MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012471	T	6	6	20	25	0 %	100 %	0 %	0 %	225869488
2	NC_012471	AGCT	2	8	41	48	25 %	25 %	25 %	25 %	225869488
3	NC_012471	T	6	6	79	84	0 %	100 %	0 %	0 %	225869488
4	NC_012471	ATG	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869488
5	NC_012471	CAA	2	6	125	130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869488
6	NC_012471	T	7	7	131	137	0 %	100 %	0 %	0 %	225869488
7	NC_012471	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	225869488
8	NC_012471	CAG	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869488
9	NC_012471	TGA	2	6	251	256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869488
10	NC_012471	CAG	2	6	314	319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869488
11	NC_012471	TGA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869488
12	NC_012471	TGC	2	6	390	395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869488
13	NC_012471	AAC	2	6	423	428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869488
14	NC_012471	TTTA	2	8	438	445	25 %	75 %	0 %	0 %	225869488
15	NC_012471	TTA	2	6	554	559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869488
16	NC_012471	TGT	2	6	567	572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869488
17	NC_012471	TCC	2	6	629	634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869488
18	NC_012471	TGA	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869488
19	NC_012471	A	7	7	661	667	100 %	0 %	0 %	0 %	225869488
20	NC_012471	ATAACA	2	12	716	727	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225869488
21	NC_012471	AGA	2	6	777	782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869488
22	NC_012471	AGC	2	6	1020	1025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869488
23	NC_012471	GAA	2	6	1081	1086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869488
24	NC_012471	CA	3	6	1149	1154	50 %	0 %	0 %	50 %	225869488
25	NC_012471	TGCT	2	8	1163	1170	0 %	50 %	25 %	25 %	225869488
26	NC_012471	GGA	2	6	1240	1245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869488
27	NC_012471	AATTGA	2	12	1317	1328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225869488
28	NC_012471	CTA	5	15	1464	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012471	TA	3	6	1490	1495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012471	TTCA	2	8	1540	1547	25 %	50 %	0 %	25 %	225869489
31	NC_012471	CAG	2	6	1575	1580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869489
32	NC_012471	TTG	2	6	1708	1713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869489
33	NC_012471	T	6	6	1750	1755	0 %	100 %	0 %	0 %	225869489
34	NC_012471	GGT	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869489
35	NC_012471	TGC	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869489
36	NC_012471	GTC	2	6	1982	1987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869489
37	NC_012471	GA	3	6	2133	2138	50 %	0 %	50 %	0 %	225869489
38	NC_012471	GAT	2	6	2158	2163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869489
39	NC_012471	TGA	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869489
40	NC_012471	AC	3	6	2309	2314	50 %	0 %	0 %	50 %	225869489
41	NC_012471	GTG	2	6	2458	2463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869489
42	NC_012471	GAT	2	6	2596	2601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869489
43	NC_012471	AG	3	6	2604	2609	50 %	0 %	50 %	0 %	225869489
44	NC_012471	T	7	7	2672	2678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012471	ATAA	2	8	2685	2692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012471	TGAG	2	8	2706	2713	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012471	TGAAA	2	10	2747	2756	60 %	20 %	20 %	0 %	225869490
48	NC_012471	A	6	6	2789	2794	100 %	0 %	0 %	0 %	225869490
49	NC_012471	GTC	2	6	2875	2880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869490
50	NC_012471	GAA	2	6	2900	2905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869490
51	NC_012471	ATT	2	6	2963	2968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012471	A	6	6	2996	3001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012471	AAAGG	2	10	3023	3032	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012471	ATG	2	6	3042	3047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869491
55	NC_012471	AAG	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869491
56	NC_012471	TTA	2	6	3259	3264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869491
57	NC_012471	TCT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869491
58	NC_012471	TAT	2	6	3349	3354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869491
59	NC_012471	GT	3	6	3376	3381	0 %	50 %	50 %	0 %	225869491
60	NC_012471	TCT	2	6	3431	3436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012471	T	8	8	3436	3443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012471	A	6	6	3463	3468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012471	A	7	7	3483	3489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012471	CAG	2	6	3501	3506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869492
65	NC_012471	GCT	2	6	3575	3580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869492
66	NC_012471	TGGTA	2	10	3613	3622	20 %	40 %	40 %	0 %	225869492
67	NC_012471	A	7	7	3671	3677	100 %	0 %	0 %	0 %	225869492
68	NC_012471	TGA	3	9	3811	3819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869492
