MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 42519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_012924	T	6	6	681367	681372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_012924	TAA	2	6	681402	681407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_012924	ATT	2	6	681509	681514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_012924	GTTT	2	8	681553	681560	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_012924	CA	3	6	681574	681579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14006	NC_012924	A	6	6	681651	681656	100 %	0 %	0 %	0 %	253751506
14007	NC_012924	GTTT	2	8	681685	681692	0 %	75 %	25 %	0 %	253751506
14008	NC_012924	TGG	2	6	681723	681728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751506
14009	NC_012924	GAA	2	6	681741	681746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751506
14010	NC_012924	ATG	2	6	681778	681783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751506
14011	NC_012924	TTC	2	6	681884	681889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751506
14012	NC_012924	AGA	2	6	681953	681958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751506
14013	NC_012924	GGT	2	6	682082	682087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751506
14014	NC_012924	TTCG	2	8	682093	682100	0 %	50 %	25 %	25 %	253751506
14015	NC_012924	ATT	2	6	682241	682246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751506
14016	NC_012924	AGA	2	6	682427	682432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751507
14017	NC_012924	CTA	2	6	682466	682471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751507
14018	NC_012924	TA	3	6	682510	682515	50 %	50 %	0 %	0 %	253751507
14019	NC_012924	CAAG	2	8	682517	682524	50 %	0 %	25 %	25 %	253751507
14020	NC_012924	GC	3	6	682527	682532	0 %	0 %	50 %	50 %	253751507
14021	NC_012924	A	6	6	682683	682688	100 %	0 %	0 %	0 %	253751507
14022	NC_012924	TTG	2	6	682783	682788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_012924	CCG	2	6	682872	682877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14024	NC_012924	AT	3	6	682974	682979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_012924	AAG	2	6	683002	683007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_012924	AGCT	2	8	683045	683052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14027	NC_012924	ACC	2	6	683192	683197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14028	NC_012924	AAAAG	2	10	683208	683217	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_012924	AAT	2	6	683251	683256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_012924	T	6	6	683272	683277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_012924	ATT	2	6	683309	683314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_012924	AGTA	2	8	683395	683402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_012924	AGG	2	6	683408	683413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_012924	ATCC	2	8	683448	683455	25 %	25 %	0 %	50 %	253751508
14035	NC_012924	ATC	2	6	683481	683486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751508
14036	NC_012924	ATG	2	6	683560	683565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751508
14037	NC_012924	TAT	2	6	683615	683620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751508
14038	NC_012924	TAGAA	2	10	683734	683743	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_012924	AGT	2	6	683759	683764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_012924	G	6	6	683765	683770	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_012924	TG	3	6	683987	683992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_012924	TGG	2	6	684036	684041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_012924	CAA	2	6	684274	684279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_012924	TTG	2	6	684294	684299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_012924	T	6	6	684307	684312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_012924	TGA	2	6	684433	684438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751509
14047	NC_012924	TCT	2	6	684462	684467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751509
14048	NC_012924	CATAG	2	10	684491	684500	40 %	20 %	20 %	20 %	253751509
14049	NC_012924	AGT	2	6	684549	684554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751509
14050	NC_012924	ATT	2	6	684617	684622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751509
14051	NC_012924	TTTC	2	8	684655	684662	0 %	75 %	0 %	25 %	253751509
14052	NC_012924	TTA	2	6	684702	684707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751509
14053	NC_012924	ATTGT	2	10	684735	684744	20 %	60 %	20 %	0 %	253751509
14054	NC_012924	CAA	2	6	684790	684795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751509
14055	NC_012924	GGT	2	6	684818	684823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751509
14056	NC_012924	CAC	2	6	684922	684927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751509
14057	NC_012924	TTC	2	6	684932	684937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751509
14058	NC_012924	ATG	2	6	684969	684974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751509
14059	NC_012924	TCA	2	6	684975	684980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751509
14060	NC_012924	TCT	2	6	684990	684995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751509
14061	NC_012924	ATG	2	6	684999	685004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751509
