MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 57249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012726	CAT	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012726	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012726	TC	3	6	62	67	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012726	TTTC	2	8	135	142	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012726	GT	3	6	180	185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012726	ATT	2	6	291	296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012726	GTCAC	2	10	358	367	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012726	ATT	2	6	384	389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012726	TAA	2	6	435	440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012726	T	7	7	447	453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012726	TATT	2	8	528	535	25 %	75 %	0 %	0 %	238618480
12	NC_012726	TAT	2	6	539	544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618480
13	NC_012726	TAT	2	6	581	586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618480
14	NC_012726	ATT	2	6	622	627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618480
15	NC_012726	GTT	2	6	642	647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618480
16	NC_012726	GTT	2	6	650	655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618480
17	NC_012726	CTT	2	6	675	680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618480
18	NC_012726	TTAC	2	8	703	710	25 %	50 %	0 %	25 %	238618480
19	NC_012726	GGT	2	6	869	874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618481
20	NC_012726	A	6	6	889	894	100 %	0 %	0 %	0 %	238618481
21	NC_012726	AG	3	6	944	949	50 %	0 %	50 %	0 %	238618481
22	NC_012726	TGC	2	6	964	969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238618481
23	NC_012726	GTAA	2	8	1052	1059	50 %	25 %	25 %	0 %	238618481
24	NC_012726	GAG	2	6	1079	1084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618481
25	NC_012726	ATGAGG	2	12	1092	1103	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	238618481
26	NC_012726	TGG	2	6	1147	1152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618481
27	NC_012726	TAT	2	6	1167	1172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618481
28	NC_012726	GATAA	2	10	1241	1250	60 %	20 %	20 %	0 %	238618481
29	NC_012726	ATA	2	6	1277	1282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618481
30	NC_012726	AGAGG	2	10	1311	1320	40 %	0 %	60 %	0 %	238618481
31	NC_012726	AT	3	6	1362	1367	50 %	50 %	0 %	0 %	238618481
32	NC_012726	TTA	2	6	1371	1376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618481
33	NC_012726	ATC	2	6	1426	1431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618481
34	NC_012726	ACG	2	6	1461	1466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238618481
35	NC_012726	AAC	2	6	1470	1475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238618481
36	NC_012726	TAA	2	6	1512	1517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618481
37	NC_012726	ATG	2	6	1527	1532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618481
38	NC_012726	AGC	2	6	1612	1617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238618481
39	NC_012726	AGCT	2	8	1620	1627	25 %	25 %	25 %	25 %	238618481
40	NC_012726	TGG	2	6	1630	1635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618481
41	NC_012726	G	6	6	1634	1639	0 %	0 %	100 %	0 %	238618481
42	NC_012726	AG	3	6	1687	1692	50 %	0 %	50 %	0 %	238618481
43	NC_012726	CCTT	2	8	1714	1721	0 %	50 %	0 %	50 %	238618481
44	NC_012726	AAG	2	6	1741	1746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618481
45	NC_012726	AGA	2	6	1759	1764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618481
46	NC_012726	TAA	2	6	1801	1806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618481
47	NC_012726	CAAA	2	8	1810	1817	75 %	0 %	0 %	25 %	238618481
48	NC_012726	AGA	2	6	1832	1837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618481
49	NC_012726	ATA	2	6	1847	1852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618481
50	NC_012726	TGG	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618481
51	NC_012726	AAG	2	6	1919	1924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618481
52	NC_012726	GTATTG	2	12	1986	1997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	238618481
53	NC_012726	TGA	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618481
54	NC_012726	AGA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
55	NC_012726	AGA	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
56	NC_012726	CTA	2	6	2141	2146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618482
57	NC_012726	GGA	2	6	2162	2167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618482
58	NC_012726	AAG	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
