MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 59755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_012632	TTG	2	6	630285	630290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_012632	TCG	2	6	630338	630343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_012632	ATA	2	6	630370	630375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_012632	TATT	2	8	630376	630383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_012632	GGA	2	6	630400	630405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584172
14006	NC_012632	TTGGG	2	10	630448	630457	0 %	40 %	60 %	0 %	229584172
14007	NC_012632	TAG	2	6	630476	630481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584172
14008	NC_012632	CTC	2	6	630509	630514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229584172
14009	NC_012632	CTT	2	6	630524	630529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229584172
14010	NC_012632	TAGC	2	8	630539	630546	25 %	25 %	25 %	25 %	229584172
14011	NC_012632	T	7	7	630554	630560	0 %	100 %	0 %	0 %	229584172
14012	NC_012632	AGG	2	6	630597	630602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584172
14013	NC_012632	AGGA	2	8	630633	630640	50 %	0 %	50 %	0 %	229584172
14014	NC_012632	GTTT	2	8	630651	630658	0 %	75 %	25 %	0 %	229584172
14015	NC_012632	TTA	2	6	630736	630741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584172
14016	NC_012632	GAG	2	6	630791	630796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584172
14017	NC_012632	GTTA	2	8	630804	630811	25 %	50 %	25 %	0 %	229584172
14018	NC_012632	AGG	2	6	630861	630866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584172
14019	NC_012632	AGC	2	6	630867	630872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229584172
14020	NC_012632	TGC	2	6	630930	630935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229584172
14021	NC_012632	TAT	2	6	630975	630980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584172
14022	NC_012632	TAA	2	6	630986	630991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584172
14023	NC_012632	CTAA	2	8	631036	631043	50 %	25 %	0 %	25 %	229584172
14024	NC_012632	A	6	6	631061	631066	100 %	0 %	0 %	0 %	229584172
14025	NC_012632	TGG	2	6	631093	631098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229584172
14026	NC_012632	GCT	2	6	631114	631119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229584172
14027	NC_012632	TAG	2	6	631131	631136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584172
14028	NC_012632	T	6	6	631177	631182	0 %	100 %	0 %	0 %	229584172
14029	NC_012632	AC	3	6	631190	631195	50 %	0 %	0 %	50 %	229584172
14030	NC_012632	AT	3	6	631204	631209	50 %	50 %	0 %	0 %	229584172
14031	NC_012632	ATA	2	6	631217	631222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584172
14032	NC_012632	AT	3	6	631342	631347	50 %	50 %	0 %	0 %	229584172
14033	NC_012632	AAT	2	6	631350	631355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584172
14034	NC_012632	AT	3	6	631377	631382	50 %	50 %	0 %	0 %	229584172
14035	NC_012632	TAG	2	6	631406	631411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584172
14036	NC_012632	ACT	2	6	631468	631473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584172
14037	NC_012632	TCAA	2	8	631501	631508	50 %	25 %	0 %	25 %	229584172
14038	NC_012632	AT	3	6	631601	631606	50 %	50 %	0 %	0 %	229584172
14039	NC_012632	GGA	2	6	631621	631626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584172
14040	NC_012632	T	6	6	631689	631694	0 %	100 %	0 %	0 %	229584173
14041	NC_012632	CTT	3	9	631695	631703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229584173
14042	NC_012632	T	7	7	631702	631708	0 %	100 %	0 %	0 %	229584173
14043	NC_012632	T	6	6	631802	631807	0 %	100 %	0 %	0 %	229584173
14044	NC_012632	ATCC	2	8	631851	631858	25 %	25 %	0 %	50 %	229584173
14045	NC_012632	CTT	2	6	631923	631928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229584173
14046	NC_012632	TGT	2	6	631940	631945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229584173
14047	NC_012632	CT	3	6	631955	631960	0 %	50 %	0 %	50 %	229584173
14048	NC_012632	TCC	2	6	631964	631969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229584173
14049	NC_012632	CGT	2	6	632001	632006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229584173
14050	NC_012632	CTC	2	6	632007	632012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229584173
14051	NC_012632	CTT	2	6	632086	632091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229584173
14052	NC_012632	TTA	2	6	632172	632177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584173
14053	NC_012632	TCA	2	6	632192	632197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584173
14054	NC_012632	T	6	6	632323	632328	0 %	100 %	0 %	0 %	229584173
14055	NC_012632	ACT	2	6	632371	632376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584173
