MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 47894

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_012471	CTT	2	6	1974123	1974128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42003	NC_012471	GTC	2	6	1974139	1974144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42004	NC_012471	CCT	2	6	1974191	1974196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42005	NC_012471	TCGC	2	8	1974203	1974210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42006	NC_012471	CTTC	2	8	1974277	1974284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42007	NC_012471	CTTA	2	8	1974358	1974365	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42008	NC_012471	TCG	2	6	1974383	1974388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42009	NC_012471	CTT	2	6	1974400	1974405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42010	NC_012471	TTA	2	6	1974440	1974445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42011	NC_012471	T	6	6	1974457	1974462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42012	NC_012471	T	6	6	1974514	1974519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42013	NC_012471	TTG	2	6	1974588	1974593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42014	NC_012471	CGA	2	6	1974620	1974625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42015	NC_012471	TG	3	6	1974626	1974631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42016	NC_012471	AC	3	6	1974636	1974641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42017	NC_012471	GAG	2	6	1974642	1974647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42018	NC_012471	T	6	6	1974655	1974660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42019	NC_012471	A	6	6	1974664	1974669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42020	NC_012471	TA	3	6	1974702	1974707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42021	NC_012471	CCT	2	6	1974788	1974793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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42023	NC_012471	AGG	2	6	1975057	1975062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42024	NC_012471	ATC	2	6	1975113	1975118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42025	NC_012471	GGC	2	6	1975131	1975136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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42029	NC_012471	GT	3	6	1975368	1975373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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42031	NC_012471	TCC	2	6	1975419	1975424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42032	NC_012471	TTA	2	6	1975428	1975433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42034	NC_012471	CACGA	2	10	1975518	1975527	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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42041	NC_012471	AT	3	6	1975889	1975894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42043	NC_012471	GTTA	2	8	1976104	1976111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42044	NC_012471	ATG	2	6	1976119	1976124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42047	NC_012471	CTT	2	6	1976182	1976187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42048	NC_012471	C	6	6	1976217	1976222	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42049	NC_012471	CTG	2	6	1976241	1976246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42050	NC_012471	TCG	2	6	1976316	1976321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42056	NC_012471	T	7	7	1976783	1976789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42057	NC_012471	TCT	2	6	1976876	1976881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42060	NC_012471	GGA	2	6	1977032	1977037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42061	NC_012471	TGC	2	6	1977076	1977081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42063	NC_012471	GCT	2	6	1977169	1977174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42064	NC_012471	TGC	2	6	1977199	1977204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42123	NC_012471	TCC	2	6	1980287	1980292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871233
42124	NC_012471	TTC	2	6	1980353	1980358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871233
42125	NC_012471	ATC	2	6	1980373	1980378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871233
42126	NC_012471	AAAT	2	8	1980412	1980419	75 %	25 %	0 %	0 %	225871233
42127	NC_012471	GCA	2	6	1980434	1980439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871233
42128	NC_012471	GAAT	2	8	1980464	1980471	50 %	25 %	25 %	0 %	225871233
42129	NC_012471	CTGA	2	8	1980480	1980487	25 %	25 %	25 %	25 %	225871233
42130	NC_012471	ATC	2	6	1980488	1980493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871233
42131	NC_012471	TGCT	2	8	1980578	1980585	0 %	50 %	25 %	25 %	225871233
42132	NC_012471	CAA	2	6	1980609	1980614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871233
42133	NC_012471	A	6	6	1980621	1980626	100 %	0 %	0 %	0 %	225871233
42134	NC_012471	AGCA	2	8	1980628	1980635	50 %	0 %	25 %	25 %	225871233
42135	NC_012471	TTTTC	2	10	1980655	1980664	0 %	80 %	0 %	20 %	225871233
42136	NC_012471	T	6	6	1980736	1980741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42137	NC_012471	A	6	6	1980745	1980750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42138	NC_012471	AAG	2	6	1980804	1980809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42139	NC_012471	CTGT	2	8	1980853	1980860	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42140	NC_012471	A	6	6	1980886	1980891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42141	NC_012471	CTT	2	6	1980900	1980905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42142	NC_012471	T	7	7	1980904	1980910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42143	NC_012471	A	7	7	1980948	1980954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42144	NC_012471	GCT	2	6	1981075	1981080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871234
42145	NC_012471	T	6	6	1981113	1981118	0 %	100 %	0 %	0 %	225871234
42146	NC_012471	CTT	2	6	1981121	1981126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871234
42147	NC_012471	TAT	2	6	1981256	1981261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871234
42148	NC_012471	T	6	6	1981317	1981322	0 %	100 %	0 %	0 %	225871234
42149	NC_012471	TGAT	2	8	1981398	1981405	25 %	50 %	25 %	0 %	225871234
42150	NC_012471	CAT	2	6	1981484	1981489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871234
