MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 59755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_012632	AAT	2	6	2426987	2426992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229585962
54002	NC_012632	CAT	2	6	2427067	2427072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585962
54003	NC_012632	TCA	2	6	2427105	2427110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585962
54004	NC_012632	GAG	2	6	2427207	2427212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229585962
54005	NC_012632	CTC	2	6	2427225	2427230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229585962
54006	NC_012632	TAG	2	6	2427251	2427256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585962
54007	NC_012632	GTA	2	6	2427289	2427294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585962
54008	NC_012632	AGA	2	6	2427323	2427328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229585962
54009	NC_012632	TTAAA	2	10	2427343	2427352	60 %	40 %	0 %	0 %	229585962
54010	NC_012632	GAT	2	6	2427357	2427362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585962
54011	NC_012632	TAT	2	6	2427409	2427414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585962
54012	NC_012632	TAA	2	6	2427464	2427469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229585962
54013	NC_012632	TATTG	2	10	2427498	2427507	20 %	60 %	20 %	0 %	229585962
54014	NC_012632	GTA	3	9	2427546	2427554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585962
54015	NC_012632	AAAG	2	8	2427584	2427591	75 %	0 %	25 %	0 %	229585962
54016	NC_012632	AGA	2	6	2427649	2427654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229585962
54017	NC_012632	CTA	2	6	2427675	2427680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585962
54018	NC_012632	AATG	2	8	2427726	2427733	50 %	25 %	25 %	0 %	229585962
54019	NC_012632	A	6	6	2427739	2427744	100 %	0 %	0 %	0 %	229585962
54020	NC_012632	TTG	2	6	2427771	2427776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229585962
54021	NC_012632	AT	3	6	2427796	2427801	50 %	50 %	0 %	0 %	229585963
54022	NC_012632	ACCCT	2	10	2427943	2427952	20 %	20 %	0 %	60 %	229585963
54023	NC_012632	AGA	2	6	2427967	2427972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229585963
54024	NC_012632	TAAC	2	8	2428002	2428009	50 %	25 %	0 %	25 %	229585963
54025	NC_012632	CTT	2	6	2428034	2428039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585963
54026	NC_012632	ACATA	2	10	2428045	2428054	60 %	20 %	0 %	20 %	229585963
54027	NC_012632	TAA	2	6	2428074	2428079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229585963
54028	NC_012632	GAA	2	6	2428279	2428284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229585963
54029	NC_012632	ATT	2	6	2428380	2428385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585964
54030	NC_012632	GTG	2	6	2428430	2428435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229585964
54031	NC_012632	TAC	2	6	2428516	2428521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585964
54032	NC_012632	A	6	6	2428560	2428565	100 %	0 %	0 %	0 %	229585964
54033	NC_012632	AAGA	2	8	2428591	2428598	75 %	0 %	25 %	0 %	229585964
54034	NC_012632	GAAT	2	8	2428607	2428614	50 %	25 %	25 %	0 %	229585964
54035	NC_012632	TTC	2	6	2428624	2428629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585964
54036	NC_012632	GGCTA	2	10	2428665	2428674	20 %	20 %	40 %	20 %	229585964
54037	NC_012632	TTA	2	6	2428741	2428746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585964
54038	NC_012632	ATA	2	6	2428831	2428836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54039	NC_012632	ACT	2	6	2428843	2428848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54040	NC_012632	GGT	2	6	2428876	2428881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54041	NC_012632	TAAA	2	8	2428908	2428915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54042	NC_012632	TA	3	6	2428987	2428992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54043	NC_012632	TA	3	6	2428996	2429001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54044	NC_012632	AT	3	6	2429033	2429038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54045	NC_012632	GTT	2	6	2429045	2429050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54046	NC_012632	TAA	2	6	2429056	2429061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54047	NC_012632	TGA	2	6	2429080	2429085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54048	NC_012632	TTA	2	6	2429128	2429133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54049	NC_012632	TAA	2	6	2429134	2429139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54050	NC_012632	AGA	2	6	2429141	2429146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54051	NC_012632	ATTT	2	8	2429164	2429171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54052	NC_012632	CCA	2	6	2429193	2429198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54053	NC_012632	TACA	2	8	2429253	2429260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54054	NC_012632	CCAT	2	8	2429336	2429343	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54055	NC_012632	CAA	2	6	2429475	2429480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54056	NC_012632	AC	3	6	2429512	2429517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54057	NC_012632	TCC	2	6	2429587	