MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_012471	ACC	2	6	2210908	2210913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871453
47002	NC_012471	GCA	2	6	2210915	2210920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871453
47003	NC_012471	ATA	2	6	2211023	2211028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871453
47004	NC_012471	CAG	2	6	2211067	2211072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871453
47005	NC_012471	TTTGC	2	10	2211135	2211144	0 %	60 %	20 %	20 %	225871453
47006	NC_012471	ATCT	2	8	2211153	2211160	25 %	50 %	0 %	25 %	225871453
47007	NC_012471	ATA	2	6	2211194	2211199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871453
47008	NC_012471	AGCT	2	8	2211466	2211473	25 %	25 %	25 %	25 %	225871453
47009	NC_012471	GCT	2	6	2211492	2211497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871453
47010	NC_012471	TAA	2	6	2211508	2211513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871453
47011	NC_012471	CTG	2	6	2211567	2211572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871453
47012	NC_012471	GCC	2	6	2211607	2211612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225871453
47013	NC_012471	TGT	2	6	2211646	2211651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871453
47014	NC_012471	TGCCT	2	10	2211694	2211703	0 %	40 %	20 %	40 %	225871453
47015	NC_012471	TAGG	2	8	2211708	2211715	25 %	25 %	50 %	0 %	225871453
47016	NC_012471	TTG	2	6	2211789	2211794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871453
47017	NC_012471	CTC	2	6	2211808	2211813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871453
47018	NC_012471	AGCTC	2	10	2211888	2211897	20 %	20 %	20 %	40 %	225871453
47019	NC_012471	CTG	2	6	2211901	2211906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871453
47020	NC_012471	GTAGCT	2	12	2211929	2211940	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225871453
47021	NC_012471	CAG	2	6	2211969	2211974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871453
47022	NC_012471	ATC	2	6	2211976	2211981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871453
47023	NC_012471	GCT	2	6	2212083	2212088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871453
47024	NC_012471	TTGT	2	8	2212141	2212148	0 %	75 %	25 %	0 %	225871453
47025	NC_012471	GCT	2	6	2212253	2212258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871453
47026	NC_012471	TAGA	2	8	2212320	2212327	50 %	25 %	25 %	0 %	225871453
47027	NC_012471	ATGC	2	8	2212477	2212484	25 %	25 %	25 %	25 %	225871453
47028	NC_012471	CT	3	6	2212534	2212539	0 %	50 %	0 %	50 %	225871453
47029	NC_012471	GCT	2	6	2212626	2212631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871453
47030	NC_012471	ATA	2	6	2212687	2212692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871453
47031	NC_012471	AGTC	2	8	2212792	2212799	25 %	25 %	25 %	25 %	225871453
47032	NC_012471	AG	3	6	2212905	2212910	50 %	0 %	50 %	0 %	225871453
47033	NC_012471	ACT	2	6	2212940	2212945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871453
47034	NC_012471	ATT	2	6	2212961	2212966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871453
47035	NC_012471	ATT	2	6	2212985	2212990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871453
47036	NC_012471	T	6	6	2212989	2212994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47037	NC_012471	AT	3	6	2213031	2213036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47038	NC_012471	A	6	6	2213065	2213070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47039	NC_012471	T	6	6	2213075	2213080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47040	NC_012471	ATG	2	6	2213115	2213120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871454
47041	NC_012471	AGC	2	6	2213131	2213136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871454
47042	NC_012471	AAG	2	6	2213142	2213147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871454
47043	NC_012471	GAT	2	6	2213193	2213198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871454
47044	NC_012471	AAC	2	6	2213201	2213206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871454
47045	NC_012471	GGCA	2	8	2213225	2213232	25 %	0 %	50 %	25 %	225871454
47046	NC_012471	GAT	2	6	2213276	2213281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871454
47047	NC_012471	CAA	2	6	2213292	2213297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871454
47048	NC_012471	T	6	6	2213301	2213306	0 %	100 %	0 %	0 %	225871454
47049	NC_012471	T	6	6	2213357	2213362	0 %	100 %	0 %	0 %	225871454
47050	NC_012471	ACT	2	6	2213393	2213398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871454
47051	NC_012471	TCTGC	2	10	2213400	2213409	0 %	40 %	20 %	40 %	225871454
47052	NC_012471	TCC	2	6	2213412	2213417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871454
47053	NC_012471	A	7	7	2213591	2213597	100 %	0 %	0 %	0 %	225871454
