MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234b

Total Repeats: 56054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_012586	GGATCG	2	12	663036	663047	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	227818900
15002	NC_012586	CGG	2	6	663076	663081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15003	NC_012586	CGGC	2	8	663143	663150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15004	NC_012586	GCG	2	6	663180	663185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15005	NC_012586	GC	3	6	663199	663204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15006	NC_012586	CGG	2	6	663225	663230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_012586	CCG	2	6	663255	663260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15008	NC_012586	CT	3	6	663275	663280	0 %	50 %	0 %	50 %	227818901
15009	NC_012586	GGT	2	6	663346	663351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818901
15010	NC_012586	GTC	2	6	663392	663397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818901
15011	NC_012586	GC	3	6	663434	663439	0 %	0 %	50 %	50 %	227818901
15012	NC_012586	CTG	2	6	663514	663519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818901
15013	NC_012586	ATC	2	6	663557	663562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818901
15014	NC_012586	GTC	3	9	663578	663586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818901
15015	NC_012586	TCC	2	6	663587	663592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818901
15016	NC_012586	CCT	2	6	663603	663608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15017	NC_012586	TGC	2	6	663680	663685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15018	NC_012586	CAC	2	6	663691	663696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15019	NC_012586	CG	3	6	663709	663714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15020	NC_012586	CTG	2	6	663820	663825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15021	NC_012586	CCGA	2	8	663840	663847	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15022	NC_012586	AACCGA	2	12	663881	663892	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15023	NC_012586	A	6	6	663900	663905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_012586	AT	3	6	663937	663942	50 %	50 %	0 %	0 %	227818902
15025	NC_012586	GGC	2	6	663988	663993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818902
15026	NC_012586	GAGC	2	8	664018	664025	25 %	0 %	50 %	25 %	227818902
15027	NC_012586	TGC	2	6	664032	664037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818902
15028	NC_012586	GGT	2	6	664105	664110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818902
15029	NC_012586	GC	3	6	664314	664319	0 %	0 %	50 %	50 %	227818902
15030	NC_012586	CCG	2	6	664338	664343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818902
15031	NC_012586	AT	3	6	664384	664389	50 %	50 %	0 %	0 %	227818902
15032	NC_012586	GGA	2	6	664414	664419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818902
15033	NC_012586	CTC	3	9	664432	664440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818902
15034	NC_012586	CGT	2	6	664570	664575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818902
15035	NC_012586	TC	4	8	664589	664596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15036	NC_012586	GCC	2	6	664656	664661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15037	NC_012586	CGG	2	6	664667	664672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15038	NC_012586	CG	3	6	664687	664692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15039	NC_012586	GGTAA	2	10	664693	664702	40 %	20 %	40 %	0 %	227818903
15040	NC_012586	CAG	2	6	664761	664766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818903
15041	NC_012586	GAC	2	6	664903	664908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818903
15042	NC_012586	GC	3	6	664943	664948	0 %	0 %	50 %	50 %	227818903
15043	NC_012586	GCCGCT	2	12	664972	664983	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	227818903
15044	NC_012586	AAGCG	2	10	664996	665005	40 %	0 %	40 %	20 %	227818903
15045	NC_012586	GTG	2	6	665027	665032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818903
15046	NC_012586	GCT	2	6	665034	665039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818903
15047	NC_012586	GTCCT	2	10	665074	665083	0 %	40 %	20 %	40 %	227818903
15048	NC_012586	GCG	2	6	665249	665254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818903
15049	NC_012586	GAT	2	6	665614	665619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818903
15050	NC_012586	TGG	2	6	665696	665701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818903
15051	NC_012586	GCC	2	6	665706	665711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818903
15052	NC_012586	GCG	2	6	665723	665728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818903
15053	NC_012586	TCG	2	6	665792	665797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818903
15054	NC_012586	ACT	2	6	665837	665842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818903
