MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 59755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_012632	CCT	2	6	2169085	2169090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229585733
48502	NC_012632	TGT	2	6	2169095	2169100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229585733
48503	NC_012632	ATTG	2	8	2169108	2169115	25 %	50 %	25 %	0 %	229585733
48504	NC_012632	T	6	6	2169195	2169200	0 %	100 %	0 %	0 %	229585733
48505	NC_012632	TCATT	2	10	2169220	2169229	20 %	60 %	0 %	20 %	229585733
48506	NC_012632	GTC	2	6	2169296	2169301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48507	NC_012632	ATT	2	6	2169364	2169369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585734
48508	NC_012632	ATC	2	6	2169382	2169387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585734
48509	NC_012632	ACC	2	6	2169396	2169401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229585734
48510	NC_012632	GAAT	2	8	2169428	2169435	50 %	25 %	25 %	0 %	229585734
48511	NC_012632	GAAAA	2	10	2169522	2169531	80 %	0 %	20 %	0 %	229585734
48512	NC_012632	TTA	2	6	2169533	2169538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585734
48513	NC_012632	ATG	2	6	2169539	2169544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585734
48514	NC_012632	CTA	2	6	2169584	2169589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585734
48515	NC_012632	TGC	2	6	2169591	2169596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229585734
48516	NC_012632	CTA	2	6	2169605	2169610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585734
48517	NC_012632	AGT	2	6	2169626	2169631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585734
48518	NC_012632	TAG	2	6	2169639	2169644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585734
48519	NC_012632	TAT	2	6	2169654	2169659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585734
48520	NC_012632	ATT	2	6	2169697	2169702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585734
48521	NC_012632	AAT	2	6	2169749	2169754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229585734
48522	NC_012632	A	6	6	2169780	2169785	100 %	0 %	0 %	0 %	229585734
48523	NC_012632	CAT	2	6	2169846	2169851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585734
48524	NC_012632	T	6	6	2169857	2169862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48525	NC_012632	ATT	2	6	2169867	2169872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48526	NC_012632	ATA	2	6	2169973	2169978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229585735
48527	NC_012632	CCA	2	6	2170019	2170024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229585735
48528	NC_012632	GAA	2	6	2170092	2170097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229585735
48529	NC_012632	CTT	2	6	2170117	2170122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585735
48530	NC_012632	TCCT	2	8	2170149	2170156	0 %	50 %	0 %	50 %	229585735
48531	NC_012632	CT	3	6	2170257	2170262	0 %	50 %	0 %	50 %	229585735
48532	NC_012632	AG	3	6	2170270	2170275	50 %	0 %	50 %	0 %	229585735
48533	NC_012632	ATT	2	6	2170277	2170282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585735
48534	NC_012632	AC	3	6	2170290	2170295	50 %	0 %	0 %	50 %	229585735
48535	NC_012632	GTA	2	6	2170333	2170338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585735
48536	NC_012632	TAT	2	6	2170342	2170347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585735
48537	NC_012632	TTC	2	6	2170429	2170434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585735
48538	NC_012632	ACT	2	6	2170548	2170553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48539	NC_012632	TCT	2	6	2170577	2170582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585736
48540	NC_012632	CTA	2	6	2170583	2170588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585736
48541	NC_012632	TAT	2	6	2170638	2170643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585736
48542	NC_012632	CCA	2	6	2170657	2170662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229585736
48543	NC_012632	AAT	2	6	2170721	2170726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229585736
48544	NC_012632	TCC	2	6	2170727	2170732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229585736
48545	NC_012632	ATT	2	6	2170771	2170776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585736
48546	NC_012632	GAAC	2	8	2170836	2170843	50 %	0 %	25 %	25 %	229585736
48547	NC_012632	AGA	2	6	2170949	2170954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229585736
48548	NC_012632	TTTTC	2	10	2170991	2171000	0 %	80 %	0 %	20 %	229585736
48549	NC_012632	TA	3	6	2171006	2171011	50 %	50 %	0 %	0 %	229585736
48550	NC_012632	A	6	6	2171023	2171028	100 %	0 %	0 %	0 %	229585736
48551	NC_012632	AT	3	6	2171100	2171105	50 %	50 %	0 %	0 %	229585736
48552	NC_012632	TAT	4	12	2171121	2171132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585736
48553	NC_012632	TGGC	2	8	2171141	2171148	0 %	25 %	50 %	25 %	229585736
48554	NC_012632	TAAA	2	8	2171158	2171165	75 %	25 %	0 %	0 %	229585736
48555	NC_012632	GGAATT	2	12	2171212	2171223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585736
48556	NC_012632	AGA	2	6	2171300	2171305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229585736
48557	NC_012632	TGC	2	6	2171319	2171324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229585736
48558	NC_012632	TAA	2	6	2171367	2171372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229585736
48559	NC_012632	A	6	6	2171386	2171391	100 %	0 %	0 %	0 %	229585736
48560	NC_012632	CTCTT	2	10	2171392	2171401	0 %	60 %	0 %	40 %	229585736
48561	NC_012632	CT	3	6	2171408	2171413	0 %	50 %	0 %	50 %	229585736
