MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 57249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_012726	TTA	2	6	1859465	1859470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620474
41502	NC_012726	TTAA	2	8	1859489	1859496	50 %	50 %	0 %	0 %	238620474
41503	NC_012726	TTG	2	6	1859589	1859594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238620474
41504	NC_012726	TTA	2	6	1859618	1859623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620474
41505	NC_012726	ATTC	2	8	1859728	1859735	25 %	50 %	0 %	25 %	238620474
41506	NC_012726	T	8	8	1859790	1859797	0 %	100 %	0 %	0 %	238620474
41507	NC_012726	CT	3	6	1859806	1859811	0 %	50 %	0 %	50 %	238620474
41508	NC_012726	TAT	2	6	1859923	1859928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620474
41509	NC_012726	TTA	2	6	1860011	1860016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620474
41510	NC_012726	ATT	2	6	1860023	1860028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620474
41511	NC_012726	TCT	2	6	1860123	1860128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620474
41512	NC_012726	T	6	6	1860257	1860262	0 %	100 %	0 %	0 %	238620474
41513	NC_012726	TTC	2	6	1860267	1860272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620474
41514	NC_012726	TTC	2	6	1860310	1860315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620474
41515	NC_012726	CAG	2	6	1860342	1860347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238620474
41516	NC_012726	CAA	2	6	1860378	1860383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238620474
41517	NC_012726	TCTGTA	2	12	1860395	1860406	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238620474
41518	NC_012726	TAA	2	6	1860439	1860444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620474
41519	NC_012726	ATTTCA	2	12	1860503	1860514	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238620474
41520	NC_012726	ATT	2	6	1860517	1860522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620474
41521	NC_012726	CTG	2	6	1860577	1860582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238620474
41522	NC_012726	ATTTAT	2	12	1860606	1860617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620474
41523	NC_012726	TA	3	6	1860669	1860674	50 %	50 %	0 %	0 %	238620475
41524	NC_012726	TAT	2	6	1860680	1860685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620475
41525	NC_012726	CA	3	6	1860818	1860823	50 %	0 %	0 %	50 %	238620475
41526	NC_012726	ACCCA	2	10	1860829	1860838	40 %	0 %	0 %	60 %	238620475
41527	NC_012726	ATC	2	6	1860975	1860980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620475
41528	NC_012726	CTT	2	6	1861126	1861131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620475
41529	NC_012726	CTGG	2	8	1861267	1861274	0 %	25 %	50 %	25 %	238620475
41530	NC_012726	ATA	2	6	1861363	1861368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620475
41531	NC_012726	T	6	6	1861404	1861409	0 %	100 %	0 %	0 %	238620475
41532	NC_012726	GGA	2	6	1861426	1861431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238620475
41533	NC_012726	CAC	2	6	1861475	1861480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238620475
41534	NC_012726	TCCTT	2	10	1861562	1861571	0 %	60 %	0 %	40 %	238620475
41535	NC_012726	TTC	2	6	1861572	1861577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620475
41536	NC_012726	T	7	7	1861589	1861595	0 %	100 %	0 %	0 %	238620475
41537	NC_012726	CTT	2	6	1861691	1861696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620475
41538	NC_012726	TCA	2	6	1861750	1861755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620475
41539	NC_012726	T	6	6	1861762	1861767	0 %	100 %	0 %	0 %	238620475
41540	NC_012726	TTA	2	6	1861805	1861810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620475
41541	NC_012726	CTTTC	2	10	1861831	1861840	0 %	60 %	0 %	40 %	238620475
41542	NC_012726	TTCC	2	8	1861843	1861850	0 %	50 %	0 %	50 %	238620475
41543	NC_012726	ATA	2	6	1861866	1861871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620475
41544	NC_012726	TTG	2	6	1861961	1861966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238620475
41545	NC_012726	A	8	8	1862002	1862009	100 %	0 %	0 %	0 %	238620475
41546	NC_012726	TTA	2	6	1862134	1862139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620476
41547	NC_012726	T	6	6	1862174	1862179	0 %	100 %	0 %	0 %	238620476
41548	NC_012726	TAA	2	6	1862185	1862190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620476
41549	NC_012726	AATT	2	8	1862279	1862286	50 %	50 %	0 %	0 %	238620476
41550	NC_012726	AAT	2	6	1862298	1862303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620476
41551	NC_012726	CAG	2	6	1862338	1862343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238620476
41552	NC_012726	TCCA	2	8	1862411	1862418	25 %	25 %	0 %	50 %	238620476
41553	NC_012726	ATA	2	6	1862448	1862453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620476
41554	NC_012726	ATG	2	6	1862589	1862594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620476
41555	NC_012726	ATC	2	6	1862649	1862654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620476