14062	NC_012924	T	7	7	685009	685015	0 %	100 %	0 %	0 %	253751509
14063	NC_012924	CGT	2	6	685109	685114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751509
14064	NC_012924	AAT	2	6	685160	685165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751509
14065	NC_012924	CA	3	6	685217	685222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14066	NC_012924	AAAG	2	8	685223	685230	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_012924	AAT	2	6	685295	685300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_012924	TGA	2	6	685308	685313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_012924	A	6	6	685358	685363	100 %	0 %	0 %	0 %	253751510
14070	NC_012924	TTA	2	6	685447	685452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751510
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14073	NC_012924	A	7	7	685527	685533	100 %	0 %	0 %	0 %	253751510
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14079	NC_012924	GTG	2	6	685721	685726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751510
14080	NC_012924	GCGAA	2	10	685860	685869	40 %	0 %	40 %	20 %	253751510
14081	NC_012924	GTA	2	6	685870	685875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751510
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14083	NC_012924	TAC	2	6	686116	686121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751511
14084	NC_012924	TGC	2	6	686148	686153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751511
14085	NC_012924	CAGT	2	8	686177	686184	25 %	25 %	25 %	25 %	253751511
14086	NC_012924	TGA	2	6	686391	686396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751511
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14088	NC_012924	AGATA	2	10	686445	686454	60 %	20 %	20 %	0 %	253751511
14089	NC_012924	ATC	2	6	686459	686464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751511
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14091	NC_012924	CGA	2	6	686591	686596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751511
14092	NC_012924	TTCT	2	8	686630	686637	0 %	75 %	0 %	25 %	253751511
14093	NC_012924	GAG	2	6	686650	686655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751511
14094	NC_012924	AGC	2	6	686685	686690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751511
14095	NC_012924	GTCGA	2	10	686705	686714	20 %	20 %	40 %	20 %	253751511
14096	NC_012924	A	7	7	686717	686723	100 %	0 %	0 %	0 %	253751511
14097	NC_012924	GAC	2	6	686745	686750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751511
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14105	NC_012924	ATG	2	6	687017	687022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751511
14106	NC_012924	AG	3	6	687045	687050	50 %	0 %	50 %	0 %	253751511
14107	NC_012924	GGT	2	6	687068	687073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_012924	T	6	6	687081	687086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_012924	A	6	6	687092	687097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_012924	AAAT	2	8	687113	687120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_012924	AT	3	6	687143	687148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_012924	ATGAT	2	10	687167	687176	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_012924	TTAC	2	8	687177	687184	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14114	NC_012924	GAAA	2	8	687185	687192	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_012924	TAA	2	6	687195	687200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_012924	GGA	2	6	687220	687225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14126	NC_012924	TGA	2	6	687480	687485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751512
14127	NC_012924	A	7	7	687541	687547	100 %	0 %	0 %	0 %	253751512
14128	NC_012924	A	7	7	687560	687566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14162	NC_012924	CTGA	2	8	689417	689424	25 %	25 %	25 %	25 %	253751515
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14230	NC_012924	G	6	6	692509	692514	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14231	NC_012924	ATC	2	6	692559	692564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751517
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14236	NC_012924	TCCA	2	8	692930	692937	25 %	25 %	0 %	50 %	253751517
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14239	NC_012924	CTT	2	6	693011	693016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751517
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14488	NC_012924	AAT	2	6	704573	704578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14489	NC_012924	TCA	2	6	704637	704642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751526
14490	NC_012924	ATC	2	6	704687	704692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751526
14491	NC_012924	TCAA	2	8	704726	704733	50 %	25 %	0 %	25 %	253751526
14492	NC_012924	ATC	2	6	704750	704755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751526
14493	NC_012924	TGA	2	6	704766	704771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751526
14494	NC_012924	ATC	2	6	704825	704830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751526
14495	NC_012924	A	6	6	704871	704876	100 %	0 %	0 %	0 %	253751526
14496	NC_012924	AAGATG	2	12	704975	704986	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	253751526
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14500	NC_012924	TCTCT	2	10	705193	705202	0 %	60 %	0 %	40 %	253751526

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