MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus Y.G.57.14 chromosome

Total Repeats: 59723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_012622	CT	3	6	2016898	2016903	0 %	50 %	0 %	50 %	229580026
45002	NC_012622	CAT	2	6	2017017	2017022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580026
45003	NC_012622	ACTGT	2	10	2017027	2017036	20 %	40 %	20 %	20 %	229580026
45004	NC_012622	TC	3	6	2017126	2017131	0 %	50 %	0 %	50 %	229580026
45005	NC_012622	TCC	2	6	2017258	2017263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229580026
45006	NC_012622	CTC	2	6	2017292	2017297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229580026
45007	NC_012622	TCT	2	6	2017353	2017358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580026
45008	NC_012622	TA	3	6	2017463	2017468	50 %	50 %	0 %	0 %	229580026
45009	NC_012622	ATTA	2	8	2017476	2017483	50 %	50 %	0 %	0 %	229580026
45010	NC_012622	CT	3	6	2017494	2017499	0 %	50 %	0 %	50 %	229580026
45011	NC_012622	CTT	2	6	2017557	2017562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580026
45012	NC_012622	CAT	2	6	2017577	2017582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580026
45013	NC_012622	TAA	2	6	2017647	2017652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580026
45014	NC_012622	ATCT	2	8	2017667	2017674	25 %	50 %	0 %	25 %	229580026
45015	NC_012622	ACC	2	6	2017681	2017686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229580026
45016	NC_012622	AGT	2	6	2017710	2017715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580026
45017	NC_012622	CTC	2	6	2017716	2017721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229580026
45018	NC_012622	TTC	2	6	2017783	2017788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580026
45019	NC_012622	TTTATT	2	12	2017789	2017800	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	229580026
45020	NC_012622	ATC	2	6	2017860	2017865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580026
45021	NC_012622	TTTC	2	8	2018002	2018009	0 %	75 %	0 %	25 %	229580027
45022	NC_012622	CAT	2	6	2018011	2018016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580027
45023	NC_012622	TTA	2	6	2018023	2018028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580027
45024	NC_012622	TCT	2	6	2018031	2018036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580027
45025	NC_012622	AAT	2	6	2018037	2018042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580027
45026	NC_012622	ACTCA	2	10	2018078	2018087	40 %	20 %	0 %	40 %	229580027
45027	NC_012622	AAAT	2	8	2018147	2018154	75 %	25 %	0 %	0 %	229580027
45028	NC_012622	AAG	2	6	2018162	2018167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580027
45029	NC_012622	ATA	2	6	2018193	2018198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580027
45030	NC_012622	TGA	2	6	2018217	2018222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580027
45031	NC_012622	CATG	2	8	2018245	2018252	25 %	25 %	25 %	25 %	229580027
45032	NC_012622	GCT	2	6	2018256	2018261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229580027
45033	NC_012622	CTC	2	6	2018270	2018275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229580027
45034	NC_012622	TCT	2	6	2018277	2018282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580027
45035	NC_012622	AG	3	6	2018334	2018339	50 %	0 %	50 %	0 %	229580027
45036	NC_012622	AT	4	8	2018367	2018374	50 %	50 %	0 %	0 %	229580027
45037	NC_012622	TAC	2	6	2018429	2018434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580027
45038	NC_012622	TAA	2	6	2018476	2018481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580027
45039	NC_012622	AT	3	6	2018516	2018521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45040	NC_012622	TGG	2	6	2018534	2018539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229580028
45041	NC_012622	AG	3	6	2018593	2018598	50 %	0 %	50 %	0 %	229580028
45042	NC_012622	TG	3	6	2018657	2018662	0 %	50 %	50 %	0 %	229580028
45043	NC_012622	AGA	2	6	2018675	2018680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580028
45044	NC_012622	AAT	2	6	2018733	2018738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580028
45045	NC_012622	CTA	2	6	2018814	2018819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580028
45046	NC_012622	TGG	2	6	2018877	2018882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229580028
45047	NC_012622	TGT	2	6	2018916	2018921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229580028
45048	NC_012622	GAA	2	6	2018962	2018967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580028
45049	NC_012622	TTA	2	6	2018996	2019001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580028