41556	NC_012726	TAT	2	6	1862660	1862665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620476
41557	NC_012726	TGC	2	6	1862696	1862701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238620476
41558	NC_012726	A	7	7	1862747	1862753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41559	NC_012726	TTA	2	6	1862809	1862814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620477
41560	NC_012726	CAT	2	6	1862933	1862938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620477
41561	NC_012726	AT	3	6	1862948	1862953	50 %	50 %	0 %	0 %	238620477
41562	NC_012726	AGC	2	6	1862967	1862972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238620477
41563	NC_012726	ATG	2	6	1862993	1862998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620477
41564	NC_012726	AGT	2	6	1863021	1863026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620477
41565	NC_012726	AT	3	6	1863057	1863062	50 %	50 %	0 %	0 %	238620477
41566	NC_012726	CTA	2	6	1863074	1863079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620477
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41570	NC_012726	GTA	2	6	1863376	1863381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620477
41571	NC_012726	AT	3	6	1863400	1863405	50 %	50 %	0 %	0 %	238620477
41572	NC_012726	A	6	6	1863411	1863416	100 %	0 %	0 %	0 %	238620477
41573	NC_012726	GA	4	8	1863441	1863448	50 %	0 %	50 %	0 %	238620477
41574	NC_012726	TA	4	8	1863465	1863472	50 %	50 %	0 %	0 %	238620477
41575	NC_012726	AG	3	6	1863498	1863503	50 %	0 %	50 %	0 %	238620477
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41578	NC_012726	A	6	6	1863552	1863557	100 %	0 %	0 %	0 %	238620477
41579	NC_012726	A	6	6	1863565	1863570	100 %	0 %	0 %	0 %	238620477
41580	NC_012726	ATCCT	2	10	1863587	1863596	20 %	40 %	0 %	40 %	238620477
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41582	NC_012726	GTT	2	6	1863616	1863621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238620477
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41584	NC_012726	A	6	6	1863687	1863692	100 %	0 %	0 %	0 %	238620477
41585	NC_012726	TAAT	2	8	1863696	1863703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41586	NC_012726	CAAG	2	8	1863767	1863774	50 %	0 %	25 %	25 %	238620478
41587	NC_012726	TAC	2	6	1863782	1863787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620478
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41589	NC_012726	TTA	2	6	1863944	1863949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620478
41590	NC_012726	AAAG	2	8	1863950	1863957	75 %	0 %	25 %	0 %	238620478
41591	NC_012726	ATA	2	6	1864040	1864045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620478
41592	NC_012726	GATAA	2	10	1864079	1864088	60 %	20 %	20 %	0 %	238620478
41593	NC_012726	AGT	2	6	1864159	1864164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620478
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41595	NC_012726	TTC	2	6	1864236	1864241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620478
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41598	NC_012726	A	6	6	1864385	1864390	100 %	0 %	0 %	0 %	238620478
41599	NC_012726	TAG	2	6	1864399	1864404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620478
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41601	NC_012726	TAA	2	6	1864452	1864457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620478
41602	NC_012726	AGA	2	6	1864516	1864521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238620478
41603	NC_012726	AG	4	8	1864651	1864658	50 %	0 %	50 %	0 %	238620478
41604	NC_012726	ACA	2	6	1864671	1864676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238620478
41605	NC_012726	GGA	2	6	1864711	1864716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238620478
41606	NC_012726	AGGA	2	8	1864733	1864740	50 %	0 %	50 %	0 %	238620478
41607	NC_012726	AGA	2	6	1864779	1864784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238620478
41608	NC_012726	AGAA	2	8	1864792	1864799	75 %	0 %	25 %	0 %	238620478
41609	NC_012726	TAG	5	15	1864815	1864829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620478
41610	NC_012726	CAA	3	9	1864874	1864882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238620479
41611	NC_012726	GA	3	6	1864934	1864939	50 %	0 %	50 %	0 %	238620479
41612	NC_012726	AGT	2	6	1864969	1864974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620479
41613	NC_012726	TA	4	8	1865004	1865011	50 %	50 %	0 %	0 %	238620479
41614	NC_012726	TA	3	6	1865017	1865022	50 %	50 %	0 %	0 %	238620479
41615	NC_012726	GTG	2	6	1865027	1865032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238620479
41616	NC_012726	AAG	2	6	1865042	1865047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238620479
41617	NC_012726	T	6	6	1865057	1865062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41619	NC_012726	GAGC	2	8	1865105	1865112	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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41976	NC_012726	TTA	2	6	1879306	1879311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620492
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