47054	NC_012471	ATG	2	6	2213662	2213667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47055	NC_012471	A	6	6	2213682	2213687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47056	NC_012471	A	6	6	2213813	2213818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47057	NC_012471	TGT	2	6	2213825	2213830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47058	NC_012471	CTT	2	6	2213834	2213839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47059	NC_012471	ATA	2	6	2213840	2213845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47060	NC_012471	TCTTA	2	10	2213851	2213860	20 %	60 %	0 %	20 %	225871455
47061	NC_012471	TGT	2	6	2213869	2213874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871455
47062	NC_012471	TCG	2	6	2213916	2213921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871455
47063	NC_012471	ATG	2	6	2214076	2214081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871455
47064	NC_012471	CAA	2	6	2214103	2214108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871455
47065	NC_012471	GAC	2	6	2214142	2214147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871455
47066	NC_012471	AGT	2	6	2214149	2214154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871455
47067	NC_012471	GAC	2	6	2214187	2214192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871455
47068	NC_012471	AAG	2	6	2214200	2214205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871455
47069	NC_012471	CTT	2	6	2214229	2214234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871455
47070	NC_012471	CCATA	2	10	2214280	2214289	40 %	20 %	0 %	40 %	225871455
47071	NC_012471	GTT	2	6	2214350	2214355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871455
47072	NC_012471	ACG	2	6	2214383	2214388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871455
47073	NC_012471	GAC	2	6	2214427	2214432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871455
47074	NC_012471	ATG	2	6	2214445	2214450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871455
47075	NC_012471	TCC	2	6	2214478	2214483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47076	NC_012471	A	6	6	2214487	2214492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47077	NC_012471	AGG	2	6	2214534	2214539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47078	NC_012471	CTG	2	6	2214605	2214610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47079	NC_012471	CA	3	6	2214617	2214622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47080	NC_012471	T	8	8	2214659	2214666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47081	NC_012471	ATATC	2	10	2214676	2214685	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47082	NC_012471	GAT	2	6	2214714	2214719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47083	NC_012471	ACA	2	6	2214748	2214753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47084	NC_012471	TAT	2	6	2214873	2214878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47085	NC_012471	TTCA	2	8	2214889	2214896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47086	NC_012471	TAA	2	6	2214902	2214907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47087	NC_012471	TTC	2	6	2214909	2214914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47088	NC_012471	CAA	2	6	2214951	2214956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47089	NC_012471	TCAA	2	8	2214993	2215000	50 %	25 %	0 %	25 %	225871456
47090	NC_012471	T	6	6	2215016	2215021	0 %	100 %	0 %	0 %	225871456
47091	NC_012471	ATT	2	6	2215062	2215067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871456
47092	NC_012471	ATAA	2	8	2215108	2215115	75 %	25 %	0 %	0 %	225871456
47093	NC_012471	T	7	7	2215150	2215156	0 %	100 %	0 %	0 %	225871456
47094	NC_012471	CAAC	2	8	2215187	2215194	50 %	0 %	0 %	50 %	225871456
47095	NC_012471	T	7	7	2215226	2215232	0 %	100 %	0 %	0 %	225871456
47096	NC_012471	TAT	2	6	2215395	2215400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871457
47097	NC_012471	CTTT	2	8	2215427	2215434	0 %	75 %	0 %	25 %	225871457
47098	NC_012471	ATA	2	6	2215438	2215443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871457
47099	NC_012471	ATC	2	6	2215444	2215449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871457
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47101	NC_012471	CCTC	2	8	2215700	2215707	0 %	25 %	0 %	75 %	225871457
47102	NC_012471	CCT	2	6	2215710	2215715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871457
47103	NC_012471	ATC	2	6	2215768	2215773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871457
47104	NC_012471	ATAG	2	8	2215777	2215784	50 %	25 %	25 %	0 %	225871457
47105	NC_012471	ATT	2	6	2215819	2215824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871457
47106	NC_012471	CAA	2	6	2215899	2215904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871457
47107	NC_012471	CT	3	6	2215944	2215949	0 %	50 %	0 %	50 %	225871457
47108	NC_012471	GCT	2	6	2216015	2216020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871457