59	NC_012726	AT	3	6	2186	2191	50 %	50 %	0 %	0 %	238618482
60	NC_012726	AAG	3	9	2243	2251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
61	NC_012726	GAA	2	6	2271	2276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
62	NC_012726	AAG	2	6	2277	2282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
63	NC_012726	ATT	2	6	2292	2297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618482
64	NC_012726	ATT	2	6	2313	2318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618482
65	NC_012726	ATT	2	6	2323	2328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618482
66	NC_012726	TAAA	2	8	2369	2376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012726	TA	5	10	2385	2394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012726	ATA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
69	NC_012726	TAT	2	6	2468	2473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618483
70	NC_012726	TAA	2	6	2503	2508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
71	NC_012726	TAA	2	6	2512	2517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
72	NC_012726	TA	3	6	2523	2528	50 %	50 %	0 %	0 %	238618483
73	NC_012726	TAGG	2	8	2566	2573	25 %	25 %	50 %	0 %	238618483
74	NC_012726	AGA	2	6	2582	2587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618483
75	NC_012726	CTTT	2	8	2664	2671	0 %	75 %	0 %	25 %	238618483
76	NC_012726	AGC	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238618483
77	NC_012726	ATT	2	6	2716	2721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618483
78	NC_012726	GAT	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618483
79	NC_012726	TAA	2	6	2830	2835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
80	NC_012726	TGC	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238618483
81	NC_012726	AAT	2	6	2876	2881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
82	NC_012726	TGC	2	6	2888	2893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238618483
83	NC_012726	GCA	2	6	2976	2981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238618483
84	NC_012726	TGAT	2	8	2989	2996	25 %	50 %	25 %	0 %	238618483
85	NC_012726	TA	3	6	3069	3074	50 %	50 %	0 %	0 %	238618483
86	NC_012726	TAC	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618483
87	NC_012726	AATTGC	2	12	3086	3097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238618483
88	NC_012726	AAT	2	6	3131	3136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
89	NC_012726	T	6	6	3251	3256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012726	T	6	6	3275	3280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012726	GGTT	2	8	3326	3333	0 %	50 %	50 %	0 %	238618484
92	NC_012726	GAA	2	6	3349	3354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618484
93	NC_012726	AAG	2	6	3359	3364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618484
94	NC_012726	TTTAAG	2	12	3368	3379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238618484
95	NC_012726	CAAT	2	8	3389	3396	50 %	25 %	0 %	25 %	238618484
96	NC_012726	ATC	3	9	3438	3446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618484
97	NC_012726	TAT	2	6	3461	3466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618484
98	NC_012726	AAC	2	6	3487	3492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238618484
99	NC_012726	GGA	2	6	3503	3508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618484
100	NC_012726	TGA	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618484
101	NC_012726	AAG	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618485
102	NC_012726	AGAA	2	8	3658	3665	75 %	0 %	25 %	0 %	238618485
103	NC_012726	CCA	2	6	3682	3687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238618485
104	NC_012726	TTTA	2	8	3699	3706	25 %	75 %	0 %	0 %	238618485
105	NC_012726	TCC	2	6	3814	3819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238618485
106	NC_012726	TCCTT	2	10	3846	3855	0 %	60 %	0 %	40 %	238618485
107	NC_012726	TTA	2	6	3872	3877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618485
108	NC_012726	ACTA	2	8	3924	3931	50 %	25 %	0 %	25 %	238618485
109	NC_012726	TTG	2	6	3941	3946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618485
110	NC_012726	TAT	3	9	3957	3965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618485
111	NC_012726	T	6	6	3965	3970	0 %	100 %	0 %	0 %	238618485
112	NC_012726	A	6	6	3979	3984	100 %	0 %	0 %	0 %	238618485
113	NC_012726	TAA	2	6	4048	4053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618485
114	NC_012726	TAG	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618485
115	NC_012726	A	6	6	4075	4080	100 %	0 %	0 %	0 %	238618485
116	NC_012726	CGTTA	2	10	4089	4098	20 %	40 %	20 %	20 %	238618485
117	NC_012726	T	6	6	4145	4150	0 %	100 %	0 %	0 %	238618485
118	NC_012726	TCC	2	6	4162	4167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238618485
