MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 42519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37002	NC_012924	AT	3	6	1815539	1815544	50 %	50 %	0 %	0 %	253752575
37003	NC_012924	TGAA	2	8	1815556	1815563	50 %	25 %	25 %	0 %	253752575
37004	NC_012924	TGG	2	6	1815632	1815637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752575
37005	NC_012924	TCA	2	6	1815648	1815653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752575
37006	NC_012924	T	6	6	1815697	1815702	0 %	100 %	0 %	0 %	253752575
37007	NC_012924	TCC	2	6	1815722	1815727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752575
37008	NC_012924	TCA	2	6	1815728	1815733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752575
37009	NC_012924	CATTGC	2	12	1815744	1815755	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	253752575
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37011	NC_012924	GAG	2	6	1815930	1815935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253752575
37012	NC_012924	ATA	2	6	1815964	1815969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752575
37013	NC_012924	CTT	2	6	1815994	1815999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752575
37014	NC_012924	TGA	2	6	1816047	1816052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752575
37015	NC_012924	ATC	2	6	1816057	1816062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752575
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37017	NC_012924	AT	3	6	1816106	1816111	50 %	50 %	0 %	0 %	253752575
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37040	NC_012924	CT	3	6	1817349	1817354	0 %	50 %	0 %	50 %	253752576
37041	NC_012924	ATC	2	6	1817367	1817372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752576
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37047	NC_012924	TA	3	6	1817813	1817818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37048	NC_012924	TTA	2	6	1817835	1817840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37049	NC_012924	A	7	7	1817846	1817852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37053	NC_012924	CCTC	2	8	1818093	1818100	0 %	25 %	0 %	75 %	253752577
37054	NC_012924	CAATC	2	10	1818206	1818215	40 %	20 %	0 %	40 %	253752577
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37106	NC_012924	TCCTT	2	10	1821492	1821501	0 %	60 %	0 %	40 %	253752578
37107	NC_012924	GTA	2	6	1821515	1821520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752578
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37117	NC_012924	T	6	6	1822127	1822132	0 %	100 %	0 %	0 %	253752578
37118	NC_012924	GAAC	2	8	1822314	1822321	50 %	0 %	25 %	25 %	253752578
37119	NC_012924	GAGG	2	8	1822327	1822334	25 %	0 %	75 %	0 %	253752578
37120	NC_012924	AGA	2	6	1822349	1822354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752578
37121	NC_012924	ATA	2	6	1822400	1822405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752578
37122	NC_012924	CAT	2	6	1822411	1822416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752578
37123	NC_012924	TTC	2	6	1822458	1822463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752578
37124	NC_012924	AAAATC	2	12	1822544	1822555	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	253752578
37125	NC_012924	GCT	2	6	1822563	1822568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752578
37126	NC_012924	CAA	2	6	1822576	1822581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752578
37127	NC_012924	AAGC	2	8	1822661	1822668	50 %	0 %	25 %	25 %	253752578
37128	NC_012924	CTT	2	6	1822675	1822680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752578
37129	NC_012924	CCT	2	6	1822740	1822745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752578
37130	NC_012924	TGG	2	6	1822789	1822794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752578
37131	NC_012924	AG	3	6	1822848	1822853	50 %	0 %	50 %	0 %	253752578
37132	NC_012924	CAT	2	6	1822870	1822875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752578
37133	NC_012924	GCA	2	6	1822890	1822895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752578
37134	NC_012924	CAC	2	6	1822903	1822908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752578
37135	NC_012924	CCA	2	6	1822919	1822924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752578
37136	NC_012924	ATTCC	2	10	1822961	1822970	20 %	40 %	0 %	40 %	253752578
37137	NC_012924	T	6	6	1823003	1823008	0 %	100 %	0 %	0 %	253752578
37138	NC_012924	TTGG	2	8	1823115	1823122	0 %	50 %	50 %	0 %	253752578
37139	NC_012924	AGA	2	6	1823143	1823148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752578
37140	NC_012924	ATTCTC	2	12	1823150	1823161	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	253752578
37141	NC_012924	AATTTC	2	12	1823226	1823237	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	253752578
37142	NC_012924	TCA	2	6	1823244	1823249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752578
37143	NC_012924	TCCT	2	8	1823423	1823430	0 %	50 %	0 %	50 %	253752578
