MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 57249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_012726	GTA	2	6	612164	612169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619130
13502	NC_012726	GCA	2	6	612170	612175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238619130
13503	NC_012726	AG	3	6	612188	612193	50 %	0 %	50 %	0 %	238619130
13504	NC_012726	AGA	2	6	612235	612240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238619130
13505	NC_012726	GTA	2	6	612257	612262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619130
13506	NC_012726	AT	3	6	612357	612362	50 %	50 %	0 %	0 %	238619130
13507	NC_012726	A	6	6	612431	612436	100 %	0 %	0 %	0 %	238619130
13508	NC_012726	ATG	2	6	612465	612470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619130
13509	NC_012726	GTA	2	6	612483	612488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619130
13510	NC_012726	ATT	2	6	612518	612523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619130
13511	NC_012726	ATC	2	6	612547	612552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13512	NC_012726	TAA	2	6	612561	612566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_012726	ATA	2	6	612612	612617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_012726	CAA	2	6	612698	612703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238619131
13515	NC_012726	AT	3	6	612786	612791	50 %	50 %	0 %	0 %	238619131
13516	NC_012726	TCT	2	6	612838	612843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238619131
13517	NC_012726	CTTC	2	8	612846	612853	0 %	50 %	0 %	50 %	238619131
13518	NC_012726	ATT	2	6	612879	612884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619131
13519	NC_012726	CTT	2	6	612897	612902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238619131
13520	NC_012726	A	6	6	612943	612948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_012726	AGA	2	6	612963	612968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_012726	T	6	6	612979	612984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_012726	T	6	6	612996	613001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_012726	TAA	2	6	613009	613014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_012726	AAG	2	6	613088	613093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_012726	AGT	2	6	613126	613131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_012726	A	6	6	613208	613213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_012726	TAA	2	6	613221	613226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_012726	TA	3	6	613231	613236	50 %	50 %	0 %	0 %	238619132
13530	NC_012726	ATT	2	6	613243	613248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619132
13531	NC_012726	T	6	6	613285	613290	0 %	100 %	0 %	0 %	238619132
13532	NC_012726	CTA	2	6	613346	613351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238619132
13533	NC_012726	TCT	2	6	613369	613374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238619132
13534	NC_012726	AT	3	6	613387	613392	50 %	50 %	0 %	0 %	238619132
13535	NC_012726	TAT	2	6	613397	613402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619132
13536	NC_012726	T	6	6	613420	613425	0 %	100 %	0 %	0 %	238619132
13537	NC_012726	TAT	2	6	613431	613436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619132
13538	NC_012726	CTG	2	6	613445	613450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238619132
13539	NC_012726	AT	3	6	613453	613458	50 %	50 %	0 %	0 %	238619132
13540	NC_012726	CTC	2	6	613478	613483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238619132
13541	NC_012726	ATA	2	6	613520	613525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619132
13542	NC_012726	TGG	2	6	613566	613571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238619132
13543	NC_012726	GGT	2	6	613582	613587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238619132
13544	NC_012726	TAAA	2	8	613599	613606	75 %	25 %	0 %	0 %	238619132
13545	NC_012726	TTC	2	6	613627	613632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238619132
13546	NC_012726	CT	3	6	613668	613673	0 %	50 %	0 %	50 %	238619132
13547	NC_012726	CCT	2	6	613693	613698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238619132
13548	NC_012726	TAC	2	6	613704	613709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238619132
13549	NC_012726	TA	3	6	613736	613741	50 %	50 %	0 %	0 %	238619132
13550	NC_012726	AAT	2	6	613761	613766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619132
13551	NC_012726	TAC	2	6	613787	613792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238619132
13552	NC_012726	AAAG	2	8	613860	613867	75 %	0 %	25 %	0 %	238619132
13553	NC_012726	TTA	2	6	613868	613873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619132
13554	NC_012726	TAA	2	6	613884	613889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619132
13555	NC_012726	AATGTA	2	12	613922	613933	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238619132
13556	NC_012726	T	6	6	613941	613946	0 %	100 %	0 %	0 %	238619132
13557	NC_012726	ATG	2	6	613970	613975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619132
13558	NC_012726	CTT	2	6	614068	614073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238619132
13559	NC_012726	AATA	2	8	614149	614156	75 %	25 %	0 %	0 %	238619132
13560	NC_012726	ACC	2	6	614172	614177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238619132
13561	NC_012726	CAT	2	6	614199	614204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238619132
13562	NC_012726	ATTTTC	2	12	614215	614226	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238619132
