MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234b

Total Repeats: 56054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012586	TGC	2	6	257173	257178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818508
6002	NC_012586	TCT	2	6	257227	257232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818508
6003	NC_012586	ATC	2	6	257259	257264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818508
6004	NC_012586	CGC	2	6	257273	257278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818508
6005	NC_012586	GAC	2	6	257282	257287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818508
6006	NC_012586	CGC	2	6	257309	257314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818508
6007	NC_012586	GCG	3	9	257368	257376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818508
6008	NC_012586	ATG	2	6	257388	257393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818508
6009	NC_012586	GC	3	6	257412	257417	0 %	0 %	50 %	50 %	227818508
6010	NC_012586	CTG	2	6	257421	257426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818508
6011	NC_012586	TGC	2	6	257438	257443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818508
6012	NC_012586	GC	3	6	257442	257447	0 %	0 %	50 %	50 %	227818508
6013	NC_012586	GGA	2	6	257570	257575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818508
6014	NC_012586	GAG	2	6	257607	257612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818508
6015	NC_012586	TGA	2	6	257623	257628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818508
6016	NC_012586	CGA	2	6	257635	257640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818508
6017	NC_012586	CCT	2	6	257641	257646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818508
6018	NC_012586	GGAC	2	8	257918	257925	25 %	0 %	50 %	25 %	227818508
6019	NC_012586	TGG	2	6	258022	258027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818508
6020	NC_012586	TGC	2	6	258143	258148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_012586	CGA	2	6	258242	258247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818509
6022	NC_012586	CTGA	2	8	258252	258259	25 %	25 %	25 %	25 %	227818509
6023	NC_012586	GCA	2	6	258321	258326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818509
6024	NC_012586	CG	3	6	258368	258373	0 %	0 %	50 %	50 %	227818509
6025	NC_012586	CGC	2	6	258389	258394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818509
6026	NC_012586	GC	4	8	258411	258418	0 %	0 %	50 %	50 %	227818509
6027	NC_012586	GGC	3	9	258491	258499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818509
6028	NC_012586	CGA	2	6	258500	258505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818509
6029	NC_012586	CG	3	6	258512	258517	0 %	0 %	50 %	50 %	227818509
6030	NC_012586	GAT	2	6	258525	258530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818509
6031	NC_012586	GGC	2	6	258722	258727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818509
6032	NC_012586	GCC	2	6	258738	258743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818509
6033	NC_012586	CTG	2	6	258776	258781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818509
6034	NC_012586	GAC	2	6	258834	258839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818509
6035	NC_012586	GC	3	6	258879	258884	0 %	0 %	50 %	50 %	227818509
6036	NC_012586	ACGA	2	8	258966	258973	50 %	0 %	25 %	25 %	227818509
6037	NC_012586	TCG	2	6	258979	258984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818509
6038	NC_012586	GC	3	6	259004	259009	0 %	0 %	50 %	50 %	227818509
6039	NC_012586	CAC	2	6	259038	259043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227818509
6040	NC_012586	CAAAA	2	10	259130	259139	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6041	NC_012586	CGG	2	6	259165	259170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_012586	GATGA	2	10	259174	259183	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_012586	CGG	3	9	259265	259273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818510
6044	NC_012586	TCG	2	6	259306	259311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818510
6045	NC_012586	ATC	2	6	259329	259334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818510
6046	NC_012586	GCC	2	6	259368	259373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818510
6047	NC_012586	GC	3	6	259381	259386	0 %	0 %	50 %	50 %	227818510
6048	NC_012586	CGAG	2	8	259414	259421	25 %	0 %	50 %	25 %	227818510
6049	NC_012586	GCC	2	6	259431	259436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818510
6050	NC_012586	GGC	2	6	259445	259450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818510
6051	NC_012586	GCG	2	6	259611	259616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818510
6052	NC_012586	GAG	2	6	259626	259631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818510
6053	NC_012586	GGC	2	6	259644	259649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818510
6054	NC_012586	CGC	2	6	259679	259684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818510
6055	NC_012586	GGC	2	6	259706	259711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818510
6056	NC_012586	GCG	2	6	259729	259734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818510
6057	NC_012586	CG	4	8	259757	259764	0 %	0 %	50 %	50 %	227818510
6058	NC_012586	CGT	2	6	259787	259792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818510
6059	NC_012586	GAT	2	6	259823	259828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818510
6060	NC_012586	AGG	2	6	259843	259848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818510
6061	NC_012586	CGC	2	6	259882	259887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818510
6062	NC_012586	CGGC	2	8	259892	259899	0 %	0 %	50 %	50 %	227818510
6063	NC_012586	GC	3	6	259990	259995	0 %	0 %	50 %	50 %	227818510
6064	NC_012586	GAT	2	6	260019	260024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818511
6065	NC_012586	ACG	2	6	260042	260047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818511
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6067	NC_012586	CAGCG	2	10	260083	260092	20 %	0 %	40 %	40 %	227818511