2429592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54058	NC_012632	CTT	2	6	2429596	2429601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54059	NC_012632	GTA	2	6	2429621	2429626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54060	NC_012632	AGG	2	6	2429824	2429829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54061	NC_012632	TAA	2	6	2429830	2429835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54062	NC_012632	TAAT	2	8	2429898	2429905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54063	NC_012632	CTC	2	6	2429932	2429937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54064	NC_012632	TGA	2	6	2429956	2429961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54065	NC_012632	TAT	2	6	2429972	2429977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54066	NC_012632	CTC	2	6	2429988	2429993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54067	NC_012632	AATT	2	8	2429998	2430005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54068	NC_012632	AG	3	6	2430021	2430026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54069	NC_012632	AAGG	2	8	2430056	2430063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54070	NC_012632	ATT	2	6	2430172	2430177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54071	NC_012632	TC	3	6	2430220	2430225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54072	NC_012632	TAA	2	6	2430378	2430383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54073	NC_012632	TTA	3	9	2430451	2430459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54074	NC_012632	TA	3	6	2430474	2430479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54075	NC_012632	GGA	2	6	2430527	2430532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54076	NC_012632	ATT	2	6	2430538	2430543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54077	NC_012632	GAAA	2	8	2430555	2430562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54078	NC_012632	TCATT	2	10	2430580	2430589	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54079	NC_012632	TCT	2	6	2430624	2430629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54080	NC_012632	CCT	2	6	2430709	2430714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54081	NC_012632	AGT	2	6	2430810	2430815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54082	NC_012632	TCA	2	6	2430821	2430826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54083	NC_012632	ATC	2	6	2430835	2430840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54085	NC_012632	TA	3	6	2430863	2430868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54086	NC_012632	TTAA	2	8	2430877	2430884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54087	NC_012632	A	8	8	2430883	2430890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54088	NC_012632	AAT	2	6	2430912	2430917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54089	NC_012632	AAT	2	6	2431055	2431060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54090	NC_012632	GGGA	2	8	2431063	2431070	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
54091	NC_012632	GAT	2	6	2431103	2431108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54092	NC_012632	TTC	2	6	2431121	2431126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54093	NC_012632	AAT	2	6	2431221	2431226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54094	NC_012632	GAT	2	6	2431283	2431288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54095	NC_012632	AGA	2	6	2431307	2431312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54096	NC_012632	ATG	2	6	2431341	2431346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54097	NC_012632	ATG	2	6	2431427	2431432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54098	NC_012632	GAAA	2	8	2431437	2431444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54099	NC_012632	TA	3	6	2431502	2431507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54100	NC_012632	TACTA	2	10	2431517	2431526	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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54103	NC_012632	AAAAG	2	10	2431596	2431605	80 %	0 %	20 %	0 %	229585965
54104	NC_012632	GAA	2	6	2431637	2431642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229585965
54105	NC_012632	ATG	2	6	2431676	2431681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585965
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54109	NC_012632	TGA	2	6	2431952	2431957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585965
54110	NC_012632	AAG	2	6	2431958	2431963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229585965
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54112	NC_012632	AC	3	6	2432007	2432012	50 %	0 %	0 %	50 %	229585965
54113	NC_012632	GAG	2	6	2432077	2432082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229585965
54114	NC_012632	TCA	2	6	2432126	2432131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585965
54115	NC_012632	AAG	2	6	2432132	2432137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229585965
54116	NC_012632	GTC	2	6	2432259	2432264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229585965
