MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234b

Total Repeats: 56054

< Previous12...3233343536373839404142...112113Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_012586	CGAC	2	8	804850	804857	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18002	NC_012586	CGGG	2	8	804874	804881	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18003	NC_012586	CCG	2	6	804924	804929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18004	NC_012586	CT	3	6	804945	804950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18005	NC_012586	GA	4	8	804951	804958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_012586	AGT	2	6	804959	804964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_012586	CGG	2	6	805023	805028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18008	NC_012586	TTG	2	6	805034	805039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18009	NC_012586	GCC	2	6	805089	805094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18010	NC_012586	GGC	2	6	805111	805116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18011	NC_012586	GGCGA	2	10	805153	805162	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18012	NC_012586	TAC	2	6	805238	805243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_012586	ATTTC	2	10	805294	805303	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18014	NC_012586	GCC	2	6	805304	805309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18015	NC_012586	CGA	2	6	805519	805524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227819044
18016	NC_012586	GCGA	2	8	805559	805566	25 %	0 %	50 %	25 %	227819044
18017	NC_012586	AGA	2	6	805592	805597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227819044
18018	NC_012586	GAG	2	6	805613	805618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227819044
18019	NC_012586	TTTG	2	8	805621	805628	0 %	75 %	25 %	0 %	227819044
18020	NC_012586	CTG	2	6	805667	805672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227819044
18021	NC_012586	CAG	2	6	805715	805720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227819044
18022	NC_012586	GTC	2	6	805724	805729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227819044
18023	NC_012586	CG	3	6	805750	805755	0 %	0 %	50 %	50 %	227819044
18024	NC_012586	GC	3	6	805777	805782	0 %	0 %	50 %	50 %	227819044
18025	NC_012586	TCGC	2	8	805798	805805	0 %	25 %	25 %	50 %	227819044
18026	NC_012586	GGAA	2	8	805878	805885	50 %	0 %	50 %	0 %	227819044
18027	NC_012586	CCG	2	6	805902	805907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227819044
18028	NC_012586	CGGGA	2	10	805915	805924	20 %	0 %	60 %	20 %	227819044
18029	NC_012586	TGA	2	6	805945	805950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227819044
18030	NC_012586	CGGA	2	8	806025	806032	25 %	0 %	50 %	25 %	227819044
18031	NC_012586	AGG	2	6	806035	806040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227819044
18032	NC_012586	TGC	2	6	806062	806067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227819044
18033	NC_012586	CG	3	6	806068	806073	0 %	0 %	50 %	50 %	227819044
18034	NC_012586	GAT	2	6	806126	806131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227819044
18035	NC_012586	CGC	2	6	806132	806137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227819044
18036	NC_012586	CGA	2	6	806188	806193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227819044
18037	NC_012586	TGA	2	6	806202	806207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227819044
18038	NC_012586	CTGG	2	8	806254	806261	0 %	25 %	50 %	25 %	227819044
18039	NC_012586	GAC	2	6	806263	806268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227819044
18040	NC_012586	GAC	2	6	806324	806329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227819044
18041	NC_012586	CGC	2	6	806402	806407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227819044
18042	NC_012586	ACGG	2	8	806459	806466	25 %	0 %	50 %	25 %	227819044
18043	NC_012586	TGG	2	6	806532	806537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227819044
18044	NC_012586	CCT	2	6	806590	806595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227819044
18045	NC_012586	GCT	2	6	806614	806619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227819044
18046	NC_012586	AGA	2	6	806671	806676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227819044
18047	NC_012586	GAC	2	6	806755	806760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227819044
18048	NC_012586	TCA	2	6	806814	806819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227819044
18049	NC_012586	GAC	2	6	806903	806908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227819044
18050	NC_012586	GGC	2	6	806914	806919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227819044
18051	NC_012586	GTG	2	6	806984	806989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227819044
18052	NC_012586	CAG	2	6	807148	807153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227819044
18053	NC_012586	CGC	2	6	807205	807210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227819044
18054	NC_012586	TTC	2	6	807236	807241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227819044
18055	NC_012586	TTGC	2	8	807281	807288	0 %	50 %	25 %	25 %	227819044
18056	NC_012586	CAT	2	6	807302	807307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227819044