37144	NC_012924	CAT	2	6	1823500	1823505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752578
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37146	NC_012924	GTA	2	6	1823642	1823647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752578
37147	NC_012924	AGA	2	6	1823708	1823713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752578
37148	NC_012924	TAC	2	6	1823737	1823742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752578
37149	NC_012924	CT	3	6	1823965	1823970	0 %	50 %	0 %	50 %	253752578
37150	NC_012924	GAC	2	6	1823975	1823980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752578
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37152	NC_012924	ATC	3	9	1824026	1824034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752578
37153	NC_012924	CAAG	2	8	1824054	1824061	50 %	0 %	25 %	25 %	253752578
37154	NC_012924	GAA	2	6	1824153	1824158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752578
37155	NC_012924	TCT	2	6	1824237	1824242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752578
37156	NC_012924	CTA	2	6	1824243	1824248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752578
37157	NC_012924	CTG	2	6	1824298	1824303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752578
37158	NC_012924	CTT	2	6	1824319	1824324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752578
37159	NC_012924	GTTC	2	8	1824346	1824353	0 %	50 %	25 %	25 %	253752578
37160	NC_012924	AG	3	6	1824362	1824367	50 %	0 %	50 %	0 %	253752578
37161	NC_012924	TCC	2	6	1824528	1824533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37162	NC_012924	TCC	2	6	1824567	1824572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37163	NC_012924	TTA	2	6	1824639	1824644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37164	NC_012924	CTT	2	6	1824693	1824698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37165	NC_012924	TTTAG	2	10	1824718	1824727	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37166	NC_012924	A	6	6	1824735	1824740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37167	NC_012924	CTC	2	6	1824753	1824758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37168	NC_012924	ATT	2	6	1824772	1824777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752579
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37171	NC_012924	TGA	2	6	1825137	1825142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752579
37172	NC_012924	TCA	2	6	1825224	1825229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752580
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37174	NC_012924	CTT	3	9	1825315	1825323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752580
37175	NC_012924	CTT	2	6	1825363	1825368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752580
37176	NC_012924	TGC	2	6	1825436	1825441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752580
37177	NC_012924	ATC	3	9	1825448	1825456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752580
37178	NC_012924	GCT	2	6	1825461	1825466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752580
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37181	NC_012924	GATT	2	8	1825552	1825559	25 %	50 %	25 %	0 %	253752580
37182	NC_012924	CGG	2	6	1825599	1825604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253752580
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37185	NC_012924	CAT	2	6	1825705	1825710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752580
37186	NC_012924	AGT	2	6	1825738	1825743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752580
37187	NC_012924	CAC	3	9	1825816	1825824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752580
37188	NC_012924	GAC	2	6	1825891	1825896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752580
37189	NC_012924	TTG	2	6	1826034	1826039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752580
37190	NC_012924	TCAA	2	8	1826115	1826122	50 %	25 %	0 %	25 %	253752580
37191	NC_012924	GAT	2	6	1826138	1826143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752580
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37193	NC_012924	CAT	2	6	1826323	1826328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752580
37194	NC_012924	GCG	2	6	1826348	1826353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253752580
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37197	NC_012924	ATC	2	6	1826590	1826595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752581
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37199	NC_012924	ATGGCC	2	12	1826724	1826735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253752582
37200	NC_012924	AAG	2	6	1826742	1826747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752582
37201	NC_012924	CATT	2	8	1826787	1826794	25 %	50 %	0 %	25 %	253752582
37202	NC_012924	TGG	2	6	1826799	1826804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752582