45050	NC_012622	GAT	2	6	2019031	2019036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580028
45051	NC_012622	ATT	2	6	2019069	2019074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580028
45052	NC_012622	ATG	2	6	2019082	2019087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580028
45053	NC_012622	AAT	2	6	2019097	2019102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580028
45054	NC_012622	AGGT	2	8	2019158	2019165	25 %	25 %	50 %	0 %	229580028
45055	NC_012622	ATT	2	6	2019170	2019175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580028
45056	NC_012622	GAA	2	6	2019186	2019191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580028
45057	NC_012622	TGA	2	6	2019204	2019209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580028
45058	NC_012622	AAT	2	6	2019276	2019281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580028
45059	NC_012622	CTA	2	6	2019296	2019301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580028
45060	NC_012622	GGT	2	6	2019307	2019312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229580028
45061	NC_012622	AAT	2	6	2019393	2019398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580028
45062	NC_012622	TGC	2	6	2019408	2019413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229580028
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45064	NC_012622	AAG	2	6	2019457	2019462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580028
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45066	NC_012622	TAA	2	6	2019554	2019559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580028
45067	NC_012622	TA	3	6	2019560	2019565	50 %	50 %	0 %	0 %	229580028
45068	NC_012622	GAG	2	6	2019574	2019579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229580029
45069	NC_012622	AAT	2	6	2019605	2019610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580029
45070	NC_012622	GCA	2	6	2019704	2019709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229580029
45071	NC_012622	AACC	2	8	2019872	2019879	50 %	0 %	0 %	50 %	229580029
45072	NC_012622	TGT	2	6	2020085	2020090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229580029
45073	NC_012622	ATA	2	6	2020093	2020098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580029
45074	NC_012622	T	6	6	2020127	2020132	0 %	100 %	0 %	0 %	229580029
45075	NC_012622	ATT	2	6	2020187	2020192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580029
45076	NC_012622	AATTGG	2	12	2020204	2020215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580029
45077	NC_012622	ATAA	2	8	2020241	2020248	75 %	25 %	0 %	0 %	229580029
45078	NC_012622	ATGT	2	8	2020348	2020355	25 %	50 %	25 %	0 %	229580029
45079	NC_012622	TGCAAG	2	12	2020393	2020404	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	229580029
45080	NC_012622	AGAT	2	8	2020418	2020425	50 %	25 %	25 %	0 %	229580030
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45082	NC_012622	TAT	2	6	2020572	2020577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580030
45083	NC_012622	AATT	2	8	2020599	2020606	50 %	50 %	0 %	0 %	229580030
45084	NC_012622	CTTTC	2	10	2020626	2020635	0 %	60 %	0 %	40 %	229580030
45085	NC_012622	TAT	2	6	2020640	2020645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580030
45086	NC_012622	TA	3	6	2020695	2020700	50 %	50 %	0 %	0 %	229580030
45087	NC_012622	GAT	2	6	2020729	2020734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580030
45088	NC_012622	TAA	2	6	2020773	2020778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580030
45089	NC_012622	TCC	2	6	2020821	2020826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229580030
45090	NC_012622	ATC	2	6	2020882	2020887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580030
45091	NC_012622	GAT	2	6	2020919	2020924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580030
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45093	NC_012622	TA	3	6	2020988	2020993	50 %	50 %	0 %	0 %	229580030
45094	NC_012622	CT	3	6	2021011	2021016	0 %	50 %	0 %	50 %	229580030
45095	NC_012622	AAT	2	6	2021037	2021042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580030
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45098	NC_012622	AAT	2	6	2021122	2021127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580030
45099	NC_012622	ATTT	2	8	2021155	2021162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45100	NC_012622	AAT	2	6	2021191	2021196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580031
45101	NC_012622	TGG	2	6	2021317	2021322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229580031
45102	NC_012622	G	6	6	2021355	2021360	0 %	0 %	100 %	0 %	229580031
