MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_012471	T	7	7	2163996	2164002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46002	NC_012471	ATAA	2	8	2164060	2164067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46003	NC_012471	AATC	2	8	2164073	2164080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46004	NC_012471	AGC	2	6	2164105	2164110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46005	NC_012471	AAT	2	6	2164126	2164131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46006	NC_012471	ATAG	2	8	2164281	2164288	50 %	25 %	25 %	0 %	225871412
46007	NC_012471	AGC	2	6	2164315	2164320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871412
46008	NC_012471	AAT	2	6	2164363	2164368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871412
46009	NC_012471	ATC	2	6	2164376	2164381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871412
46010	NC_012471	ACT	2	6	2164385	2164390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871412
46011	NC_012471	AGT	2	6	2164447	2164452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871412
46012	NC_012471	A	6	6	2164465	2164470	100 %	0 %	0 %	0 %	225871412
46013	NC_012471	CAA	2	6	2164488	2164493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871412
46014	NC_012471	ATA	2	6	2164504	2164509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871412
46015	NC_012471	GTA	2	6	2164513	2164518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871412
46016	NC_012471	ATA	2	6	2164526	2164531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871412
46017	NC_012471	T	6	6	2164532	2164537	0 %	100 %	0 %	0 %	225871412
46018	NC_012471	AAC	2	6	2164697	2164702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871413
46019	NC_012471	GTAAA	2	10	2164745	2164754	60 %	20 %	20 %	0 %	225871413
46020	NC_012471	AAT	2	6	2164781	2164786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871413
46021	NC_012471	TGT	2	6	2164837	2164842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871413
46022	NC_012471	CAA	2	6	2164865	2164870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871413
46023	NC_012471	CAC	2	6	2164943	2164948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871413
46024	NC_012471	T	6	6	2164962	2164967	0 %	100 %	0 %	0 %	225871413
46025	NC_012471	CTAAA	2	10	2165057	2165066	60 %	20 %	0 %	20 %	225871413
46026	NC_012471	TTC	2	6	2165107	2165112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871413
46027	NC_012471	CAA	2	6	2165192	2165197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46028	NC_012471	CCA	2	6	2165235	2165240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46029	NC_012471	TGC	2	6	2165277	2165282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46030	NC_012471	TAA	2	6	2165286	2165291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46031	NC_012471	TCC	2	6	2165322	2165327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46032	NC_012471	TAT	2	6	2165346	2165351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46033	NC_012471	ATTTT	2	10	2165367	2165376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46034	NC_012471	T	7	7	2165373	2165379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46035	NC_012471	T	7	7	2165556	2165562	0 %	100 %	0 %	0 %	225871414
46036	NC_012471	ATC	2	6	2165616	2165621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871414
46037	NC_012471	TAAAAA	2	12	2165722	2165733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	225871414
46038	NC_012471	A	6	6	2165789	2165794	100 %	0 %	0 %	0 %	225871414
46039	NC_012471	AGCT	2	8	2165823	2165830	25 %	25 %	25 %	25 %	225871414
46040	NC_012471	TAC	2	6	2165889	2165894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871414
46041	NC_012471	AAT	2	6	2165923	2165928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871414
46042	NC_012471	A	6	6	2165943	2165948	100 %	0 %	0 %	0 %	225871414
46043	NC_012471	ATC	2	6	2165992	2165997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871414
46044	NC_012471	GAA	2	6	2166062	2166067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871414
46045	NC_012471	ATG	2	6	2166156	2166161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871414
46046	NC_012471	TAAT	2	8	2166168	2166175	50 %	50 %	0 %	0 %	225871414
46047	NC_012471	TAC	2	6	2166189	2166194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871414
46048	NC_012471	AGA	2	6	2166202	2166207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871414
46049	NC_012471	A	6	6	2166241	2166246	100 %	0 %	0 %	0 %	225871414