14056	NC_012632	TC	3	6	632402	632407	0 %	50 %	0 %	50 %	229584173
14057	NC_012632	TAA	2	6	632415	632420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584173
14058	NC_012632	AGG	2	6	632449	632454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584173
14059	NC_012632	CTA	2	6	632535	632540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584173
14060	NC_012632	TCCAA	2	10	632587	632596	40 %	20 %	0 %	40 %	229584173
14061	NC_012632	CTT	2	6	632628	632633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229584173
14062	NC_012632	TAC	2	6	632721	632726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584173
14063	NC_012632	GCTGG	2	10	632742	632751	0 %	20 %	60 %	20 %	229584173
14064	NC_012632	CT	3	6	632884	632889	0 %	50 %	0 %	50 %	229584173
14065	NC_012632	ATT	2	6	632903	632908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584173
14066	NC_012632	TA	3	6	632997	633002	50 %	50 %	0 %	0 %	229584173
14067	NC_012632	TTA	2	6	633015	633020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584173
14068	NC_012632	GTAA	2	8	633039	633046	50 %	25 %	25 %	0 %	229584173
14069	NC_012632	ACCA	2	8	633049	633056	50 %	0 %	0 %	50 %	229584173
14070	NC_012632	TTA	2	6	633093	633098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584173
14071	NC_012632	TTC	2	6	633113	633118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229584173
14072	NC_012632	ATA	2	6	633163	633168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584173
14073	NC_012632	CCTT	2	8	633191	633198	0 %	50 %	0 %	50 %	229584173
14074	NC_012632	TCA	2	6	633272	633277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584173
14075	NC_012632	TC	3	6	633296	633301	0 %	50 %	0 %	50 %	229584173
14076	NC_012632	AAG	2	6	633319	633324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_012632	TA	3	6	633341	633346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_012632	TAT	3	9	633349	633357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_012632	TGA	2	6	633375	633380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_012632	AAGTT	2	10	633382	633391	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_012632	GA	3	6	633468	633473	50 %	0 %	50 %	0 %	229584174
14082	NC_012632	TAA	2	6	633498	633503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584174
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14087	NC_012632	AAGGG	2	10	633617	633626	40 %	0 %	60 %	0 %	229584174
14088	NC_012632	GAT	2	6	633710	633715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584174
14089	NC_012632	TCCT	2	8	633733	633740	0 %	50 %	0 %	50 %	229584174
14090	NC_012632	AT	3	6	633743	633748	50 %	50 %	0 %	0 %	229584174
14091	NC_012632	GAA	2	6	633925	633930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584174
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14093	NC_012632	ATT	2	6	633984	633989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584174
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14096	NC_012632	AAT	2	6	634307	634312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584174
14097	NC_012632	TAGT	2	8	634323	634330	25 %	50 %	25 %	0 %	229584174
14098	NC_012632	AT	3	6	634350	634355	50 %	50 %	0 %	0 %	229584174
14099	NC_012632	AT	3	6	634440	634445	50 %	50 %	0 %	0 %	229584174
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14101	NC_012632	AAAG	2	8	634522	634529	75 %	0 %	25 %	0 %	229584174
14102	NC_012632	CAG	2	6	634597	634602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14103	NC_012632	AAAT	2	8	634607	634614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_012632	TCA	2	6	634633	634638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_012632	TACT	2	8	634694	634701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14106	NC_012632	GA	3	6	634705	634710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_012632	TTA	2	6	634740	634745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_012632	ACTTTC	2	12	634752	634763	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14109	NC_012632	GTA	2	6	634799	634804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_012632	AAT	2	6	634840	634845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_012632	TAA	2	6	634867	634872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_012632	GA	4	8	634874	634881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_012632	CTT	2	6	634930	634935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14114	NC_012632	ATA	2	6	635026	635031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_012632	TCA	2	6	635059	635064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_012632	TAG	2	6	635097	635102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_012632	TCT	2	6	635130	635135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14118	NC_012632	TAA	2	6	635157	635162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_012632	TA	3	6	635167	635172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_012632	TTG	2	6	635187	635192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_012632	AGA	2	6	635218	635223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_012632	TAT	2	6	635236	635241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_012632	AAATTT	2	12	635279	635290	50 %	50 %	0 %	0 %	229584175
