MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 42519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_012924	CCA	2	6	1514092	1514097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752286
31003	NC_012924	TAGG	2	8	1514210	1514217	25 %	25 %	50 %	0 %	253752286
31004	NC_012924	TTGC	2	8	1514235	1514242	0 %	50 %	25 %	25 %	253752286
31005	NC_012924	GTCTG	2	10	1514252	1514261	0 %	40 %	40 %	20 %	253752286
31006	NC_012924	CAC	2	6	1514349	1514354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752286
31007	NC_012924	A	7	7	1514362	1514368	100 %	0 %	0 %	0 %	253752286
31008	NC_012924	GAA	2	6	1514391	1514396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752286
31009	NC_012924	GAA	2	6	1514415	1514420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752286
31010	NC_012924	CGCAT	2	10	1514425	1514434	20 %	20 %	20 %	40 %	253752286
31011	NC_012924	CGTT	2	8	1514459	1514466	0 %	50 %	25 %	25 %	253752286
31012	NC_012924	AT	3	6	1514477	1514482	50 %	50 %	0 %	0 %	253752286
31013	NC_012924	AAG	2	6	1514518	1514523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752286
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31015	NC_012924	TTC	3	9	1514544	1514552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752286
31016	NC_012924	ATA	2	6	1514577	1514582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752286
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31018	NC_012924	TACT	2	8	1514638	1514645	25 %	50 %	0 %	25 %	253752286
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31021	NC_012924	ATCC	2	8	1514874	1514881	25 %	25 %	0 %	50 %	253752286
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31033	NC_012924	AGAT	2	8	1515550	1515557	50 %	25 %	25 %	0 %	253752286
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31045	NC_012924	TGA	2	6	1516143	1516148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752287
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31055	NC_012924	CGA	2	6	1516538	1516543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752287
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31057	NC_012924	AG	3	6	1516746	1516751	50 %	0 %	50 %	0 %	253752287
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31063	NC_012924	CT	3	6	1517086	1517091	0 %	50 %	0 %	50 %	253752288
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31084	NC_012924	TC	3	6	1518023	1518028	0 %	50 %	0 %	50 %	253752289
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31089	NC_012924	AAG	2	6	1518541	1518546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752289
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31091	NC_012924	TAT	2	6	1518587	1518592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31092	NC_012924	AAG	2	6	1518636	1518641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31102	NC_012924	ATG	2	6	1519211	1519216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752290
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31105	NC_012924	GCA	2	6	1519277	1519282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752290
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31107	NC_012924	A	6	6	1519352	1519357	100 %	0 %	0 %	0 %	253752290
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31118	NC_012924	TCT	2	6	1519942	1519947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752291
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31142	NC_012924	A	6	6	1521148	1521153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31145	NC_012924	T	6	6	1521222	1521227	0 %	100 %	0 %	0 %	253752292
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31182	NC_012924	TAGA	2	8	1523345	1523352	50 %	25 %	25 %	0 %	253752293
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31209	NC_012924	CTA	2	6	1524699	1524704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31213	NC_012924	A	7	7	1524781	1524787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31214	NC_012924	TTA	2	6	1524832	1524837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31216	NC_012924	TCT	3	9	1525088	1525096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752296
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31218	NC_012924	TCT	2	6	1525238	1525243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752296
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31224	NC_012924	T	7	7	1525486	1525492	0 %	100 %	0 %	0 %	253752296
31225	NC_012924	T	7	7	1525497	1525503	0 %	100 %	0 %	0 %	253752296
31226	NC_012924	AG	3	6	1525519	1525524	50 %	0 %	50 %	0 %	253752297
31227	NC_012924	GA	3	6	1525527	1525532	50 %	0 %	50 %	0 %	253752297
31228	NC_012924	CCG	2	6	1525554	1525559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253752297
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31230	NC_012924	AG	3	6	1525744	1525749	50 %	0 %	50 %	0 %	253752297
31231	NC_012924	T	6	6	1525814	1525819	0 %	100 %	0 %	0 %	253752297
31232	NC_012924	CAA	3	9	1525820	1525828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752297
31233	NC_012924	AT	3	6	1525833	1525838	50 %	50 %	0 %	0 %	253752297
31234	NC_012924	CCG	2	6	1525846	1525851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253752297
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31237	NC_012924	TCT	2	6	1525896	1525901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31238	NC_012924	AGA	2	6	1525926	1525931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752298
31239	NC_012924	TCT	2	6	1525935	1525940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752298
31240	NC_012924	ATA	2	6	1525957	1525962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752298
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31272	NC_012924	TAT	2	6	1527637	1527642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31273	NC_012924	TTCT	2	8	1527704	1527711	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31274	NC_012924	CTTC	2	8	1527758	1527765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31275	NC_012924	TA	3	6	1527797	1527802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31276	NC_012924	TACT	2	8	1527809	1527816	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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31331	NC_012924	TTC	2	6	1530717	1530722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752303
