MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234b

Total Repeats: 56054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_012586	ACTC	2	8	594013	594020	25 %	25 %	0 %	50 %	227818837
13502	NC_012586	GCT	2	6	594058	594063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818837
13503	NC_012586	TCG	2	6	594075	594080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818837
13504	NC_012586	TCA	2	6	594093	594098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818837
13505	NC_012586	GAG	3	9	594189	594197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_012586	GCAT	2	8	594203	594210	25 %	25 %	25 %	25 %	227818838
13507	NC_012586	GCC	3	9	594274	594282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818838
13508	NC_012586	GGA	2	6	594297	594302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818838
13509	NC_012586	TGG	2	6	594323	594328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818838
13510	NC_012586	GCG	2	6	594374	594379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818838
13511	NC_012586	GAA	2	6	594529	594534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818838
13512	NC_012586	CG	3	6	594535	594540	0 %	0 %	50 %	50 %	227818838
13513	NC_012586	TCAAT	2	10	594544	594553	40 %	40 %	0 %	20 %	227818838
13514	NC_012586	CGC	2	6	594567	594572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818838
13515	NC_012586	CGC	2	6	594712	594717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818838
13516	NC_012586	GAC	2	6	594724	594729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818838
13517	NC_012586	GGC	2	6	594775	594780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818838
13518	NC_012586	GCG	2	6	594808	594813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818838
13519	NC_012586	GAC	2	6	594849	594854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818838
13520	NC_012586	GCC	2	6	594946	594951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818838
13521	NC_012586	GAA	2	6	594957	594962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818838
13522	NC_012586	TGGA	2	8	594964	594971	25 %	25 %	50 %	0 %	227818838
13523	NC_012586	GATC	2	8	594972	594979	25 %	25 %	25 %	25 %	227818838
13524	NC_012586	CTTT	2	8	595071	595078	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13525	NC_012586	TCG	3	9	595353	595361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818839
13526	NC_012586	CGG	2	6	595594	595599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818839
13527	NC_012586	CAA	3	9	595601	595609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227818839
13528	NC_012586	TCGC	2	8	595620	595627	0 %	25 %	25 %	50 %	227818839
13529	NC_012586	GC	3	6	595626	595631	0 %	0 %	50 %	50 %	227818839
13530	NC_012586	CGA	2	6	595660	595665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818839
13531	NC_012586	AGG	2	6	595698	595703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818839
13532	NC_012586	GAT	2	6	595744	595749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818839
13533	NC_012586	CACG	2	8	595756	595763	25 %	0 %	25 %	50 %	227818839
13534	NC_012586	TCG	2	6	595821	595826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818839
13535	NC_012586	TCT	2	6	595845	595850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818839
13536	NC_012586	CAC	2	6	595904	595909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227818839
13537	NC_012586	CGAG	2	8	596059	596066	25 %	0 %	50 %	25 %	227818840
13538	NC_012586	CCT	2	6	596092	596097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818840
13539	NC_012586	GCG	2	6	596110	596115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818840
13540	NC_012586	GAT	2	6	596186	596191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818840
13541	NC_012586	CGG	2	6	596335	596340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818840
13542	NC_012586	ACG	2	6	596477	596482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818840
13543	NC_012586	GCA	2	6	596490	596495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818840
13544	NC_012586	GGC	3	9	596675	596683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818840
13545	NC_012586	GCA	2	6	596699	596704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818840
13546	NC_012586	GCC	2	6	596775	596780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818840
13547	NC_012586	ATC	3	9	596815	596823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818841
13548	NC_012586	GCTGAC	2	12	596865	596876	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	227818841
13549	NC_012586	CCG	2	6	596918	596923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818841
13550	NC_012586	ATC	2	6	596995	597000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818841
13551	NC_012586	CGC	2	6	597063	597068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818841
13552	NC_012586	CGC	2	6	597078	597083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818841
13553	NC_012586	GC	3	6	597114	597119	0 %	0 %	50 %	50 %	227818841
13554	NC_012586	CAA	2	6	597190	597195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13555	NC_012586	CTATG	2	10	597201	597210	20 %	40 %	20 %	20 %	227818842
13556	NC_012586	TCA	2	6	597351	597356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818842
13557	NC_012586	ATC	2	6	597376	597381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818842
13558	NC_012586	GC	3	6	597397	597402	0 %	0 %	50 %	50 %	227818842
13559	NC_012586	TCA	2	6	597422	597427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818842
13560	NC_012586	CGG	2	6	597431	597436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818842
13561	NC_012586	CAT	2	6	597541	597546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818842
13562	NC_012586	CG	3	6	597562	597567	0 %	0 %	50 %	50 %	227818842
13563	NC_012586	GCG	2	6	597622	597627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818842