14124	NC_012632	GAC	2	6	635359	635364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229584175
14125	NC_012632	TTC	2	6	635468	635473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229584175
14126	NC_012632	ATC	2	6	635511	635516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229584175
14127	NC_012632	T	6	6	635565	635570	0 %	100 %	0 %	0 %	229584175
14128	NC_012632	TCT	2	6	635572	635577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229584175
14129	NC_012632	TAA	2	6	635583	635588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584175
14130	NC_012632	AAT	2	6	635612	635617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_012632	A	6	6	635642	635647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14132	NC_012632	TTA	2	6	635651	635656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14133	NC_012632	TTA	2	6	635661	635666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229584176
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14143	NC_012632	GAA	2	6	636390	636395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14146	NC_012632	TTG	2	6	636608	636613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229584177
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14191	NC_012632	GTA	2	6	638439	638444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584178
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14241	NC_012632	TA	3	6	640350	640355	50 %	50 %	0 %	0 %	229584180
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14248	NC_012632	AGG	2	6	640631	640636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584180
14249	NC_012632	GAA	2	6	640642	640647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584180
14250	NC_012632	GGA	2	6	640670	640675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584180
14251	NC_012632	TTTA	2	8	640820	640827	25 %	75 %	0 %	0 %	229584180
14252	NC_012632	TGA	2	6	640895	640900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584180
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14254	NC_012632	GAA	2	6	640910	640915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229584180
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14256	NC_012632	CCGGT	2	10	640998	641007	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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14259	NC_012632	TTAGA	2	10	641045	641054	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14260	NC_012632	TAG	2	6	641109	641114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14263	NC_012632	AT	3	6	641264	641269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14264	NC_012632	TTAT	2	8	641271	641278	25 %	75 %	0 %	0 %	229584181
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14352	NC_012632	AT	3	6	646053	646058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14353	NC_012632	ATCT	2	8	646074	646081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14354	NC_012632	ATA	2	6	646086	646091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14358	NC_012632	TAA	2	6	646322	646327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229584185
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14362	NC_012632	CCA	2	6	646510	646515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14363	NC_012632	TAT	2	6	646527	646532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14364	NC_012632	GAA	2	6	646599	646604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14365	NC_012632	ATT	2	6	646612	646617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14366	NC_012632	TAA	2	6	646628	646633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14367	NC_012632	A	6	6	646710	646715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14368	NC_012632	ATG	2	6	646726	646731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14369	NC_012632	TC	3	6	646733	646738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14371	NC_012632	GGT	2	6	646835	646840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14496	NC_012632	AGG	2	6	653232	653237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229584192
14497	NC_012632	TTG	2	6	653252	653257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229584192
14498	NC_012632	CCT	2	6	653278	653283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229584192
14499	NC_012632	TA	3	6	653296	653301	50 %	50 %	0 %	0 %	229584192
14500	NC_012632	TGA	2	6	653424	653429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229584192

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