MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 42519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33502	NC_012924	TAA	2	6	1640997	1641002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752415
33503	NC_012924	ACT	2	6	1641010	1641015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752415
33504	NC_012924	TCA	2	6	1641038	1641043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752415
33505	NC_012924	ATC	2	6	1641049	1641054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752415
33506	NC_012924	ACCAG	2	10	1641125	1641134	40 %	0 %	20 %	40 %	253752415
33507	NC_012924	CAA	2	6	1641150	1641155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752415
33508	NC_012924	TAAA	2	8	1641177	1641184	75 %	25 %	0 %	0 %	253752415
33509	NC_012924	TCA	2	6	1641303	1641308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752416
33510	NC_012924	TCT	2	6	1641325	1641330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752416
33511	NC_012924	T	6	6	1641347	1641352	0 %	100 %	0 %	0 %	253752416
33512	NC_012924	TCT	2	6	1641358	1641363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752416
33513	NC_012924	CGG	2	6	1641420	1641425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253752416
33514	NC_012924	CAT	2	6	1641514	1641519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752416
33515	NC_012924	AAG	2	6	1641591	1641596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752416
33516	NC_012924	CAT	2	6	1641616	1641621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752416
33517	NC_012924	TGA	2	6	1641622	1641627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752416
33518	NC_012924	TGAC	2	8	1641630	1641637	25 %	25 %	25 %	25 %	253752416
33519	NC_012924	TGC	2	6	1641659	1641664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752416
33520	NC_012924	CAA	2	6	1641676	1641681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752416
33521	NC_012924	TTC	2	6	1641699	1641704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752416
33522	NC_012924	TCA	2	6	1641712	1641717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752416
33523	NC_012924	GGA	2	6	1641735	1641740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253752416
33524	NC_012924	T	6	6	1641977	1641982	0 %	100 %	0 %	0 %	253752416
33525	NC_012924	TCA	2	6	1642107	1642112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752416
33526	NC_012924	CAA	3	9	1642186	1642194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752416
33527	NC_012924	TAA	2	6	1642345	1642350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752416
33528	NC_012924	AAG	2	6	1642401	1642406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752416
33529	NC_012924	ACA	2	6	1642464	1642469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752416
33530	NC_012924	TTTC	2	8	1642513	1642520	0 %	75 %	0 %	25 %	253752416
33531	NC_012924	CCT	2	6	1642525	1642530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752416
33532	NC_012924	TAT	2	6	1642594	1642599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33533	NC_012924	AAT	2	6	1642679	1642684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752417
33534	NC_012924	CTTCT	2	10	1642694	1642703	0 %	60 %	0 %	40 %	253752417
33535	NC_012924	ATTT	2	8	1642757	1642764	25 %	75 %	0 %	0 %	253752417
33536	NC_012924	T	7	7	1642762	1642768	0 %	100 %	0 %	0 %	253752417
33537	NC_012924	TCCC	2	8	1642789	1642796	0 %	25 %	0 %	75 %	253752417
33538	NC_012924	CCT	2	6	1642824	1642829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752417
33539	NC_012924	ACC	2	6	1642838	1642843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752417
33540	NC_012924	T	6	6	1642970	1642975	0 %	100 %	0 %	0 %	253752417
33541	NC_012924	GAA	2	6	1643014	1643019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752417
33542	NC_012924	CTG	2	6	1643020	1643025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752417
33543	NC_012924	ACC	2	6	1643027	1643032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752417
33544	NC_012924	AAT	2	6	1643060	1643065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752417
33545	NC_012924	CCTTC	2	10	1643092	1643101	0 %	40 %	0 %	60 %	253752417
33546	NC_012924	CAA	2	6	1643104	1643109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752417
33547	NC_012924	TTG	2	6	1643141	1643146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752417
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33551	NC_012924	T	6	6	1643278	1643283	0 %	100 %	0 %	0 %	253752417
33552	NC_012924	CCG	2	6	1643317	1643322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253752417
33553	NC_012924	AAT	2	6	1643336	1643341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752417
33554	NC_012924	TTC	2	6	1643384	1643389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752417
33555	NC_012924	AGC	2	6	1643420	1643425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752417
33556	NC_012924	TTGA	2	8	1643462	1643469	25 %	50 %	25 %	0 %	253752417
33557	NC_012924	TCC	2	6	1643485	1643490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33558	NC_012924	TC	4	8	1643497	1643504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33559	NC_012924	C	9	9	1643512	1643520	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33560	NC_012924	A	7	7	1643539	1643545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33561	NC_012924	CTG	2	6	1643554	1643559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33562	NC_012924	ATG	2	6	1643605	1643610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752418
33563	NC_012924	TGA	2	6	1643695	1643700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752418
33564	NC_012924	ACG	2	6	1643721	1643726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752418
33565	NC_012924	T	6	6	1643742	1643747	0 %	100 %	0 %	0 %	253752418
33566	NC_012924	AGG	2	6	1643815	1643820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253752418
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33568	NC_012924	CCA	2	6	1643944	1643949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752418
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33570	NC_012924	AGA	2	6	1643968	1643973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752418
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33572	NC_012924	CCAG	2	8	1644092	1644099	25 %	0 %	25 %	50 %	253752418
33573	NC_012924	CTC	2	6	1644173	1644178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752418