6068	NC_012586	GGC	2	6	260142	260147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818511
6069	NC_012586	GCC	2	6	260157	260162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818511
6070	NC_012586	AAGCGT	2	12	260175	260186	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227818511
6071	NC_012586	CGG	2	6	260187	260192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818511
6072	NC_012586	CGC	2	6	260251	260256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818511
6073	NC_012586	CGC	2	6	260267	260272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818511
6074	NC_012586	CCG	2	6	260343	260348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818511
6075	NC_012586	CAG	2	6	260398	260403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818511
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6080	NC_012586	GCG	2	6	260566	260571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818512
6081	NC_012586	TCC	2	6	260593	260598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818512
6082	NC_012586	ATCG	2	8	260599	260606	25 %	25 %	25 %	25 %	227818512
6083	NC_012586	GCG	3	9	260614	260622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818512
6084	NC_012586	TCA	2	6	260650	260655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818512
6085	NC_012586	TCA	2	6	260694	260699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_012586	ATC	2	6	260714	260719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818513
6087	NC_012586	AACCGC	2	12	260766	260777	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	227818513
6088	NC_012586	GCC	2	6	260780	260785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818513
6089	NC_012586	TCG	2	6	260787	260792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818513
6090	NC_012586	GCGG	2	8	260819	260826	0 %	0 %	75 %	25 %	227818513
6091	NC_012586	TTC	2	6	260859	260864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818513
6092	NC_012586	CGC	2	6	260917	260922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818513
6093	NC_012586	TGC	2	6	260957	260962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818513
6094	NC_012586	CGA	2	6	261148	261153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818513
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6099	NC_012586	GAC	2	6	261221	261226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818513
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6101	NC_012586	TCG	2	6	261363	261368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818513
6102	NC_012586	CGCTGG	2	12	261417	261428	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	227818513
6103	NC_012586	CCG	2	6	261429	261434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818513
6104	NC_012586	GCT	2	6	261439	261444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818513
6105	NC_012586	TCA	2	6	261637	261642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818513
6106	NC_012586	TCG	2	6	261648	261653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818513
6107	NC_012586	TCC	2	6	261678	261683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818513
6108	NC_012586	ATC	2	6	261693	261698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818513
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6110	NC_012586	CGA	2	6	261733	261738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818513
6111	NC_012586	GAC	2	6	261740	261745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818513
6112	NC_012586	TGA	2	6	261781	261786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818513
6113	NC_012586	CG	3	6	261840	261845	0 %	0 %	50 %	50 %	227818514
6114	NC_012586	CGA	2	6	261895	261900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818514
6115	NC_012586	GGTGAC	2	12	261901	261912	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	227818514
6116	NC_012586	CCAG	2	8	261942	261949	25 %	0 %	25 %	50 %	227818514
6117	NC_012586	GCC	2	6	261961	261966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818514
6118	NC_012586	CAT	2	6	262029	262034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818514
6119	NC_012586	GAC	3	9	262075	262083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818514
6120	NC_012586	CGT	2	6	262141	262146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818514
6121	NC_012586	GCC	2	6	262189	262194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818514
6122	NC_012586	GGT	2	6	262266	262271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818514
6123	NC_012586	GAC	2	6	262276	262281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818514
6124	NC_012586	TCG	2	6	262361	262366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818514
6125	NC_012586	GCA	2	6	262389	262394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818514
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6127	NC_012586	TCA	2	6	262440	262445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818514
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6129	NC_012586	TGGC	2	8	262469	262476	0 %	25 %	50 %	25 %	227818514
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6135	NC_012586	GCC	2	6	262705	262710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818514
6136	NC_012586	TGA	2	6	262719	262724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818514
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6143	NC_012586	CGC	2	6	263460	263465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818514
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6148	NC_012586	GC	3	6	263788	263793	0 %	0 %	50 %	50 %	227818514
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6151	NC_012586	GAC	2	6	263848	263853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818514
6152	NC_012586	CGC	2	6	263866	263871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818514
6153	NC_012586	CGGC	2	8	263894	263901	0 %	0 %	50 %	50 %	227818514
6154	NC_012586	GC	3	6	263942	263947	0 %	0 %	50 %	50 %	227818514
6155	NC_012586	TCG	2	6	263960	263965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818514