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31333	NC_012924	A	7	7	1530780	1530786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31334	NC_012924	AAGT	2	8	1530818	1530825	50 %	25 %	25 %	0 %	253752304
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31339	NC_012924	TCT	2	6	1531016	1531021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752304
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31341	NC_012924	A	6	6	1531131	1531136	100 %	0 %	0 %	0 %	253752304
31342	NC_012924	ACC	2	6	1531140	1531145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752304
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31345	NC_012924	TTG	2	6	1531351	1531356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31346	NC_012924	CGTTTG	2	12	1531373	1531384	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31347	NC_012924	GACCA	2	10	1531402	1531411	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31348	NC_012924	GAT	2	6	1531579	1531584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31349	NC_012924	T	6	6	1531614	1531619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31350	NC_012924	GCT	2	6	1531641	1531646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31351	NC_012924	CTGC	2	8	1531785	1531792	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31352	NC_012924	ATTGAC	2	12	1531939	1531950	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31353	NC_012924	ACC	2	6	1531964	1531969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31354	NC_012924	CAGA	2	8	1531995	1532002	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31355	NC_012924	CGG	2	6	1532090	1532095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31356	NC_012924	CTA	2	6	1532178	1532183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31357	NC_012924	CTG	2	6	1532322	1532327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752305
31358	NC_012924	AGCCA	2	10	1532338	1532347	40 %	0 %	20 %	40 %	253752305
31359	NC_012924	GGGAGA	2	12	1532393	1532404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253752305
31360	NC_012924	CTT	2	6	1532457	1532462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752305
31361	NC_012924	GCT	2	6	1532474	1532479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752305
31362	NC_012924	CTGA	2	8	1532565	1532572	25 %	25 %	25 %	25 %	253752305
31363	NC_012924	TTCC	2	8	1532734	1532741	0 %	50 %	0 %	50 %	253752305
31364	NC_012924	TTC	2	6	1532827	1532832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752305
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31368	NC_012924	TCT	2	6	1533115	1533120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31369	NC_012924	TCAA	2	8	1533143	1533150	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31370	NC_012924	AAT	2	6	1533156	1533161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31371	NC_012924	TACT	2	8	1533212	1533219	25 %	50 %	0 %	25 %	253752306
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31377	NC_012924	AAAG	2	8	1533392	1533399	75 %	0 %	25 %	0 %	253752306
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31395	NC_012924	TA	4	8	1534319	1534326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31396	NC_012924	TATC	2	8	1534351	1534358	25 %	50 %	0 %	25 %	253752308
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31415	NC_012924	TCCT	2	8	1535274	1535281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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31446	NC_012924	AGT	2	6	1536818	1536823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31475	NC_012924	T	6	6	1538031	1538036	0 %	100 %	0 %	0 %	253752311
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31477	NC_012924	CCA	2	6	1538073	1538078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752311
31478	NC_012924	TA	3	6	1538174	1538179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31479	NC_012924	TA	3	6	1538222	1538227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31480	NC_012924	TC	3	6	1538239	1538244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31481	NC_012924	TCA	2	6	1538246	1538251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752312
31482	NC_012924	TC	3	6	1538310	1538315	0 %	50 %	0 %	50 %	253752312
31483	NC_012924	AGA	2	6	1538338	1538343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752312
31484	NC_012924	AAT	2	6	1538487	1538492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752312
31485	NC_012924	TCA	2	6	1538502	1538507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752312
31486	NC_012924	ATA	2	6	1538562	1538567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752312
31487	NC_012924	CATTC	2	10	1538573	1538582	20 %	40 %	0 %	40 %	253752312
31488	NC_012924	AT	3	6	1538596	1538601	50 %	50 %	0 %	0 %	253752312
31489	NC_012924	CTG	2	6	1538650	1538655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752312
31490	NC_012924	TCT	2	6	1538706	1538711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752312
31491	NC_012924	CTTT	2	8	1538820	1538827	0 %	75 %	0 %	25 %	253752312
31492	NC_012924	AGAC	2	8	1538842	1538849	50 %	0 %	25 %	25 %	253752312
31493	NC_012924	ATA	2	6	1539025	1539030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752313
31494	NC_012924	GCT	2	6	1539064	1539069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752313
31495	NC_012924	GCTT	2	8	1539074	1539081	0 %	50 %	25 %	25 %	253752313
31496	NC_012924	CGA	2	6	1539188	1539193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752313
31497	NC_012924	T	6	6	1539196	1539201	0 %	100 %	0 %	0 %	253752313
31498	NC_012924	CCG	2	6	1539268	1539273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253752313
31499	NC_012924	ACC	2	6	1539288	1539293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752313
31500	NC_012924	AGT	2	6	1539380	1539385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752313

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