MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 chromosome

Total Repeats: 93965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012587	GGA	2	6	162178	162183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_012587	ATTGC	2	10	162191	162200	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4003	NC_012587	TCATG	2	10	162223	162232	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4004	NC_012587	CGGC	2	8	162264	162271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_012587	GGC	2	6	162346	162351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_012587	CGC	2	6	162453	162458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820728
4007	NC_012587	GGC	2	6	162558	162563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820728
4008	NC_012587	GCC	2	6	162673	162678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820728
4009	NC_012587	GC	3	6	162721	162726	0 %	0 %	50 %	50 %	227820728
4010	NC_012587	GTC	2	6	162829	162834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820728
4011	NC_012587	CGG	2	6	162845	162850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820728
4012	NC_012587	CGG	2	6	162855	162860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820728
4013	NC_012587	CTG	2	6	162886	162891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820728
4014	NC_012587	CGC	2	6	162916	162921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820728
4015	NC_012587	GCCA	2	8	162955	162962	25 %	0 %	25 %	50 %	227820728
4016	NC_012587	CGCT	2	8	162977	162984	0 %	25 %	25 %	50 %	227820728
4017	NC_012587	GGCCG	2	10	163011	163020	0 %	0 %	60 %	40 %	227820728
4018	NC_012587	TTC	2	6	163051	163056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820728
4019	NC_012587	CAT	2	6	163059	163064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820728
4020	NC_012587	GCC	2	6	163088	163093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820728
4021	NC_012587	TCG	2	6	163094	163099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820728
4022	NC_012587	CCTGTC	2	12	163107	163118	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	227820728
4023	NC_012587	GCT	2	6	163173	163178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820728
4024	NC_012587	GAG	2	6	163249	163254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820728
4025	NC_012587	CGA	2	6	163278	163283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820728
4026	NC_012587	AAG	2	6	163342	163347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820728
4027	NC_012587	GCG	2	6	163370	163375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820728
4028	NC_012587	A	6	6	163482	163487	100 %	0 %	0 %	0 %	227820728
4029	NC_012587	CGGCCT	2	12	163494	163505	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	227820728
4030	NC_012587	CGCC	2	8	163539	163546	0 %	0 %	25 %	75 %	227820728
4031	NC_012587	TCAT	2	8	163550	163557	25 %	50 %	0 %	25 %	227820728
4032	NC_012587	GT	3	6	163640	163645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_012587	CGG	2	6	163705	163710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_012587	GCG	2	6	163817	163822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820729
4035	NC_012587	CCG	2	6	163833	163838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820729
4036	NC_012587	CTC	2	6	163885	163890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227820729
4037	NC_012587	TTC	2	6	163896	163901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820729
4038	NC_012587	TCG	2	6	163914	163919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820729
4039	NC_012587	GTC	2	6	163961	163966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820729
4040	NC_012587	CGG	2	6	163972	163977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820729
4041	NC_012587	CTC	2	6	163978	163983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227820729
4042	NC_012587	CTC	2	6	164041	164046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227820729
4043	NC_012587	GCC	2	6	164084	164089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820729
4044	NC_012587	CGAC	2	8	164142	164149	25 %	0 %	25 %	50 %	227820729
4045	NC_012587	AGC	2	6	164181	164186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820729
4046	NC_012587	CGC	2	6	164200	164205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820729
4047	NC_012587	GTC	3	9	164210	164218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820729
4048	NC_012587	TCG	2	6	164229	164234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820729
4049	NC_012587	AAG	2	6	164246	164251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820729
4050	NC_012587	GCTTC	2	10	164267	164276	0 %	40 %	20 %	40 %	227820729
4051	NC_012587	CGC	2	6	164290	164295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820729
4052	NC_012587	GCACG	2	10	164314	164323	20 %	0 %	40 %	40 %	227820729
4053	NC_012587	CG	3	6	164322	164327	0 %	0 %	50 %	50 %	227820729
4054	NC_012587	GAAGA	2	10	164336	164345	60 %	0 %	40 %	0 %	227820729
4055	NC_012587	TCA	2	6	164385	164390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820729
4056	NC_012587	CGA	2	6	164404	164409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820729
4057	NC_012587	AAG	2	6	164423	164428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820729
4058	NC_012587	CAA	2	6	164506	164511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227820729
4059	NC_012587	AAC	2	6	164549	164554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227820729
4060	NC_012587	TTC	2	6	164645	164650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820729
4061	NC_012587	AAG	2	6	164657	164662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820729
4062	NC_012587	CGT	2	6	164674	164679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820729
4063	NC_012587	TTC	2	6	164705	164710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820729
4064	NC_012587	CGA	2	6	164713	164718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820729
4065	NC_012587	GAT	2	6	164722	164727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820729
4066	NC_012587	GAA	2	6	164786	164791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820729
4067	NC_012587	CGG	2	6	164886	164891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_012587	TAC	2	6	164927	164932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820730
4069	NC_012587	TTG	2	6	164965	164970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227820730
4070	NC_012587	GCCG	2	8	164979	164986	0 %	0 %	50 %	50 %	227820730
4071	NC_012587	CGCT	2	8	164991	164998	0 %	25 %	25 %	50 %	227820730
4072	NC_012587	GCA	2	6	165010	165015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820730
4073	NC_012587	GCCG	2	8	165080	165087	0 %	0 %	50 %	50 %	227820730
4074	NC_012587	GCT	2	6	165107	165112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820730