48562	NC_012632	TTC	2	6	2171424	2171429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585736
48563	NC_012632	CTT	2	6	2171449	2171454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585737
48564	NC_012632	GCTTT	2	10	2171455	2171464	0 %	60 %	20 %	20 %	229585737
48565	NC_012632	CTA	2	6	2171490	2171495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585737
48566	NC_012632	TCT	2	6	2171499	2171504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585737
48567	NC_012632	TTC	2	6	2171509	2171514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585737
48568	NC_012632	CTC	2	6	2171525	2171530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229585737
48569	NC_012632	CAT	2	6	2171557	2171562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585737
48570	NC_012632	TTG	2	6	2171563	2171568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229585737
48571	NC_012632	CATTTC	2	12	2171569	2171580	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	229585737
48572	NC_012632	CTT	2	6	2171596	2171601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585737
48573	NC_012632	GAT	2	6	2171651	2171656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585737
48574	NC_012632	AGA	2	6	2171661	2171666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229585737
48575	NC_012632	ATTATA	2	12	2171687	2171698	50 %	50 %	0 %	0 %	229585737
48576	NC_012632	TATC	2	8	2171709	2171716	25 %	50 %	0 %	25 %	229585737
48577	NC_012632	TAT	2	6	2171754	2171759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48578	NC_012632	TAA	2	6	2171767	2171772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48579	NC_012632	GGGA	2	8	2171854	2171861	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48580	NC_012632	ATC	2	6	2171874	2171879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48581	NC_012632	TTA	2	6	2171911	2171916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48582	NC_012632	AT	3	6	2171978	2171983	50 %	50 %	0 %	0 %	229585738
48583	NC_012632	CA	3	6	2171991	2171996	50 %	0 %	0 %	50 %	229585738
48584	NC_012632	AGGC	2	8	2172075	2172082	25 %	0 %	50 %	25 %	229585738
48585	NC_012632	CA	3	6	2172095	2172100	50 %	0 %	0 %	50 %	229585738
48586	NC_012632	AGG	2	6	2172123	2172128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229585738
48587	NC_012632	GAAG	2	8	2172133	2172140	50 %	0 %	50 %	0 %	229585738
48588	NC_012632	TAGTT	2	10	2172217	2172226	20 %	60 %	20 %	0 %	229585738
48589	NC_012632	AGG	2	6	2172298	2172303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229585738
48590	NC_012632	AATGGC	2	12	2172331	2172342	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	229585738
48591	NC_012632	CAG	2	6	2172381	2172386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229585738
48592	NC_012632	ATT	2	6	2172529	2172534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585738
48593	NC_012632	ATGT	2	8	2172626	2172633	25 %	50 %	25 %	0 %	229585738
48594	NC_012632	AAC	2	6	2172724	2172729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229585738
48595	NC_012632	CAA	2	6	2172750	2172755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229585738
48596	NC_012632	GAT	2	6	2172812	2172817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585738
48597	NC_012632	AT	3	6	2172844	2172849	50 %	50 %	0 %	0 %	229585738
48598	NC_012632	TGG	2	6	2172865	2172870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229585738
48599	NC_012632	AGT	2	6	2172913	2172918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585738
48600	NC_012632	ACT	2	6	2172928	2172933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585738
48601	NC_012632	AGG	2	6	2173069	2173074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229585738
48602	NC_012632	GTT	2	6	2173139	2173144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229585738
48603	NC_012632	GAC	2	6	2173181	2173186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229585738
48604	NC_012632	AGGG	2	8	2173217	2173224	25 %	0 %	75 %	0 %	229585738
48605	NC_012632	GGT	2	6	2173406	2173411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229585738
48606	NC_012632	TGAT	2	8	2173446	2173453	25 %	50 %	25 %	0 %	229585738
48607	NC_012632	GACTT	2	10	2173467	2173476	20 %	40 %	20 %	20 %	229585738
48608	NC_012632	GAG	3	9	2173487	2173495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229585738
48609	NC_012632	TCC	2	6	2173522	2173527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229585738
48610	NC_012632	CCT	2	6	2173566	2173571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229585738
48611	NC_012632	T	6	6	2173616	2173621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48612	NC_012632	TATG	2	8	2173645	2173652	25 %	50 %	25 %	0 %	229585739
48613	NC_012632	AGG	2	6	2173769	2173774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229585739
48614	NC_012632	TTG	2	6	2173778	2173783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229585739
48615	NC_012632	A	6	6	2173819	2173824	100 %	0 %	0 %	0 %	229585739
48616	NC_012632	TAGA	2	8	2173854	2173861	50 %	25 %	25 %	0 %	229585739
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48618	NC_012632	GCTAAA	2	12	2173949	2173960	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	229585739
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48679	NC_012632	AATGA	2	10	2176745	2176754	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48680	NC_012632	AAT	2	6	2176778	2176783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48683	NC_012632	TTTA	2	8	2176884	2176891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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