MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus islandicus L.S.2.15 chromosome

Total Repeats: 60391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012589	CAT	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012589	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012589	CCT	2	6	47	52	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_012589	TC	3	6	61	66	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012589	TTTC	2	8	134	141	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012589	GT	3	6	179	184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012589	ATT	2	6	290	295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012589	GTCAC	2	10	357	366	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_012589	ATT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012589	TAA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012589	T	8	8	444	451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012589	TATT	2	8	525	532	25 %	75 %	0 %	0 %	227829021
13	NC_012589	TAT	2	6	536	541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829021
14	NC_012589	TAT	2	6	578	583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829021
15	NC_012589	ATT	2	6	619	624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829021
16	NC_012589	GTT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227829021
17	NC_012589	GTT	2	6	647	652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227829021
18	NC_012589	CTT	2	6	672	677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227829021
19	NC_012589	TTAC	2	8	700	707	25 %	50 %	0 %	25 %	227829021
20	NC_012589	GGT	2	6	866	871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227829022
21	NC_012589	A	6	6	886	891	100 %	0 %	0 %	0 %	227829022
22	NC_012589	AG	3	6	941	946	50 %	0 %	50 %	0 %	227829022
23	NC_012589	TGC	2	6	961	966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227829022
24	NC_012589	GTAA	2	8	1049	1056	50 %	25 %	25 %	0 %	227829022
25	NC_012589	GAG	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227829022
26	NC_012589	ATGAGG	2	12	1089	1100	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	227829022
27	NC_012589	TGG	2	6	1144	1149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227829022
28	NC_012589	TAT	2	6	1164	1169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829022
29	NC_012589	GATAA	2	10	1238	1247	60 %	20 %	20 %	0 %	227829022
30	NC_012589	ATA	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227829022
31	NC_012589	AGAGG	2	10	1308	1317	40 %	0 %	60 %	0 %	227829022
32	NC_012589	AT	3	6	1359	1364	50 %	50 %	0 %	0 %	227829022
33	NC_012589	TTA	2	6	1368	1373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829022
34	NC_012589	ATC	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227829022
35	NC_012589	ACG	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227829022
36	NC_012589	AAC	2	6	1467	1472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227829022
37	NC_012589	TAA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227829022
38	NC_012589	ATG	2	6	1524	1529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227829022
39	NC_012589	AGC	2	6	1609	1614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227829022
40	NC_012589	AGCT	2	8	1617	1624	25 %	25 %	25 %	25 %	227829022
41	NC_012589	TGG	2	6	1627	1632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227829022
42	NC_012589	G	6	6	1631	1636	0 %	0 %	100 %	0 %	227829022
43	NC_012589	AG	3	6	1684	1689	50 %	0 %	50 %	0 %	227829022
44	NC_012589	CCTT	2	8	1711	1718	0 %	50 %	0 %	50 %	227829022
45	NC_012589	AAG	2	6	1738	1743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227829022
46	NC_012589	AGA	2	6	1756	1761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227829022
47	NC_012589	TAA	2	6	1798	1803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227829022
48	NC_012589	CAAA	2	8	1807	1814	75 %	0 %	0 %	25 %	227829022
49	NC_012589	AGA	2	6	1829	1834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227829022
50	NC_012589	ATA	2	6	1844	1849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227829022
51	NC_012589	TGG	2	6	1906	1911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227829022
52	NC_012589	AAG	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227829022
53	NC_012589	GTATTG	2	12	1983	1994	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227829022
54	NC_012589	TGA	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227829022
55	NC_012589	AGA	2	6	2033	2038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227829023
56	NC_012589	AGA	2	6	2087	2092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227829023
57	NC_012589	CTA	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227829023
58	NC_012589	GGA	2	6	2159	2164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227829023
59	NC_012589	AAG	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227829023
60	NC_012589	AT	3	6	2183	2188	50 %	50 %	0 %	0 %	227829023
61	NC_012589	AAG	3	9	2240	2248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227829023
62	NC_012589	GAA	2	6	2268	2273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227829023
63	NC_012589	AAG	2	6	2274	2279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227829023
64	NC_012589	ATT	2	6	2289	2294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829023