119	NC_012726	CTT	2	6	4207	4212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618485
120	NC_012726	CATT	2	8	4224	4231	25 %	50 %	0 %	25 %	238618485
121	NC_012726	TC	3	6	4277	4282	0 %	50 %	0 %	50 %	238618486
122	NC_012726	TC	3	6	4313	4318	0 %	50 %	0 %	50 %	238618486
123	NC_012726	CCTCTG	2	12	4504	4515	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	238618486
124	NC_012726	CTGTG	2	10	4520	4529	0 %	40 %	40 %	20 %	238618486
125	NC_012726	AAG	2	6	4536	4541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618486
126	NC_012726	CCA	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238618486
127	NC_012726	GTAAT	2	10	4666	4675	40 %	40 %	20 %	0 %	238618486
128	NC_012726	AAT	2	6	4708	4713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618486
129	NC_012726	GTTTT	2	10	4740	4749	0 %	80 %	20 %	0 %	238618486
130	NC_012726	TC	3	6	4783	4788	0 %	50 %	0 %	50 %	238618486
131	NC_012726	AGG	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618486
132	NC_012726	TAT	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012726	TCT	2	6	4950	4955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618487
134	NC_012726	TACG	2	8	4988	4995	25 %	25 %	25 %	25 %	238618487
135	NC_012726	TA	3	6	5002	5007	50 %	50 %	0 %	0 %	238618487
136	NC_012726	ATTGAT	2	12	5012	5023	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238618487
137	NC_012726	CTT	2	6	5047	5052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618487
138	NC_012726	TAA	2	6	5054	5059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618487
139	NC_012726	CTAAA	2	10	5083	5092	60 %	20 %	0 %	20 %	238618487
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141	NC_012726	CAT	2	6	5251	5256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618487
142	NC_012726	CTTAT	2	10	5289	5298	20 %	60 %	0 %	20 %	238618487
143	NC_012726	AT	3	6	5297	5302	50 %	50 %	0 %	0 %	238618487
144	NC_012726	TCT	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618487
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150	NC_012726	TACAAA	2	12	5743	5754	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_012726	TAT	2	6	5840	5845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_012726	GAA	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012726	ATGTT	2	10	6113	6122	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_012726	GTA	2	6	9070	9075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_012726	A	6	6	9856	9861	100 %	0 %	0 %	0 %	238618492
258	NC_012726	CATC	2	8	9904	9911	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
259	NC_012726	TCA	2	6	9925	9930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618493
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261	NC_012726	ATTT	2	8	10016	10023	25 %	75 %	0 %	0 %	238618493
262	NC_012726	TTATA	2	10	10159	10168	40 %	60 %	0 %	0 %	238618493
263	NC_012726	AG	4	8	10177	10184	50 %	0 %	50 %	0 %	238618493
264	NC_012726	GAGT	2	8	10193	10200	25 %	25 %	50 %	0 %	238618493
265	NC_012726	ATC	2	6	10250	10255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618493
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268	NC_012726	ATCC	2	8	10293	10300	25 %	25 %	0 %	50 %	238618493
269	NC_012726	TTA	2	6	10314	10319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618493
270	NC_012726	ATA	2	6	10350	10355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618493
271	NC_012726	TCT	2	6	10481	10486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618493
272	NC_012726	ATA	2	6	10556	10561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618493
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379	NC_012726	TAT	2	6	16077	16082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618496
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381	NC_012726	ATC	2	6	16212	16217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618496
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385	NC_012726	ATT	2	6	16340	16345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_012726	TAA	2	6	16559	16564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618497
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393	NC_012726	TCT	2	6	16698	16703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618497
394	NC_012726	ACT	2	6	16767	16772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618497
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397	NC_012726	TAT	2	6	16873	16878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618497
398	NC_012726	T	6	6	16880	16885	0 %	100 %	0 %	0 %	238618497
399	NC_012726	TCGC	2	8	16925	16932	0 %	25 %	25 %	50 %	238618497
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401	NC_012726	ATTA	2	8	17049	17056	50 %	50 %	0 %	0 %	238618498
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