15055	NC_012586	CGAGC	2	10	665845	665854	20 %	0 %	40 %	40 %	227818903
15056	NC_012586	AAG	2	6	665881	665886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818903
15057	NC_012586	CTATC	2	10	665915	665924	20 %	40 %	0 %	40 %	227818903
15058	NC_012586	CCT	2	6	666183	666188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818904
15059	NC_012586	CCG	2	6	666202	666207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818904
15060	NC_012586	TTCG	2	8	666218	666225	0 %	50 %	25 %	25 %	227818904
15061	NC_012586	GACG	2	8	666254	666261	25 %	0 %	50 %	25 %	227818904
15062	NC_012586	TC	3	6	666293	666298	0 %	50 %	0 %	50 %	227818904
15063	NC_012586	AGCC	2	8	666340	666347	25 %	0 %	25 %	50 %	227818904
15064	NC_012586	GGCA	2	8	666634	666641	25 %	0 %	50 %	25 %	227818904
15065	NC_012586	GCAG	2	8	666652	666659	25 %	0 %	50 %	25 %	227818904
15066	NC_012586	CTT	2	6	666664	666669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818904
15067	NC_012586	GCC	2	6	666686	666691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818904
15068	NC_012586	CTC	2	6	666731	666736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818904
15069	NC_012586	T	6	6	666747	666752	0 %	100 %	0 %	0 %	227818904
15070	NC_012586	TCG	2	6	666789	666794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818904
15071	NC_012586	GGCG	2	8	666817	666824	0 %	0 %	75 %	25 %	227818904
15072	NC_012586	CGGA	2	8	666859	666866	25 %	0 %	50 %	25 %	227818904
15073	NC_012586	GCAC	2	8	666870	666877	25 %	0 %	25 %	50 %	227818904
15074	NC_012586	GTT	2	6	666902	666907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227818904
15075	NC_012586	GTC	2	6	666962	666967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818904
15076	NC_012586	CGG	2	6	667024	667029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818904
15077	NC_012586	CGG	2	6	667047	667052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818904
15078	NC_012586	TGAG	2	8	667110	667117	25 %	25 %	50 %	0 %	227818904
15079	NC_012586	TTC	2	6	667190	667195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818904
15080	NC_012586	GC	3	6	667237	667242	0 %	0 %	50 %	50 %	227818904
15081	NC_012586	ACG	2	6	667295	667300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818904
15082	NC_012586	CGC	2	6	667332	667337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818904
15083	NC_012586	GGC	2	6	667348	667353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818904
15084	NC_012586	GC	3	6	667386	667391	0 %	0 %	50 %	50 %	227818904
15085	NC_012586	AAG	2	6	667394	667399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818904
15086	NC_012586	CGG	2	6	667430	667435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15087	NC_012586	AAGT	2	8	667479	667486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_012586	GATCG	2	10	667497	667506	20 %	20 %	40 %	20 %	227818905
15089	NC_012586	TGC	2	6	667525	667530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818905
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15092	NC_012586	CGC	2	6	667742	667747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818905
15093	NC_012586	GATC	2	8	667757	667764	25 %	25 %	25 %	25 %	227818905
15094	NC_012586	CGG	2	6	667790	667795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818905
15095	NC_012586	ACC	2	6	667821	667826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227818905
15096	NC_012586	TCG	2	6	667900	667905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818905
15097	NC_012586	CGAG	2	8	668019	668026	25 %	0 %	50 %	25 %	227818906
15098	NC_012586	TCC	2	6	668047	668052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818906
15099	NC_012586	CGG	3	9	668132	668140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818906
15100	NC_012586	GTC	2	6	668190	668195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818906
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15102	NC_012586	CGA	2	6	668333	668338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818906
15103	NC_012586	TCGA	2	8	668340	668347	25 %	25 %	25 %	25 %	227818906
15104	NC_012586	GGA	2	6	668369	668374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818906
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15106	NC_012586	CG	3	6	668447	668452	0 %	0 %	50 %	50 %	227818906
15107	NC_012586	CGA	2	6	668507	668512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818906
15108	NC_012586	ATG	2	6	668571	668576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818906
15109	NC_012586	CGT	2	6	668591	668596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818906
15110	NC_012586	CGA	2	6	668629	668634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818906
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15113	NC_012586	ATC	2	6	668781	668786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818906
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15116	NC_012586	CGTCA	2	10	668867	668876	20 %	20 %	20 %	40 %	227818906