54117	NC_012632	CAT	2	6	2432323	2432328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54118	NC_012632	CT	3	6	2432361	2432366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54119	NC_012632	ATC	2	6	2432467	2432472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54120	NC_012632	CAA	2	6	2432494	2432499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54121	NC_012632	TA	3	6	2432597	2432602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54122	NC_012632	AGGGGT	2	12	2432759	2432770	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54123	NC_012632	ATT	2	6	2432794	2432799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54124	NC_012632	AAC	2	6	2432835	2432840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54125	NC_012632	TGAAA	2	10	2432864	2432873	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54126	NC_012632	TAC	2	6	2432953	2432958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54127	NC_012632	GAAA	2	8	2433001	2433008	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54128	NC_012632	ACG	2	6	2433019	2433024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54129	NC_012632	AAG	2	6	2433222	2433227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54130	NC_012632	AC	3	6	2433246	2433251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54131	NC_012632	GAA	2	6	2433263	2433268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54132	NC_012632	AGG	2	6	2433323	2433328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54133	NC_012632	TTA	2	6	2433402	2433407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54134	NC_012632	TTG	2	6	2433414	2433419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54135	NC_012632	TTG	2	6	2433453	2433458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54136	NC_012632	GTT	2	6	2433479	2433484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54139	NC_012632	GTTT	2	8	2433549	2433556	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54140	NC_012632	CTT	2	6	2433559	2433564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54141	NC_012632	ATT	2	6	2433576	2433581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54142	NC_012632	AAG	2	6	2433638	2433643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54143	NC_012632	TAA	2	6	2433688	2433693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54144	NC_012632	TCCC	2	8	2433721	2433728	0 %	25 %	0 %	75 %	229585966
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54182	NC_012632	GTA	2	6	2435168	2435173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585968
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54219	NC_012632	ATT	2	6	2436773	2436778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54220	NC_012632	GATTA	2	10	2436781	2436790	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54221	NC_012632	TA	3	6	2436816	2436821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54222	NC_012632	CTT	2	6	2436855	2436860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54223	NC_012632	TA	4	8	2436867	2436874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54224	NC_012632	T	7	7	2436892	2436898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54225	NC_012632	GT	3	6	2436914	2436919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54226	NC_012632	CAA	2	6	2436921	2436926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54227	NC_012632	T	6	6	2436933	2436938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54228	NC_012632	TAG	2	6	2436945	2436950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54230	NC_012632	TAT	2	6	2436964	2436969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54231	NC_012632	GAT	2	6	2436981	2436986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54232	NC_012632	TAG	2	6	2436987	2436992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54233	NC_012632	T	6	6	2437034	2437039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54234	NC_012632	TCC	2	6	2437053	2437058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54235	NC_012632	TC	3	6	2437113	2437118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54236	NC_012632	GAG	2	6	2437122	2437127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54237	NC_012632	GAG	2	6	2437152	2437157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54238	NC_012632	TAT	2	6	2437168	2437173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54239	NC_012632	GGA	2	6	2437175	2437180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54240	NC_012632	ACT	2	6	2437190	2437195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54241	NC_012632	CCTCC	2	10	2437196	2437205	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
54242	NC_012632	CCT	2	6	2437229	2437234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229585970
54243	NC_012632	GTA	2	6	2437248	2437253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585970
54244	NC_012632	TCC	2	6	2437266	2437271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229585970
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54246	NC_012632	AAAT	2	8	2437281	2437288	75 %	25 %	0 %	0 %	229585970
54247	NC_012632	AT	3	6	2437300	2437305	50 %	50 %	0 %	0 %	229585970
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54366	NC_012632	AAT	2	6	2442987	2442992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54374	NC_012632	ACT	2	6	2443312	2443317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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