MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 57249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012726	TG	3	6	459610	459615	0 %	50 %	50 %	0 %	238619000
10002	NC_012726	AGTGT	2	10	459634	459643	20 %	40 %	40 %	0 %	238619000
10003	NC_012726	TAAC	2	8	459667	459674	50 %	25 %	0 %	25 %	238619000
10004	NC_012726	TTA	2	6	459745	459750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619000
10005	NC_012726	TTGAT	2	10	459811	459820	20 %	60 %	20 %	0 %	238619000
10006	NC_012726	TGG	2	6	459828	459833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238619000
10007	NC_012726	ATT	2	6	459882	459887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619000
10008	NC_012726	TAT	2	6	459890	459895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619000
10009	NC_012726	GTA	2	6	459917	459922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619000
10010	NC_012726	AT	3	6	459948	459953	50 %	50 %	0 %	0 %	238619000
10011	NC_012726	TTA	2	6	459995	460000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619000
10012	NC_012726	A	6	6	460066	460071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_012726	GAAG	2	8	460116	460123	50 %	0 %	50 %	0 %	238619001
10014	NC_012726	TAA	2	6	460135	460140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619001
10015	NC_012726	TTGT	2	8	460256	460263	0 %	75 %	25 %	0 %	238619001
10016	NC_012726	GAA	2	6	460362	460367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238619001
10017	NC_012726	TAT	2	6	460375	460380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619001
10018	NC_012726	AATT	2	8	460393	460400	50 %	50 %	0 %	0 %	238619001
10019	NC_012726	AAAG	2	8	460416	460423	75 %	0 %	25 %	0 %	238619001
10020	NC_012726	AGT	2	6	460448	460453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_012726	TGG	2	6	460582	460587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238619002
10022	NC_012726	TAG	2	6	460599	460604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619002
10023	NC_012726	AAAT	2	8	460616	460623	75 %	25 %	0 %	0 %	238619002
10024	NC_012726	TA	3	6	460654	460659	50 %	50 %	0 %	0 %	238619002
10025	NC_012726	CTT	2	6	460733	460738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238619002
10026	NC_012726	ATT	2	6	460796	460801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619002
10027	NC_012726	A	9	9	460841	460849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_012726	TGG	2	6	460873	460878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238619003
10029	NC_012726	TAT	2	6	460914	460919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619003
10030	NC_012726	GTTATG	2	12	461032	461043	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	238619003
10031	NC_012726	AAT	2	6	461045	461050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619003
10032	NC_012726	ATA	2	6	461068	461073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619003
10033	NC_012726	GAA	2	6	461114	461119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238619003
10034	NC_012726	AG	3	6	461209	461214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_012726	AAG	2	6	461241	461246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_012726	T	9	9	461249	461257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_012726	T	6	6	461280	461285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_012726	TAAT	2	8	461305	461312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_012726	TAA	2	6	461363	461368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_012726	ATT	2	6	461408	461413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_012726	T	6	6	461444	461449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_012726	TACT	2	8	461456	461463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10043	NC_012726	TCA	2	6	461611	461616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238619004
10044	NC_012726	TA	3	6	461628	461633	50 %	50 %	0 %	0 %	238619004
10045	NC_012726	TAC	3	9	461659	461667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238619004
10046	NC_012726	ATA	2	6	461689	461694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619004
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10050	NC_012726	AT	3	6	461794	461799	50 %	50 %	0 %	0 %	238619004
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10053	NC_012726	AATG	2	8	461978	461985	50 %	25 %	25 %	0 %	238619005
10054	NC_012726	AG	3	6	462089	462094	50 %	0 %	50 %	0 %	238619005
10055	NC_012726	ATACG	2	10	462108	462117	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10056	NC_012726	CAA	2	6	462344	462349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_012726	TTC	2	6	462459	462464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238619006
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10059	NC_012726	AGCT	2	8	462541	462548	25 %	25 %	25 %	25 %	238619006
10060	NC_012726	ATC	2	6	462575	462580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238619006
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10063	NC_012726	AG	3	6	462688	462693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_012726	TTG	2	6	462804	462809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238619007
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10069	NC_012726	TGAA	2	8	463110	463117	50 %	25 %	25 %	0 %	238619007
10070	NC_012726	TAA	2	6	463165	463170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619007
10071	NC_012726	CAT	2	6	463180	463185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238619007
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10075	NC_012726	TAT	2	6	463466	463471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238619008
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10090	NC_012726	TCGTT	2	10	464375	464384	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10091	NC_012726	AAT	2	6	464397	464402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_012726	TAAAGC	2	12	464414	464425	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10093	NC_012726	AGGT	2	8	464452	464459	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_012726	CTT	2	6	464463	464468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_012726	ATA	2	6	464500	464505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_012726	AGGA	2	8	464512	464519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_012726	TGG	2	6	464528	464533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_012726	TA	4	8	464584	464591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_012726	TCT	2	6	464592	464597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_012726	TACTT	2	10	464603	464612	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10101	NC_012726	T	7	7	464611	464617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_012726	CATT	2	8	464704	464711	25 %	50 %	0 %	25 %	238619009
10103	NC_012726	ATAA	2	8	464735	464742	75 %	25 %	0 %	0 %	238619009
10104	NC_012726	AAT	2	6	464743	464748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619009
10105	NC_012726	GA	3	6	464756	464761	50 %	0 %	50 %	0 %	238619009
10106	NC_012726	AGAA	2	8	464843	464850	75 %	0 %	25 %	0 %	238619009
10107	NC_012726	CGA	2	6	464869	464874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238619009
10108	NC_012726	TGATT	2	10	464896	464905	20 %	60 %	20 %	0 %	238619009
10109	NC_012726	AAT	2	6	464915	464920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619009
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10112	NC_012726	ATA	2	6	465009	465014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619009
10113	NC_012726	T	6	6	465038	465043	0 %	100 %	0 %	0 %	238619009
10114	NC_012726	T	6	6	465104	465109	0 %	100 %	0 %	0 %	238619009
10115	NC_012726	A	6	6	465225	465230	100 %	0 %	0 %	0 %	238619009
10116	NC_012726	CCGTA	2	10	465317	465326	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10117	NC_012726	TA	3	6	465431	465436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_012726	TCT	2	6	465454	465459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_012726	TAAT	2	8	465481	465488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_012726	GTAT	2	8	465508	465515	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_012726	A	6	6	465600	465605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_012726	TC	3	6	465615	465620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10123	NC_012726	ATT	2	6	465695	465700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_012726	TAA	2	6	465709	465714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_012726	ATA	2	6	465732	465737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_012726	AAT	2	6	465799	465804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_012726	ATG	2	6	465839	465844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10252	NC_012726	AT	4	8	472013	472020	50 %	50 %	0 %	0 %	238619012
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10495	NC_012726	CCATT	2	10	484104	484113	20 %	40 %	0 %	40 %	238619022
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10497	NC_012726	GTA	2	6	484208	484213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619022
10498	NC_012726	TCC	2	6	484222	484227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238619022
10499	NC_012726	AT	3	6	484304	484309	50 %	50 %	0 %	0 %	238619022
10500	NC_012726	GTA	2	6	484322	484327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619022

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