18057	NC_012586	ACG	2	6	807318	807323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227819044
18058	NC_012586	TGT	2	6	807477	807482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227819044
18059	NC_012586	G	6	6	807520	807525	0 %	0 %	100 %	0 %	227819044
18060	NC_012586	GTG	2	6	807546	807551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227819044
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18063	NC_012586	GGGT	2	8	807678	807685	0 %	25 %	75 %	0 %	227819044
18064	NC_012586	GGC	2	6	807733	807738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227819044
18065	NC_012586	GC	3	6	807764	807769	0 %	0 %	50 %	50 %	227819044
18066	NC_012586	CAG	2	6	807827	807832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227819044
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18071	NC_012586	TCGA	2	8	808347	808354	25 %	25 %	25 %	25 %	227819044
18072	NC_012586	TCAT	2	8	808482	808489	25 %	50 %	0 %	25 %	227819044
18073	NC_012586	CG	3	6	808525	808530	0 %	0 %	50 %	50 %	227819044
18074	NC_012586	CAC	2	6	808606	808611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227819044
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18080	NC_012586	TTG	2	6	808893	808898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18081	NC_012586	TGCGGC	2	12	808924	808935	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18082	NC_012586	TGT	2	6	808946	808951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18083	NC_012586	GCT	2	6	808952	808957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18088	NC_012586	TTC	2	6	809140	809145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227819045
18089	NC_012586	CTT	2	6	809163	809168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227819045
18090	NC_012586	CGA	2	6	809181	809186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227819045
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18093	NC_012586	GAAG	2	8	809326	809333	50 %	0 %	50 %	0 %	227819045
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18096	NC_012586	GCTTC	2	10	809400	809409	0 %	40 %	20 %	40 %	227819045
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18100	NC_012586	ATG	2	6	809497	809502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227819045
18101	NC_012586	CG	3	6	809612	809617	0 %	0 %	50 %	50 %	227819045
18102	NC_012586	CGG	2	6	809634	809639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227819045
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18106	NC_012586	GAA	2	6	809723	809728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227819045
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18109	NC_012586	TGC	2	6	809857	809862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227819045
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18112	NC_012586	TGC	2	6	810002	810007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18121	NC_012586	TTCA	2	8	810601	810608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18122	NC_012586	AAG	2	6	810670	810675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18123	NC_012586	CTG	2	6	810688	810693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18124	NC_012586	TCA	2	6	810847	810852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227819047
18125	NC_012586	GAG	2	6	810882	810887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227819047
18126	NC_012586	CGGC	2	8	810893	810900	0 %	0 %	50 %	50 %	227819047
18127	NC_012586	TGGGC	2	10	810925	810934	0 %	20 %	60 %	20 %	227819047
18128	NC_012586	GGCAGC	2	12	810948	810959	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	227819047
18129	NC_012586	GAC	2	6	810962	810967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227819047
18130	NC_012586	GAA	2	6	811098	811103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227819048
18131	NC_012586	AGAA	2	8	811113	811120	75 %	0 %	25 %	0 %	227819048
18132	NC_012586	TTC	2	6	811192	811197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227819048
18133	NC_012586	CCTGC	2	10	811210	811219	0 %	20 %	20 %	60 %	227819048
18134	NC_012586	TGC	2	6	811232	811237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227819048
18135	NC_012586	GAT	2	6	811329	811334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227819048
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18140	NC_012586	GACA	2	8	811548	811555	50 %	0 %	25 %	25 %	227819048
18141	NC_012586	GCCG	2	8	811566	811573	0 %	0 %	50 %	50 %	227819048
18142	NC_012586	CGC	2	6	811577	811582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227819048
18143	NC_012586	GCCG	2	8	811617	811624	0 %	0 %	50 %	50 %	227819048
18144	NC_012586	GCC	2	6	811659	811664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227819048
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18154	NC_012586	CCGG	2	8	812360	812367	0 %	0 %	50 %	50 %	227819048
18155	NC_012586	CGC	2	6	812402	812407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227819048
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18160	NC_012586	CG	3	6	812554	812559	0 %	0 %	50 %	50 %	227819048
18161	NC_012586	TAACCG	2	12	812617	812628	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227819048
18162	NC_012586	GAAG	2	8	812631	812638	50 %	0 %	50 %	0 %	227819048
18163	NC_012586	GTC	2	6	812731	812736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227819048
