MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 42519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_012924	CCAAG	2	10	1665220	1665229	40 %	0 %	20 %	40 %	253752441
34003	NC_012924	CAA	2	6	1665232	1665237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752441
34004	NC_012924	ATT	2	6	1665252	1665257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752441
34005	NC_012924	TCC	2	6	1665263	1665268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752442
34006	NC_012924	CAA	2	6	1665271	1665276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752442
34007	NC_012924	T	6	6	1665316	1665321	0 %	100 %	0 %	0 %	253752442
34008	NC_012924	CTT	2	6	1665480	1665485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752442
34009	NC_012924	CTT	2	6	1665501	1665506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752442
34010	NC_012924	CTGG	2	8	1665582	1665589	0 %	25 %	50 %	25 %	253752442
34011	NC_012924	CTT	2	6	1665648	1665653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752442
34012	NC_012924	ACC	2	6	1665718	1665723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752442
34013	NC_012924	CCAA	2	8	1665765	1665772	50 %	0 %	0 %	50 %	253752442
34014	NC_012924	CCCAG	2	10	1665777	1665786	20 %	0 %	20 %	60 %	253752442
34015	NC_012924	AACGA	2	10	1665826	1665835	60 %	0 %	20 %	20 %	253752442
34016	NC_012924	AGATGG	2	12	1665901	1665912	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	253752442
34017	NC_012924	TGG	2	6	1665932	1665937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752442
34018	NC_012924	CTG	2	6	1665978	1665983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752442
34019	NC_012924	GAC	2	6	1665984	1665989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752442
34020	NC_012924	AGCA	2	8	1666097	1666104	50 %	0 %	25 %	25 %	253752442
34021	NC_012924	TTG	2	6	1666123	1666128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752442
34022	NC_012924	T	7	7	1666159	1666165	0 %	100 %	0 %	0 %	253752442
34023	NC_012924	CTT	2	6	1666178	1666183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34024	NC_012924	CAA	2	6	1666224	1666229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34025	NC_012924	GCAG	2	8	1666233	1666240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34026	NC_012924	ACG	2	6	1666266	1666271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34027	NC_012924	TAA	2	6	1666272	1666277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34028	NC_012924	GCC	2	6	1666366	1666371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34029	NC_012924	AAGT	2	8	1666430	1666437	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34030	NC_012924	TA	4	8	1666462	1666469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34031	NC_012924	CTG	2	6	1666591	1666596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752443
34032	NC_012924	TGA	2	6	1666635	1666640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752443
34033	NC_012924	CTGT	2	8	1666729	1666736	0 %	50 %	25 %	25 %	253752443
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34037	NC_012924	ATA	2	6	1666892	1666897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752443
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34039	NC_012924	TTA	2	6	1667015	1667020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34040	NC_012924	ATT	2	6	1667076	1667081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34041	NC_012924	TGGCT	2	10	1667089	1667098	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34042	NC_012924	CTT	2	6	1667139	1667144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34043	NC_012924	TAG	2	6	1667257	1667262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752444
34044	NC_012924	TAC	2	6	1667275	1667280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752444
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34053	NC_012924	T	7	7	1667701	1667707	0 %	100 %	0 %	0 %	253752444
34054	NC_012924	TTC	2	6	1667803	1667808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752444
34055	NC_012924	TCA	2	6	1667825	1667830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752444
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34059	NC_012924	ACG	2	6	1667987	1667992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34060	NC_012924	TTTA	2	8	1668031	1668038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34061	NC_012924	A	6	6	1668094	1668099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34062	NC_012924	CTAT	2	8	1668113	1668120	25 %	50 %	0 %	25 %	253752445
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34064	NC_012924	CAT	2	6	1668205	1668210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752445
34065	NC_012924	TAT	2	6	1668211	1668216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752445
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34240	NC_012924	TAAA	2	8	1676867	1676874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34356	NC_012924	A	6	6	1681646	1681651	100 %	0 %	0 %	0 %	253752456
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34360	NC_012924	A	6	6	1681757	1681762	100 %	0 %	0 %	0 %	253752456
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34474	NC_012924	CTT	2	6	1687726	1687731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752461
34475	NC_012924	TCT	2	6	1687738	1687743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752461
34476	NC_012924	TCT	2	6	1687909	1687914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752461
34477	NC_012924	CGT	2	6	1688069	1688074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752461
34478	NC_012924	TTC	2	6	1688084	1688089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752461
34479	NC_012924	CCT	2	6	1688164	1688169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752461
34480	NC_012924	CT	3	6	1688282	1688287	0 %	50 %	0 %	50 %	253752461
34481	NC_012924	GTTT	2	8	1688301	1688308	0 %	75 %	25 %	0 %	253752461
34482	NC_012924	CCA	2	6	1688341	1688346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752461
34483	NC_012924	T	7	7	1688352	1688358	0 %	100 %	0 %	0 %	253752461
34484	NC_012924	T	7	7	1688367	1688373	0 %	100 %	0 %	0 %	253752461
34485	NC_012924	AGC	2	6	1688393	1688398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752461
34486	NC_012924	ATC	2	6	1688402	1688407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752461
34487	NC_012924	TCA	2	6	1688431	1688436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752461
34488	NC_012924	ACC	2	6	1688469	1688474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752461
34489	NC_012924	T	6	6	1688486	1688491	0 %	100 %	0 %	0 %	253752461
34490	NC_012924	TCC	2	6	1688499	1688504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752461
34491	NC_012924	AGT	2	6	1688632	1688637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752461
34492	NC_012924	GCA	2	6	1688688	1688693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752461
34493	NC_012924	ATT	2	6	1688783	1688788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752461
34494	NC_012924	AGACC	2	10	1688824	1688833	40 %	0 %	20 %	40 %	253752461
34495	NC_012924	TTGA	2	8	1688852	1688859	25 %	50 %	25 %	0 %	253752461
34496	NC_012924	CAT	2	6	1688882	1688887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752461
34497	NC_012924	GTGG	2	8	1688921	1688928	0 %	25 %	75 %	0 %	253752461
34498	NC_012924	TCA	2	6	1689018	1689023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752461
34499	NC_012924	CAT	2	6	1689043	1689048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752461
34500	NC_012924	ATC	2	6	1689053	1689058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752461

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