15117	NC_012586	ACT	2	6	668890	668895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818906
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15119	NC_012586	CGCT	2	8	668936	668943	0 %	25 %	25 %	50 %	227818906
15120	NC_012586	TTG	2	6	669047	669052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227818906
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15122	NC_012586	CG	3	6	669088	669093	0 %	0 %	50 %	50 %	227818906
15123	NC_012586	GACC	2	8	669192	669199	25 %	0 %	25 %	50 %	227818906
15124	NC_012586	CGG	2	6	669232	669237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818906
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15127	NC_012586	ACGG	2	8	669356	669363	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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15153	NC_012586	GGCG	2	8	670681	670688	0 %	0 %	75 %	25 %	227818908
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15215	NC_012586	CAA	2	6	673548	673553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15216	NC_012586	CT	3	6	673650	673655	0 %	50 %	0 %	50 %	227818911
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15224	NC_012586	GGCG	2	8	674032	674039	0 %	0 %	75 %	25 %	227818911
15225	NC_012586	TGA	2	6	674099	674104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818911
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15227	NC_012586	TCG	2	6	674136	674141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818911
15228	NC_012586	GTGCG	2	10	674144	674153	0 %	20 %	60 %	20 %	227818911
15229	NC_012586	ATTG	2	8	674322	674329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15230	NC_012586	GC	3	6	674417	674422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15231	NC_012586	AGC	2	6	674428	674433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15232	NC_012586	GGA	2	6	674468	674473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15233	NC_012586	GAC	2	6	674510	674515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818912
15234	NC_012586	CAT	2	6	674734	674739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818912
15235	NC_012586	A	6	6	674753	674758	100 %	0 %	0 %	0 %	227818912
15236	NC_012586	CGT	2	6	674779	674784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818912
15237	NC_012586	TGA	2	6	674826	674831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818912
15238	NC_012586	TGC	2	6	674910	674915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818912
15239	NC_012586	TAC	2	6	674951	674956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818912
15240	NC_012586	CGGG	2	8	674976	674983	0 %	0 %	75 %	25 %	227818912
15241	NC_012586	TGGCGC	2	12	675009	675020	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	227818912
15242	NC_012586	CGA	2	6	675043	675048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818912
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15363	NC_012586	CTA	2	6	680827	680832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818916
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15423	NC_012586	ATCG	2	8	683952	683959	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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15482	NC_012586	ACG	2	6	687136	687141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818922
15483	NC_012586	CAG	2	6	687142	687147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818922
15484	NC_012586	TGC	2	6	687159	687164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818922
15485	NC_012586	GCC	2	6	687167	687172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818922
15486	NC_012586	GCC	2	6	687178	687183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818922
15487	NC_012586	CGGGG	2	10	687228	687237	0 %	0 %	80 %	20 %	227818922
15488	NC_012586	GCG	2	6	687349	687354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818922
15489	NC_012586	GAA	2	6	687384	687389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818922
15490	NC_012586	CGT	2	6	687456	687461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15491	NC_012586	CGA	2	6	687476	687481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15492	NC_012586	GCGCG	2	10	687558	687567	0 %	0 %	60 %	40 %	227818923
15493	NC_012586	ATC	2	6	687610	687615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818923
15494	NC_012586	GCG	2	6	687698	687703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818923
15495	NC_012586	TTC	2	6	687733	687738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818923
15496	NC_012586	TCGA	2	8	687742	687749	25 %	25 %	25 %	25 %	227818923
15497	NC_012586	CGA	2	6	687795	687800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818923
15498	NC_012586	GTT	2	6	687823	687828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227818923
15499	NC_012586	TCGA	2	8	687856	687863	25 %	25 %	25 %	25 %	227818923
15500	NC_012586	GC	3	6	687875	687880	0 %	0 %	50 %	50 %	227818923

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