46050	NC_012471	TAT	2	6	2166279	2166284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46051	NC_012471	A	7	7	2166314	2166320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46052	NC_012471	AGAA	2	8	2166404	2166411	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46053	NC_012471	CCAG	2	8	2166415	2166422	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46054	NC_012471	ACA	2	6	2166526	2166531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46055	NC_012471	TCA	2	6	2166557	2166562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46056	NC_012471	CAT	2	6	2166602	2166607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46057	NC_012471	CT	3	6	2166644	2166649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46058	NC_012471	CTG	2	6	2166733	2166738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871415
46059	NC_012471	GTT	2	6	2166759	2166764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871415
46060	NC_012471	T	6	6	2166788	2166793	0 %	100 %	0 %	0 %	225871415
46061	NC_012471	GA	3	6	2166812	2166817	50 %	0 %	50 %	0 %	225871415
46062	NC_012471	CCT	2	6	2166876	2166881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871415
46063	NC_012471	TTG	2	6	2166920	2166925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871415
46064	NC_012471	TTG	2	6	2166948	2166953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871415
46065	NC_012471	TGC	2	6	2166989	2166994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871415
46066	NC_012471	GCA	2	6	2167005	2167010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871415
46067	NC_012471	ATG	2	6	2167055	2167060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871415
46068	NC_012471	T	6	6	2167085	2167090	0 %	100 %	0 %	0 %	225871415
46069	NC_012471	CTGA	2	8	2167114	2167121	25 %	25 %	25 %	25 %	225871415
46070	NC_012471	AGC	2	6	2167137	2167142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871415
46071	NC_012471	ATC	2	6	2167157	2167162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871415
46072	NC_012471	TTA	2	6	2167209	2167214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871415
46073	NC_012471	AAG	2	6	2167320	2167325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871416
46074	NC_012471	TCA	2	6	2167386	2167391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871416
46075	NC_012471	TGC	2	6	2167429	2167434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871416
46076	NC_012471	TCC	2	6	2167437	2167442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871416
46077	NC_012471	T	8	8	2167495	2167502	0 %	100 %	0 %	0 %	225871416
46078	NC_012471	TCA	2	6	2167519	2167524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871416
46079	NC_012471	TAT	2	6	2167540	2167545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871416
46080	NC_012471	TAT	2	6	2167567	2167572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871416
46081	NC_012471	GTC	2	6	2167599	2167604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871416
46082	NC_012471	A	7	7	2167635	2167641	100 %	0 %	0 %	0 %	225871416
46083	NC_012471	TTC	2	6	2167649	2167654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871416
46084	NC_012471	CAG	2	6	2167673	2167678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871416
46085	NC_012471	TCT	2	6	2167686	2167691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871416
46086	NC_012471	TGA	2	6	2167701	2167706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871416
46087	NC_012471	AGAT	2	8	2167707	2167714	50 %	25 %	25 %	0 %	225871416
46088	NC_012471	CTG	2	6	2167721	2167726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871416
46089	NC_012471	TAC	2	6	2167849	2167854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871416
46090	NC_012471	TTC	2	6	2167861	2167866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871417
46091	NC_012471	CA	3	6	2167899	2167904	50 %	0 %	0 %	50 %	225871417
46092	NC_012471	CCTGT	2	10	2167937	2167946	0 %	40 %	20 %	40 %	225871417
46093	NC_012471	CAT	2	6	2168043	2168048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871417
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46095	NC_012471	GTAAAT	2	12	2168137	2168148	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225871417
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46097	NC_012471	CCGAT	2	10	2168177	2168186	20 %	20 %	20 %	40 %	225871417
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46101	NC_012471	TAAA	2	8	2168387	2168394	75 %	25 %	0 %	0 %	225871417
46102	NC_012471	AATACC	2	12	2168466	2168477	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225871417
46103	NC_012471	TAA	2	6	2168549	2168554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871417
