MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 59755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_012632	TGG	2	6	809098	809103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18002	NC_012632	GGA	2	6	809150	809155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18003	NC_012632	AGG	2	6	809183	809188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18004	NC_012632	TGA	2	6	809200	809205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_012632	AAC	2	6	809231	809236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18006	NC_012632	GTT	2	6	809284	809289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_012632	ATAA	2	8	809301	809308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18008	NC_012632	AGC	2	6	809337	809342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18009	NC_012632	TAT	2	6	809363	809368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18010	NC_012632	A	6	6	809388	809393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_012632	CTA	2	6	809410	809415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18012	NC_012632	TAA	2	6	809459	809464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18013	NC_012632	TTC	2	6	809465	809470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18014	NC_012632	TTC	2	6	809489	809494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18015	NC_012632	TAA	2	6	809509	809514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_012632	TAT	2	6	809523	809528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_012632	AT	3	6	809579	809584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18018	NC_012632	TCT	2	6	809592	809597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18019	NC_012632	ATT	2	6	809644	809649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_012632	ATT	2	6	809667	809672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18021	NC_012632	TAA	2	6	809673	809678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_012632	AT	3	6	809685	809690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18023	NC_012632	A	6	6	809702	809707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18024	NC_012632	CT	3	6	809739	809744	0 %	50 %	0 %	50 %	229584326
18025	NC_012632	CTTAA	2	10	809819	809828	40 %	40 %	0 %	20 %	229584326
18026	NC_012632	ATT	2	6	809900	809905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584326
18027	NC_012632	ATTA	2	8	809965	809972	50 %	50 %	0 %	0 %	229584326
18028	NC_012632	ACT	2	6	810007	810012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584326
18029	NC_012632	AAG	2	6	810020	810025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584326
18030	NC_012632	AT	3	6	810045	810050	50 %	50 %	0 %	0 %	229584326
18031	NC_012632	TAG	2	6	810085	810090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584326
18032	NC_012632	TCC	2	6	810094	810099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229584326
18033	NC_012632	TCT	2	6	810105	810110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229584326
18034	NC_012632	AGG	2	6	810193	810198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584326
18035	NC_012632	TCA	2	6	810215	810220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584326
18036	NC_012632	CCT	2	6	810266	810271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229584326
18037	NC_012632	T	6	6	810273	810278	0 %	100 %	0 %	0 %	229584326
18038	NC_012632	TTA	2	6	810390	810395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584326
18039	NC_012632	ACA	2	6	810407	810412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229584326
18040	NC_012632	CCA	2	6	810416	810421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229584326
18041	NC_012632	TCT	2	6	810524	810529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229584326
18042	NC_012632	CT	3	6	810543	810548	0 %	50 %	0 %	50 %	229584326
18043	NC_012632	CTC	2	6	810564	810569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229584326
18044	NC_012632	TAT	2	6	810570	810575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584326
18045	NC_012632	CCA	2	6	810579	810584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229584326
18046	NC_012632	TAC	2	6	810610	810615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584326
18047	NC_012632	ATCC	2	8	810635	810642	25 %	25 %	0 %	50 %	229584326
18048	NC_012632	CAT	2	6	810666	810671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584326
18049	NC_012632	GCA	2	6	810728	810733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229584326
18050	NC_012632	ACA	2	6	810743	810748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229584326
18051	NC_012632	AGT	2	6	810763	810768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584326
18052	NC_012632	GAA	2	6	810830	810835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584326
18053	NC_012632	AACT	2	8	810876	810883	50 %	25 %	0 %	25 %	229584326
18054	NC_012632	CT	3	6	810916	810921	0 %	50 %	0 %	50 %	229584326
18055	NC_012632	TA	4	8	811020	811027	50 %	50 %	0 %	0 %	229584326
18056	NC_012632	TAG	2	6	811035	811040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584326
18057	NC_012632	CAT	2	6	811063	811068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584326
18058	NC_012632	ATTTG	2	10	811121	811130	20 %	60 %	20 %	0 %	229584326
18059	NC_012632	TCA	2	6	811175	811180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584326
18060	NC_012632	TCC	2	6	811202	811207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229584326
18061	NC_012632	TA	3	6	811269	811274	50 %	50 %	0 %	0 %	229584326
18062	NC_012632	CAT	2	6	811278	811283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584326
18063	NC_012632	GTC	2	6	811285	811290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229584326
18064	NC_012632	ATA	2	6	811337	811342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584326