37203	NC_012924	ACC	2	6	1826892	1826897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752582
37204	NC_012924	GAAA	2	8	1826944	1826951	75 %	0 %	25 %	0 %	253752582
37205	NC_012924	AGCAG	2	10	1827024	1827033	40 %	0 %	40 %	20 %	253752582
37206	NC_012924	AGAGC	2	10	1827093	1827102	40 %	0 %	40 %	20 %	253752582
37207	NC_012924	AGGA	2	8	1827104	1827111	50 %	0 %	50 %	0 %	253752582
37208	NC_012924	AGCG	2	8	1827125	1827132	25 %	0 %	50 %	25 %	253752582
37209	NC_012924	ACC	2	6	1827311	1827316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752582
37210	NC_012924	AGCT	2	8	1827329	1827336	25 %	25 %	25 %	25 %	253752582
37211	NC_012924	ATC	2	6	1827375	1827380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752582
37212	NC_012924	CCA	3	9	1827396	1827404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752582
37213	NC_012924	TTC	2	6	1827452	1827457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752582
37214	NC_012924	TAG	2	6	1827458	1827463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752582
37215	NC_012924	CTT	2	6	1827473	1827478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37216	NC_012924	CGA	2	6	1827490	1827495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752583
37217	NC_012924	TGGC	2	8	1827500	1827507	0 %	25 %	50 %	25 %	253752583
37218	NC_012924	TC	3	6	1827509	1827514	0 %	50 %	0 %	50 %	253752583
37219	NC_012924	ATGA	2	8	1827562	1827569	50 %	25 %	25 %	0 %	253752583
37220	NC_012924	TCT	2	6	1827570	1827575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752583
37221	NC_012924	CTG	2	6	1827633	1827638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752583
37222	NC_012924	ACA	2	6	1827653	1827658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752583
37223	NC_012924	GCA	3	9	1827659	1827667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752583
37224	NC_012924	TCC	2	6	1827778	1827783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752583
37225	NC_012924	ACTG	2	8	1827927	1827934	25 %	25 %	25 %	25 %	253752583
37226	NC_012924	TAA	2	6	1827946	1827951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752583
37227	NC_012924	GA	4	8	1827978	1827985	50 %	0 %	50 %	0 %	253752583
37228	NC_012924	AGC	2	6	1827991	1827996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752583
37229	NC_012924	TGC	2	6	1828045	1828050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752583
37230	NC_012924	TCTTTT	2	12	1828055	1828066	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	253752583
37231	NC_012924	CCA	2	6	1828087	1828092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752583
37232	NC_012924	ATT	2	6	1828153	1828158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752584
37233	NC_012924	T	6	6	1828157	1828162	0 %	100 %	0 %	0 %	253752584
37234	NC_012924	TTA	2	6	1828194	1828199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752584
37235	NC_012924	T	6	6	1828202	1828207	0 %	100 %	0 %	0 %	253752584
37236	NC_012924	GAC	2	6	1828225	1828230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752584
37237	NC_012924	AGA	2	6	1828287	1828292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752584
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37258	NC_012924	TCA	2	6	1829397	1829402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752584
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37461	NC_012924	T	6	6	1838681	1838686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37474	NC_012924	CTTG	2	8	1839391	1839398	0 %	50 %	25 %	25 %	253752593
37475	NC_012924	AT	3	6	1839491	1839496	50 %	50 %	0 %	0 %	253752594
37476	NC_012924	TGCT	2	8	1839499	1839506	0 %	50 %	25 %	25 %	253752594
37477	NC_012924	TGA	2	6	1839554	1839559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752594
37478	NC_012924	GCTG	2	8	1839587	1839594	0 %	25 %	50 %	25 %	253752594
37479	NC_012924	CTA	2	6	1839603	1839608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752594
37480	NC_012924	AAG	2	6	1839660	1839665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752594
37481	NC_012924	GCA	2	6	1839731	1839736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752594
37482	NC_012924	A	6	6	1839751	1839756	100 %	0 %	0 %	0 %	253752594
37483	NC_012924	ATC	2	6	1839782	1839787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752594
37484	NC_012924	GGT	2	6	1839833	1839838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752594
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37488	NC_012924	T	6	6	1839920	1839925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37489	NC_012924	TCTG	2	8	1839965	1839972	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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37494	NC_012924	TTCT	2	8	1840376	1840383	0 %	75 %	0 %	25 %	253752595
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37499	NC_012924	ATG	2	6	1840615	1840620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752595
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