46104	NC_012471	A	6	6	2168594	2168599	100 %	0 %	0 %	0 %	225871417
46105	NC_012471	TAA	2	6	2168636	2168641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871417
46106	NC_012471	TAAT	2	8	2168647	2168654	50 %	50 %	0 %	0 %	225871417
46107	NC_012471	CGA	2	6	2168668	2168673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871417
46108	NC_012471	ATC	2	6	2168679	2168684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871417
46109	NC_012471	ATCA	2	8	2168691	2168698	50 %	25 %	0 %	25 %	225871417
46110	NC_012471	AAGC	2	8	2168732	2168739	50 %	0 %	25 %	25 %	225871417
46111	NC_012471	GAA	2	6	2168774	2168779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871417
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46113	NC_012471	CTT	2	6	2168853	2168858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871417
46114	NC_012471	CAT	2	6	2168925	2168930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871417
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46117	NC_012471	CT	3	6	2169081	2169086	0 %	50 %	0 %	50 %	225871418
46118	NC_012471	TC	3	6	2169101	2169106	0 %	50 %	0 %	50 %	225871418
46119	NC_012471	ACG	2	6	2169130	2169135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871418
46120	NC_012471	T	6	6	2169141	2169146	0 %	100 %	0 %	0 %	225871418
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46221	NC_012471	GCCC	2	8	2174285	2174292	0 %	0 %	25 %	75 %	225871421
46222	NC_012471	TATAG	2	10	2174359	2174368	40 %	40 %	20 %	0 %	225871421
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46226	NC_012471	AT	3	6	2174547	2174552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46227	NC_012471	A	7	7	2174588	2174594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46228	NC_012471	GTA	2	6	2174597	2174602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46229	NC_012471	ATT	2	6	2174644	2174649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46230	NC_012471	TGC	2	6	2174689	2174694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46231	NC_012471	ACTT	2	8	2174895	2174902	25 %	50 %	0 %	25 %	225871422
46232	NC_012471	CAC	2	6	2174976	2174981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871422
46233	NC_012471	GCCA	2	8	2175017	2175024	25 %	0 %	25 %	50 %	225871422
46234	NC_012471	TGC	2	6	2175037	2175042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871422
46235	NC_012471	AAGGAC	2	12	2175144	2175155	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	225871422
46236	NC_012471	ATCA	2	8	2175284	2175291	50 %	25 %	0 %	25 %	225871422
46237	NC_012471	GCAA	2	8	2175306	2175313	50 %	0 %	25 %	25 %	225871422
46238	NC_012471	AAG	2	6	2175338	2175343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871422
46239	NC_012471	TGA	2	6	2175379	2175384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871422
46240	NC_012471	TGA	2	6	2175439	2175444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871422
46241	NC_012471	GA	4	8	2175476	2175483	50 %	0 %	50 %	0 %	225871422
46242	NC_012471	TTGA	2	8	2175527	2175534	25 %	50 %	25 %	0 %	225871422
46243	NC_012471	CTT	2	6	2175626	2175631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871422
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46246	NC_012471	A	6	6	2175716	2175721	100 %	0 %	0 %	0 %	225871422
46247	NC_012471	GCT	2	6	2175758	2175763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871422
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46250	NC_012471	CAG	2	6	2175991	2175996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871422
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46254	NC_012471	AAGC	2	8	2176209	2176216	50 %	0 %	25 %	25 %	225871422
46255	NC_012471	ATC	2	6	2176301	2176306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871422
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46259	NC_012471	TAA	2	6	2176516	2176521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46260	NC_012471	T	6	6	2176554	2176559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46261	NC_012471	ATG	2	6	2176588	2176593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871423
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46264	NC_012471	TCAA	2	8	2176676	2176683	50 %	25 %	0 %	25 %	225871423
46265	NC_012471	AAAT	2	8	2176718	2176725	75 %	25 %	0 %	0 %	225871423
46266	NC_012471	TGA	2	6	2176751	2176756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871423
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46292	NC_012471	T	6	6	2178145	2178150	0 %	100 %	0 %	0 %	225871424
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