18065	NC_012632	TAA	2	6	811417	811422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18066	NC_012632	AT	4	8	811455	811462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18067	NC_012632	AT	4	8	811494	811501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18068	NC_012632	AT	3	6	811523	811528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18069	NC_012632	TAAA	2	8	811529	811536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18070	NC_012632	ATAG	2	8	811542	811549	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18071	NC_012632	AT	5	10	811574	811583	50 %	50 %	0 %	0 %	229584327
18072	NC_012632	GAA	2	6	811590	811595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584327
18073	NC_012632	AT	3	6	811597	811602	50 %	50 %	0 %	0 %	229584327
18074	NC_012632	AGG	2	6	811623	811628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584327
18075	NC_012632	AGG	2	6	811659	811664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584327
18076	NC_012632	CAG	2	6	811721	811726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229584327
18077	NC_012632	AT	3	6	811749	811754	50 %	50 %	0 %	0 %	229584327
18078	NC_012632	GATGC	2	10	811780	811789	20 %	20 %	40 %	20 %	229584327
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18080	NC_012632	AAG	2	6	811984	811989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584327
18081	NC_012632	ATT	2	6	812004	812009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584327
18082	NC_012632	GAG	2	6	812030	812035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584327
18083	NC_012632	ATT	2	6	812042	812047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584327
18084	NC_012632	AC	4	8	812142	812149	50 %	0 %	0 %	50 %	229584327
18085	NC_012632	TTC	2	6	812162	812167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229584327
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18087	NC_012632	ATT	2	6	812210	812215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584327
18088	NC_012632	CTT	2	6	812257	812262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229584327
18089	NC_012632	AAG	2	6	812498	812503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584328
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18091	NC_012632	AGA	2	6	812583	812588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584328
18092	NC_012632	GAA	2	6	812605	812610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584328
18093	NC_012632	AAAG	2	8	812625	812632	75 %	0 %	25 %	0 %	229584328
18094	NC_012632	AGA	2	6	812634	812639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584328
18095	NC_012632	GAT	2	6	812656	812661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584328
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18097	NC_012632	GGA	2	6	812728	812733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584328
18098	NC_012632	CA	3	6	812770	812775	50 %	0 %	0 %	50 %	229584328
18099	NC_012632	TA	3	6	812797	812802	50 %	50 %	0 %	0 %	229584328
18100	NC_012632	CTA	2	6	812864	812869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584328
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18103	NC_012632	TA	3	6	812953	812958	50 %	50 %	0 %	0 %	229584328
18104	NC_012632	TAG	2	6	812975	812980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584328
18105	NC_012632	ACT	2	6	812989	812994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584328
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18107	NC_012632	AAG	2	6	813189	813194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584328
18108	NC_012632	ATG	2	6	813235	813240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584328
18109	NC_012632	AAT	2	6	813462	813467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584328
18110	NC_012632	GA	3	6	813505	813510	50 %	0 %	50 %	0 %	229584328
18111	NC_012632	GA	3	6	813564	813569	50 %	0 %	50 %	0 %	229584328
18112	NC_012632	GGA	2	6	813663	813668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584328
18113	NC_012632	A	6	6	813672	813677	100 %	0 %	0 %	0 %	229584328
18114	NC_012632	T	6	6	813705	813710	0 %	100 %	0 %	0 %	229584329
18115	NC_012632	CTTT	2	8	813711	813718	0 %	75 %	0 %	25 %	229584329
18116	NC_012632	TTCTAT	2	12	813777	813788	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	229584329
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18121	NC_012632	TCT	2	6	813961	813966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229584329
18122	NC_012632	T	6	6	814090	814095	0 %	100 %	0 %	0 %	229584329
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18124	NC_012632	CTA	2	6	814205	814210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584329
18125	NC_012632	TCC	2	6	814228	814233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229584329
18126	NC_012632	AGT	2	6	814287	814292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584329
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18143	NC_012632	ATT	2	6	815215	815220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18144	NC_012632	TTTA	2	8	815230	815237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18145	NC_012632	TAG	2	6	815238	815243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18146	NC_012632	TCT	2	6	815258	815263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18147	NC_012632	T	6	6	815377	815382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18148	NC_012632	TA	3	6	815395	815400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18149	NC_012632	AAT	2	6	815410	815415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18150	NC_012632	AGTT	2	8	815424	815431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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18162	NC_012632	AAT	2	6	815982	815987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18163	NC_012632	GTA	2	6	816019	816024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18165	NC_012632	T	6	6	816059	816064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18223	NC_012632	GTT	2	6	