45103	NC_012622	TAT	2	6	2021452	2021457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580031
45104	NC_012622	TAT	2	6	2021471	2021476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580031
45105	NC_012622	CAAC	2	8	2021484	2021491	50 %	0 %	0 %	50 %	229580031
45106	NC_012622	A	6	6	2021502	2021507	100 %	0 %	0 %	0 %	229580031
45107	NC_012622	TGT	2	6	2021530	2021535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229580031
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45110	NC_012622	AG	3	6	2021705	2021710	50 %	0 %	50 %	0 %	229580031
45111	NC_012622	ATT	2	6	2021726	2021731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580031
45112	NC_012622	ATG	2	6	2021763	2021768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580031
45113	NC_012622	ATA	2	6	2021900	2021905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580031
45114	NC_012622	GTA	2	6	2022024	2022029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580031
45115	NC_012622	TGGT	2	8	2022053	2022060	0 %	50 %	50 %	0 %	229580031
45116	NC_012622	GGT	2	6	2022119	2022124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229580031
45117	NC_012622	AGT	2	6	2022304	2022309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580031
45118	NC_012622	CTTA	2	8	2022331	2022338	25 %	50 %	0 %	25 %	229580031
45119	NC_012622	AAGT	2	8	2022363	2022370	50 %	25 %	25 %	0 %	229580031
45120	NC_012622	TAT	2	6	2022397	2022402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580031
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45126	NC_012622	GA	3	6	2022664	2022669	50 %	0 %	50 %	0 %	229580032
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45137	NC_012622	CTAG	2	8	2023129	2023136	25 %	25 %	25 %	25 %	229580032
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45142	NC_012622	TA	3	6	2023361	2023366	50 %	50 %	0 %	0 %	229580032
45143	NC_012622	TAT	2	6	2023493	2023498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580032
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45145	NC_012622	A	6	6	2023631	2023636	100 %	0 %	0 %	0 %	229580032
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45172	NC_012622	TAT	2	6	2024764	2024769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45173	NC_012622	T	6	6	2024771	2024776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45174	NC_012622	CAA	2	6	2024779	2024784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45223	NC_012622	TA	3	6	2026663	2026668	50 %	50 %	0 %	0 %	229580035
45224	NC_012622	TGGT	2	8	2026751	2026758	0 %	50 %	50 %	0 %	229580036
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45228	NC_012622	TAG	2	6	2027123	2027128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580036
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45231	NC_012622	GTAG	2	8	2027458	2027465	25 %	25 %	50 %	0 %	229580036
45232	NC_012622	GTT	2	6	2027518	2027523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229580036
45233	NC_012622	TA	3	6	2027637	2027642	50 %	50 %	0 %	0 %	229580037
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45354	NC_012622	CAT	2	6	2032902	2032907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580041
45355	NC_012622	ATC	2	6	2033008	2033013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580041
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45358	NC_012622	TTG	2	6	2033073	2033078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229580041
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45365	NC_012622	ATT	2	6	2033453	2033458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45366	NC_012622	ATCC	2	8	2033483	2033490	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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45384	NC_012622	TAAA	2	8	2034098	2034105	75 %	25 %	0 %	0 %	229580044
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45392	NC_012622	AGA	2	6	2034653	2034658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580044
45393	NC_012622	TTAT	2	8	2034744	2034751	25 %	75 %	0 %	0 %	229580044
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45423	NC_012622	AT	3	6	2036299	2036304	50 %	50 %	0 %	0 %	229580044
45424	NC_012622	AAT	2	6	2036319	2036324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580044
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45440	NC_012622	T	7	7	2037058	2037064	0 %	100 %	0 %	0 %	229580045
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45444	NC_012622	ATC	2	6	2037203	2037208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580045
45445	NC_012622	AAT	2	6	2037283	2037288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45446	NC_012622	AAG	2	6	2037345	2037350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580046
