MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_012471	CAAA	2	8	1998349	1998356	75 %	0 %	0 %	25 %	225871245
42502	NC_012471	CT	3	6	1998361	1998366	0 %	50 %	0 %	50 %	225871245
42503	NC_012471	TTA	2	6	1998421	1998426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871245
42504	NC_012471	TAT	2	6	1998449	1998454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871245
42505	NC_012471	TCAATA	2	12	1998508	1998519	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225871245
42506	NC_012471	GTT	2	6	1998566	1998571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871245
42507	NC_012471	TCC	2	6	1998664	1998669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871245
42508	NC_012471	TTA	2	6	1998802	1998807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871245
42509	NC_012471	ATA	2	6	1998814	1998819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871245
42510	NC_012471	TTC	2	6	1998872	1998877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42511	NC_012471	AGT	2	6	1998894	1998899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871246
42512	NC_012471	TTTC	2	8	1998940	1998947	0 %	75 %	0 %	25 %	225871246
42513	NC_012471	AAT	3	9	1999034	1999042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871246
42514	NC_012471	CTTTTG	2	12	1999103	1999114	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225871246
42515	NC_012471	ATA	2	6	1999133	1999138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871246
42516	NC_012471	CCA	2	6	1999185	1999190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871246
42517	NC_012471	AGT	2	6	1999253	1999258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871246
42518	NC_012471	ATCAC	2	10	1999266	1999275	40 %	20 %	0 %	40 %	225871246
42519	NC_012471	T	6	6	1999286	1999291	0 %	100 %	0 %	0 %	225871246
42520	NC_012471	CTT	2	6	1999406	1999411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871246
42521	NC_012471	CAC	2	6	1999430	1999435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871246
42522	NC_012471	CTGTA	3	15	1999506	1999520	20 %	40 %	20 %	20 %	225871246
42523	NC_012471	CGG	2	6	1999540	1999545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225871246
42524	NC_012471	TGA	2	6	1999587	1999592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871246
42525	NC_012471	ACG	2	6	1999667	1999672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871246
42526	NC_012471	AGG	2	6	1999685	1999690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225871246
42527	NC_012471	TTGTT	2	10	1999718	1999727	0 %	80 %	20 %	0 %	225871246
42528	NC_012471	CTT	2	6	1999813	1999818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871246
42529	NC_012471	CAT	2	6	1999861	1999866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871246
42530	NC_012471	T	7	7	1999966	1999972	0 %	100 %	0 %	0 %	225871246
42531	NC_012471	TCA	2	6	1999998	2000003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871246
42532	NC_012471	TCT	2	6	2000037	2000042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871246
42533	NC_012471	CCA	2	6	2000043	2000048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871246
42534	NC_012471	CAC	2	6	2000099	2000104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871246
42535	NC_012471	TCA	3	9	2000163	2000171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871246
42536	NC_012471	CGTG	2	8	2000355	2000362	0 %	25 %	50 %	25 %	225871246
42537	NC_012471	GT	3	6	2000371	2000376	0 %	50 %	50 %	0 %	225871246
42538	NC_012471	CAT	2	6	2000419	2000424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871246
42539	NC_012471	AG	3	6	2000444	2000449	50 %	0 %	50 %	0 %	225871246
42540	NC_012471	CCAC	2	8	2000488	2000495	25 %	0 %	0 %	75 %	225871246
42541	NC_012471	ATA	2	6	2000523	2000528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871246
42542	NC_012471	CTG	2	6	2000599	2000604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871246
42543	NC_012471	TGGAA	2	10	2000612	2000621	40 %	20 %	40 %	0 %	225871246
42544	NC_012471	ATC	2	6	2000624	2000629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871246
42545	NC_012471	TTG	2	6	2000659	2000664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871246
42546	NC_012471	TCCAC	2	10	2000698	2000707	20 %	20 %	0 %	60 %	225871246
42547	NC_012471	ATC	2	6	2000730	2000735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871246
42548	NC_012471	TCA	2	6	2000736	2000741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871246
42549	NC_012471	CTC	2	6	2000763	2000768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871247
42550	NC_012471	TCT	2	6	2000852	2000857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871247
42551	NC_012471	GTAG	2	8	2000880	2000887	25 %	25 %	50 %	0 %	225871247
42552	NC_012471	AG	3	6	2000892	2000897	50 %	0 %	50 %	0 %	225871247
42553	NC_012471	T	6	6	2000918	2000923	0 %	100 %	0 %	0 %	225871247
42554	NC_012471	TGAGC	2	10	2000933	2000942	20 %	20 %	40 %	20 %	225871247
42555	NC_012471	ATT	2	6	2000955	2000960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871247
42556	NC_012471	TCT	2	6	2000998	2001003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871247
42557	NC_012471	T	6	6	2001027	2001032	0 %	100 %	0 %	0 %	225871247
42558	NC_012471	CTG	2	6	2001036	2001041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871247
42559	NC_012471	TGT	2	6	2001066	2001071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871247
42560	NC_012471	GCTCC	2	10	2001194	2001203	0 %	20 %	20 %	60 %	225871247
42561	NC_012471	A	6	6	2001212	2001217	100 %	0 %	0 %	0 %	225871247
42562	NC_012471	TCA	2	6	2001337	2001342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871247
