MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 59755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_012632	AAC	2	6	853413	853418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19002	NC_012632	ATTT	2	8	853427	853434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19003	NC_012632	CAT	2	6	853488	853493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19004	NC_012632	AT	3	6	853495	853500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19005	NC_012632	TTTA	2	8	853508	853515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19006	NC_012632	ATTA	2	8	853519	853526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19007	NC_012632	TTA	2	6	853550	853555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19008	NC_012632	TAAA	2	8	853608	853615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19009	NC_012632	AGT	2	6	853707	853712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584365
19010	NC_012632	TGT	2	6	853746	853751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229584365
19011	NC_012632	A	6	6	853783	853788	100 %	0 %	0 %	0 %	229584365
19012	NC_012632	A	6	6	853809	853814	100 %	0 %	0 %	0 %	229584365
19013	NC_012632	TAA	2	6	853817	853822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584365
19014	NC_012632	ATG	2	6	853874	853879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584365
19015	NC_012632	TAAA	2	8	853898	853905	75 %	25 %	0 %	0 %	229584365
19016	NC_012632	AAT	2	6	853906	853911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584365
19017	NC_012632	ATAA	2	8	853981	853988	75 %	25 %	0 %	0 %	229584365
19018	NC_012632	ATAA	2	8	854020	854027	75 %	25 %	0 %	0 %	229584365
19019	NC_012632	ACA	2	6	854057	854062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229584365
19020	NC_012632	TAA	2	6	854154	854159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584365
19021	NC_012632	TAT	2	6	854188	854193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584365
19022	NC_012632	GAA	2	6	854208	854213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584365
19023	NC_012632	AAT	2	6	854214	854219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584365
19024	NC_012632	A	6	6	854220	854225	100 %	0 %	0 %	0 %	229584365
19025	NC_012632	CTA	2	6	854297	854302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19026	NC_012632	TTTA	2	8	854314	854321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19027	NC_012632	TAAA	2	8	854326	854333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19028	NC_012632	ATAGTA	2	12	854336	854347	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19029	NC_012632	TAA	2	6	854371	854376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19030	NC_012632	T	6	6	854403	854408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19031	NC_012632	TAA	2	6	854458	854463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19032	NC_012632	TAGGAT	2	12	854682	854693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584366
19033	NC_012632	A	6	6	854697	854702	100 %	0 %	0 %	0 %	229584366
19034	NC_012632	TAA	2	6	854732	854737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584366
19035	NC_012632	ATAAAA	2	12	854764	854775	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	229584366
19036	NC_012632	ATA	2	6	854807	854812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584366
19037	NC_012632	TAT	2	6	854814	854819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584366
19038	NC_012632	GTAA	2	8	854821	854828	50 %	25 %	25 %	0 %	229584366
19039	NC_012632	TAA	2	6	854868	854873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584366
19040	NC_012632	CTC	2	6	854909	854914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229584366
19041	NC_012632	ATA	2	6	854935	854940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584366
19042	NC_012632	GAG	2	6	854959	854964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584366
19043	NC_012632	TTG	2	6	855014	855019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229584366
19044	NC_012632	ACT	2	6	855046	855051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584366
19045	NC_012632	TAT	2	6	855081	855086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584366
19046	NC_012632	TA	3	6	855091	855096	50 %	50 %	0 %	0 %	229584366
19047	NC_012632	TTTA	2	8	855167	855174	25 %	75 %	0 %	0 %	229584366
19048	NC_012632	ATG	2	6	855206	855211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584366
19049	NC_012632	A	6	6	855227	855232	100 %	0 %	0 %	0 %	229584366
19050	NC_012632	A	6	6	855235	855240	100 %	0 %	0 %	0 %	229584366
19051	NC_012632	A	6	6	855308	855313	100 %	0 %	0 %	0 %	229584366
19052	NC_012632	AAG	2	6	855320	855325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584366
19053	NC_012632	GA	3	6	855404	855409	50 %	0 %	50 %	0 %	229584366
19054	NC_012632	TTA	2	6	855418	855423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584366
19055	NC_012632	AGAA	2	8	855550	855557	75 %	0 %	25 %	0 %	229584366
19056	NC_012632	A	6	6	855602	855607	100 %	0 %	0 %	0 %	229584366
19057	NC_012632	ATT	2	6	855642	855647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584366
19058	NC_012632	GGTA	2	8	855655	855662	25 %	25 %	50 %	0 %	229584366
19059	NC_012632	TG	3	6	855685	855690	0 %	50 %	50 %	0 %	229584367
19060	NC_012632	TAATG	2	10	855701	855710	40 %	40 %	20 %	0 %	229584367
19061	NC_012632	TAA	2	6	855772	855777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584367
19062	NC_012632	AAG	2	6	855787	855792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584367
19063	NC_012632	GGT	2	6	855855	855860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229584367
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19066	NC_012632	ATA	2	6	856092	856097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584367
19067	NC_012632	GGA	3	9	856101	856109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584367
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19070	NC_012632	ATT	2	6	856263	856268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584367
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19073	NC_012632	AATA	2	8	856319	856326	75 %	25 %	0 %	0 %	229584367
19074	NC_012632	TTAC	2	8	856327	856334	25 %	50 %	0 %	25 %	229584367
19075	NC_012632	GAAA	2	8	856365	856372	75 %	0 %	25 %	0 %	229584367
