MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 42519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_012924	AAG	2	6	1764108	1764113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752529
36003	NC_012924	ACCT	2	8	1764229	1764236	25 %	25 %	0 %	50 %	253752530
36004	NC_012924	CGG	2	6	1764328	1764333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253752530
36005	NC_012924	CCT	2	6	1764362	1764367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752530
36006	NC_012924	TTC	2	6	1764436	1764441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752530
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36009	NC_012924	ACT	2	6	1764506	1764511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752530
36010	NC_012924	ATA	2	6	1764533	1764538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752530
36011	NC_012924	TGT	2	6	1764610	1764615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752530
36012	NC_012924	AAT	3	9	1764628	1764636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752530
36013	NC_012924	ACAAG	2	10	1764646	1764655	60 %	0 %	20 %	20 %	253752530
36014	NC_012924	AAT	2	6	1764664	1764669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752530
36015	NC_012924	ACC	2	6	1764685	1764690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752530
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36017	NC_012924	TCA	2	6	1764815	1764820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752530
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36019	NC_012924	CAAT	2	8	1764927	1764934	50 %	25 %	0 %	25 %	253752530
36020	NC_012924	ATG	2	6	1764995	1765000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752530
36021	NC_012924	T	7	7	1765058	1765064	0 %	100 %	0 %	0 %	253752530
36022	NC_012924	ATC	2	6	1765102	1765107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752530
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36024	NC_012924	TCAA	2	8	1765202	1765209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36025	NC_012924	TA	3	6	1765261	1765266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36026	NC_012924	ACT	2	6	1765267	1765272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36027	NC_012924	A	6	6	1765326	1765331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36028	NC_012924	TTC	2	6	1765403	1765408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36029	NC_012924	TAG	2	6	1765424	1765429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36030	NC_012924	CTA	2	6	1765453	1765458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36031	NC_012924	A	6	6	1765494	1765499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36032	NC_012924	TCT	2	6	1765532	1765537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36033	NC_012924	ATT	2	6	1765543	1765548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752531
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36036	NC_012924	TGCT	2	8	1765694	1765701	0 %	50 %	25 %	25 %	253752531
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36102	NC_012924	A	7	7	1768787	1768793	100 %	0 %	0 %	0 %	253752532
36103	NC_012924	T	7	7	1768823	1768829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36104	NC_012924	GAGT	2	8	1768876	1768883	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36105	NC_012924	AGA	2	6	1768949	1768954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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36120	NC_012924	GTC	2	6	1769552	1769557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752533
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36139	NC_012924	T	6	6	1770539	1770544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36140	NC_012924	ATTTC	2	10	1770568	1770577	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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36143	NC_012924	TTC	2	6	1770668	1770673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36144	NC_012924	TTGG	2	8	1770686	1770693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36145	NC_012924	TTCA	2	8	1770805	1770812	25 %	50 %	0 %	25 %	253752534
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36224	NC_012924	TTAA	2	8	1774994	1775001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36227	NC_012924	T	7	7	1775073	1775079	0 %	100 %	0 %	0 %	253752538
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36234	NC_012924	AAGA	2	8	1775291	1775298	75 %	0 %	25 %	0 %	253752538
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36236	NC_012924	GAT	2	6	1775355	1775360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752538
36237	NC_012924	T	6	6	1775388	1775393	0 %	100 %	0 %	0 %	253752538
36238	NC_012924	CGA	2	6	1775408	1775413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752538
36239	NC_012924	ATG	2	6	1775414	1775419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752538
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36241	NC_012924	AAT	2	6	1775452	1775457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752538
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36243	NC_012924	CGC	2	6	1775602	1775607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253752538
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36268	NC_012924	TCA	2	6	1776976	1776981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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36270	NC_012924	ATTG	2	8	1776992	1776999	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36271	NC_012924	CATA	2	8	1777015	1777022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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36335	NC_012924	AGA	2	6	1780365	1780370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36336	NC_012924	TTAC	2	8	1780374	1780381	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36337	NC_012924	T	7	7	1780401	1780407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36338	NC_012924	A	8	8	1780413	1780420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36339	NC_012924	ATCA	2	8	1780510	1780517	50 %	25 %	0 %	25 %	253752543
36340	NC_012924	TTTTC	2	10	1780629	1780638	0 %	80 %	0 %	20 %	253752543
36341	NC_012924	ACA	2	6	1780652	1780657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752543
36342	NC_012924	CTTT	2	8	1780693	1780700	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36343	NC_012924	T	6	6	1780698	1780703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36344	NC_012924	T	6	6	1780759	1780764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36345	NC_012924	CAT	2	6	1780767	1780772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752544
36346	NC_012924	GAT	2	6	1780785	1780790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752544