69	NC_012471	AATT	2	8	3894	3901	50 %	50 %	0 %	0 %	225869492
70	NC_012471	AATC	2	8	3915	3922	50 %	25 %	0 %	25 %	225869492
71	NC_012471	A	6	6	3945	3950	100 %	0 %	0 %	0 %	225869492
72	NC_012471	A	6	6	4002	4007	100 %	0 %	0 %	0 %	225869492
73	NC_012471	GAA	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869492
74	NC_012471	GAT	2	6	4058	4063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869492
75	NC_012471	A	6	6	4068	4073	100 %	0 %	0 %	0 %	225869492
76	NC_012471	TTA	2	6	4091	4096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869492
77	NC_012471	TGA	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869492
78	NC_012471	GCA	2	6	4190	4195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869492
79	NC_012471	GTT	2	6	4211	4216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869492
80	NC_012471	AGA	3	9	4234	4242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869492
81	NC_012471	GAT	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869492
82	NC_012471	ACTTGG	2	12	4342	4353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225869492
83	NC_012471	GTGC	2	8	4382	4389	0 %	25 %	50 %	25 %	225869492
84	NC_012471	CAC	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869492
85	NC_012471	AGC	2	6	4423	4428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869492
86	NC_012471	ATG	2	6	4485	4490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869492
87	NC_012471	GTC	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869492
88	NC_012471	AGGA	2	8	4545	4552	50 %	0 %	50 %	0 %	225869492
89	NC_012471	AT	3	6	4558	4563	50 %	50 %	0 %	0 %	225869492
90	NC_012471	A	6	6	4682	4687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012471	GCT	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012471	CAAA	2	8	4813	4820	75 %	0 %	0 %	25 %	225869493
93	NC_012471	AGA	2	6	4881	4886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869493
94	NC_012471	ATCA	2	8	4921	4928	50 %	25 %	0 %	25 %	225869493
95	NC_012471	ATTT	2	8	4936	4943	25 %	75 %	0 %	0 %	225869493
96	NC_012471	AAT	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869493
97	NC_012471	ATG	2	6	5039	5044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869493
98	NC_012471	ATT	2	6	5119	5124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869493
99	NC_012471	TTA	2	6	5195	5200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869493
100	NC_012471	GAT	2	6	5227	5232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869493
101	NC_012471	CAAT	2	8	5240	5247	50 %	25 %	0 %	25 %	225869493
102	NC_012471	TAT	2	6	5281	5286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869493
103	NC_012471	A	6	6	5294	5299	100 %	0 %	0 %	0 %	225869493
104	NC_012471	GCA	2	6	5316	5321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869493
105	NC_012471	ATT	2	6	5351	5356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869494
106	NC_012471	AGC	3	9	5444	5452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869494
107	NC_012471	GTG	2	6	5493	5498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869494
108	NC_012471	CTTG	2	8	5546	5553	0 %	50 %	25 %	25 %	225869494
109	NC_012471	T	6	6	5574	5579	0 %	100 %	0 %	0 %	225869494
110	NC_012471	GAT	2	6	5583	5588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869494
111	NC_012471	CTG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869494
112	NC_012471	T	6	6	5654	5659	0 %	100 %	0 %	0 %	225869494
113	NC_012471	TTAGC	2	10	5692	5701	20 %	40 %	20 %	20 %	225869494
114	NC_012471	CAG	2	6	5739	5744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869494
115	NC_012471	AAG	2	6	5796	5801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869494
116	NC_012471	T	6	6	5919	5924	0 %	100 %	0 %	0 %	225869494
117	NC_012471	TGA	2	6	5927	5932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869494
118	NC_012471	TC	3	6	5973	5978	0 %	50 %	0 %	50 %	225869494
119	NC_012471	AAG	2	6	5982	5987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869494
120	NC_012471	GGA	2	6	6032	6037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869494
121	NC_012471	AGC	2	6	6067	6072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869494
122	NC_012471	GGA	2	6	6107	6112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869494
123	NC_012471	AAG	2	6	6130	6135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869494
124	NC_012471	AATG	2	8	6183	6190	50 %	25 %	25 %	0 %	225869494
125	NC_012471	T	6	6	6228	6233	0 %	100 %	0 %	0 %	225869494
126	NC_012471	GAT	2	6	6234	6239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869494
127	NC_012471	AGTT	2	8	6247	6254	25 %	50 %	25 %	0 %	225869494
128	NC_012471	TTG	2	6	6291	6296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869494
129	NC_012471	GAT	2	6	6300	6305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869494
130	NC_012471	ATT	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869494
131	NC_012471	CTT	2	6	6386	6391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869494
132	NC_012471	TCAA	2	8	6472	6479	50 %	25 %	0 %	25 %	225869494
133	NC_012471	TGA	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869494
134	NC_012471	TCA	2	6	6551	6556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869494
135	NC_012471	CTG	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869494
136	NC_012471	ATT	2	6	6651	6656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869494
