MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 42519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_012924	CAAC	2	8	1239930	1239937	50 %	0 %	0 %	50 %	253752021
25503	NC_012924	CAA	2	6	1239957	1239962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752021
25504	NC_012924	TAAG	2	8	1240016	1240023	50 %	25 %	25 %	0 %	253752021
25505	NC_012924	GAT	2	6	1240053	1240058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752021
25506	NC_012924	TA	3	6	1240062	1240067	50 %	50 %	0 %	0 %	253752021
25507	NC_012924	CCA	2	6	1240103	1240108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752021
25508	NC_012924	ATA	2	6	1240115	1240120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752021
25509	NC_012924	T	7	7	1240137	1240143	0 %	100 %	0 %	0 %	253752021
25510	NC_012924	T	7	7	1240154	1240160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25511	NC_012924	T	6	6	1240162	1240167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25512	NC_012924	GT	3	6	1240168	1240173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25513	NC_012924	AGCAA	2	10	1240262	1240271	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25514	NC_012924	AC	3	6	1240295	1240300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25515	NC_012924	TCGCT	2	10	1240309	1240318	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25516	NC_012924	T	6	6	1240322	1240327	0 %	100 %	0 %	0 %	253752022
25517	NC_012924	GGTA	2	8	1240444	1240451	25 %	25 %	50 %	0 %	253752022
25518	NC_012924	TTC	2	6	1240476	1240481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752022
25519	NC_012924	TCT	2	6	1240486	1240491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752022
25520	NC_012924	TTCATG	2	12	1240563	1240574	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	253752022
25521	NC_012924	TCA	2	6	1240604	1240609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752022
25522	NC_012924	CTC	2	6	1240641	1240646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752022
25523	NC_012924	TGCC	2	8	1240701	1240708	0 %	25 %	25 %	50 %	253752022
25524	NC_012924	CTGCT	2	10	1240779	1240788	0 %	40 %	20 %	40 %	253752022
25525	NC_012924	GGT	2	6	1240855	1240860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752023
25526	NC_012924	CTT	2	6	1240885	1240890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752023
25527	NC_012924	AGT	2	6	1240969	1240974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752023
25528	NC_012924	CG	3	6	1241035	1241040	0 %	0 %	50 %	50 %	253752023
25529	NC_012924	GGTA	2	8	1241077	1241084	25 %	25 %	50 %	0 %	253752023
25530	NC_012924	CCG	2	6	1241136	1241141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253752023
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25532	NC_012924	GA	3	6	1241203	1241208	50 %	0 %	50 %	0 %	253752023
25533	NC_012924	ATT	2	6	1241216	1241221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752023
25534	NC_012924	AAG	2	6	1241241	1241246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752023
25535	NC_012924	T	6	6	1241272	1241277	0 %	100 %	0 %	0 %	253752023
25536	NC_012924	GCT	2	6	1241370	1241375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752023
25537	NC_012924	TTC	2	6	1241515	1241520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752024
25538	NC_012924	CCAA	2	8	1241607	1241614	50 %	0 %	0 %	50 %	253752024
25539	NC_012924	CGC	2	6	1241649	1241654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253752024
25540	NC_012924	TAAG	2	8	1241659	1241666	50 %	25 %	25 %	0 %	253752024
25541	NC_012924	TTG	2	6	1241669	1241674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752024
25542	NC_012924	CAT	2	6	1241736	1241741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752024
25543	NC_012924	TTC	2	6	1241797	1241802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752024
25544	NC_012924	CAA	2	6	1241835	1241840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752024
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25547	NC_012924	TTC	2	6	1241989	1241994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752024
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25551	NC_012924	ATA	2	6	1242166	1242171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752024
25552	NC_012924	ATAG	2	8	1242187	1242194	50 %	25 %	25 %	0 %	253752024
25553	NC_012924	ACC	2	6	1242247	1242252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752024
25554	NC_012924	AAT	2	6	1242259	1242264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752024
25555	NC_012924	A	6	6	1242340	1242345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25556	NC_012924	GAC	2	6	1242352	1242357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25557	NC_012924	ATC	2	6	1242393	1242398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752025
25558	NC_012924	ATG	2	6	1242399	1242404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752025
25559	NC_012924	ACG	2	6	1242480	1242485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752025
25560	NC_012924	CTG	2	6	1242568	1242573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752025
25561	NC_012924	GCT	2	6	1242723	1242728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752025
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25567	NC_012924	A	7	7	1242921	1242927	100 %	0 %	0 %	0 %	253752025
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25577	NC_012924	TAT	2	6	1243253	1243258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25578	NC_012924	TAAA	2	8	1243279	1243286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25579	NC_012924	A	6	6	1243300	1243305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25584	NC_012924	ATAA	2	8	1243474	1243481	75 %	25 %	0 %	0 %	253752026
