 %	25 %	253755246
14067	NC_012926	CAA	2	6	695348	695353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253755246
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14070	NC_012926	AGA	2	6	695431	695436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253755246
14071	NC_012926	GCT	2	6	695444	695449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755246
14072	NC_012926	TTG	2	6	695460	695465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253755246
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14074	NC_012926	GTT	2	6	695516	695521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253755246
14075	NC_012926	ATG	2	6	695537	695542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755246
14076	NC_012926	TGT	2	6	695545	695550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253755246
14077	NC_012926	GGT	2	6	695651	695656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253755246
14078	NC_012926	GCTAAA	2	12	695768	695779	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	253755246
14079	NC_012926	CAGCTA	2	12	695781	695792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	253755246
14080	NC_012926	ACA	3	9	695822	695830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253755246
14081	NC_012926	T	7	7	695898	695904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_012926	AGAA	2	8	695989	695996	75 %	0 %	25 %	0 %	253755247
14083	NC_012926	A	6	6	696064	696069	100 %	0 %	0 %	0 %	253755247
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14086	NC_012926	CAG	2	6	696348	696353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253755248
14087	NC_012926	GA	3	6	696384	696389	50 %	0 %	50 %	0 %	253755248
14088	NC_012926	TAT	2	6	696439	696444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253755248
14089	NC_012926	GGA	2	6	696448	696453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253755248
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14091	NC_012926	TTG	2	6	696537	696542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253755248
14092	NC_012926	ATT	2	6	696579	696584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253755248
14093	NC_012926	TGG	2	6	696733	696738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253755248
14094	NC_012926	TTC	2	6	696752	696757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253755248
14095	NC_012926	AT	3	6	696856	696861	50 %	50 %	0 %	0 %	253755248
14096	NC_012926	AGCTC	2	10	697003	697012	20 %	20 %	20 %	40 %	253755248
14097	NC_012926	TAAT	2	8	697057	697064	50 %	50 %	0 %	0 %	253755248
14098	NC_012926	TGGG	2	8	697081	697088	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_012926	TAA	2	6	697163	697168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_012926	GCA	2	6	697233	697238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253755249
14101	NC_012926	GGCTT	2	10	697267	697276	0 %	40 %	40 %	20 %	253755249
14102	NC_012926	CTG	2	6	697283	697288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755249
14103	NC_012926	CTT	2	6	697407	697412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253755249
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14105	NC_012926	TTC	2	6	697513	697518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253755249
14106	NC_012926	GAAA	2	8	697599	697606	75 %	0 %	25 %	0 %	253755249
14107	NC_012926	TAGTC	2	10	697626	697635	20 %	40 %	20 %	20 %	253755249
14108	NC_012926	CT	3	6	697640	697645	0 %	50 %	0 %	50 %	253755249
14109	NC_012926	T	6	6	697677	697682	0 %	100 %	0 %	0 %	253755249
14110	NC_012926	CAGC	2	8	697716	697723	25 %	0 %	25 %	50 %	253755249
14111	NC_012926	GCA	2	6	697759	697764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253755249
14112	NC_012926	TTATGA	2	12	697769	697780	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	253755249
14113	NC_012926	GAT	2	6	697842	697847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755249
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14116	NC_012926	AT	3	6	698097	698102	50 %	50 %	0 %	0 %	253755249
14117	NC_012926	GAT	3	9	698127	698135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755249
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14119	NC_012926	GGC	2	6	698211	698216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253755249
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14237	NC_012926	AAAC	2	8	704241	704248	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14241	NC_012926	TA	3	6	704661	704666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14242	NC_012926	A	6	6	704666	704671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14243	NC_012926	TGT	2	6	704683	704688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14462	NC_012926	GA	3	6	715539	715544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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