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33576	NC_012924	ATTT	2	8	1644252	1644259	25 %	75 %	0 %	0 %	253752418
33577	NC_012924	CTA	2	6	1644293	1644298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752418
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33588	NC_012924	ATTT	2	8	1644747	1644754	25 %	75 %	0 %	0 %	253752419
33589	NC_012924	GTTG	2	8	1644771	1644778	0 %	50 %	50 %	0 %	253752419
33590	NC_012924	T	6	6	1644811	1644816	0 %	100 %	0 %	0 %	253752419
33591	NC_012924	CTT	2	6	1644993	1644998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752419
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33598	NC_012924	CTGTAT	2	12	1645347	1645358	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	253752419
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33600	NC_012924	TGC	2	6	1645604	1645609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752419
33601	NC_012924	ATT	2	6	1645729	1645734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752419
33602	NC_012924	TTG	2	6	1645800	1645805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752419
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33607	NC_012924	CCAG	2	8	1646132	1646139	25 %	0 %	25 %	50 %	253752419
33608	NC_012924	ATA	2	6	1646152	1646157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752419
33609	NC_012924	GCC	2	6	1646300	1646305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253752419
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33611	NC_012924	GAC	2	6	1646324	1646329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752419
33612	NC_012924	TTCAG	2	10	1646378	1646387	20 %	40 %	20 %	20 %	253752419
33613	NC_012924	GCT	2	6	1646397	1646402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752419
33614	NC_012924	CATAA	2	10	1646404	1646413	60 %	20 %	0 %	20 %	253752419
33615	NC_012924	T	6	6	1646488	1646493	0 %	100 %	0 %	0 %	253752419
33616	NC_012924	ATG	2	6	1646519	1646524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752419
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33738	NC_012924	ATC	2	6	1652565	1652570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752429
33739	NC_012924	TTG	2	6	1652655	1652660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752429
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33782	NC_012924	T	7	7	1654527	1654533	0 %	100 %	0 %	0 %	253752432
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33834	NC_012924	CAA	2	6	1656829	1656834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752433
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33843	NC_012924	ATCA	2	8	1657322	1657329	50 %	25 %	0 %	25 %	253752433
33844	NC_012924	GCT	2	6	1657380	1657385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752433
33845	NC_012924	TCC	2	6	1657439	1657444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33846	NC_012924	AAT	2	6	1657514	1657519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33847	NC_012924	ACAA	2	8	1657531	1657538	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33848	NC_012924	T	6	6	1657599	1657604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33849	NC_012924	TTA	2	6	1657643	1657648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752434
33850	NC_012924	AGC	2	6	1657656	1657661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752434
33851	NC_012924	TTGA	2	8	1657681	1657688	25 %	50 %	25 %	0 %	253752434
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33853	NC_012924	C	7	7	1657700	1657706	0 %	0 %	0 %	100 %	253752434
33854	NC_012924	TTTGCT	2	12	1657708	1657719	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	253752434
33855	NC_012924	CCCT	2	8	1657772	1657779	0 %	25 %	0 %	75 %	253752434
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33950	NC_012924	CTAT	2	8	1662507	1662514	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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33952	NC_012924	TAA	2	6	1662619	1662624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33953	NC_012924	TCA	2	6	1662631	1662636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33954	NC_012924	T	6	6	1662662	1662667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33955	NC_012924	T	6	6	1662683	1662688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33956	NC_012924	AAC	2	6	1662751	1662756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33957	NC_012924	A	7	7	1662901	1662907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33958	NC_012924	TAT	2	6	1662935	1662940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33959	NC_012924	ATC	2	6	1662962	1662967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752440
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33967	NC_012924	CGAT	2	8	1663185	1663192	25 %	25 %	25 %	25 %	253752440
33968	NC_012924	CCT	2	6	1663213	1663218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752441
33969	NC_012924	AG	3	6	1663279	1663284	50 %	0 %	50 %	0 %	253752441
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33971	NC_012924	TCT	2	6	1663395	1663400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752441
33972	NC_012924	GCA	3	9	1663422	1663430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752441
33973	NC_012924	GCTG	2	8	1663571	1663578	0 %	25 %	50 %	25 %	253752441
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33975	NC_012924	GCTG	2	8	1663692	1663699	0 %	25 %	50 %	25 %	253752441
33976	NC_012924	CCAA	2	8	1663769	1663776	50 %	0 %	0 %	50 %	253752441
33977	NC_012924	ACG	2	6	1663811	1663816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752441
33978	NC_012924	GAA	2	6	1663862	1663867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752441
33979	NC_012924	AGG	2	6	1663872	1663877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253752441
33980	NC_012924	CTG	2	6	1663939	1663944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752441
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33994	NC_012924	GCTG	2	8	1664877	1664884	0 %	25 %	50 %	25 %	253752441
33995	NC_012924	GTC	2	6	1664952	1664957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752441
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33999	NC_012924	CTG	2	6	1665062	1665067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752441
34000	NC_012924	GGCGT	2	10	1665100	1665109	0 %	20 %	60 %	20 %	253752441

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