818512	818517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18224	NC_012632	CTA	2	6	818568	818573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18227	NC_012632	ATA	2	6	818693	818698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18228	NC_012632	CCT	2	6	818755	818760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18229	NC_012632	CCT	2	6	818777	818782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18230	NC_012632	CAGC	2	8	818800	818807	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18231	NC_012632	ATG	2	6	818812	818817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18232	NC_012632	TCC	2	6	818923	818928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18233	NC_012632	GTA	2	6	818930	818935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18234	NC_012632	GAAGA	2	10	818979	818988	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18235	NC_012632	TA	4	8	819035	819042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18236	NC_012632	TAT	2	6	819092	819097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18237	NC_012632	GAA	2	6	819142	819147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18239	NC_012632	TGAA	2	8	819165	819172	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18240	NC_012632	GAA	2	6	819188	819193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18241	NC_012632	GAA	2	6	819234	819239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18242	NC_012632	TAA	2	6	819257	819262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584336
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18245	NC_012632	G	6	6	819348	819353	0 %	0 %	100 %	0 %	229584336
18246	NC_012632	CAA	2	6	819380	819385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229584336
18247	NC_012632	AG	3	6	819448	819453	50 %	0 %	50 %	0 %	229584336
18248	NC_012632	AATA	2	8	819468	819475	75 %	25 %	0 %	0 %	229584336
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18250	NC_012632	GTC	2	6	819549	819554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229584336
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18372	NC_012632	GTAG	2	8	824828	824835	25 %	25 %	50 %	0 %	229584340
18373	NC_012632	ATA	2	6	824865	824870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584340
18374	NC_012632	GCT	2	6	824936	824941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229584340
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18376	NC_012632	CT	3	6	825093	825098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18377	NC_012632	TTA	2	6	825151	825156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18378	NC_012632	AGAA	2	8	825173	825180	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18379	NC_012632	ATT	2	6	825193	825198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18380	NC_012632	ATTT	2	8	825261	825268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18381	NC_012632	TGG	2	6	825381	825386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229584341
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18403	NC_012632	GTT	2	6	826453	826458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18407	NC_012632	GTA	2	6	826803	826808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584342
18408	NC_012632	GAC	2	6	826818	826823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229584342
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18430	NC_012632	CTT	2	6	827774	827779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18443	NC_012632	ATG	2	6	828322	828327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18445	NC_012632	ATG	2	6	828447	828452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18452	NC_012632	TA	3	6	828638	828643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18453	NC_012632	A	6	6	828690	828695	100 %	0 %	0 %	0 %	229584343
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18476	NC_012632	CTTA	2	8	830010	830017	25 %	50 %	0 %	25 %	229584344
18477	NC_012632	TCT	2	6	830122	830127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229584344
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18481	NC_012632	ATATT	2	10	830395	830404	40 %	60 %	0 %	0 %	229584344
18482	NC_012632	GAT	2	6	830423	830428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584344
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18484	NC_012632	TTCT	2	8	830560	830567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18485	NC_012632	TAA	2	6	830625	830630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18486	NC_012632	TGAT	2	8	830716	830723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18487	NC_012632	AGA	2	6	830745	830750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584345
18488	NC_012632	TGG	2	6	830817	830822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229584345
18489	NC_012632	AACA	2	8	830885	830892	75 %	0 %	0 %	25 %	229584345
18490	NC_012632	CAT	2	6	830903	830908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584345
18491	NC_012632	AC	3	6	831002	831007	50 %	0 %	0 %	50 %	229584345
18492	NC_012632	CTA	2	6	831046	831051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584345
18493	NC_012632	GTA	2	6	831079	831084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584345
18494	NC_012632	TA	3	6	831139	831144	50 %	50 %	0 %	0 %	229584345
18495	NC_012632	AGC	2	6	831306	831311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229584345
18496	NC_012632	AAT	2	6	831348	831353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584345
18497	NC_012632	TTC	2	6	831491	831496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229584345
18498	NC_012632	TGC	2	6	831519	831524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229584345
18499	NC_012632	CAA	2	6	831532	831537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229584345
18500	NC_012632	TATT	3	12	831554	831565	25 %	75 %	0 %	0 %	229584345

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