4075	NC_012587	CGC	2	6	165118	165123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820730
4076	NC_012587	TCC	2	6	165135	165140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227820730
4077	NC_012587	GTTC	2	8	165141	165148	0 %	50 %	25 %	25 %	227820730
4078	NC_012587	GCG	2	6	165180	165185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820730
4079	NC_012587	CGACG	2	10	165242	165251	20 %	0 %	40 %	40 %	227820730
4080	NC_012587	GGC	2	6	165350	165355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820730
4081	NC_012587	GCTG	2	8	165388	165395	0 %	25 %	50 %	25 %	227820730
4082	NC_012587	CGT	2	6	165404	165409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820730
4083	NC_012587	GCT	2	6	165410	165415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820730
4084	NC_012587	GTCGCC	2	12	165417	165428	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	227820730
4085	NC_012587	GGC	2	6	165429	165434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820730
4086	NC_012587	CAC	2	6	165455	165460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820730
4087	NC_012587	TCG	3	9	165508	165516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820730
4088	NC_012587	TCG	2	6	165519	165524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820730
4089	NC_012587	GAC	2	6	165536	165541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820730
4090	NC_012587	CAT	2	6	165548	165553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820730
4091	NC_012587	GGCC	2	8	165572	165579	0 %	0 %	50 %	50 %	227820730
4092	NC_012587	TTC	2	6	165582	165587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820730
4093	NC_012587	CGG	2	6	165601	165606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820730
4094	NC_012587	TTC	3	9	165609	165617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820730
4095	NC_012587	GCC	2	6	165645	165650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820730
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4097	NC_012587	CTG	2	6	165681	165686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820730
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4100	NC_012587	CGC	2	6	165755	165760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820730
4101	NC_012587	CGA	2	6	165838	165843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820730
4102	NC_012587	CTT	2	6	165854	165859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820730
4103	NC_012587	CCG	2	6	165964	165969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820730
4104	NC_012587	CAT	2	6	165983	165988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820730
4105	NC_012587	GTC	2	6	166004	166009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820730
4106	NC_012587	ATC	2	6	166023	166028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820730
4107	NC_012587	GCTC	2	8	166057	166064	0 %	25 %	25 %	50 %	227820730
4108	NC_012587	TTC	2	6	166105	166110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820730
4109	NC_012587	TCG	2	6	166129	166134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820730
4110	NC_012587	GC	3	6	166135	166140	0 %	0 %	50 %	50 %	227820730
4111	NC_012587	TGC	2	6	166141	166146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820730
4112	NC_012587	CG	3	6	166156	166161	0 %	0 %	50 %	50 %	227820730
4113	NC_012587	GAT	2	6	166175	166180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820730
4114	NC_012587	CGT	2	6	166181	166186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820730
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4116	NC_012587	GAC	2	6	166238	166243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820730
4117	NC_012587	CGC	2	6	166294	166299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820730
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4119	NC_012587	GCC	2	6	166455	166460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820731
4120	NC_012587	CGC	2	6	166486	166491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820731
4121	NC_012587	TTC	2	6	166541	166546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820731
4122	NC_012587	ACG	2	6	166601	166606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820731
4123	NC_012587	GAA	2	6	166648	166653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820731
4124	NC_012587	AGC	2	6	166674	166679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820731
4125	NC_012587	TGA	2	6	166680	166685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820731
4126	NC_012587	AGC	2	6	166725	166730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820731
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4128	NC_012587	CGAC	2	8	166770	166777	25 %	0 %	25 %	50 %	227820731
4129	NC_012587	GAA	2	6	166919	166924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820731
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4134	NC_012587	TGGCG	2	10	167056	167065	0 %	20 %	60 %	20 %	227820731
4135	NC_012587	TCG	2	6	167067	167072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820731
4136	NC_012587	ATG	2	6	167084	167089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820731
4137	NC_012587	CGC	2	6	167125	167130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820731
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4139	NC_012587	GAA	2	6	167158	167163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820731
4140	NC_012587	GACC	2	8	167170	167177	25 %	0 %	25 %	50 %	227820731
4141	NC_012587	TCAACA	2	12	167187	167198	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	227820731
4142	NC_012587	CGC	2	6	167203	167208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820731
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4145	NC_012587	TGA	2	6	167310	167315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820731
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4148	NC_012587	GCC	2	6	167362	167367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820731
4149	NC_012587	CTCGGC	2	12	167387	167398	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	227820731
4150	NC_012587	CCA	2	6	167422	167427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820731
4151	NC_012587	TGC	2	6	167430	167435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820731
4152	NC_012587	ATC	2	6	167468	167473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820731
4153	NC_012587	GCT	3	9	167506	167514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820731
4154	NC_012587	TCG	3	9	167532	167540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820731
4155	NC_012587	CGC	2	6	167553	167558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820731
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4162	NC_012587	GTCC	2	8	167904	167911	0 %	25 %	25 %	50 %	227820732