47109	NC_012471	AAT	2	6	2216023	2216028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871457
47110	NC_012471	TGT	2	6	2216050	2216055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871457
47111	NC_012471	GAAC	2	8	2216114	2216121	50 %	0 %	25 %	25 %	225871457
47112	NC_012471	TAAT	2	8	2216135	2216142	50 %	50 %	0 %	0 %	225871457
47113	NC_012471	AAT	2	6	2216224	2216229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871457
47114	NC_012471	TCC	2	6	2216231	2216236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871457
47115	NC_012471	TGA	2	6	2216286	2216291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871457
47116	NC_012471	CTA	2	6	2216316	2216321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871457
47117	NC_012471	GGTA	2	8	2216350	2216357	25 %	25 %	50 %	0 %	225871457
47118	NC_012471	CAA	2	6	2216373	2216378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871457
47119	NC_012471	CCA	2	6	2216390	2216395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871457
47120	NC_012471	ATC	2	6	2216416	2216421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871457
47121	NC_012471	GTT	2	6	2216438	2216443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871457
47122	NC_012471	CAT	2	6	2216454	2216459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871457
47123	NC_012471	T	6	6	2216662	2216667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47124	NC_012471	CTT	2	6	2216717	2216722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871458
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47132	NC_012471	GCT	2	6	2217184	2217189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871459
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47139	NC_012471	CTG	2	6	2217379	2217384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871459
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47174	NC_012471	TAT	2	6	2219190	2219195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871460
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47223	NC_012471	TCTT	2	8	2221904	2221911	0 %	75 %	0 %	25 %	225871462
47224	NC_012471	TTC	2	6	2221978	2221983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871462
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47233	NC_012471	T	6	6	2222385	2222390	0 %	100 %	0 %	0 %	225871462
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47235	NC_012471	GCA	2	6	2222454	2222459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871462
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47238	NC_012471	CAT	2	6	2222787	2222792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871462
47239	NC_012471	CAA	3	9	2222850	2222858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871462
47240	NC_012471	TCA	2	6	2222880	2222885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871462
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47242	NC_012471	TAT	2	6	2223058	2223063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47244	NC_012471	T	6	6	2223095	2223100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47245	NC_012471	TAA	2	6	2223134	2223139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47248	NC_012471	CAT	2	6	2223199	2223204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871463
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47338	NC_012471	ATA	2	6	2227031	2227036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871467
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47350	NC_012471	GACT	2	8	2227740	2227747	25 %	25 %	25 %	25 %	225871468
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47472	NC_012471	CAG	2	6	2233601	2233606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871475
47473	NC_012471	TATT	2	8	2233674	2233681	25 %	75 %	0 %	0 %	225871475
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47475	NC_012471	AAG	2	6	2233695	2233700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871475
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47490	NC_012471	TGAG	2	8	2234483	2234490	25 %	25 %	50 %	0 %	225871475
47491	NC_012471	ACAA	2	8	2234505	2234512	75 %	0 %	0 %	25 %	225871475
47492	NC_012471	AAGA	2	8	2234530	2234537	75 %	0 %	25 %	0 %	225871475
47493	NC_012471	CAA	2	6	2234558	2234563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871475
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47495	NC_012471	TGAT	2	8	2234648	2234655	25 %	50 %	25 %	0 %	225871475
47496	NC_012471	A	7	7	2234670	2234676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47497	NC_012471	CAA	2	6	2234755	2234760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871476
47498	NC_012471	T	6	6	2234798	2234803	0 %	100 %	0 %	0 %	225871476
47499	NC_012471	ATA	2	6	2234847	2234852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871476
47500	NC_012471	GCT	2	6	2234901	2234906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871476

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