MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 59755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_012632	TTGT	2	8	2381022	2381029	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53002	NC_012632	TTA	2	6	2381070	2381075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53003	NC_012632	CTAT	2	8	2381137	2381144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53004	NC_012632	ATA	2	6	2381165	2381170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53005	NC_012632	TA	3	6	2381172	2381177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53006	NC_012632	TA	3	6	2381183	2381188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53007	NC_012632	GAA	2	6	2381200	2381205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53008	NC_012632	T	7	7	2381245	2381251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53009	NC_012632	TA	3	6	2381273	2381278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53010	NC_012632	TAA	2	6	2381295	2381300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53011	NC_012632	AACAT	2	10	2381326	2381335	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53012	NC_012632	CAG	2	6	2381371	2381376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53013	NC_012632	A	7	7	2381385	2381391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53014	NC_012632	AG	3	6	2381393	2381398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53015	NC_012632	AGTAA	2	10	2381415	2381424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53016	NC_012632	CTTTT	2	10	2381444	2381453	0 %	80 %	0 %	20 %	229585924
53017	NC_012632	AT	3	6	2381460	2381465	50 %	50 %	0 %	0 %	229585924
53018	NC_012632	T	6	6	2381465	2381470	0 %	100 %	0 %	0 %	229585924
53019	NC_012632	CT	3	6	2381486	2381491	0 %	50 %	0 %	50 %	229585924
53020	NC_012632	TTC	2	6	2381503	2381508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585924
53021	NC_012632	AAT	2	6	2381759	2381764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229585924
53022	NC_012632	TTC	2	6	2381884	2381889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585925
53023	NC_012632	CAT	2	6	2381910	2381915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585925
53024	NC_012632	AAT	2	6	2381949	2381954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229585925
53025	NC_012632	CAT	2	6	2381976	2381981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585925
53026	NC_012632	TCT	2	6	2381993	2381998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585925
53027	NC_012632	TTTA	2	8	2382001	2382008	25 %	75 %	0 %	0 %	229585925
53028	NC_012632	ACT	2	6	2382014	2382019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585925
53029	NC_012632	CT	3	6	2382018	2382023	0 %	50 %	0 %	50 %	229585925
53030	NC_012632	AT	3	6	2382034	2382039	50 %	50 %	0 %	0 %	229585925
53031	NC_012632	ATC	2	6	2382119	2382124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585925
53032	NC_012632	GAA	2	6	2382171	2382176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229585925
53033	NC_012632	CCG	2	6	2382188	2382193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229585925
53034	NC_012632	TCC	2	6	2382213	2382218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229585925
53035	NC_012632	ATA	2	6	2382328	2382333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229585925
53036	NC_012632	TGT	2	6	2382437	2382442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229585925
53037	NC_012632	TCC	2	6	2382476	2382481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229585925
53038	NC_012632	GAA	2	6	2382536	2382541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53039	NC_012632	CTT	2	6	2382633	2382638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53040	NC_012632	TAAAAT	2	12	2382688	2382699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53041	NC_012632	TCT	2	6	2382714	2382719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585926
53042	NC_012632	AAT	2	6	2382750	2382755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229585926
53043	NC_012632	ATA	2	6	2382777	2382782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229585926
53044	NC_012632	ATT	2	6	2382791	2382796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585926
53045	NC_012632	T	6	6	2382795	2382800	0 %	100 %	0 %	0 %	229585926
53046	NC_012632	AGG	2	6	2382834	2382839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229585926
53047	NC_012632	ATG	2	6	2382840	2382845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585926
53048	NC_012632	TAC	2	6	2382854	2382859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229585926
53049	NC_012632	TAGAAG	2	12	2382860	2382871	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	229585926
53050	NC_012632	AAG	2	6	2382922	2382927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229585926
53051	NC_012632	AGA	2	6	2382941	2382946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229585926
53052	NC_012632	CCT	2	6	2382999	2383004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229585926
53053	NC_012632	ACA	2	6	2383017	2383022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229585926
53054	NC_012632	TTC	2	6	2383128	2383133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585926
53055	NC_012632	AC	3	6	2383150	2383155	50 %	0 %	0 %	50 %	229585926
53056	NC_012632	TGT	2	6	2383160	2383165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229585926
53057	NC_012632	ATA	2	6	2383290	2383295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229585926
53058	NC_012632	TGA	2	6	2383325	2383330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585926
53059	NC_012632	AGAGA	2	10	2383395	2383404	60 %	0 %	40 %	0 %	229585926
53060	NC_012632	TA	3	6	2383416	2383421	50 %	50 %	0 %	0 %	229585926
53061	NC_012632	AG	4	8	2383423	2383430	50 %	0 %	50 %	0 %	229585926
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53063	NC_012632	GA	3	6	2383464	2383469	50 %	0 %	50 %	0 %	229585926
53064	NC_012632	TAAG	2	8	2383510	2383517	50 %	25 %	25 %	0 %	229585926
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53066	NC_012632	GAG	2	6	2383625	2383630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229585926
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53070	NC_012632	AT	3	6	2383767	2383772	50 %	50 %	0 %	0 %	229585926
53071	NC_012632	AGT	2	6	2383887	2383892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585926
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53073	NC_012632	TGA	2	6	2383973	2383978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585926
53074	NC_012632	GATA	2	8	2383979	2383986	50 %	25 %	25 %	0 %	229585926