13564	NC_012586	GCG	2	6	597638	597643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818842
13565	NC_012586	GGT	2	6	597658	597663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_012586	CCT	2	6	597730	597735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818843
13567	NC_012586	GACC	2	8	597851	597858	25 %	0 %	25 %	50 %	227818843
13568	NC_012586	ATC	2	6	597866	597871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818843
13569	NC_012586	CGA	2	6	597958	597963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818843
13570	NC_012586	CCG	2	6	598033	598038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818843
13571	NC_012586	ATC	2	6	598070	598075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818843
13572	NC_012586	TTG	2	6	598101	598106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227818843
13573	NC_012586	CGA	2	6	598135	598140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818843
13574	NC_012586	CGT	2	6	598160	598165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818843
13575	NC_012586	GCGCG	2	10	598168	598177	0 %	0 %	60 %	40 %	227818843
13576	NC_012586	TCT	2	6	598225	598230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818843
13577	NC_012586	CTG	2	6	598296	598301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818843
13578	NC_012586	GGT	2	6	598357	598362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818843
13579	NC_012586	GCG	2	6	598389	598394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818843
13580	NC_012586	GGA	2	6	598439	598444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818843
13581	NC_012586	GCTG	2	8	598456	598463	0 %	25 %	50 %	25 %	227818843
13582	NC_012586	TGG	2	6	598505	598510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818843
13583	NC_012586	CGA	3	9	598540	598548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818843
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13585	NC_012586	CG	3	6	598664	598669	0 %	0 %	50 %	50 %	227818843
13586	NC_012586	GCTC	2	8	598725	598732	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13587	NC_012586	CGATG	2	10	598751	598760	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13588	NC_012586	GGA	2	6	598803	598808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_012586	TCG	2	6	598811	598816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13590	NC_012586	CGC	2	6	598829	598834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13591	NC_012586	GCG	2	6	598999	599004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13592	NC_012586	TCA	2	6	599027	599032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13593	NC_012586	CGT	2	6	599065	599070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818844
13594	NC_012586	CTT	2	6	599108	599113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818844
13595	NC_012586	GC	3	6	599136	599141	0 %	0 %	50 %	50 %	227818844
13596	NC_012586	TCT	2	6	599152	599157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818844
13597	NC_012586	TG	3	6	599164	599169	0 %	50 %	50 %	0 %	227818844
13598	NC_012586	TG	3	6	599282	599287	0 %	50 %	50 %	0 %	227818844
13599	NC_012586	TCT	3	9	599398	599406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818844
13600	NC_012586	ATG	2	6	599409	599414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818844
13601	NC_012586	CCT	2	6	599569	599574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818844
13602	NC_012586	GAT	2	6	599600	599605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_012586	TCC	2	6	599634	599639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13604	NC_012586	CCG	2	6	599837	599842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818845
13605	NC_012586	CAC	2	6	599953	599958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227818845
13606	NC_012586	GCAC	2	8	600044	600051	25 %	0 %	25 %	50 %	227818845
13607	NC_012586	CAG	2	6	600076	600081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818845
13608	NC_012586	GTC	2	6	600163	600168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818845
13609	NC_012586	TCCT	2	8	600217	600224	0 %	50 %	0 %	50 %	227818845
13610	NC_012586	GC	3	6	600229	600234	0 %	0 %	50 %	50 %	227818845
13611	NC_012586	AAG	2	6	600311	600316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818845
13612	NC_012586	TGT	2	6	600330	600335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227818845
13613	NC_012586	CCGT	3	12	600359	600370	0 %	25 %	25 %	50 %	227818845
13614	NC_012586	CTT	2	6	600424	600429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818845
13615	NC_012586	CGG	2	6	600453	600458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818845
13616	NC_012586	GA	3	6	600477	600482	50 %	0 %	50 %	0 %	227818845
13617	NC_012586	GGGGAT	2	12	600519	600530	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	227818845
13618	NC_012586	TCCGCC	2	12	600560	600571	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	227818845
13619	NC_012586	TCA	2	6	600668	600673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818845
13620	NC_012586	CTG	2	6	600682	600687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818845
13621	NC_012586	AGCA	2	8	600688	600695	50 %	0 %	25 %	25 %	227818845
13622	NC_012586	GCG	2	6	600720	600725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818845
13623	NC_012586	CT	3	6	600778	600783	0 %	50 %	0 %	50 %	227818845
13624	NC_012586	TCC	2	6	600813	600818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818845
13625	NC_012586	GCC	2	6	600824	600829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818845
13626	NC_012586	GCGA	2	8	600830	600837	25 %	0 %	50 %	25 %	227818845
13627	NC_012586	GAA	2	6	600883	600888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818845
13628	NC_012586	CGG	2	6	600891	600896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818845
13629	NC_012586	GAT	2	6	600930	600935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818845
13630	NC_012586	CTG	2	6	600987	600992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818845