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19080	NC_012632	TA	3	6	856484	856489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19081	NC_012632	TTA	2	6	856495	856500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19082	NC_012632	TA	3	6	856550	856555	50 %	50 %	0 %	0 %	229584368
19083	NC_012632	ATAG	2	8	856562	856569	50 %	25 %	25 %	0 %	229584368
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19087	NC_012632	A	6	6	856947	856952	100 %	0 %	0 %	0 %	229584368
19088	NC_012632	CA	3	6	857142	857147	50 %	0 %	0 %	50 %	229584368
19089	NC_012632	TGA	2	6	857158	857163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584368
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19091	NC_012632	GAG	2	6	857203	857208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584368
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19093	NC_012632	TTA	2	6	857298	857303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584368
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19095	NC_012632	ATTA	2	8	857425	857432	50 %	50 %	0 %	0 %	229584368
19096	NC_012632	AGA	2	6	857507	857512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584368
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19103	NC_012632	ACT	2	6	857861	857866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584368
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19106	NC_012632	AAAGA	2	10	857943	857952	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19107	NC_012632	ATA	2	6	857959	857964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584369
19108	NC_012632	TA	4	8	857995	858002	50 %	50 %	0 %	0 %	229584369
19109	NC_012632	ATAG	2	8	858009	858016	50 %	25 %	25 %	0 %	229584369
19110	NC_012632	TAT	2	6	858046	858051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584369
19111	NC_012632	T	7	7	858068	858074	0 %	100 %	0 %	0 %	229584369
19112	NC_012632	AT	3	6	858081	858086	50 %	50 %	0 %	0 %	229584369
19113	NC_012632	ACT	2	6	858132	858137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584369
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19116	NC_012632	AT	3	6	858179	858184	50 %	50 %	0 %	0 %	229584369
19117	NC_012632	TAGGAT	2	12	858196	858207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584369
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19120	NC_012632	ACAT	2	8	858408	858415	50 %	25 %	0 %	25 %	229584369
19121	NC_012632	GGTTG	2	10	858435	858444	0 %	40 %	60 %	0 %	229584369
19122	NC_012632	AGTT	2	8	858475	858482	25 %	50 %	25 %	0 %	229584369
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19124	NC_012632	TGA	2	6	858608	858613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584369
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19146	NC_012632	ATGAT	2	10	859560	859569	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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19152	NC_012632	TCT	2	6	859741	859746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19153	NC_012632	TC	3	6	859759	859764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19241	NC_012632	TAT	2	6	863087	863092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19243	NC_012632	TA	3	6	863154	863159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19247	NC_012632	TAG	2	6	863259	863264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584372
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19253	NC_012632	AATT	2	8	863616	863623	50 %	50 %	0 %	0 %	229584372
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19372	NC_012632	AG	3	6	868460	868465	50 %	0 %	50 %	0 %	229584376
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19376	NC_012632	AAAT	2	8	868543	868550	75 %	25 %	0 %	0 %	229584376
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19385	NC_012632	ATAG	2	8	868953	868960	50 %	25 %	25 %	0 %	229584376
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19411	NC_012632	AT	3	6	869754	869759	50 %	50 %	0 %	0 %	229584376
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19434	NC_012632	ATC	2	6	871043	871048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19437	NC_012632	TTA	2	6	871183	871188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19457	NC_012632	AAGT	2	8	872433	872440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19458	NC_012632	TCA	2	6	872448	872453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19461	NC_012632	CCT	2	6	872626	872631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19464	NC_012632	AAC	2	6	872735	872740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19465	NC_012632	ATG	2	6	872741	872746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19467	NC_012632	TAA	2	6	872810	872815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19468	NC_012632	GTT	2	6	872829	872834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19473	NC_012632	GA	3	6	873136	873141	50 %	0 %	50 %	0 %	229584378
19474	NC_012632	GTA	2	6	873179	873184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584378
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19477	NC_012632	ACT	2	6	873255	873260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584378
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19479	NC_012632	GTAGT	2	10	873522	873531	20 %	40 %	40 %	0 %	229584378
19480	NC_012632	AGG	2	6	873551	873556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584378
19481	NC_012632	TCA	2	6	873558	873563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584378
19482	NC_012632	GGAG	2	8	873577	873584	25 %	0 %	75 %	0 %	229584378
19483	NC_012632	CTTA	2	8	873639	873646	25 %	50 %	0 %	25 %	229584378
19484	NC_012632	GCTGA	2	10	873647	873656	20 %	20 %	40 %	20 %	229584378
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19487	NC_012632	TA	3	6	873699	873704	50 %	50 %	0 %	0 %	229584378
19488	NC_012632	GAG	2	6	873752	873757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584378
19489	NC_012632	AAGAGG	2	12	873845	873856	50 %	0 %	50 %	0 %	229584378
19490	NC_012632	TGG	2	6	873885	873890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229584378
19491	NC_012632	GGA	2	6	873937	873942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584378
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19493	NC_012632	TGA	2	6	873987	873992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584378
19494	NC_012632	AAC	2	6	874018	874023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19495	NC_012632	GAC	2	6	874049	874054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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