4163	NC_012587	CCGG	2	8	167982	167989	0 %	0 %	50 %	50 %	227820732
4164	NC_012587	CGA	2	6	167998	168003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820732
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4169	NC_012587	CGA	2	6	168157	168162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820732
4170	NC_012587	TCG	2	6	168165	168170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820732
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4172	NC_012587	CGG	2	6	168244	168249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820732
4173	NC_012587	CAG	3	9	168251	168259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820732
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4175	NC_012587	GC	3	6	168376	168381	0 %	0 %	50 %	50 %	227820732
4176	NC_012587	CATCGT	2	12	168391	168402	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227820732
4177	NC_012587	GCA	2	6	168415	168420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820732
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4182	NC_012587	ATG	2	6	168597	168602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820733
4183	NC_012587	CGA	2	6	168629	168634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820733
4184	NC_012587	CCG	2	6	168653	168658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820733
4185	NC_012587	GGC	2	6	168672	168677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820733
4186	NC_012587	TGG	2	6	168691	168696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227820733
4187	NC_012587	TCCG	2	8	168702	168709	0 %	25 %	25 %	50 %	227820733
4188	NC_012587	CGA	2	6	168755	168760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820733
4189	NC_012587	CGA	2	6	168770	168775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820733
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4191	NC_012587	CGA	2	6	169070	169075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820733
4192	NC_012587	ATG	2	6	169125	169130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820733
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4199	NC_012587	TGC	2	6	169524	169529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820734
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4204	NC_012587	GTC	2	6	169667	169672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820734
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4208	NC_012587	CGC	2	6	169802	169807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820734
4209	NC_012587	CTC	2	6	169844	169849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227820734
4210	NC_012587	GT	3	6	169875	169880	0 %	50 %	50 %	0 %	227820734
4211	NC_012587	GCT	2	6	169894	169899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820734
4212	NC_012587	CGA	2	6	169930	169935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820734
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4214	NC_012587	GCG	2	6	170016	170021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820734
4215	NC_012587	AGAA	2	8	170079	170086	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4216	NC_012587	GTC	2	6	170128	170133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820735
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4220	NC_012587	CCA	2	6	170353	170358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820735
4221	NC_012587	GCCG	2	8	170393	170400	0 %	0 %	50 %	50 %	227820735
4222	NC_012587	GCG	2	6	170430	170435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820735
4223	NC_012587	GCC	2	6	170478	170483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820735
4224	NC_012587	CTT	2	6	170612	170617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820735
4225	NC_012587	CCG	2	6	170751	170756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4226	NC_012587	CCG	2	6	170885	170890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4227	NC_012587	T	6	6	170896	170901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4228	NC_012587	TTG	2	6	170947	170952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4229	NC_012587	GCC	2	6	170985	170990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820736
4230	NC_012587	GGC	2	6	170995	171000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820736
4231	NC_012587	CGA	3	9	171041	171049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820736
4232	NC_012587	CAA	2	6	171071	171076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227820736
4233	NC_012587	CGC	2	6	171077	171082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820736
4234	NC_012587	TGCG	2	8	171098	171105	0 %	25 %	50 %	25 %	227820736
4235	NC_012587	CGAG	2	8	171117	171124	25 %	0 %	50 %	25 %	227820736
4236	NC_012587	GGA	2	6	171147	171152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820736
4237	NC_012587	CCCATC	2	12	171209	171220	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	227820736
4238	NC_012587	TCG	2	6	171221	171226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820736
4239	NC_012587	ACG	2	6	171275	171280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820736
4240	NC_012587	CGG	2	6	171314	171319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820736
4241	NC_012587	TTC	2	6	171340	171345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820736
4242	NC_012587	GC	3	6	171388	171393	0 %	0 %	50 %	50 %	227820736
4243	NC_012587	TCA	2	6	171434	171439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820736
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4246	NC_012587	CGG	2	6	171486	171491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820736
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4484	NC_012587	CGCC	2	8	181503	181510	0 %	0 %	25 %	75 %	227820746
4485	NC_012587	GCG	2	6	181554	181559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4486	NC_012587	GACC	2	8	181565	181572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4487	NC_012587	CGAGG	2	10	181616	181625	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4488	NC_012587	CCG	2	6	181628	181633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4489	NC_012587	CAGG	2	8	181641	181648	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4490	NC_012587	ACG	2	6	181682	181687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4491	NC_012587	CCT	2	6	181741	181746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227820747
4492	NC_012587	GCC	2	6	181752	181757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820747
4493	NC_012587	GCC	2	6	181853	181858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820747
4494	NC_012587	CTC	2	6	181859	181864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227820747
4495	NC_012587	TCG	2	6	182004	182009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820747
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