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45451	NC_012622	ATTA	2	8	2037550	2037557	50 %	50 %	0 %	0 %	229580046
45452	NC_012622	ATT	2	6	2037613	2037618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580046
45453	NC_012622	GAAA	2	8	2037624	2037631	75 %	0 %	25 %	0 %	229580046
45454	NC_012622	TAT	2	6	2037644	2037649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580046
45455	NC_012622	TAT	2	6	2037687	2037692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580046
45456	NC_012622	TCT	2	6	2037740	2037745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580047
45457	NC_012622	TAT	2	6	2037784	2037789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580047
45458	NC_012622	TTCTA	2	10	2037799	2037808	20 %	60 %	0 %	20 %	229580047
45459	NC_012622	TA	3	6	2037858	2037863	50 %	50 %	0 %	0 %	229580047
45460	NC_012622	TTA	2	6	2037893	2037898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580047
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45463	NC_012622	TAC	2	6	2037999	2038004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580047
45464	NC_012622	TGC	2	6	2038048	2038053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229580047
45465	NC_012622	TCC	2	6	2038072	2038077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229580047
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45467	NC_012622	TCC	2	6	2038150	2038155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229580047
45468	NC_012622	AC	3	6	2038174	2038179	50 %	0 %	0 %	50 %	229580047
45469	NC_012622	TTC	2	6	2038227	2038232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580047
45470	NC_012622	TAAG	2	8	2038260	2038267	50 %	25 %	25 %	0 %	229580047
45471	NC_012622	ATT	2	6	2038288	2038293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580047
45472	NC_012622	AGG	2	6	2038315	2038320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229580047
45473	NC_012622	CTT	2	6	2038390	2038395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580047
45474	NC_012622	TC	3	6	2038457	2038462	0 %	50 %	0 %	50 %	229580047
45475	NC_012622	AGA	2	6	2038496	2038501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580047
45476	NC_012622	GA	3	6	2038503	2038508	50 %	0 %	50 %	0 %	229580047
45477	NC_012622	TTC	2	6	2038560	2038565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580047
45478	NC_012622	GTC	2	6	2038599	2038604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229580047
45479	NC_012622	ATA	2	6	2038729	2038734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580047
45480	NC_012622	TCT	2	6	2038794	2038799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580047
45481	NC_012622	CTA	2	6	2038818	2038823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580047
45482	NC_012622	AT	3	6	2039002	2039007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45483	NC_012622	AAAG	2	8	2039169	2039176	75 %	0 %	25 %	0 %	229580048
45484	NC_012622	TAA	2	6	2039183	2039188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580048
45485	NC_012622	TGCAGT	2	12	2039333	2039344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	229580048
45486	NC_012622	AGG	2	6	2039375	2039380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229580048
45487	NC_012622	GTA	2	6	2039452	2039457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580048
45488	NC_012622	CAG	2	6	2039569	2039574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229580048
45489	NC_012622	ATG	2	6	2039598	2039603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580048
45490	NC_012622	AG	3	6	2039640	2039645	50 %	0 %	50 %	0 %	229580048
45491	NC_012622	AAG	2	6	2039656	2039661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229580048
45492	NC_012622	TAT	2	6	2039691	2039696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580048
45493	NC_012622	CAA	2	6	2039723	2039728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229580048
45494	NC_012622	GATTT	2	10	2039905	2039914	20 %	60 %	20 %	0 %	229580048
45495	NC_012622	TAT	2	6	2039929	2039934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229580048
45496	NC_012622	TAG	2	6	2039935	2039940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580048
45497	NC_012622	AAT	2	6	2039990	2039995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229580048
45498	NC_012622	TAC	2	6	2040033	2040038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229580048
45499	NC_012622	CTT	2	6	2040080	2040085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229580048
45500	NC_012622	ATG	2	6	2040115	2040120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229580048

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