65	NC_012589	ATT	2	6	2310	2315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829023
66	NC_012589	ATT	2	6	2320	2325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829023
67	NC_012589	TAAA	2	8	2366	2373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012589	TA	5	10	2382	2391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012589	ATA	2	6	2409	2414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227829024
70	NC_012589	TAT	2	6	2465	2470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829024
71	NC_012589	TAA	2	6	2500	2505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227829024
72	NC_012589	TAA	2	6	2509	2514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227829024
73	NC_012589	TA	3	6	2520	2525	50 %	50 %	0 %	0 %	227829024
74	NC_012589	TAGG	2	8	2563	2570	25 %	25 %	50 %	0 %	227829024
75	NC_012589	AGA	2	6	2579	2584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227829024
76	NC_012589	CTTT	2	8	2661	2668	0 %	75 %	0 %	25 %	227829024
77	NC_012589	AGC	2	6	2681	2686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227829024
78	NC_012589	ATT	2	6	2713	2718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829024
79	NC_012589	GAT	2	6	2820	2825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227829024
80	NC_012589	TAA	2	6	2827	2832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227829024
81	NC_012589	TGC	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227829024
82	NC_012589	AAT	2	6	2873	2878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227829024
83	NC_012589	TGC	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227829024
84	NC_012589	GCA	2	6	2973	2978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227829024
85	NC_012589	TGAT	2	8	2986	2993	25 %	50 %	25 %	0 %	227829024
86	NC_012589	TA	3	6	3066	3071	50 %	50 %	0 %	0 %	227829024
87	NC_012589	TAC	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227829024
88	NC_012589	AATTGC	2	12	3083	3094	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227829024
89	NC_012589	AAT	2	6	3128	3133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227829024
90	NC_012589	T	6	6	3248	3253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012589	T	6	6	3272	3277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012589	GGTT	2	8	3323	3330	0 %	50 %	50 %	0 %	227829025
93	NC_012589	GAA	2	6	3346	3351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227829025
94	NC_012589	AAG	2	6	3356	3361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227829025
95	NC_012589	TTTAAG	2	12	3365	3376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227829025
96	NC_012589	CAAT	2	8	3386	3393	50 %	25 %	0 %	25 %	227829025
97	NC_012589	ATC	3	9	3435	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227829025
98	NC_012589	TAT	2	6	3458	3463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829025
99	NC_012589	AAC	2	6	3484	3489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227829025
100	NC_012589	GGA	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227829025
101	NC_012589	TGA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227829025
102	NC_012589	AAG	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227829026
103	NC_012589	AGAA	2	8	3655	3662	75 %	0 %	25 %	0 %	227829026
104	NC_012589	CCA	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227829026
105	NC_012589	TTTA	2	8	3696	3703	25 %	75 %	0 %	0 %	227829026
106	NC_012589	TCC	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227829026
107	NC_012589	TCCTT	2	10	3843	3852	0 %	60 %	0 %	40 %	227829026
108	NC_012589	TTA	2	6	3869	3874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829026
109	NC_012589	ACTA	2	8	3921	3928	50 %	25 %	0 %	25 %	227829026
110	NC_012589	TTG	2	6	3938	3943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227829026
111	NC_012589	TAT	3	9	3954	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829026
112	NC_012589	T	6	6	3962	3967	0 %	100 %	0 %	0 %	227829026
113	NC_012589	TAA	2	6	4045	4050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227829026
114	NC_012589	TAG	2	6	4066	4071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227829026
115	NC_012589	A	6	6	4072	4077	100 %	0 %	0 %	0 %	227829026
116	NC_012589	CGTTA	2	10	4086	4095	20 %	40 %	20 %	20 %	227829026
117	NC_012589	T	6	6	4142	4147	0 %	100 %	0 %	0 %	227829026
118	NC_012589	TCC	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227829026
119	NC_012589	CTT	2	6	4204	4209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227829026
120	NC_012589	CATT	2	8	4221	4228	25 %	50 %	0 %	25 %	227829026
121	NC_012589	TC	3	6	4274	4279	0 %	50 %	0 %	50 %	227829027
122	NC_012589	TC	3	6	4310	4315	0 %	50 %	0 %	50 %	227829027
123	NC_012589	CCTCTG	2	12	4501	4512	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	227829027
124	NC_012589	CTGTG	2	10	4517	4526	0 %	40 %	40 %	20 %	227829027
125	NC_012589	AAG	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227829027
126	NC_012589	CCA	2	6	4603	4608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227829027
127	NC_012589	GTAAT	2	10	4663	4672	40 %	40 %	20 %	0 %	227829027
128	NC_012589	AAT	2	6	4705	4710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227829027
129	NC_012589	GTTTT	2	10	4737	4746	0 %	80 %	20 %	0 %	227829027
130	NC_012589	TC	3	6	4780	4785	0 %	50 %	0 %	50 %	227829027