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6159	NC_012586	CAT	2	6	264097	264102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818514
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6169	NC_012586	GCCGA	2	10	264481	264490	20 %	0 %	40 %	40 %	227818515
6170	NC_012586	TCG	2	6	264491	264496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818515
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6183	NC_012586	CGA	2	6	264875	264880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818515
6184	NC_012586	GGTT	2	8	264917	264924	0 %	50 %	50 %	0 %	227818515
6185	NC_012586	GAA	2	6	264950	264955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818516
6186	NC_012586	AGC	2	6	264969	264974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818516
6187	NC_012586	ACG	2	6	264984	264989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818516
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6189	NC_012586	CAGCGT	2	12	265064	265075	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	227818516
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6191	NC_012586	TCG	2	6	265119	265124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818516
6192	NC_012586	TCG	2	6	265144	265149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818516
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6202	NC_012586	TTG	2	6	265527	265532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227818516
6203	NC_012586	AGC	2	6	265533	265538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818516
6204	NC_012586	CAG	2	6	265556	265561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818516
6205	NC_012586	ACG	2	6	265581	265586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818516
6206	NC_012586	TGA	2	6	265615	265620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818516
6207	NC_012586	TCA	3	9	265669	265677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818516
6208	NC_012586	CGA	2	6	265762	265767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818516
6209	NC_012586	AGCC	2	8	265770	265777	25 %	0 %	25 %	50 %	227818516
6210	NC_012586	ATA	2	6	265787	265792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227818516
6211	NC_012586	GCC	2	6	265802	265807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818516
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6213	NC_012586	CGGC	2	8	265875	265882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6214	NC_012586	GCG	2	6	265885	265890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6215	NC_012586	GCC	2	6	265904	265909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6216	NC_012586	AGGC	2	8	265917	265924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6217	NC_012586	CGT	2	6	265988	265993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818517
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6219	NC_012586	CGC	2	6	266123	266128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818517
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6221	NC_012586	GCC	2	6	266143	266148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818517
6222	NC_012586	GCCGC	2	10	266155	266164	0 %	0 %	40 %	60 %	227818517
6223	NC_012586	AGC	2	6	266176	266181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818517
6224	NC_012586	TCT	2	6	266210	266215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818517
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6227	NC_012586	TCGA	2	8	266338	266345	25 %	25 %	25 %	25 %	227818517
6228	NC_012586	CA	3	6	266416	266421	50 %	0 %	0 %	50 %	227818517
6229	NC_012586	GAC	2	6	266427	266432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818517
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6232	NC_012586	GGCC	2	8	266594	266601	0 %	0 %	50 %	50 %	227818517
6233	NC_012586	ATG	3	9	266608	266616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818517
6234	NC_012586	GCC	2	6	266625	266630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818517
6235	NC_012586	CAT	2	6	266649	266654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818517
6236	NC_012586	CTT	2	6	266655	266660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818517
6237	NC_012586	TCA	2	6	266825	266830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818517
6238	NC_012586	AAT	2	6	266858	266863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227818517
6239	NC_012586	GC	3	6	266918	266923	0 %	0 %	50 %	50 %	227818517
6240	NC_012586	CGG	2	6	266960	266965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818517
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6355	NC_012586	TCGA	2	8	271842	271849	25 %	25 %	25 %	25 %	227818522
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6357	NC_012586	GC	3	6	271883	271888	0 %	0 %	50 %	50 %	227818522
6358	NC_012586	GTGGC	2	10	271899	271908	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6359	NC_012586	ACCGCT	2	12	271917	271928	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6360	NC_012586	CTC	2	6	271948	271953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6362	NC_012586	GCG	2	6	272085	272090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6484	NC_012586	GAT	2	6	276914	276919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818526
6485	NC_012586	ATC	2	6	276972	276977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818526
6486	NC_012586	GCC	2	6	277006	277011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818526
6487	NC_012586	GCG	3	9	277014	277022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818526
6488	NC_012586	CG	3	6	277026	277031	0 %	0 %	50 %	50 %	227818526
6489	NC_012586	TGC	2	6	277039	277044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818526
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6492	NC_012586	CCAGCG	2	12	277109	277120	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	227818526
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6495	NC_012586	CGA	2	6	277177	277182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818526
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