36347	NC_012924	GGAA	2	8	1780833	1780840	50 %	0 %	50 %	0 %	253752544
36348	NC_012924	CCT	2	6	1780854	1780859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752544
36349	NC_012924	ATT	2	6	1780868	1780873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752544
36350	NC_012924	TTGG	2	8	1780889	1780896	0 %	50 %	50 %	0 %	253752544
36351	NC_012924	CGAAT	2	10	1780956	1780965	40 %	20 %	20 %	20 %	253752544
36352	NC_012924	GTT	2	6	1780993	1780998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752544
36353	NC_012924	GCTTCT	2	12	1781034	1781045	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	253752544
36354	NC_012924	GCT	2	6	1781046	1781051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752544
36355	NC_012924	TCAT	2	8	1781124	1781131	25 %	50 %	0 %	25 %	253752544
36356	NC_012924	ATAAC	2	10	1781184	1781193	60 %	20 %	0 %	20 %	253752544
36357	NC_012924	TCT	2	6	1781208	1781213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752544
36358	NC_012924	ATT	2	6	1781366	1781371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752544
36359	NC_012924	CATT	2	8	1781398	1781405	25 %	50 %	0 %	25 %	253752544
36360	NC_012924	T	6	6	1781533	1781538	0 %	100 %	0 %	0 %	253752544
36361	NC_012924	AAT	2	6	1781558	1781563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752544
36362	NC_012924	CTG	2	6	1781573	1781578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752544
36363	NC_012924	AATCAA	2	12	1781603	1781614	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	253752544
36364	NC_012924	CCT	2	6	1781677	1781682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752545
36365	NC_012924	AT	3	6	1781835	1781840	50 %	50 %	0 %	0 %	253752545
36366	NC_012924	ATC	2	6	1781855	1781860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752545
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36370	NC_012924	TTA	2	6	1781994	1781999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752545
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36382	NC_012924	TGC	2	6	1782530	1782535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752545
36383	NC_012924	TCC	2	6	1782587	1782592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752545
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36385	NC_012924	TCA	2	6	1782735	1782740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752545
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36388	NC_012924	TAAA	2	8	1782815	1782822	75 %	25 %	0 %	0 %	253752545
36389	NC_012924	GTAC	2	8	1782870	1782877	25 %	25 %	25 %	25 %	253752545
36390	NC_012924	T	6	6	1782915	1782920	0 %	100 %	0 %	0 %	253752545
36391	NC_012924	TTTC	2	8	1782943	1782950	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36392	NC_012924	TATT	2	8	1782953	1782960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36393	NC_012924	TAT	3	9	1782997	1783005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36394	NC_012924	T	6	6	1783027	1783032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36395	NC_012924	T	7	7	1783034	1783040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36396	NC_012924	ATGA	2	8	1783050	1783057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36397	NC_012924	A	6	6	1783076	1783081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36398	NC_012924	A	6	6	1783113	1783118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36399	NC_012924	TCC	2	6	1783190	1783195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36400	NC_012924	CCA	2	6	1783199	1783204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36401	NC_012924	CGT	2	6	1783234	1783239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752546
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36422	NC_012924	TTA	2	6	1784361	1784366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36449	NC_012924	ATCAAT	2	12	1785620	1785631	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	253752548
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36459	NC_012924	TGA	2	6	1786337	1786342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752548
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36461	NC_012924	CAT	2	6	1786426	1786431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752548
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36463	NC_012924	TGGT	2	8	1786523	1786530	0 %	50 %	50 %	0 %	253752548
36464	NC_012924	TCC	2	6	1786556	1786561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36465	NC_012924	CTA	2	6	1786580	1786585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36466	NC_012924	GCTT	2	8	1786712	1786719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36467	NC_012924	TAG	2	6	1786736	1786741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36468	NC_012924	A	7	7	1786749	1786755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36469	NC_012924	TAT	2	6	1786777	1786782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752549
36470	NC_012924	CCAG	2	8	1786800	1786807	25 %	0 %	25 %	50 %	253752549
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36472	NC_012924	GAT	2	6	1786873	1786878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752549
36473	NC_012924	GTA	2	6	1786880	1786885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752549
36474	NC_012924	CCA	2	6	1786938	1786943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752549
36475	NC_012924	GCC	2	6	1787099	1787104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253752549
36476	NC_012924	GAT	2	6	1787365	1787370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752549
36477	NC_012924	TGG	2	6	1787451	1787456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752549
36478	NC_012924	AT	3	6	1787476	1787481	50 %	50 %	0 %	0 %	253752549
36479	NC_012924	TAA	2	6	1787583	1787588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752549
36480	NC_012924	AG	3	6	1787610	1787615	50 %	0 %	50 %	0 %	253752549
36481	NC_012924	CCT	2	6	1787679	1787684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752549
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36492	NC_012924	ACT	2	6	1787987	1787992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752550
36493	NC_012924	TGA	2	6	1788037	1788042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752550
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36496	NC_012924	ACT	2	6	1788228	1788233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752550
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36498	NC_012924	ATTG	2	8	1788379	1788386	25 %	50 %	25 %	0 %	253752550
36499	NC_012924	CAT	2	6	1788420	1788425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752550
36500	NC_012924	ATC	2	6	1788530	1788535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752550

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