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18166	NC_012586	CAG	2	6	812852	812857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18167	NC_012586	CCCGG	2	10	812858	812867	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18168	NC_012586	CGCTT	2	10	812895	812904	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18169	NC_012586	ACT	2	6	812909	812914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18172	NC_012586	GCG	2	6	813164	813169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18173	NC_012586	TCG	2	6	813285	813290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18174	NC_012586	TGC	2	6	813343	813348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18175	NC_012586	GTC	2	6	813412	813417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18181	NC_012586	GGGA	2	8	813772	813779	25 %	0 %	75 %	0 %	227819050
18182	NC_012586	GC	6	12	813861	813872	0 %	0 %	50 %	50 %	227819050
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18189	NC_012586	CCT	2	6	814455	814460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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18192	NC_012586	TCG	2	6	814578	814583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227819052
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18195	NC_012586	GCC	2	6	814716	814721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227819052
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18201	NC_012586	GCA	2	6	814836	814841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18203	NC_012586	ATC	2	6	814858	814863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18204	NC_012586	C	6	6	814966	814971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18205	NC_012586	TCGCA	2	10	815069	815078	20 %	20 %	20 %	40 %	227819053
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18212	NC_012586	GAG	2	6	815433	815438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227819053
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18216	NC_012586	GCG	2	6	815672	815677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18217	NC_012586	CGAT	2	8	815742	815749	25 %	25 %	25 %	25 %	227819054
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18222	NC_012586	CCG	2	6	815984	815989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18223	NC_012586	GCA	2	6	816004	816009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18224	NC_012586	GCGG	2	8	816038	816045	0 %	0 %	75 %	25 %	227819055
18225	NC_012586	TCT	2	6	816087	816092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227819055
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18227	NC_012586	GCG	2	6	816250	816255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227819055
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18229	NC_012586	CG	3	6	816441	816446	0 %	0 %	50 %	50 %	227819056
18230	NC_012586	T	6	6	816489	816494	0 %	100 %	0 %	0 %	227819056
18231	NC_012586	CCT	2	6	816645	816650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227819056
18232	NC_012586	GC	3	6	816658	816663	0 %	0 %	50 %	50 %	227819056
18233	NC_012586	A	6	6	816731	816736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18234	NC_012586	GAC	2	6	816753	816758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18235	NC_012586	TGC	2	6	816769	816774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18236	NC_012586	GAA	2	6	816788	816793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18237	NC_012586	CGG	2	6	816794	816799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18238	NC_012586	TGC	2	6	816867	816872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227819057
18239	NC_012586	TTC	2	6	816897	816902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227819057
18240	NC_012586	GCGG	2	8	816910	816917	0 %	0 %	75 %	25 %	227819057
18241	NC_012586	CGG	2	6	817003	817008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227819057
18242	NC_012586	GCT	2	6	817027	817032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227819057
18243	NC_012586	TGC	2	6	817067	817072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227819057
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18245	NC_012586	CGT	2	6	817152	817157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227819057
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18486	NC_012586	ATC	2	6	828344	828349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227819070
18487	NC_012586	TGA	2	6	828362	828367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227819070
18488	NC_012586	TGCG	2	8	828383	828390	0 %	25 %	50 %	25 %	227819070
18489	NC_012586	CAA	2	6	828408	828413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227819070
18490	NC_012586	GGC	2	6	828418	828423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227819070
18491	NC_012586	CTT	3	9	828454	828462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227819070
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18497	NC_012586	CGT	2	6	828709	828714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18498	NC_012586	CCG	2	6	828759	828764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18499	NC_012586	TCGT	2	8	828771	828778	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18500	NC_012586	GAA	2	6	828827	828832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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