42563	NC_012471	TTGA	2	8	2001376	2001383	25 %	50 %	25 %	0 %	225871247
42564	NC_012471	CAG	2	6	2001441	2001446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871247
42565	NC_012471	GGT	2	6	2001522	2001527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225871247
42566	NC_012471	ATA	2	6	2001562	2001567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871247
42567	NC_012471	T	6	6	2001582	2001587	0 %	100 %	0 %	0 %	225871247
42568	NC_012471	AG	3	6	2001599	2001604	50 %	0 %	50 %	0 %	225871247
42569	NC_012471	TTA	2	6	2001883	2001888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871247
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42571	NC_012471	TAC	2	6	2002004	2002009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871247
42572	NC_012471	A	6	6	2002031	2002036	100 %	0 %	0 %	0 %	225871247
42573	NC_012471	ATA	2	6	2002048	2002053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871247
42574	NC_012471	CAT	2	6	2002076	2002081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871247
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42577	NC_012471	AT	3	6	2002198	2002203	50 %	50 %	0 %	0 %	225871247
42578	NC_012471	CAC	2	6	2002229	2002234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871247
42579	NC_012471	CAT	2	6	2002238	2002243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871247
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42581	NC_012471	AAAAT	2	10	2002388	2002397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42582	NC_012471	ATCA	2	8	2002404	2002411	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42583	NC_012471	GT	3	6	2002457	2002462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42584	NC_012471	T	6	6	2002550	2002555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42585	NC_012471	A	6	6	2002569	2002574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42586	NC_012471	TGT	2	6	2002597	2002602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42587	NC_012471	TTTA	2	8	2002603	2002610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42588	NC_012471	CTT	2	6	2002645	2002650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871248
42589	NC_012471	CTTC	2	8	2002668	2002675	0 %	50 %	0 %	50 %	225871248
42590	NC_012471	TCC	2	6	2002703	2002708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871248
42591	NC_012471	ACTA	2	8	2002837	2002844	50 %	25 %	0 %	25 %	225871248
42592	NC_012471	TAA	2	6	2002867	2002872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871248
42593	NC_012471	TCT	2	6	2002943	2002948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871248
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42598	NC_012471	TCA	2	6	2003200	2003205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871249
42599	NC_012471	CGA	2	6	2003242	2003247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871249
42600	NC_012471	CTT	2	6	2003328	2003333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871249
42601	NC_012471	AATC	2	8	2003433	2003440	50 %	25 %	0 %	25 %	225871250
42602	NC_012471	ATA	2	6	2003629	2003634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871250
42603	NC_012471	ATT	2	6	2003649	2003654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42604	NC_012471	AT	3	6	2003669	2003674	50 %	50 %	0 %	0 %	225871251
42605	NC_012471	GCT	2	6	2003680	2003685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871251
42606	NC_012471	TCT	2	6	2003692	2003697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871251
42607	NC_012471	TCT	2	6	2003734	2003739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871251
42608	NC_012471	TGTTT	2	10	2003816	2003825	0 %	80 %	20 %	0 %	225871251
42609	NC_012471	CTC	2	6	2003838	2003843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871251
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42614	NC_012471	ACTTA	2	10	2004009	2004018	40 %	40 %	0 %	20 %	225871251
42615	NC_012471	CCTAT	2	10	2004025	2004034	20 %	40 %	0 %	40 %	225871251
42616	NC_012471	CTTAT	2	10	2004040	2004049	20 %	60 %	0 %	20 %	225871251
42617	NC_012471	TAAT	2	8	2004118	2004125	50 %	50 %	0 %	0 %	225871251
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42850	NC_012471	T	6	6	2014506	2014511	0 %	100 %	0 %	0 %	225871264
42851	NC_012471	A	6	6	2014563	2014568	100 %	0 %	0 %	0 %	225871264
42852	NC_012471	CTT	2	6	2014634	2014639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871265
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42974	NC_012471	ATA	2	6	2019580	2019585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871269
42975	NC_012471	GCT	2	6	2019596	2019601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871269
42976	NC_012471	AGT	2	6	2019663	2019668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871269
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42979	NC_012471	ACC	2	6	2019747	2019752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871269
42980	NC_012471	TTC	2	6	2019753	2019758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871269
42981	NC_012471	CCA	3	9	2019799	2019807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871269
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42985	NC_012471	TCA	2	6	2020075	2020080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871269
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42989	NC_012471	TTA	2	6	2020142	2020147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871269
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42994	NC_012471	CAAG	2	8	2020294	2020301	50 %	0 %	25 %	25 %	225871269
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43000	NC_012471	T	6	6	2020503	2020508	0 %	100 %	0 %	0 %	225871269

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