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53076	NC_012632	ATGG	2	8	2384049	2384056	25 %	25 %	50 %	0 %	229585926
53077	NC_012632	GTT	2	6	2384082	2384087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229585926
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53080	NC_012632	TTA	2	6	2384206	2384211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585926
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53086	NC_012632	GGA	2	6	2384366	2384371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229585926
53087	NC_012632	TAGA	2	8	2384407	2384414	50 %	25 %	25 %	0 %	229585926
53088	NC_012632	TGA	2	6	2384422	2384427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585926
53089	NC_012632	AGA	2	6	2384451	2384456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229585926
53090	NC_012632	ATA	2	6	2384495	2384500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53091	NC_012632	TC	3	6	2384534	2384539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53092	NC_012632	TCCTT	2	10	2384595	2384604	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
53093	NC_012632	TA	3	6	2384619	2384624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53094	NC_012632	A	7	7	2384686	2384692	100 %	0 %	0 %	0 %	229585927
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53101	NC_012632	CAATA	2	10	2384832	2384841	60 %	20 %	0 %	20 %	229585927
53102	NC_012632	TTAT	2	8	2384842	2384849	25 %	75 %	0 %	0 %	229585927
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53105	NC_012632	AGGA	2	8	2384935	2384942	50 %	0 %	50 %	0 %	229585927
53106	NC_012632	ATTT	2	8	2384949	2384956	25 %	75 %	0 %	0 %	229585927
53107	NC_012632	TAT	2	6	2385068	2385073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585927
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53109	NC_012632	TCT	3	9	2385156	2385164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585927
53110	NC_012632	CTCTT	2	10	2385176	2385185	0 %	60 %	0 %	40 %	229585927
53111	NC_012632	TAT	2	6	2385210	2385215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585927
53112	NC_012632	A	6	6	2385227	2385232	100 %	0 %	0 %	0 %	229585927
53113	NC_012632	CGT	2	6	2385316	2385321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229585927
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53117	NC_012632	TTGC	2	8	2385539	2385546	0 %	50 %	25 %	25 %	229585927
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53359	NC_012632	TAA	2	6	2397215	2397220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229585939
53360	NC_012632	CTC	3	9	2397232	2397240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229585939
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53363	NC_012632	CCT	2	6	2397318	2397323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229585940
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53457	NC_012632	TA	3	6	2401843	2401848	50 %	50 %	0 %	0 %	229585942
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53461	NC_012632	AT	3	6	2402012	2402017	50 %	50 %	0 %	0 %	229585942
53462	NC_012632	TAA	2	6	2402019	2402024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229585942
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53465	NC_012632	TA	3	6	2402124	2402129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53466	NC_012632	CTA	2	6	2402161	2402166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53467	NC_012632	ACTT	2	8	2402176	2402183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53468	NC_012632	GGT	2	6	2402208	2402213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53469	NC_012632	TTA	2	6	2402214	2402219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53470	NC_012632	TAT	2	6	2402220	2402225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53471	NC_012632	TAA	3	9	2402233	2402241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53472	NC_012632	AAGA	2	8	2402307	2402314	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53473	NC_012632	TGC	2	6	2402411	2402416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53474	NC_012632	TTA	2	6	2402461	2402466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229585943
53475	NC_012632	AG	3	6	2402497	2402502	50 %	0 %	50 %	0 %	229585943
53476	NC_012632	GAT	2	6	2402521	2402526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585943
53477	NC_012632	AG	3	6	2402689	2402694	50 %	0 %	50 %	0 %	229585943
53478	NC_012632	A	6	6	2402763	2402768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53479	NC_012632	TATT	3	12	2402769	2402780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53480	NC_012632	AT	3	6	2402809	2402814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53481	NC_012632	AGATAA	2	12	2402891	2402902	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	229585944
53482	NC_012632	AGG	2	6	2402915	2402920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229585944
53483	NC_012632	TGA	2	6	2402958	2402963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585944
53484	NC_012632	TTC	2	6	2402980	2402985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585944
53485	NC_012632	GTT	2	6	2403073	2403078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229585944
53486	NC_012632	CTT	2	6	2403086	2403091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585944
53487	NC_012632	TAGA	2	8	2403122	2403129	50 %	25 %	25 %	0 %	229585944
53488	NC_012632	GAG	2	6	2403178	2403183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229585944
53489	NC_012632	GAAAT	2	10	2403304	2403313	60 %	20 %	20 %	0 %	229585944
53490	NC_012632	CTT	3	9	2403347	2403355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229585944
53491	NC_012632	CTT	2	6	2403366	2403371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53492	NC_012632	TCC	2	6	2403386	2403391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53493	NC_012632	TAT	2	6	2403426	2403431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53494	NC_012632	TA	4	8	2403460	2403467	50 %	50 %	0 %	0 %	229585945
53495	NC_012632	CAA	2	6	2403537	2403542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229585945
53496	NC_012632	ACCAAA	2	12	2403574	2403585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229585945
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53498	NC_012632	GAG	2	6	2403630	2403635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229585945
53499	NC_012632	AGT	2	6	2403642	2403647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229585945
53500	NC_012632	AATC	2	8	2403708	2403715	50 %	25 %	0 %	25 %	229585945

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