131	NC_012589	AGG	2	6	4788	4793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227829027
132	NC_012589	TAT	2	6	4871	4876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012589	TCT	2	6	4947	4952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227829028
134	NC_012589	TACG	2	8	4985	4992	25 %	25 %	25 %	25 %	227829028
135	NC_012589	TA	3	6	4999	5004	50 %	50 %	0 %	0 %	227829028
136	NC_012589	ATTGAT	2	12	5009	5020	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	227829028
137	NC_012589	CTT	2	6	5044	5049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227829028
138	NC_012589	TAA	2	6	5051	5056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227829028
139	NC_012589	CTAAA	2	10	5080	5089	60 %	20 %	0 %	20 %	227829028
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141	NC_012589	CAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227829028
142	NC_012589	CTTAT	2	10	5286	5295	20 %	60 %	0 %	20 %	227829028
143	NC_012589	AT	3	6	5294	5299	50 %	50 %	0 %	0 %	227829028
144	NC_012589	TCT	2	6	5313	5318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227829028
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151	NC_012589	TACAAA	2	12	5740	5751	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_012589	TAT	2	6	5837	5842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012589	AAG	2	6	5875	5880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_012589	GTTC	2	8	6200	6207	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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240	NC_012589	GTA	2	6	9067	9072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_012589	A	6	6	9853	9858	100 %	0 %	0 %	0 %	227829033
261	NC_012589	CATC	2	8	9901	9908	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
262	NC_012589	TCA	2	6	9922	9927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227829034
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265	NC_012589	TTATA	2	10	10156	10165	40 %	60 %	0 %	0 %	227829034
266	NC_012589	AG	4	8	10174	10181	50 %	0 %	50 %	0 %	227829034
267	NC_012589	GAGT	2	8	10190	10197	25 %	25 %	50 %	0 %	227829034
268	NC_012589	ATC	2	6	10247	10252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227829034
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270	NC_012589	ATT	2	6	10265	10270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829034
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272	NC_012589	TTA	2	6	10311	10316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829034
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307	NC_012589	TCC	2	6	12183	12188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227829036
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342	NC_012589	TC	3	6	13441	13446	0 %	50 %	0 %	50 %	227829036
343	NC_012589	AT	3	6	13455	13460	50 %	50 %	0 %	0 %	227829036
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353	NC_012589	TCTA	2	8	13976	13983	25 %	50 %	0 %	25 %	227829036
354	NC_012589	AT	3	6	14005	14010	50 %	50 %	0 %	0 %	227829036
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358	NC_012589	TTCT	2	8	14176	14183	0 %	75 %	0 %	25 %	227829036
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363	NC_012589	TTA	2	6	14455	14460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829036
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375	NC_012589	TCC	2	6	15281	15286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227829037
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382	NC_012589	T	7	7	16047	16053	0 %	100 %	0 %	0 %	227829037
383	NC_012589	TAT	2	6	16074	16079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829037
384	NC_012589	C	6	6	16139	16144	0 %	0 %	0 %	100 %	227829037
385	NC_012589	ATC	2	6	16209	16214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227829037
386	NC_012589	TAA	2	6	16218	16223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227829037
387	NC_012589	TTC	2	6	16242	16247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227829037
388	NC_012589	TC	3	6	16310	16315	0 %	50 %	0 %	50 %	227829037
389	NC_012589	ATT	2	6	16337	16342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
390	NC_012589	ATG	2	6	16378	16383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227829038
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392	NC_012589	TACT	2	8	16531	16538	25 %	50 %	0 %	25 %	227829038
393	NC_012589	TAA	2	6	16556	16561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227829038
394	NC_012589	CTT	2	6	16573	16578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227829038
395	NC_012589	CGG	2	6	16601	16606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227829038
396	NC_012589	ATT	2	6	16616	16621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829038
397	NC_012589	TCT	2	6	16695	16700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227829038
398	NC_012589	ACT	2	6	16764	16769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227829038
399	NC_012589	TAC	2	6	16841	16846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227829038
400	NC_012589	ATC	2	6	16862	16867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227829038
401	NC_012589	TAT	2	6	16870	16875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227829038
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