13563	NC_012726	TA	3	6	614233	614238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_012726	T	6	6	614269	614274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_012726	CAAGAA	2	12	614277	614288	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13566	NC_012726	TA	3	6	614289	614294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_012726	TGATA	2	10	614311	614320	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_012726	T	6	6	614352	614357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_012726	ATA	2	6	614358	614363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_012726	TAGA	2	8	614375	614382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_012726	ATT	2	6	614384	614389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_012726	AACG	2	8	614446	614453	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13573	NC_012726	TAT	2	6	614454	614459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_012726	T	6	6	614492	614497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_012726	CAG	2	6	614515	614520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13576	NC_012726	TAA	2	6	614620	614625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_012726	AT	3	6	614695	614700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13578	NC_012726	TTA	2	6	614759	614764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13579	NC_012726	AT	3	6	614824	614829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_012726	TA	4	8	614846	614853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13581	NC_012726	TCT	2	6	614892	614897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13582	NC_012726	GT	3	6	614951	614956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13583	NC_012726	CTC	2	6	615045	615050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13584	NC_012726	TA	3	6	615087	615092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_012726	CTG	2	6	615207	615212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13586	NC_012726	AT	4	8	615240	615247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13587	NC_012726	TTTA	2	8	615271	615278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_012726	TA	3	6	615288	615293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_012726	TAA	2	6	615298	615303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_012726	TA	3	6	615306	615311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_012726	TA	3	6	615331	615336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_012726	AT	3	6	615365	615370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_012726	AT	3	6	615386	615391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_012726	TTATAT	2	12	615434	615445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_012726	AAG	2	6	615456	615461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238619133
13596	NC_012726	AT	3	6	615489	615494	50 %	50 %	0 %	0 %	238619133
13597	NC_012726	GTT	2	6	615512	615517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238619133
13598	NC_012726	GAG	2	6	615533	615538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238619133
13599	NC_012726	GAT	2	6	615560	615565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619133
13600	NC_012726	AC	3	6	615717	615722	50 %	0 %	0 %	50 %	238619133
13601	NC_012726	AGATGC	2	12	615739	615750	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238619133
13602	NC_012726	TCC	2	6	615757	615762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238619133
13603	NC_012726	ATA	2	6	615809	615814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619133
13604	NC_012726	ATT	2	6	615841	615846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619133
13605	NC_012726	TTAA	2	8	615866	615873	50 %	50 %	0 %	0 %	238619133
13606	NC_012726	TTCT	2	8	615915	615922	0 %	75 %	0 %	25 %	238619133
13607	NC_012726	GTAT	2	8	615924	615931	25 %	50 %	25 %	0 %	238619133
13608	NC_012726	TTC	2	6	615933	615938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238619133
13609	NC_012726	GAT	2	6	616009	616014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619133
13610	NC_012726	AG	3	6	616017	616022	50 %	0 %	50 %	0 %	238619133
13611	NC_012726	GAGAA	2	10	616052	616061	60 %	0 %	40 %	0 %	238619133
13612	NC_012726	GAAAA	2	10	616066	616075	80 %	0 %	20 %	0 %	238619133
13613	NC_012726	ATA	2	6	616103	616108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619133
13614	NC_012726	TCTTA	2	10	616109	616118	20 %	60 %	0 %	20 %	238619133
13615	NC_012726	TAA	2	6	616191	616196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619133
13616	NC_012726	GAATA	2	10	616329	616338	60 %	20 %	20 %	0 %	238619133
13617	NC_012726	ATA	3	9	616350	616358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619133
13618	NC_012726	AAT	3	9	616368	616376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619133
13619	NC_012726	CTA	2	6	616383	616388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13620	NC_012726	ATTT	2	8	616463	616470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_012726	TAG	2	6	616482	616487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_012726	TCT	2	6	616500	616505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13623	NC_012726	TAT	2	6	616534	616539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13624	NC_012726	TAC	2	6	616558	616563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238619134
13625	NC_012726	TAT	3	9	616589	616597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619134
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13627	NC_012726	AT	4	8	616629	616636	50 %	50 %	0 %	0 %	238619134
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