25585	NC_012924	ATG	2	6	1243491	1243496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752026
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25619	NC_012924	AATC	2	8	1245046	1245053	50 %	25 %	0 %	25 %	253752028
25620	NC_012924	TCT	2	6	1245076	1245081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752028
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25654	NC_012924	CA	3	6	1247189	1247194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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25739	NC_012924	GCA	2	6	1251152	1251157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752033
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25769	NC_012924	AT	3	6	1252439	1252444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25770	NC_012924	T	6	6	1252444	1252449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25843	NC_012924	CT	3	6	1255925	1255930	0 %	50 %	0 %	50 %	253752035
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25856	NC_012924	TCT	2	6	1256696	1256701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752036
25857	NC_012924	TGGCA	2	10	1256765	1256774	20 %	20 %	40 %	20 %	253752036
25858	NC_012924	GAG	3	9	1256816	1256824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253752036
25859	NC_012924	TCT	2	6	1256857	1256862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752036
25860	NC_012924	CG	3	6	1256922	1256927	0 %	0 %	50 %	50 %	253752036
25861	NC_012924	ATGGT	2	10	1256992	1257001	20 %	40 %	40 %	0 %	253752036
25862	NC_012924	GACCT	2	10	1257042	1257051	20 %	20 %	20 %	40 %	253752036
25863	NC_012924	AATG	2	8	1257077	1257084	50 %	25 %	25 %	0 %	253752036
25864	NC_012924	TCTG	2	8	1257166	1257173	0 %	50 %	25 %	25 %	253752036
25865	NC_012924	CTC	2	6	1257174	1257179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752036
25866	NC_012924	TAA	2	6	1257248	1257253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752036
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25868	NC_012924	TA	4	8	1257451	1257458	50 %	50 %	0 %	0 %	253752037
25869	NC_012924	CGACC	2	10	1257470	1257479	20 %	0 %	20 %	60 %	253752037
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25924	NC_012924	TAT	2	6	1260221	1260226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25929	NC_012924	A	6	6	1260389	1260394	100 %	0 %	0 %	0 %	253752040
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25932	NC_012924	A	6	6	1260456	1260461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25955	NC_012924	CTG	2	6	1261582	1261587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752041
25956	NC_012924	T	6	6	1261679	1261684	0 %	100 %	0 %	0 %	253752041
25957	NC_012924	T	6	6	1261773	1261778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25958	NC_012924	TCA	2	6	1261856	1261861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25959	NC_012924	AG	3	6	1261872	1261877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25960	NC_012924	AC	3	6	1261878	1261883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25961	NC_012924	CTT	2	6	1261919	1261924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752042
25962	NC_012924	ATG	2	6	1261992	1261997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752042
25963	NC_012924	A	6	6	1262037	1262042	100 %	0 %	0 %	0 %	253752042
25964	NC_012924	TTG	2	6	1262043	1262048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752042
25965	NC_012924	ATG	2	6	1262184	1262189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752042
25966	NC_012924	A	6	6	1262248	1262253	100 %	0 %	0 %	0 %	253752042
25967	NC_012924	CAAA	2	8	1262311	1262318	75 %	0 %	0 %	25 %	253752042
25968	NC_012924	TGA	2	6	1262401	1262406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752042
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25970	NC_012924	TGA	2	6	1262485	1262490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752042
25971	NC_012924	ATT	2	6	1262503	1262508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752042
25972	NC_012924	TTG	2	6	1262580	1262585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752042
25973	NC_012924	AAT	2	6	1262591	1262596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752042
25974	NC_012924	CGAT	2	8	1262731	1262738	25 %	25 %	25 %	25 %	253752042
25975	NC_012924	GAT	2	6	1262753	1262758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752042
25976	NC_012924	GAT	2	6	1262852	1262857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752042
25977	NC_012924	GAA	2	6	1262858	1262863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752042
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25979	NC_012924	ATT	2	6	1262897	1262902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752042
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25982	NC_012924	ACA	2	6	1263165	1263170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25983	NC_012924	T	6	6	1263182	1263187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25984	NC_012924	AAAG	2	8	1263254	1263261	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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25987	NC_012924	TGTT	2	8	1263604	1263611	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25988	NC_012924	TA	3	6	1263682	1263687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25989	NC_012924	ACT	2	6	1263703	1263708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752043
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