137	NC_012471	TGA	2	6	6686	6691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869494
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139	NC_012471	CGT	2	6	6741	6746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869494
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268	NC_012471	ATG	2	6	12285	12290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869499
269	NC_012471	TTATC	2	10	12318	12327	20 %	60 %	0 %	20 %	225869499
270	NC_012471	GAC	2	6	12353	12358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869499
271	NC_012471	CAT	2	6	12420	12425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869500
272	NC_012471	A	6	6	12426	12431	100 %	0 %	0 %	0 %	225869500
273	NC_012471	TCA	2	6	12450	12455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869500
274	NC_012471	TGG	2	6	12477	12482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869500
275	NC_012471	TGC	2	6	12500	12505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869500
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277	NC_012471	TGC	2	6	12675	12680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869500
278	NC_012471	T	6	6	12700	12705	0 %	100 %	0 %	0 %	225869500
279	NC_012471	GCA	2	6	12717	12722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869500
280	NC_012471	ATT	2	6	12728	12733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869500
281	NC_012471	CAT	2	6	12751	12756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869500
282	NC_012471	TGA	2	6	12759	12764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869500
283	NC_012471	TGA	2	6	12782	12787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869500
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285	NC_012471	TCA	2	6	12963	12968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869500
286	NC_012471	TGAT	2	8	13016	13023	25 %	50 %	25 %	0 %	225869500
287	NC_012471	CTG	2	6	13042	13047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869500
288	NC_012471	TGA	2	6	13059	13064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869500
289	NC_012471	T	6	6	13101	13106	0 %	100 %	0 %	0 %	225869500
290	NC_012471	GCT	2	6	13117	13122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869500
291	NC_012471	T	8	8	13129	13136	0 %	100 %	0 %	0 %	225869500
292	NC_012471	ATT	2	6	13145	13150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869500
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298	NC_012471	TA	3	6	13424	13429	50 %	50 %	0 %	0 %	225869500
299	NC_012471	AGGC	2	8	13456	13463	25 %	0 %	50 %	25 %	225869500
300	NC_012471	A	7	7	13494	13500	100 %	0 %	0 %	0 %	225869500
301	NC_012471	AGC	2	6	13538	13543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869500
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305	NC_012471	A	6	6	13704	13709	100 %	0 %	0 %	0 %	225869501
306	NC_012471	ATT	2	6	13730	13735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869501
307	NC_012471	TGA	2	6	13839	13844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869501
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309	NC_012471	TGG	2	6	13897	13902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869501
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311	NC_012471	TTG	2	6	13974	13979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869501
312	NC_012471	ATT	2	6	13985	13990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869501
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314	NC_012471	GATTA	2	10	14154	14163	40 %	40 %	20 %	0 %	225869501
315	NC_012471	ATT	2	6	14238	14243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_012471	ATTA	2	8	14383	14390	50 %	50 %	0 %	0 %	225869502
322	NC_012471	GCA	2	6	14439	14444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869502
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370	NC_012471	AATA	2	8	16215	16222	75 %	25 %	0 %	0 %	225869502
371	NC_012471	ATT	2	6	16230	16235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
372	NC_012471	AT	3	6	16237	16242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
373	NC_012471	T	6	6	16271	16276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_012471	TAT	2	6	16548	16553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869503
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383	NC_012471	ATC	2	6	16690	16695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869503
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389	NC_012471	A	6	6	17126	17131	100 %	0 %	0 %	0 %	225869503
390	NC_012471	GTATT	2	10	17144	17153	20 %	60 %	20 %	0 %	225869503
391	NC_012471	GCA	2	6	17281	17286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869503
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394	NC_012471	GTT	2	6	17449	17454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869503
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396	NC_012471	A	6	6	17571	17576	100 %	0 %	0 %	0 %	225869503
397	NC_012471	TAT	2	6	17640	17645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869503
398	NC_012471	ATGC	2	8	17729	17736	25 %	25 %	25 %	25 %	225869503
399	NC_012471	AAGA	2	8	17756	17763	75 %	0 %	25 %	0 %	225869503
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401	NC_012471	A	7	7	17863	17869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_012471	GGC	2	6	18071	18076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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