13631	NC_012586	T	6	6	600999	601004	0 %	100 %	0 %	0 %	227818845
13632	NC_012586	CGC	2	6	601074	601079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818845
13633	NC_012586	CAT	2	6	601089	601094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818845
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13635	NC_012586	TCAA	2	8	601130	601137	50 %	25 %	0 %	25 %	227818845
13636	NC_012586	CTG	2	6	601219	601224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818845
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13639	NC_012586	CGT	2	6	601311	601316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818845
13640	NC_012586	GCCA	2	8	601457	601464	25 %	0 %	25 %	50 %	227818845
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13647	NC_012586	ATC	2	6	601750	601755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818845
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13649	NC_012586	GGA	2	6	601794	601799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818845
13650	NC_012586	GCAA	2	8	601864	601871	50 %	0 %	25 %	25 %	227818845
13651	NC_012586	CGA	2	6	601878	601883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818845
13652	NC_012586	ACGCC	2	10	601972	601981	20 %	0 %	20 %	60 %	227818845
13653	NC_012586	TGC	2	6	601987	601992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818845
13654	NC_012586	TCG	2	6	602006	602011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818845
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13658	NC_012586	CCT	2	6	602157	602162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13659	NC_012586	CTCG	2	8	602187	602194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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13700	NC_012586	CAG	3	9	604273	604281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818847
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13724	NC_012586	CGGC	2	8	605485	605492	0 %	0 %	50 %	50 %	227818848
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13733	NC_012586	TTG	2	6	605842	605847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227818849
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13735	NC_012586	AGC	2	6	605896	605901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818849
13736	NC_012586	CTGAG	2	10	606031	606040	20 %	20 %	40 %	20 %	227818849
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13858	NC_012586	ATC	2	6	611608	611613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13859	NC_012586	TCG	2	6	611633	611638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13860	NC_012586	GTC	2	6	611640	611645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13861	NC_012586	TCC	2	6	611731	611736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13862	NC_012586	GCC	2	6	611807	611812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13863	NC_012586	TGA	2	6	611827	611832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13864	NC_012586	GGT	2	6	611863	611868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13865	NC_012586	CGAG	2	8	611872	611879	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13866	NC_012586	CAG	2	6	611884	611889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13867	NC_012586	GCC	2	6	611913	611918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818854
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13869	NC_012586	CAT	2	6	612047	612052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818854
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13872	NC_012586	GCTC	2	8	612213	612220	0 %	25 %	25 %	50 %	227818854
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13875	NC_012586	CG	4	8	612273	612280	0 %	0 %	50 %	50 %	227818854
13876	NC_012586	ACC	2	6	612297	612302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227818854
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13879	NC_012586	CG	3	6	612454	612459	0 %	0 %	50 %	50 %	227818854
13880	NC_012586	ACA	2	6	612474	612479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227818854
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13882	NC_012586	TGGACA	2	12	612526	612537	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227818854
13883	NC_012586	CCT	2	6	612539	612544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13891	NC_012586	CTT	2	6	613059	613064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13892	NC_012586	CAT	2	6	613089	613094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13894	NC_012586	CGC	2	6	613213	613218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818856
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13979	NC_012586	TGGCG	2	10	617361	617370	0 %	20 %	60 %	20 %	227818860
13980	NC_012586	CG	3	6	617403	617408	0 %	0 %	50 %	50 %	227818860
13981	NC_012586	TCA	2	6	617423	617428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818860
13982	NC_012586	TTC	2	6	617530	617535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818860
13983	NC_012586	CTT	2	6	617541	617546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818860
13984	NC_012586	GTGAA	2	10	617567	617576	40 %	20 %	40 %	0 %	227818860
13985	NC_012586	GGT	2	6	617580	617585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818860
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13989	NC_012586	CGT	2	6	617700	617705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818860
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13992	NC_012586	ATC	2	6	617833	617838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818860
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13998	NC_012586	CG	3	6	618189	618194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13999	NC_012586	C	6	6	618309	618314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14000	NC_012586	ACC	2	6	618315	618320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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