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42152	NC_012471	AGC	3	9	1981557	1981565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871234
42153	NC_012471	ACTC	2	8	1981580	1981587	25 %	25 %	0 %	50 %	225871234
42154	NC_012471	GTC	2	6	1981702	1981707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871234
42155	NC_012471	CCT	2	6	1981739	1981744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871234
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42157	NC_012471	ACA	2	6	1981783	1981788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871234
42158	NC_012471	GACTT	2	10	1981811	1981820	20 %	40 %	20 %	20 %	225871234
42159	NC_012471	TCC	2	6	1981825	1981830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871234
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42161	NC_012471	TGA	2	6	1981878	1981883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871234
42162	NC_012471	TA	3	6	1981929	1981934	50 %	50 %	0 %	0 %	225871234
42163	NC_012471	CAA	2	6	1981971	1981976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871234
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42170	NC_012471	GACT	2	8	1982510	1982517	25 %	25 %	25 %	25 %	225871234
42171	NC_012471	T	6	6	1982517	1982522	0 %	100 %	0 %	0 %	225871234
42172	NC_012471	A	6	6	1982541	1982546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42173	NC_012471	CAG	2	6	1982622	1982627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42174	NC_012471	TC	3	6	1982631	1982636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42175	NC_012471	ATG	2	6	1982644	1982649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42177	NC_012471	ATA	2	6	1982752	1982757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42178	NC_012471	TAG	2	6	1982760	1982765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42179	NC_012471	CGC	2	6	1982791	1982796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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42181	NC_012471	TAA	2	6	1982824	1982829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42182	NC_012471	TGC	2	6	1982853	1982858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42183	NC_012471	CAA	3	9	1982886	1982894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42184	NC_012471	AGCA	2	8	1982907	1982914	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42185	NC_012471	TGA	3	9	1982923	1982931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42186	NC_012471	GCA	2	6	1982960	1982965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42188	NC_012471	CT	4	8	1982989	1982996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42189	NC_012471	CTG	3	9	1983004	1983012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42190	NC_012471	ACG	2	6	1983076	1983081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42192	NC_012471	ATT	2	6	1983155	1983160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42213	NC_012471	TAT	2	6	1984083	1984088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42214	NC_012471	ATT	2	6	1984093	1984098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42215	NC_012471	ATA	2	6	1984113	1984118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42216	NC_012471	AGTC	2	8	1984133	1984140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42217	NC_012471	AGCT	2	8	1984197	1984204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42218	NC_012471	A	6	6	1984481	1984486	100 %	0 %	0 %	0 %	225871236
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42226	NC_012471	CAATGC	2	12	1984951	1984962	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225871236
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42228	NC_012471	CTC	2	6	1984991	1984996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871236
42229	NC_012471	TCG	2	6	1985050	1985055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871236
42230	NC_012471	TCA	2	6	1985082	1985087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871236
42231	NC_012471	CTT	2	6	1985220	1985225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42232	NC_012471	TCT	2	6	1985233	1985238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42233	NC_012471	AGC	2	6	1985299	1985304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42234	NC_012471	TGG	2	6	1985466	1985471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225871237
42235	NC_012471	GCT	2	6	1985485	1985490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871237
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42237	NC_012471	ATT	2	6	1985575	1985580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871237
42238	NC_012471	TC	3	6	1985646	1985651	0 %	50 %	0 %	50 %	225871237
42239	NC_012471	GTCTG	2	10	1985724	1985733	0 %	40 %	40 %	20 %	225871237
42240	NC_012471	TCC	2	6	1985734	1985739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871237
42241	NC_012471	TCA	2	6	1985978	1985983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871237
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42243	NC_012471	TGA	2	6	1986117	1986122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871237
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42350	NC_012471	AT	3	6	1991492	1991497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42351	NC_012471	A	6	6	1991595	1991600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42352	NC_012471	CTG	2	6	1991635	1991640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42353	NC_012471	ATCAA	2	10	1991740	1991749	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42354	NC_012471	ATA	2	6	1991803	1991808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42355	NC_012471	TA	3	6	1991883	1991888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42356	NC_012471	ATC	2	6	1991902	1991907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42357	NC_012471	A	6	6	1991941	1991946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42358	NC_012471	TACT	2	8	1991950	1991957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42359	NC_012471	AAT	2	6	1992002	1992007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871241
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42482	NC_012471	T	6	6	1997888	1997893	0 %	100 %	0 %	0 %	225871245
42483	NC_012471	TTC	2	6	1997961	1997966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871245
42484	NC_012471	TC	3	6	1997965	1997970	0 %	50 %	0 %	50 %	225871245
42485	NC_012471	GAT	2	6	1997978	1997983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871245
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